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Heatmap: Cluster_51 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.07 -1.34 -0.09 -0.52 -0.18 -0.95 0.65 -1.28 0.45 -0.86 0.58 1.09
0.19 -0.32 0.19 -0.02 -0.5 -0.28 -0.03 -0.45 0.59 -0.34 -0.38 0.7
- - 0.08 0.46 0.37 - 0.41 - 1.47 - 0.83 1.27
-0.11 -0.47 -0.22 -0.17 -0.14 -0.19 0.09 -0.32 0.48 -0.19 0.47 0.38
-0.02 0.09 -0.01 -0.39 -0.04 -0.35 -0.21 0.27 0.15 -0.02 0.1 0.26
-0.44 -0.56 0.22 -0.1 -0.28 0.15 0.25 -0.75 -0.45 0.04 0.55 0.63
0.03 -0.38 0.22 -0.04 -0.48 0.0 0.11 -0.64 0.2 0.1 0.04 0.47
-0.09 -0.2 0.14 -0.01 0.03 -0.03 -0.03 0.03 -0.05 -0.09 0.01 0.26
-0.22 -0.18 -0.14 -0.14 -0.31 0.2 0.15 -0.12 0.08 -0.06 0.17 0.41
-0.61 -0.94 -0.45 0.64 0.3 0.7 -0.41 0.33 -0.65 -0.19 0.33 -0.15
-0.49 -0.56 -0.44 0.93 0.13 -0.35 -0.71 0.28 -0.17 -0.29 0.3 0.4
0.2 -1.34 -0.24 -0.12 -0.17 0.21 -0.14 -1.55 0.45 -0.4 0.68 0.73
0.08 -0.32 0.14 -0.19 -0.01 0.11 0.15 -0.31 0.08 -0.12 -0.04 0.29
0.06 -1.28 -0.27 -0.55 -0.01 -0.55 0.54 -1.04 0.32 -0.74 0.77 0.9
0.14 -1.59 -0.2 -0.25 -0.2 -0.62 0.57 -1.08 0.56 -0.76 0.74 0.71
0.08 -0.29 -0.14 -0.08 -0.02 0.03 0.1 -0.04 0.15 -0.22 -0.06 0.37
0.51 -0.93 0.22 -0.61 -1.01 0.4 0.29 0.56 -0.07 -0.71 -0.52 0.55
0.02 -0.29 0.09 0.05 -0.18 -0.25 -0.04 0.18 0.24 -0.95 -0.01 0.62
0.07 -0.15 0.02 0.02 -0.21 -0.06 0.18 -0.03 -0.06 -0.08 0.01 0.23
0.12 -0.41 -0.04 -0.17 -0.21 0.05 -0.1 0.18 0.08 0.05 0.07 0.26
0.1 -0.24 0.02 -0.01 -0.13 -0.03 0.15 0.03 -0.03 -0.11 -0.01 0.2
-0.03 -1.32 -0.6 0.21 -0.11 -0.29 -0.0 -1.28 0.55 -0.2 0.76 0.7
-0.06 -1.21 -0.49 0.28 -0.03 -0.41 -0.13 -1.35 0.43 -0.1 0.99 0.48
0.05 -0.75 0.24 -0.13 0.05 -0.5 0.05 -0.74 0.2 -0.33 0.42 0.69
0.06 -0.32 0.22 -0.12 -0.07 -0.23 0.13 -0.11 0.1 0.03 0.15 0.06
1.5 -0.54 0.31 0.67 - - - 0.94 1.11 - - 0.67
0.13 -0.69 0.11 -0.81 -0.14 0.17 0.44 -0.98 0.03 0.03 0.48 0.38
-0.01 -0.75 -0.26 0.33 0.01 -0.02 -0.05 -0.82 0.37 -1.19 0.83 0.36
0.09 -0.28 0.17 -0.12 -0.09 -0.04 0.13 -0.07 -0.03 -0.17 0.08 0.25
0.13 -0.11 0.0 -0.01 -0.12 -0.02 -0.02 -0.09 0.07 -0.04 -0.27 0.38
-0.04 -0.15 -0.07 0.01 -0.04 -0.08 0.1 -0.13 -0.1 0.02 -0.03 0.41
0.14 -0.39 -0.06 0.13 0.1 -0.24 0.22 -0.12 0.08 -0.16 -0.07 0.23
-0.1 -0.56 -0.15 0.06 -0.62 -0.58 0.31 -0.79 0.1 -0.08 0.19 1.11
0.01 -1.82 0.25 -0.33 0.22 -0.98 0.55 -1.33 0.2 -1.07 0.62 1.02
0.06 0.02 -0.27 -0.12 -0.01 0.14 0.02 0.14 0.13 -0.12 -0.16 0.09
-0.18 -0.68 -0.21 0.38 0.48 -0.38 -0.13 0.79 -0.07 -0.83 -0.16 0.14
0.53 -0.15 -0.14 -0.43 -0.09 -0.08 -0.1 -0.01 0.37 -0.55 -0.19 0.43
0.04 -0.34 0.18 -0.26 -0.12 -0.26 0.19 -0.17 0.21 -0.18 0.26 0.27
0.11 0.01 0.06 -0.16 -0.35 -0.23 -0.08 -0.37 0.05 0.01 0.26 0.46
-0.03 -0.54 -0.09 -0.07 0.02 -0.13 0.19 -0.17 0.37 -0.24 0.19 0.27
-0.08 -0.2 -0.06 0.01 -0.05 0.12 0.05 -0.09 0.03 -0.1 0.05 0.26
-0.11 -0.55 -0.43 -0.28 -0.0 0.08 0.43 -0.38 0.17 -0.58 0.53 0.5
0.09 -1.54 -0.2 -0.16 -0.02 -0.49 0.5 -0.9 0.25 -0.63 0.6 0.87
0.34 -0.18 0.19 -0.13 -0.3 0.03 0.37 -1.0 -0.03 -0.97 0.18 0.64
-0.12 -0.48 0.14 0.02 -0.2 0.0 0.11 -0.05 -0.12 0.02 0.14 0.37
-0.5 -0.67 -0.28 -0.18 0.12 -0.07 0.01 -0.17 0.36 -0.12 0.6 0.38
-0.17 -0.94 -0.41 0.09 -0.32 -0.47 0.59 0.51 0.2 -0.36 -0.13 0.56
0.04 -0.74 0.24 -0.08 -0.14 -0.15 0.23 -0.23 0.18 -0.04 0.23 0.17
0.0 -0.36 -0.08 -0.04 -0.28 0.04 0.04 0.17 0.03 -0.04 0.08 0.31
0.15 -0.33 0.1 -0.37 -0.51 0.11 -0.13 -0.71 0.14 -0.05 0.45 0.61
0.24 -0.52 -0.07 -0.3 -0.04 -0.62 0.14 -1.41 0.43 -0.34 0.47 0.79
0.19 -0.79 -0.15 -0.29 -0.1 -0.17 -0.24 -1.73 0.42 -0.37 0.9 0.68
0.06 -0.99 -0.63 -0.08 -0.65 -1.08 0.5 -0.43 0.38 -1.24 0.95 0.95
-0.26 -0.75 0.34 -0.89 0.14 0.24 -0.47 -0.37 0.26 -0.62 0.45 0.83
0.38 0.02 -0.33 -1.29 -0.16 0.14 0.26 -0.4 0.43 -0.19 0.02 0.37
0.2 0.35 -0.05 -0.75 -0.07 -0.16 -0.12 0.05 0.21 -0.04 -0.27 0.34
0.04 -0.96 0.35 -0.15 -0.25 -0.0 0.13 0.17 -0.01 -0.18 -0.01 0.43
-0.04 -0.86 -0.03 -0.44 0.19 0.02 0.75 -1.41 0.32 -3.84 0.36 0.96
-0.01 -1.33 -0.69 0.13 -0.24 -0.32 -0.06 -1.09 0.56 0.02 0.85 0.62
-0.02 0.15 0.07 -0.48 -0.19 -0.26 0.11 0.44 0.07 -0.51 0.23 0.08
0.16 -0.46 0.01 -0.06 0.07 -0.31 0.17 -0.07 0.14 -0.12 0.22 0.11
0.1 -0.15 0.13 -0.03 0.03 -0.05 -0.21 0.15 0.12 -0.31 -0.24 0.33
-1.77 -0.57 -0.02 0.43 0.26 -0.49 0.6 0.71 0.26 -1.37 - 1.04
0.02 0.36 0.02 -0.66 -0.24 0.0 0.22 0.66 0.05 -0.61 -0.24 -0.09
0.04 -1.17 -0.29 -0.16 -0.01 -0.69 -0.24 -1.24 0.6 0.02 0.98 0.52
0.17 -1.13 -0.0 -0.46 -0.36 -0.56 0.43 -1.35 0.5 -0.87 0.59 1.02
-0.34 -0.54 -0.64 -0.27 -0.04 -0.34 0.42 -0.7 0.35 -0.71 0.68 0.88
-0.07 -0.16 0.06 0.14 -0.11 -0.33 0.03 -0.13 0.13 -0.01 0.04 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.