Heatmap: Cluster_145 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.21 0.05 0.09 -0.06 -0.09 -0.3 -0.08 -0.1 -0.1 0.1 -0.2 0.34
0.18 -0.77 0.21 -0.09 -0.13 0.33 0.19 -0.12 -0.3 -0.11 0.0 0.28
-0.07 -0.11 0.03 0.01 -0.18 -0.03 -0.01 -0.15 0.22 -0.02 0.06 0.19
0.07 0.35 -0.08 0.18 -0.31 -0.28 -0.23 0.06 0.15 -0.11 -0.16 0.19
0.22 -0.02 0.18 -0.19 -0.09 -0.1 0.03 0.03 -0.03 0.0 -0.25 0.13
-0.02 -0.07 0.07 0.08 -0.13 -0.0 -0.06 -0.1 -0.07 -0.07 0.07 0.26
0.13 -0.07 0.05 0.08 -0.21 -0.17 -0.1 -0.02 -0.1 -0.07 0.05 0.35
0.03 0.08 0.12 0.05 -0.03 -0.03 -0.06 -0.01 -0.17 -0.04 -0.11 0.14
-0.07 0.08 0.06 -0.01 -0.07 -0.06 0.09 0.02 -0.13 -0.08 -0.09 0.21
0.04 -0.17 0.19 -0.09 -0.06 0.22 -0.03 -0.1 -0.12 -0.09 0.04 0.11
-0.18 -0.05 0.07 -0.01 0.0 -0.01 0.12 -0.06 -0.11 0.03 -0.07 0.22
0.08 -0.06 0.11 0.06 -0.02 0.02 -0.02 -0.08 -0.1 -0.12 -0.13 0.21
-0.0 0.07 0.02 -0.18 0.03 0.03 -0.15 0.03 -0.14 0.02 -0.17 0.36
-0.04 0.02 0.08 0.1 -0.07 -0.01 -0.01 0.06 -0.2 -0.02 -0.1 0.15
0.02 0.03 0.02 -0.05 -0.03 0.13 0.08 0.04 -0.18 -0.07 -0.09 0.07
0.25 0.12 -0.06 -0.01 -0.19 -0.22 -0.15 -0.04 0.1 -0.11 -0.0 0.22
0.25 -0.06 0.07 -0.08 -0.37 -0.09 -0.13 -0.1 0.17 -0.03 0.06 0.2
0.15 -0.08 -0.03 -0.11 -0.02 -0.08 0.1 0.12 -0.39 0.09 -0.15 0.29
0.18 -0.19 -0.03 -0.2 -0.06 -0.17 -0.01 0.07 -0.08 0.12 -0.08 0.34
0.25 0.3 0.01 0.09 -0.19 -0.34 -0.13 -0.01 -0.15 -0.02 -0.04 0.12
0.13 0.12 -0.02 0.0 -0.06 -0.11 -0.05 -0.0 -0.09 -0.04 -0.01 0.11
0.09 -0.15 0.17 0.11 -0.18 -0.17 0.08 -0.13 0.0 -0.09 -0.02 0.21
0.16 -0.07 0.07 -0.04 -0.05 -0.05 0.02 -0.17 -0.25 0.05 -0.08 0.32
0.22 0.5 0.19 0.05 -0.13 -0.33 -0.37 -0.03 -0.16 -0.22 -0.2 0.21
0.06 -0.18 0.1 -0.09 -0.21 -0.07 0.08 -0.26 0.19 -0.06 0.03 0.3
0.07 0.11 -0.07 0.06 -0.07 -0.02 0.02 -0.16 0.02 -0.16 -0.08 0.23
-0.08 0.09 -0.1 -0.09 -0.13 0.01 0.25 0.06 -0.13 -0.2 -0.11 0.33
0.13 -0.06 0.05 -0.08 -0.06 -0.01 0.08 -0.23 -0.11 -0.14 -0.02 0.35
0.23 -0.1 -0.0 -0.2 -0.06 -0.19 0.11 0.05 -0.12 -0.02 -0.1 0.3
0.04 0.11 0.02 0.04 -0.15 -0.09 0.14 -0.18 0.01 -0.03 -0.14 0.18
0.23 -0.1 0.16 -0.03 -0.21 -0.08 -0.1 -0.08 -0.01 -0.1 -0.11 0.33
0.1 0.0 0.06 -0.02 -0.02 -0.05 -0.04 0.02 -0.09 -0.05 -0.14 0.2
-0.04 -0.15 -0.0 -0.01 -0.0 -0.06 -0.03 -0.0 -0.05 0.0 -0.02 0.31
0.27 -0.13 0.16 -0.12 -0.19 -0.2 -0.16 -0.17 0.21 -0.07 -0.18 0.39
0.18 -0.05 0.16 -0.02 -0.29 0.03 0.14 0.06 -0.28 -0.09 -0.37 0.37
0.2 0.27 0.06 -0.02 -0.13 -0.04 -0.07 -0.05 -0.14 -0.22 -0.09 0.14
0.3 0.22 0.12 -0.05 -0.18 -0.03 -0.06 -0.34 -0.09 -0.43 0.02 0.32
0.02 0.04 0.01 -0.02 -0.0 -0.04 -0.0 0.01 -0.11 0.03 -0.09 0.14
0.29 0.09 0.14 -0.2 -0.1 -0.04 -0.02 -0.07 -0.09 -0.04 -0.24 0.18
0.1 0.03 0.14 -0.05 -0.11 -0.02 0.11 -0.05 -0.17 0.03 -0.15 0.1
0.55 -0.18 0.12 -0.35 -0.35 -0.33 -0.07 -0.56 -0.13 -0.1 0.43 0.45
0.04 0.07 0.03 -0.09 -0.07 -0.0 -0.14 0.03 -0.28 0.03 -0.12 0.41
0.13 -0.06 0.13 -0.08 -0.14 -0.02 0.03 -0.08 -0.0 -0.03 0.01 0.09
0.04 0.01 -0.01 -0.09 -0.05 -0.07 -0.02 0.05 -0.11 0.0 -0.04 0.25
0.09 0.16 -0.02 -0.04 -0.15 0.01 0.1 -0.0 -0.12 -0.06 -0.2 0.16
0.07 0.01 -0.17 0.11 -0.07 0.06 0.14 0.1 -0.16 -0.02 -0.12 0.01
0.12 0.13 0.08 -0.0 -0.03 0.03 0.02 -0.03 -0.21 -0.01 -0.2 0.07
0.08 -0.05 0.1 -0.08 -0.08 -0.01 0.0 -0.07 -0.07 -0.02 0.01 0.15
0.06 0.09 0.12 0.1 -0.13 0.05 -0.03 0.04 -0.24 -0.04 -0.26 0.16
0.09 0.07 0.07 -0.03 0.1 0.04 -0.07 -0.02 -0.18 0.06 -0.22 0.05
0.15 -0.41 0.09 -0.17 -0.15 -0.15 -0.21 0.18 0.13 0.18 -0.02 0.22
-0.09 -0.1 0.23 0.31 -0.04 -0.22 -0.31 0.11 -0.3 0.11 -0.04 0.18
0.11 0.04 0.11 0.09 -0.03 -0.05 0.03 -0.01 -0.41 -0.14 -0.45 0.48
0.04 0.01 -0.08 -0.12 0.1 -0.14 0.06 0.04 -0.25 -0.09 0.01 0.34
0.01 0.11 0.07 -0.03 -0.17 -0.01 0.02 -0.1 0.13 -0.14 -0.09 0.16
0.17 -0.21 0.32 0.18 -0.09 -0.27 0.04 -0.12 -0.15 -0.07 -0.09 0.16
0.03 0.25 0.23 0.07 -0.48 -0.27 0.39 0.25 -0.31 -0.46 -0.47 0.35
0.33 -0.08 -0.01 -0.01 -0.07 -0.12 -0.02 -0.3 0.03 -0.18 0.04 0.27
0.1 0.12 0.08 0.03 -0.13 -0.03 -0.04 -0.18 0.1 -0.21 -0.06 0.17
-0.06 0.09 0.1 -0.02 -0.1 -0.04 0.02 -0.08 -0.08 -0.0 0.0 0.15
0.09 -0.08 0.08 0.05 0.01 -0.13 -0.12 -0.06 0.05 0.02 0.02 0.06
0.55 -0.28 0.2 -0.63 -0.09 -0.22 -0.01 -0.41 0.32 0.0 -0.11 0.27
0.0 0.04 0.03 0.02 -0.12 0.05 -0.05 0.05 -0.09 -0.13 -0.07 0.25
-0.3 -0.04 -0.17 -0.24 0.44 -0.81 0.17 -0.25 -0.62 -0.01 -0.19 1.05
0.14 0.22 -0.1 -0.24 -0.95 -0.19 -0.04 -0.17 0.34 -0.29 -0.41 0.9
0.0 -0.2 0.12 -0.01 0.13 -0.16 0.05 -0.11 -0.14 -0.07 -0.02 0.31
0.3 -0.13 -0.07 -0.02 -0.01 -0.18 0.09 0.13 -0.49 0.15 -0.07 0.15
-0.07 0.03 0.16 -0.07 0.04 -0.05 -0.11 -0.1 -0.22 -0.19 0.05 0.41
0.16 -0.05 -0.04 0.06 -0.12 -0.1 -0.01 -0.08 0.09 -0.0 -0.11 0.16
0.07 -0.15 0.09 -0.17 -0.21 -0.11 0.04 -0.33 0.02 -0.19 0.19 0.53
0.55 -0.42 0.54 -0.64 -0.7 -0.22 -0.23 -0.71 -0.4 0.2 0.39 0.62
0.04 0.05 0.08 -0.11 -0.29 0.12 0.07 -0.1 0.05 -0.13 0.07 0.09
0.08 -0.15 0.03 0.08 0.05 -0.03 0.04 -0.11 -0.13 0.04 -0.09 0.14
0.02 -0.01 0.0 0.03 -0.07 -0.12 0.08 -0.01 -0.08 -0.08 -0.33 0.45
0.15 -0.01 0.05 0.03 0.06 0.0 0.07 -0.02 -0.28 -0.01 -0.17 0.07
0.05 -0.05 0.13 -0.12 -0.06 -0.09 -0.14 -0.09 -0.13 0.07 -0.17 0.46
0.18 0.06 0.22 -0.06 -0.15 -0.2 0.11 -0.07 -0.3 -0.16 -0.33 0.49
-0.02 0.09 0.11 -0.06 -0.02 0.03 -0.06 -0.05 -0.14 -0.08 -0.0 0.16
-0.1 0.12 0.08 0.1 -0.31 0.07 0.11 -0.18 0.26 -0.33 -0.2 0.23
0.21 -0.52 0.33 -0.15 -0.29 -0.09 -0.12 0.02 0.12 -0.12 -0.1 0.43
0.12 -0.1 0.04 -0.06 -0.0 -0.03 0.06 -0.02 -0.05 -0.07 -0.03 0.11
0.11 -0.06 0.08 -0.27 -0.24 0.15 -0.01 0.15 -0.16 0.2 -0.23 0.16
-0.01 -0.4 0.18 -0.17 -0.11 0.15 0.05 -0.08 0.31 -0.04 -0.02 0.01
0.81 0.26 -1.01 -0.71 -2.31 -0.1 -0.45 -1.2 0.13 -0.4 0.54 1.23
0.09 -0.12 -0.06 0.06 -0.02 -0.01 0.05 -0.07 -0.13 0.02 -0.16 0.29
-0.01 0.01 0.12 -0.17 -0.1 -0.08 -0.02 0.11 -0.09 -0.09 -0.11 0.35
0.25 -0.1 0.23 0.06 -0.18 -0.34 -0.3 -0.1 -0.2 -0.01 0.04 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.