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Heatmap: Cluster_270 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.04 -0.36 -0.64 -0.19 0.47 -0.29 -0.17 -0.25 0.36 0.2 0.33 0.15
0.12 -0.25 -0.68 -1.19 -1.99 - 1.32 -0.8 0.54 0.37 0.17 0.86
-0.16 -0.36 -0.25 0.08 0.37 0.19 0.2 -0.01 -0.32 0.25 -0.2 -0.01
0.16 -0.48 -0.3 -0.49 -0.21 0.26 0.26 0.49 -0.2 0.2 -0.58 0.35
-0.2 -0.22 0.08 0.01 0.04 0.11 0.08 0.18 -0.1 0.11 0.02 -0.16
0.83 -2.86 -1.3 -0.19 -0.29 0.87 0.07 -0.98 -0.04 0.36 -0.43 0.68
-0.04 -0.07 0.07 -0.14 0.11 -0.01 0.25 0.04 -0.21 0.08 -0.37 0.18
-0.76 -0.08 -0.29 0.15 0.09 -0.24 0.6 -0.62 -0.38 0.19 0.26 0.44
0.61 -1.25 -1.2 -0.61 -0.58 0.73 0.42 -0.56 0.28 0.06 0.23 0.26
-0.1 0.13 -0.3 0.04 0.16 -0.03 0.41 -0.1 -0.05 -0.13 -0.13 -0.04
-0.14 -0.18 -0.09 0.15 0.02 -0.03 0.03 -0.02 -0.0 0.14 -0.05 0.13
-0.04 -0.24 -0.0 -0.07 0.06 -0.08 -0.0 0.07 -0.09 0.09 0.03 0.22
-0.03 0.04 0.02 0.07 0.03 0.17 -0.09 -0.13 -0.13 -0.1 0.22 -0.12
0.0 -0.18 -0.18 0.09 0.09 0.1 0.13 -0.08 -0.15 0.09 0.08 -0.05
-0.1 -0.7 -0.29 -0.64 -0.38 -0.23 0.61 0.14 0.48 -0.5 0.34 0.47
0.26 -2.01 -0.9 0.67 -1.07 0.58 1.37 -1.86 -1.08 1.07 -1.16 -0.82
-0.03 -0.08 -0.24 0.22 0.04 0.03 -0.07 0.18 0.02 -0.11 -0.0 -0.01
-0.02 -0.82 0.16 -0.82 0.07 0.89 -0.57 -0.25 0.83 -2.27 0.13 0.33
-0.04 -0.35 -1.14 -0.28 0.46 -0.87 -1.11 0.07 -1.03 0.4 1.51 -0.19
0.15 -0.14 -0.14 -0.02 0.09 0.03 0.13 -0.13 -0.08 0.08 0.06 -0.06
-0.13 -0.23 -0.17 -0.07 0.21 0.08 0.07 0.07 -0.06 0.29 -0.0 -0.14
-0.17 -0.53 -0.16 -0.22 -0.24 0.14 0.27 0.08 0.15 -0.03 0.14 0.35
0.39 -0.17 -0.55 -0.39 0.09 0.46 0.19 -0.33 -0.32 0.04 0.21 0.0
1.1 -0.83 -1.72 0.48 -0.89 0.47 -0.57 - -0.8 0.1 1.12 0.24
0.23 -0.2 -0.59 -0.32 0.32 -0.15 0.24 -0.03 -0.28 0.07 -0.02 0.4
0.67 -0.55 0.14 -0.61 -0.27 -0.88 0.68 -1.32 -0.03 0.48 -0.13 0.39
0.81 -0.66 -1.51 -1.19 -0.72 0.22 0.52 -0.98 -0.66 0.22 1.21 0.0
-0.47 -0.14 -0.45 -1.17 -0.54 -0.53 0.79 0.31 -0.09 0.07 0.58 0.44
-0.7 -0.86 0.12 -0.2 0.3 -0.15 -0.16 0.04 0.35 0.59 0.19 -0.15
-0.16 -0.24 0.0 0.07 -0.08 0.01 -0.07 0.04 -0.11 0.17 -0.01 0.3
0.12 -0.77 -0.29 0.1 -0.19 0.27 -0.62 -0.98 -0.76 0.04 1.06 0.58
0.36 -0.27 -0.36 -0.22 0.23 0.29 -0.09 0.06 0.06 -0.09 0.15 -0.38
0.16 -0.01 0.1 -0.1 0.02 -0.18 0.06 0.01 -0.33 -0.04 0.21 0.02
0.11 -0.2 -0.12 -0.04 -0.18 0.14 -0.09 -0.14 -0.01 0.13 0.14 0.19
0.22 0.09 -0.32 0.11 0.08 0.29 -0.12 -0.35 -0.01 0.12 -0.2 -0.07
-0.61 -0.28 0.42 0.24 0.33 0.33 0.29 -0.05 -0.78 -0.03 -0.05 -0.36
1.6 - - - 2.13 - - - - - 2.2 -
0.06 -0.52 0.48 -0.03 -0.56 -0.02 0.65 0.33 -0.4 -0.34 0.1 -0.39
0.12 0.13 0.04 -0.38 0.08 -0.26 0.18 -0.14 0.17 -0.65 0.36 0.07
-0.17 -0.32 -0.04 -0.39 -0.39 -0.09 0.35 0.08 -0.02 0.19 0.07 0.45
0.16 0.02 0.19 -0.38 -0.09 0.43 -0.3 -0.06 -0.3 0.18 0.26 -0.39
0.27 0.46 -1.09 -0.97 -0.54 0.62 0.13 -1.03 -2.14 0.64 1.03 -0.34
0.41 0.71 -1.08 -0.14 -0.35 0.81 -0.62 -0.26 -0.36 -0.36 -0.6 0.49
0.3 -0.59 0.05 -1.5 -1.7 0.94 1.17 -0.61 -0.05 - 0.53 0.23
-0.43 -0.39 -0.3 0.24 0.02 -0.44 -0.22 -0.07 -0.11 0.69 0.11 0.41
-0.06 0.62 0.52 -0.15 -1.68 -0.08 -0.44 -0.38 -0.01 -0.13 0.81 -0.4
-0.02 -0.96 0.17 -0.82 -0.61 0.3 0.48 -0.8 - 0.97 0.89 0.17
0.1 -0.24 -0.19 0.01 0.06 -0.02 -0.09 -0.02 -0.11 0.18 0.16 0.1
-0.43 0.3 -0.38 0.26 -0.07 -1.33 -0.04 0.67 -0.1 0.26 -0.53 0.41
0.86 1.11 - - 1.39 - 1.42 - - - 1.45 -
-0.05 0.06 0.03 0.01 0.09 0.1 0.02 -0.0 -0.27 0.1 -0.21 0.06
-0.37 0.02 -0.02 0.16 0.01 -0.23 -0.1 0.11 -0.03 0.2 0.25 -0.11
-0.1 -0.17 0.13 0.47 0.26 0.1 0.02 -0.39 -0.36 -0.15 0.07 -0.11
-0.14 -0.54 0.03 -0.03 -0.14 0.03 0.22 -0.05 0.27 0.23 0.02 -0.07
- -0.03 - 1.66 - - - 1.43 0.77 - 0.55 0.99
-0.75 0.15 0.04 0.11 0.57 -0.11 0.41 -0.35 0.21 0.21 -0.11 -1.22
-0.09 0.15 0.13 -0.45 -0.1 0.18 0.7 -1.74 -0.63 0.26 -0.33 0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.