Heatmap: Cluster_21 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.15 1.33 0.54 0.64 4.72 1.45 0.98 0.52 2.44 2.72 0.99 0.63
0.3 1.62 1.23 1.16 1.06 1.0 0.81 0.73 0.9 1.23 1.5 0.62
77.29 73.79 61.5 72.97 58.56 75.59 79.71 66.88 95.65 73.1 69.0 88.89
0.05 0.14 0.19 0.28 0.1 0.08 0.11 0.17 0.1 0.15 0.48 0.2
10.23 9.9 8.37 11.0 13.85 11.67 10.94 9.83 15.93 11.89 12.63 12.89
0.03 0.03 0.07 0.13 0.53 0.45 0.11 0.37 0.28 0.55 0.16 0.08
1.52 1.38 0.85 1.73 0.96 1.06 2.12 2.09 1.22 1.3 2.49 1.28
0.0 0.0 0.03 0.0 0.24 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
9.38 11.84 10.1 10.23 12.58 11.71 10.71 10.73 10.34 10.57 10.68 9.46
4.23 3.24 3.92 3.39 3.8 4.24 3.99 3.57 3.73 3.9 3.69 3.71
0.07 0.08 0.07 0.04 0.15 0.15 0.09 0.02 0.02 0.0 0.04 0.04
0.41 0.5 0.63 0.75 0.47 0.52 0.75 0.61 0.67 0.41 1.15 0.95
8.37 3.03 3.76 6.04 6.58 5.53 7.73 6.82 6.79 2.56 10.78 5.21
0.9 2.16 2.2 0.76 3.88 3.03 2.01 1.52 3.53 3.31 2.64 3.06
0.03 0.06 0.05 0.13 0.12 0.08 0.06 0.04 0.19 0.15 0.14 0.37
9.94 5.79 7.99 6.09 7.08 7.27 7.48 8.01 8.24 7.13 8.16 8.92
9.98 12.93 15.79 16.51 14.33 5.35 17.25 15.26 9.12 9.15 15.65 9.04
98.14 98.69 74.41 92.66 72.7 91.04 102.17 87.96 111.81 99.96 83.67 112.98
0.92 0.78 1.09 1.0 0.81 0.69 0.91 0.64 0.9 0.94 1.04 0.97
3.65 3.18 2.5 2.22 2.67 2.76 2.41 2.76 3.04 2.87 1.96 2.31
3.67 4.47 2.66 2.73 8.56 7.1 5.15 4.87 4.51 4.84 3.47 4.16
47.76 64.06 57.06 51.85 73.72 51.93 42.81 53.27 68.98 72.62 77.94 57.38
0.18 0.47 0.7 0.64 0.5 0.11 0.75 0.84 0.47 1.18 0.64 0.46
1.07 0.59 0.91 0.91 0.75 0.76 0.85 1.22 0.88 0.72 0.78 0.74
13.01 11.78 9.75 13.56 13.46 13.13 13.26 14.77 10.43 12.63 13.74 12.19
0.51 0.44 0.32 0.45 0.37 0.21 0.5 0.3 0.32 0.91 0.56 0.61
83.66 108.53 97.09 100.0 111.57 109.0 98.4 102.92 112.94 130.52 117.99 99.35
2.66 3.02 4.04 3.53 3.03 2.98 4.61 3.48 2.96 3.71 3.7 4.38
20.42 29.57 20.9 20.58 35.58 26.52 20.23 24.06 19.99 39.68 33.65 16.24
1.37 2.33 2.79 1.81 4.09 3.2 2.63 2.11 2.82 1.93 1.86 1.16
20.64 15.17 12.3 15.13 13.71 17.5 15.15 18.23 17.28 15.79 15.77 17.62
64.38 62.55 60.08 54.33 80.74 60.42 58.6 69.81 64.89 72.64 70.92 54.48
6.65 12.62 6.26 10.88 18.85 15.96 10.16 11.61 16.04 11.62 10.97 18.6
18.31 11.34 9.04 9.26 10.41 12.17 8.21 20.46 11.73 11.97 15.06 13.61
0.84 0.73 0.61 0.74 1.11 0.81 0.64 0.64 0.59 1.01 1.02 0.99
0.82 0.46 0.34 0.4 0.51 0.6 0.5 0.56 0.61 0.69 0.53 0.96
1.65 2.87 3.22 2.34 4.07 3.04 2.14 2.13 4.89 3.47 4.19 4.47
0.29 0.58 0.34 0.73 1.21 0.64 0.44 0.58 0.86 0.66 0.65 0.68
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.03 0.04 0.02 0.0 0.07 0.0
0.19 0.16 0.24 0.22 0.21 0.09 0.13 0.14 0.07 0.15 0.31 0.2
1.37 1.58 1.47 2.26 1.02 1.77 2.55 1.87 1.85 2.3 2.6 2.05
0.6 0.97 0.27 1.32 3.19 1.7 1.34 0.64 1.67 0.57 1.47 1.13
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02
51338.27 57640.1 53301.31 51944.35 53669.48 52342.67 63655.15 57436.71 52801.21 50638.25 53171.42 51246.35
0.09 0.03 0.0 0.05 0.06 0.0 0.05 0.04 0.02 0.04 0.04 0.04
0.16 0.25 0.12 0.25 0.31 0.1 0.18 0.22 0.16 0.06 0.22 0.11
1.36 1.42 1.21 1.91 1.34 1.37 2.17 1.55 1.78 1.72 1.67 1.47
0.0 0.1 0.0 0.17 0.38 0.11 0.2 0.36 0.1 0.12 0.21 0.0
7.39 6.55 10.97 6.29 8.52 5.22 8.61 7.24 7.93 8.71 8.64 7.41
0.77 0.48 0.63 0.84 1.01 0.73 0.87 0.46 1.14 0.93 0.71 0.67
0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02
0.51 1.48 1.26 0.8 1.35 1.3 1.18 0.96 2.58 1.67 1.51 1.4
2.81 1.78 1.17 2.59 3.41 2.42 2.16 2.75 1.08 2.73 2.6 1.88
0.16 0.27 0.39 0.1 0.5 0.3 0.15 0.02 0.36 0.25 0.03 0.11
158.81 173.46 165.26 157.25 193.99 160.75 144.29 177.67 168.63 196.38 196.02 122.75
0.34 0.55 0.8 0.49 0.81 0.67 0.68 0.45 1.08 1.29 1.16 0.85
1.35 0.96 1.71 1.29 1.18 1.22 1.69 1.24 1.49 0.89 1.94 2.23
0.76 0.77 1.47 0.74 0.79 0.8 0.99 0.79 0.86 0.91 0.96 1.01
4.46 3.46 3.9 3.96 3.64 3.18 2.09 4.61 2.16 2.71 3.54 2.58
0.48 0.33 0.19 0.29 0.38 0.44 0.39 0.42 0.35 0.49 0.49 0.73
0.97 2.25 3.61 1.88 1.97 1.5 1.53 2.25 1.43 2.9 2.77 1.35
0.0 0.02 0.02 0.02 0.12 0.12 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05
0.1 0.04 0.15 0.12 0.21 0.02 0.09 0.06 0.16 0.09 0.27 0.31
20.04 26.72 24.66 19.67 29.25 24.88 22.6 21.43 29.67 32.28 31.85 29.79
5.12 11.47 7.52 6.16 10.87 11.72 6.75 5.15 8.89 12.9 10.94 7.21
50.44 79.98 56.51 47.78 85.16 60.16 46.43 61.53 47.08 92.99 74.12 46.21
0.0 0.07 0.14 0.04 0.11 0.04 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0
0.18 0.03 0.1 0.11 0.21 0.22 0.21 0.1 0.09 0.11 0.21 0.18
6.95 7.51 8.05 6.03 10.7 7.87 8.65 6.31 9.6 9.81 11.67 10.51
3.28 2.61 2.72 2.98 2.79 2.63 2.54 2.19 4.36 3.52 4.39 4.95
12.24 16.75 14.52 14.68 11.8 14.83 13.4 14.35 13.97 13.94 12.55 14.02
1.49 1.26 1.22 1.66 1.34 1.41 1.28 1.44 2.31 2.0 2.11 3.48
0.19 0.17 0.17 0.21 0.1 0.15 0.11 0.09 0.29 0.15 0.21 0.18
0.29 0.7 0.61 0.31 0.58 0.35 0.52 0.54 0.45 0.6 1.12 1.1
0.4 0.74 0.29 0.7 1.02 0.38 0.42 0.52 0.37 0.54 0.73 0.85
2.04 1.21 1.26 1.18 1.54 1.69 1.3 1.25 1.3 1.34 1.49 1.44
0.1 0.15 0.19 0.2 0.29 0.04 0.25 0.04 0.16 0.13 0.16 0.27
0.0 0.02 0.02 0.04 0.03 0.02 0.05 0.02 0.01 0.03 0.06 0.04
2.96 6.34 5.31 4.07 8.35 5.47 5.6 3.74 5.54 7.08 6.62 4.17
0.41 0.68 0.8 0.49 0.96 0.48 0.7 0.36 0.68 0.49 0.41 0.86
1.88 1.96 3.25 3.09 2.1 1.02 3.98 2.98 1.6 1.71 3.01 1.52
1.29 0.91 0.6 0.77 0.91 1.11 0.74 1.02 1.39 1.34 1.66 1.91
0.0 0.33 0.16 0.21 0.3 0.0 0.41 0.46 0.36 1.44 0.98 0.14
0.92 0.99 1.17 1.33 1.57 0.48 1.58 1.52 0.85 0.84 1.36 0.82
0.07 1.22 0.33 0.24 1.82 0.52 0.47 0.2 0.51 1.82 0.64 1.47
1.29 2.9 1.55 1.53 1.73 2.5 2.24 2.24 1.51 2.4 2.77 2.9
0.27 0.36 0.26 0.52 0.36 0.44 0.59 0.43 0.28 0.36 0.66 0.49
0.31 0.35 0.51 0.59 0.8 0.64 0.75 0.37 0.33 0.5 0.85 0.16
0.45 0.39 2.3 1.63 1.75 0.85 1.24 1.97 0.99 1.59 1.41 0.95
0.04 0.05 0.14 0.06 0.04 0.06 0.05 0.04 0.06 0.09 0.11 0.02
0.06 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.05 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02
1.41 2.12 1.51 2.25 3.61 0.89 2.27 1.97 1.83 2.35 2.01 2.66
0.27 0.72 0.63 0.4 0.74 1.18 0.58 0.63 0.19 0.52 0.3 0.79

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)