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Heatmap: Cluster_22 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.15 -0.12 -0.12 0.08 0.01 0.11 0.09 0.04 0.02 -0.13 -0.04 -0.13
0.41 -0.42 -0.24 0.92 0.22 -2.23 1.87 -0.16 -0.52 -1.79 -1.98 -
0.08 0.09 0.16 -0.15 0.2 -0.08 0.46 -0.29 -0.31 -0.58 -0.01 0.16
-0.41 -0.01 -0.22 0.23 -0.26 -0.08 0.22 0.46 0.05 -0.02 -0.01 -0.18
0.63 0.27 0.24 0.5 0.51 -0.65 1.06 0.6 - - -0.01 -
0.41 0.88 1.29 -0.36 0.74 -2.3 0.48 - -2.56 -2.25 0.97 -
0.06 -0.07 0.05 0.02 -0.2 -0.17 0.48 -0.1 -0.1 -0.05 0.03 -0.09
-1.74 1.32 0.65 0.13 0.62 -0.34 0.78 -2.23 -1.62 - 0.98 -
-0.64 -0.16 1.29 0.89 0.54 -0.64 0.71 -1.49 -1.65 -0.89 -1.68 -0.12
0.34 0.4 0.3 -0.22 -0.19 0.42 -0.34 -0.22 -0.55 -0.2 -0.53 0.3
0.08 -0.07 0.06 0.08 -0.08 -0.01 -0.12 -0.09 0.23 -0.02 0.05 -0.14
0.41 0.67 -0.16 0.1 -0.16 -0.25 -0.04 -0.17 -0.3 0.13 -1.79 0.4
-0.11 -0.02 0.54 -0.24 0.18 -0.37 0.2 -0.72 0.46 -0.18 0.03 -0.24
0.09 -0.19 -0.11 0.17 -0.13 0.02 -0.26 0.0 0.39 -0.2 0.13 -0.06
0.27 0.16 -0.37 0.05 0.56 -0.81 0.43 -2.36 -0.22 0.14 -0.14 0.51
-2.11 -0.77 0.01 -0.8 0.03 0.42 0.09 1.04 -0.65 -0.09 0.66 -0.06
1.92 - - 2.12 - - 1.95 - - - - -
-0.21 0.39 0.19 -1.32 -0.26 0.14 0.52 0.03 0.0 0.27 -0.03 -0.48
-0.14 0.86 -0.97 -1.42 -0.4 0.26 -1.11 1.4 -2.78 0.72 -0.49 -0.27
-0.45 -0.37 0.34 -0.17 -1.12 -1.65 0.51 -0.85 0.57 0.12 0.73 0.43
- - - -0.02 1.74 - 1.6 0.88 -0.09 -0.22 - 0.03
-0.24 -0.08 0.22 0.12 0.23 -0.22 0.16 -0.27 -0.06 0.01 -0.21 0.2
0.1 0.05 0.1 -0.18 -0.01 -0.31 0.22 -0.04 -0.18 -0.18 -0.04 0.34
0.34 -0.37 0.36 0.18 -0.03 0.06 -0.12 -0.24 0.19 -0.37 -0.03 -0.23
0.17 0.14 0.12 0.01 -0.22 0.2 -0.23 0.09 -0.08 0.13 -0.29 -0.15
0.14 0.03 -0.08 0.05 -0.3 0.21 -0.36 0.24 -0.24 0.0 -0.26 0.34
0.37 -0.3 -0.07 0.15 0.04 0.02 -0.02 0.16 -0.03 0.19 -0.32 -0.39
0.24 -0.18 -0.25 0.08 -0.21 -0.11 0.16 -0.08 0.26 0.05 0.19 -0.28
1.11 0.63 0.93 - 0.96 -0.1 -2.03 0.96 -1.93 -1.65 -1.14 -1.81
0.33 0.18 0.03 -0.22 -0.06 0.02 0.32 0.11 -0.37 0.24 -0.45 -0.42
0.32 0.01 0.21 -0.16 -0.38 0.15 -0.2 -0.24 -0.09 -0.04 0.19 0.07
0.26 0.08 0.2 -0.33 -0.63 0.17 0.39 -0.36 -0.05 0.18 -0.64 0.26
0.15 -0.11 0.05 0.11 -0.01 0.15 -0.34 -0.12 0.07 0.07 -0.06 -0.04
1.08 -2.15 0.16 0.76 -1.92 -0.46 - -0.18 0.8 -0.02 0.98 -1.79
0.09 0.0 0.11 0.06 -0.07 0.06 0.01 0.06 0.04 -0.05 -0.08 -0.28
0.55 -0.29 0.06 0.11 -0.44 0.03 -0.09 -0.29 0.14 0.06 -0.37 0.22
0.34 0.11 0.11 0.08 -0.12 0.04 -0.37 -0.48 0.05 -0.15 -0.1 0.27
-0.04 -0.13 0.01 -0.02 -0.18 0.04 -0.04 0.06 0.01 0.11 -0.11 0.23
0.66 1.09 0.08 -0.8 - 0.31 - 0.97 - 1.0 -0.06 -0.98
0.04 0.04 0.2 0.15 -0.2 0.2 0.03 0.27 0.04 -0.34 -0.19 -0.42
0.17 0.01 0.18 -0.09 -0.16 0.01 -0.0 0.06 -0.23 0.03 -0.22 0.16
0.3 -0.19 0.1 0.34 -0.07 -0.15 -0.1 -0.34 0.39 -0.24 -0.16 -0.11
-0.07 -0.85 -0.02 0.02 -0.01 0.45 0.35 -0.42 0.18 -0.19 0.1 0.05
0.1 0.22 0.4 0.25 0.17 -0.37 -0.23 -0.25 0.02 -0.59 0.22 -0.3
0.05 -0.24 0.01 0.13 -0.06 0.01 0.33 -0.26 -0.07 -0.11 0.27 -0.23
-1.13 1.1 -0.36 -0.74 0.29 -0.71 0.68 -1.65 0.7 0.71 -0.45 -1.88
0.71 -1.36 -0.65 -0.16 0.81 0.38 -0.75 0.08 0.29 -0.14 -1.73 0.39
0.25 -0.07 0.48 -0.57 -0.16 -0.35 0.19 0.02 -0.03 -0.39 0.56 -0.44
0.27 -0.28 0.29 0.55 0.24 -0.63 0.54 -1.63 -0.52 0.25 0.12 -0.48
0.04 0.34 -0.03 0.03 -0.22 0.36 0.07 -0.11 -0.1 -0.16 -0.25 -0.12
-0.18 0.07 1.07 0.08 - - 1.72 - - - 1.38 0.01
-0.44 0.14 0.48 0.05 0.39 -0.16 -0.02 -0.27 -0.76 0.55 -1.1 0.25
0.28 -0.06 -0.07 0.0 -0.31 0.59 -0.12 0.28 -0.52 0.02 -0.52 0.01
0.44 -0.09 0.02 - - 0.14 - -0.67 0.38 1.8 -0.62 0.61
-0.32 -0.15 -0.05 0.35 -0.24 0.18 0.23 -0.67 -0.09 0.12 0.23 0.08
0.25 -0.14 0.09 0.12 -0.1 0.02 -0.21 -0.18 0.36 -0.14 0.01 -0.23
0.11 1.13 -0.04 -0.04 -0.41 0.07 0.7 -0.84 -3.99 -0.56 0.26 -0.2
- - - 2.67 - - 2.5 - - - - -
- - - - 1.78 - 2.27 - 1.91 - - -
0.58 0.03 0.11 0.48 -0.28 -0.42 -0.26 -0.27 0.08 -0.08 -0.13 -0.22
-0.91 - 0.28 1.08 -0.33 0.45 1.42 -2.11 -0.82 -3.22 0.35 0.18
-0.27 0.74 0.44 -0.58 -0.32 -0.84 0.82 0.6 -0.83 0.02 -0.05 -1.79
0.42 0.01 0.04 -0.11 -0.22 0.3 -0.74 0.21 -0.18 0.09 -0.15 -0.0
0.26 -0.01 0.13 -0.09 -0.12 0.12 -0.36 0.08 -0.04 0.2 -0.3 -0.01
- - 0.48 0.62 - - 1.47 0.96 - 1.18 1.05 -
0.19 0.22 0.35 -0.14 -0.21 -0.09 0.1 0.07 0.04 -0.01 0.06 -0.93
-0.25 1.11 -0.09 -1.64 -1.84 - 1.17 -1.63 0.8 -0.11 0.66 -0.65
0.13 -0.05 0.09 -0.02 -0.04 0.08 -0.15 0.02 0.2 0.06 0.05 -0.46
-0.01 -0.15 -0.11 -0.02 -0.06 0.15 -0.02 0.0 0.07 0.08 -0.1 0.14
-0.06 0.07 0.38 0.33 0.01 -0.21 0.46 -0.44 -0.42 0.15 -0.46 -0.22
-0.34 0.04 0.5 0.3 0.14 -0.09 0.35 -0.58 -0.4 0.24 -0.72 -0.0
0.16 -0.76 0.23 -0.08 -0.23 0.46 0.29 -0.41 0.26 -0.18 0.01 -0.17
0.27 -0.34 -0.07 0.24 0.26 0.51 -0.18 -0.2 -0.51 -0.06 0.04 -0.31
0.16 0.15 -0.01 -0.08 -0.08 0.03 -0.34 0.07 0.08 0.08 0.02 -0.15
0.24 -0.12 0.28 0.09 -0.18 -0.09 -0.14 0.18 -0.22 0.01 -0.41 0.18
- - - 2.47 - - 2.29 0.66 - - - -
0.18 0.11 -0.21 0.14 -0.35 0.28 0.04 0.2 -0.18 -0.15 -0.14 -0.07
-0.59 0.62 0.24 -0.18 -0.73 0.09 0.39 -0.68 -0.3 -0.08 0.52 -0.09
0.27 -0.22 0.13 0.12 -0.16 0.01 -0.06 -0.19 0.24 -0.22 -0.01 -0.03
0.37 - - 1.64 - 0.8 1.47 - - 1.62 - -
-1.24 -0.09 -0.66 -0.52 -1.82 -1.54 0.58 0.78 -0.52 0.57 0.99 0.37
-2.33 0.98 -0.57 -2.14 -1.88 0.99 1.13 -0.24 0.55 -1.0 -0.6 0.01
-1.85 -2.15 -0.72 0.89 -1.29 0.1 0.79 0.84 0.17 -0.31 0.4 -0.34
-0.15 -0.12 -0.33 -0.01 0.29 -0.23 0.78 0.01 -0.36 0.68 -0.46 -1.04
0.56 -0.31 0.29 0.31 -0.17 0.17 0.46 -1.5 0.34 -1.01 -0.07 -0.33
-0.65 -0.08 1.12 0.98 - 0.37 0.69 -2.09 -1.45 0.25 0.53 -2.9
- - - - 1.81 - 2.3 - 1.84 - - -
0.31 -0.3 0.16 0.13 0.01 -0.15 -0.26 -0.43 0.58 -0.12 0.23 -0.6
0.08 -0.2 0.07 -0.02 0.1 0.3 -0.07 -0.0 -0.0 0.04 -0.09 -0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.