Heatmap: Cluster_217 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.13 0.46 -0.24 -0.09 -0.2 -0.34 0.39 -0.29 -0.64 0.1 -0.12 0.57
-0.21 -0.26 -0.34 -0.21 -0.42 -0.09 -0.23 0.19 0.08 0.32 0.33 0.49
0.04 -0.01 0.04 0.02 0.0 -0.05 0.04 -0.0 -0.27 0.01 -0.16 0.27
-0.33 0.19 -0.2 -0.48 -0.34 -0.74 0.64 -0.41 0.02 0.22 0.61 0.1
-0.22 0.12 0.16 0.22 0.06 -0.21 0.05 -0.11 -0.16 0.15 -0.11 -0.03
-0.31 -0.07 -0.12 -0.07 -0.12 -0.09 0.04 -0.04 -0.03 0.18 0.18 0.34
0.09 -0.04 0.12 0.06 -0.04 -0.14 0.05 -0.13 -0.19 -0.01 -0.01 0.19
0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 -0.0 0.04 -0.24 -0.19 -0.13 -0.14 0.43
0.02 0.08 0.02 -0.2 -0.01 -0.14 0.04 -0.22 0.03 -0.09 -0.17 0.5
0.03 -0.2 -0.02 0.2 -0.09 -0.17 0.27 -0.38 -0.08 0.0 -0.09 0.36
-0.04 0.05 -0.15 0.24 0.14 -0.49 0.38 -0.69 -0.01 -0.01 0.04 0.21
-0.03 0.43 0.01 -0.23 -0.51 -0.32 -0.1 -0.25 -0.51 0.18 0.2 0.63
0.05 0.22 0.2 -0.02 -0.24 -0.29 -0.0 -0.17 0.13 -0.3 0.11 0.18
-0.94 1.22 -1.92 0.6 -0.25 -1.79 1.13 -1.25 -0.66 -0.9 -1.02 0.98
-0.29 -0.11 -0.16 0.19 -0.24 -0.21 0.09 -0.03 0.16 0.28 0.15 0.03
-0.03 -0.08 0.31 -0.11 -0.4 -0.22 0.12 -0.29 -0.09 -0.31 0.1 0.64
-0.04 -0.23 -0.45 -0.05 -0.23 -0.74 0.39 -0.3 -0.21 0.5 0.47 0.3
-1.65 0.56 -0.74 0.21 0.88 -2.88 0.78 -2.76 -0.48 0.1 -1.74 1.33
-0.06 -0.01 -0.26 0.14 -0.1 -0.13 0.25 -0.07 -0.08 -0.19 0.04 0.34
0.32 -0.07 -1.83 -0.35 -0.56 -1.27 1.04 -1.3 -0.31 0.16 0.27 1.03
-0.2 0.15 0.05 -0.05 -0.26 -0.15 0.04 -0.1 -0.1 -0.13 0.06 0.52
-0.01 0.71 0.13 -0.4 -0.47 -0.56 -0.67 0.14 -0.4 -0.15 0.39 0.5
-0.2 0.15 -0.09 -0.03 -0.25 -0.25 0.03 -0.06 0.18 -0.05 0.09 0.34
0.05 0.39 0.04 0.05 -0.14 -0.33 -0.16 -0.07 -0.12 0.09 0.01 0.08
-0.12 0.3 0.1 0.24 -0.03 -0.37 -0.02 -0.01 -0.03 -0.03 -0.17 0.02
0.12 0.06 0.02 0.03 -0.13 -0.14 -0.0 -0.2 -0.23 -0.11 0.09 0.38
-0.2 0.57 -0.03 0.33 -0.05 -0.38 -0.31 -0.39 -0.41 0.08 -0.07 0.42
-0.14 -0.31 0.15 -0.02 0.09 -0.02 0.08 0.09 -0.23 0.02 -0.33 0.45
0.34 -0.52 -0.07 0.14 -0.57 -0.36 0.27 -0.47 -0.49 0.33 -0.27 0.85
0.14 0.22 0.03 -0.1 -0.07 -0.56 -0.38 -0.2 0.14 0.28 0.03 0.25
-0.28 -0.13 -0.09 0.05 -0.0 -0.2 0.23 -0.13 -0.14 0.23 -0.1 0.4
-0.04 0.14 -0.01 0.04 -0.11 -0.34 0.06 -0.44 0.27 -0.18 -0.07 0.46
-0.39 -0.07 -0.34 -0.23 -0.36 -0.08 0.28 0.11 -0.22 0.39 0.34 0.27
0.02 0.13 0.02 -0.07 -0.37 -0.2 -0.02 -0.03 -0.37 0.05 0.1 0.53
0.21 0.32 0.27 0.26 -0.01 -0.68 -0.29 -0.43 -0.23 -0.09 -0.09 0.36
-0.26 0.24 -0.03 0.21 0.05 -0.11 -0.22 -0.24 -0.03 0.0 0.16 0.12
0.82 0.19 0.2 -1.46 -0.11 0.2 0.68 -0.36 -0.23 -0.47 -0.91 0.04
0.26 0.44 -0.27 0.02 -0.33 -0.64 0.45 -0.89 0.01 -0.05 -0.24 0.53
-0.28 0.15 -0.14 0.01 0.09 -0.38 -0.02 -0.07 0.09 0.13 0.15 0.15
-0.04 -0.02 0.1 -0.01 -0.06 -0.54 0.16 -0.11 0.02 -0.09 -0.03 0.43
-0.25 - -0.03 - - 0.07 0.07 - 1.11 1.03 0.66 1.2
0.03 0.22 -0.23 -0.07 -0.28 -0.57 0.36 -0.47 -0.44 0.44 -0.1 0.57
-0.15 -0.02 -0.0 0.08 -0.03 -0.08 -0.0 -0.01 -0.04 -0.01 0.11 0.13
-0.69 -1.14 -1.04 - -1.01 0.06 -0.18 -0.22 0.96 0.93 -0.35 1.33
-0.73 -1.31 -0.65 -0.04 -0.75 -0.6 -0.99 0.07 0.4 0.63 0.59 1.14
-0.35 0.14 -0.13 -0.07 -0.18 -0.37 -0.06 -0.06 -0.21 0.12 0.28 0.6
0.06 0.02 0.08 0.05 -0.13 -0.3 0.1 -0.27 0.13 -0.1 0.03 0.23
0.29 0.31 -0.06 0.1 -0.36 -0.72 -0.24 -0.21 -0.14 0.22 0.18 0.28
-0.21 0.89 -0.98 0.08 -0.49 -1.43 0.59 -0.08 0.32 0.19 -1.29 0.49
-0.04 0.32 -0.18 -0.08 -0.26 -0.21 -0.31 -0.21 0.02 0.29 0.22 0.23
-0.15 -0.18 -0.17 -0.03 -0.03 -0.2 0.14 0.03 -0.08 -0.03 0.17 0.4
0.11 -0.04 -0.01 -0.04 -0.01 -0.1 -0.01 0.01 -0.17 0.04 -0.06 0.24
-0.07 -0.06 0.13 -0.02 -0.19 -0.11 -0.05 -0.34 -0.04 -0.01 0.11 0.49
0.06 0.13 -0.17 -0.11 -0.32 -0.35 0.07 -0.17 0.0 0.14 0.26 0.29
0.08 0.33 0.19 -0.28 -0.08 -0.69 -0.44 -0.18 -0.11 0.07 0.24 0.46
0.33 -0.16 -0.04 -0.36 0.03 0.14 0.66 -0.41 -0.12 -0.33 -1.01 0.51
0.24 0.46 -0.02 -0.93 -1.05 0.01 -0.54 -0.52 -0.72 0.09 0.68 0.83
0.1 -0.11 0.09 0.01 -0.05 -0.02 -0.01 -0.2 -0.08 0.01 0.07 0.15
-0.21 -0.34 -0.13 0.06 -0.56 -0.6 -0.14 -0.3 0.02 0.48 0.69 0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.