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Heatmap: Cluster_114 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.55 0.14 -2.48 0.08 -0.67 0.56 0.77 0.01 -1.0 0.33 0.2 -1.04
- 0.63 - 0.6 - 0.58 0.32 0.27 - 0.29 1.21 0.54
0.2 0.91 -0.18 -0.11 -0.64 0.22 -0.18 0.12 -0.02 0.29 -0.53 -1.06
-1.18 0.14 0.66 -0.19 -1.92 1.07 -0.65 0.81 -0.07 -1.3 -0.44 0.21
0.21 -0.77 -0.18 0.41 -1.1 0.69 0.28 -0.25 0.27 0.58 -2.44 0.04
0.22 2.02 - -0.4 -0.71 0.7 - 0.77 -0.77 -0.37 - -0.46
1.23 0.45 - -0.19 - 0.68 - - 0.95 0.67 - 1.2
0.16 0.02 -0.06 -0.08 -0.01 0.11 0.01 -0.06 -0.1 0.07 -0.09 -0.01
0.68 -0.55 0.48 -1.23 -0.57 -0.21 0.08 0.18 -0.24 0.12 -0.04 0.34
0.06 0.19 0.17 0.21 0.06 -0.02 -0.1 -0.08 0.05 -0.29 -0.32 -0.02
-0.06 0.17 -0.02 0.11 -0.03 0.17 -0.15 -0.12 -0.06 0.2 -0.23 -0.06
0.28 0.3 -0.02 0.09 0.45 -0.03 -0.19 -0.06 -0.79 -0.25 -0.47 0.25
0.1 0.13 0.06 -0.16 -0.12 0.18 -0.08 0.09 -0.02 -0.05 -0.02 -0.15
-0.11 0.1 0.02 0.03 -0.43 0.33 -0.0 -0.02 -0.01 -0.15 -0.24 0.3
0.13 -0.03 -0.26 0.11 -0.6 0.48 -0.49 -0.16 -0.04 -0.0 -0.31 0.64
1.57 0.54 - - 1.67 0.66 - - -1.1 0.63 -0.32 -
0.06 0.02 0.12 -0.09 -0.17 0.0 -0.13 -0.05 0.01 0.05 -0.03 0.18
-1.21 0.74 -0.15 -1.17 -1.64 0.44 -0.01 0.1 0.06 -0.1 -0.07 0.91
0.29 0.55 -0.1 -0.05 -0.17 -0.36 -0.17 -0.47 -0.34 0.11 -0.09 0.4
0.13 0.36 -0.56 -0.08 -0.09 -0.57 -0.55 0.21 0.18 0.36 -0.19 0.32
0.01 0.33 0.16 -0.03 -0.12 -0.09 -0.01 0.03 -0.1 -0.14 -0.07 -0.03
0.14 0.22 -0.09 0.2 -0.33 -0.07 0.07 -0.06 -0.36 0.0 0.01 0.14
-0.07 0.16 0.3 0.01 0.14 0.08 -0.42 0.08 -0.05 0.01 -0.27 -0.11
1.21 1.24 0.87 -1.92 -0.59 -1.11 -0.01 -1.49 -0.78 -0.52 -0.74 -0.17
0.15 0.1 0.09 -0.09 -0.1 -0.2 -0.04 -0.09 0.02 0.11 0.02 -0.02
0.96 0.54 -2.68 -0.1 0.97 0.29 -0.45 -2.87 -1.45 0.61 0.02 -0.84
0.99 0.42 -0.94 -0.74 -0.4 0.51 -0.28 -0.13 -0.48 -0.02 0.02 -0.12
0.14 0.18 0.04 -0.09 -0.06 0.01 -0.11 -0.04 -0.21 -0.02 -0.1 0.2
0.08 0.23 0.05 -0.21 -0.06 0.06 0.0 0.03 0.07 -0.21 -0.09 -0.01
0.59 0.26 0.45 -0.07 0.37 -0.27 -0.44 -0.13 -0.36 -0.26 -1.53 0.33
-0.64 0.43 -0.48 -0.35 0.96 0.96 -0.09 -0.34 -1.16 -0.06 -1.1 0.01
0.13 0.09 0.05 0.05 -0.14 0.29 -0.02 -0.15 0.03 -0.14 -0.17 -0.1
0.97 1.74 0.14 - - 1.38 0.08 - -0.09 -0.03 - -
0.37 0.56 0.77 -1.62 -0.35 0.49 -0.51 0.13 0.3 0.37 -0.91 -2.59
- 1.4 0.79 - - 1.04 0.12 - -0.24 0.84 0.88 -
0.32 0.0 0.02 0.13 0.4 0.19 0.05 -0.34 -0.21 -0.57 -0.33 0.03
-0.31 0.43 -1.17 -0.32 -0.93 0.49 0.1 -0.2 0.74 0.37 -0.62 0.16
0.81 1.22 0.35 - -1.74 0.42 -0.61 1.2 - -0.03 -2.43 -0.17
0.1 0.13 0.08 0.11 -0.31 0.1 -0.12 0.49 -0.3 -0.07 -0.25 -0.17
0.03 0.98 -1.94 0.23 0.35 1.09 -0.49 0.69 -2.13 -0.52 -1.86 -0.66
0.49 0.01 -0.46 -0.28 0.06 0.36 -0.25 0.09 -0.68 0.35 -0.02 -0.12
0.34 0.52 0.0 0.27 0.04 0.13 -0.33 0.21 -0.56 -0.01 -0.66 -0.49
0.37 0.7 -0.18 0.44 -0.83 -0.18 -0.14 -0.29 0.1 -0.06 -0.6 -0.03
-0.45 1.1 0.86 -0.14 -0.66 -0.42 -1.66 -2.79 -0.69 1.19 -2.24 0.54
0.1 0.48 0.03 0.07 -0.04 0.07 -0.14 0.3 -0.41 0.13 -0.33 -0.58
0.81 0.2 0.18 -0.13 -0.33 0.29 0.15 0.54 -1.44 0.14 -1.01 -1.02
0.33 0.4 0.08 0.01 -0.01 -0.62 -0.25 -0.05 -0.18 0.22 -0.39 0.14
0.37 0.04 0.06 0.22 -0.1 -0.16 -0.09 0.37 -0.2 -0.35 -0.39 -0.02
1.0 0.99 -0.83 -0.69 -0.06 - - -1.02 -0.19 0.52 -0.24 1.16
0.5 0.56 -0.06 -0.22 -0.13 -0.69 -0.27 0.68 -1.46 -0.36 0.01 0.23
- 1.84 - 0.96 - 2.07 - - - - 1.19 -
0.04 0.55 0.14 0.06 0.04 -0.25 0.13 -0.57 0.15 -0.16 -0.4 -0.05
- 0.36 0.39 0.48 - 1.58 0.28 0.15 - - 0.08 0.72
- 1.71 0.95 - 0.02 0.72 - - -0.15 1.08 - 0.17
-0.08 0.46 -0.23 -0.03 -0.24 0.0 -0.3 0.14 -0.47 0.28 -0.02 0.22
-0.39 1.33 0.77 0.39 -0.98 0.56 -1.29 -0.91 0.96 -1.4 - -1.15
0.85 0.76 0.44 -0.88 0.02 - 0.18 0.75 -0.59 -0.34 -2.4 0.17
0.35 0.2 -0.07 0.04 -0.02 0.09 -0.42 0.07 -0.14 -0.14 -0.1 -0.01
-0.62 0.64 0.14 0.93 -1.52 -0.18 -0.46 -0.37 0.54 -0.36 0.06 -0.35
-0.18 1.16 0.04 0.56 -1.06 0.6 -0.35 0.35 -1.44 0.18 -2.05 -0.78
-0.81 0.76 0.14 -0.08 -0.23 0.94 -1.32 -0.06 -0.59 -0.26 -0.09 0.17
0.39 0.06 0.04 0.12 -0.02 -0.21 0.02 0.16 -0.24 -0.27 -0.38 0.14
0.77 1.24 -0.38 -3.08 0.15 0.34 -1.35 0.86 -0.47 -0.12 -3.47 -0.45
-0.28 0.07 -0.14 0.3 0.0 0.45 -0.84 0.79 0.11 -0.97 -2.0 0.58
-1.05 0.77 0.37 0.28 0.29 0.99 0.15 0.11 -0.95 -1.28 -1.75 -0.54
-0.11 1.12 -0.9 -0.34 -0.33 0.9 0.23 0.16 -0.07 -0.85 -0.75 -0.95
0.48 0.09 0.12 -0.31 -0.22 0.16 -0.31 0.64 -0.49 -0.47 -0.15 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.