Heatmap: Cluster_108 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	13 h after light	15 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark
MA_10363858g0010	-0.13	-0.04	-0.08	0.13	0.05	-0.05	-0.08	-0.02	0.13	-0.02	0.08	0.02
MA_10425815g0010	-0.25	0.05	-0.02	0.15	-0.14	-0.07	-0.11	-0.13	0.27	-0.09	0.12	0.13
MA_10426143g0010	-0.02	-0.13	-0.03	0.12	-0.08	-0.06	-0.14	-0.24	0.24	0.03	0.17	0.06
MA_10426840g0010	-0.26	0.07	0.06	0.01	-0.09	-0.18	-0.21	0.06	0.34	0.13	0.02	-0.04
MA_10426938g0010	-0.07	-0.06	0.07	0.07	-0.06	-0.06	0.02	-0.09	0.08	-0.04	-0.02	0.14
MA_10427006g0010	-0.12	0.1	-0.03	-0.03	-0.19	-0.25	-0.01	0.11	0.27	0.0	0.06	0.01
MA_10427218g0010	-0.32	0.07	-0.14	0.1	-0.04	-0.13	-0.01	0.14	0.15	-0.1	0.19	0.0
MA_10427530g0010	-0.1	-0.18	-0.35	-0.18	-0.12	-0.11	0.27	0.06	0.35	0.07	0.21	-0.08
MA_10427774g0040	-0.3	-0.01	0.11	0.13	-0.15	-0.05	-0.06	-0.04	0.4	-0.03	-0.06	-0.04
MA_10428546g0010	-0.06	-0.1	0.01	0.11	-0.05	0.03	-0.09	-0.09	0.2	0.06	-0.06	0.01
MA_10428918g0010	-0.06	-0.05	0.03	0.04	-0.04	-0.03	-0.1	0.11	0.11	0.03	-0.07	0.01
MA_10429211g0010	-0.06	-0.12	0.03	0.0	0.04	-0.09	-0.14	-0.16	0.24	0.01	0.09	0.11
MA_10429932g0010	-0.09	0.05	0.08	-0.04	-0.07	-0.15	0.04	-0.19	0.16	-0.07	0.1	0.13
MA_10430361g0020	-0.06	-0.07	0.05	0.02	-0.09	-0.12	-0.02	-0.03	0.2	-0.01	0.06	0.03
MA_10430431g0030	-0.29	-0.0	0.1	-0.05	0.03	0.02	-0.28	0.05	0.47	0.11	-0.61	0.18
MA_10430996g0010	-0.13	-0.03	-0.08	0.22	0.01	-0.04	-0.1	-0.14	0.11	0.13	0.03	-0.02
MA_10432378g0010	-0.09	-0.13	0.01	0.08	-0.24	-0.19	-0.08	0.12	0.49	-0.05	-0.0	-0.07
MA_10432717g0010	-0.08	0.02	0.06	0.11	-0.1	-0.13	-0.01	-0.03	0.19	-0.14	-0.0	0.08
MA_10433801g0010	-0.24	-0.09	-0.02	0.17	-0.11	-0.06	-0.13	-0.05	0.42	-0.03	0.09	-0.08
MA_10434081g0010	-0.05	-0.19	-0.04	-0.07	-0.13	-0.03	0.17	-0.06	0.26	-0.06	-0.06	0.18
MA_10434126g0020	-0.13	-0.19	0.11	-0.01	-0.08	-0.06	0.07	-0.07	0.1	0.04	0.03	0.14
MA_10434816g0010	-0.2	-0.24	0.07	0.18	-0.08	0.01	-0.29	0.08	0.15	-0.36	0.26	0.25
MA_10435120g0010	-0.08	-0.01	0.04	-0.04	-0.11	-0.13	-0.04	-0.05	0.22	0.05	0.05	0.07
MA_10435414g0010	-0.1	-0.22	-0.02	0.08	-0.03	-0.04	-0.0	-0.05	0.2	0.01	0.04	0.1
MA_10435856g0010	-0.09	-0.09	-0.06	0.09	-0.0	0.02	0.07	-0.07	0.12	-0.02	-0.03	0.03
MA_10435875g0010	-0.09	0.02	-0.01	0.13	-0.02	-0.03	-0.11	-0.05	0.21	-0.05	0.05	-0.07
MA_10436199g0010	-0.06	0.13	0.07	0.15	-0.08	0.03	-0.12	-0.11	0.18	-0.1	-0.07	-0.06
MA_10436427g0010	-0.04	-0.0	-0.01	0.08	-0.02	-0.16	-0.15	-0.12	0.27	-0.11	0.09	0.12
MA_10436637g0010	-0.09	0.03	0.01	-0.06	-0.12	-0.08	-0.07	-0.09	0.37	0.06	0.03	-0.05
MA_10437099g0030	0.03	-0.11	0.11	0.12	-0.15	0.0	-0.24	-0.4	0.49	-0.36	0.23	0.03
MA_10437183g0010	0.02	-0.1	0.13	0.07	-0.17	-0.05	-0.05	-0.11	0.15	-0.07	-0.05	0.18
MA_10437264g0010	-0.04	-0.06	-0.06	-0.05	0.09	-0.04	0.06	-0.03	0.13	-0.04	-0.05	0.07
MA_111413g0010	-0.15	-0.01	-0.04	-0.29	-0.39	-0.3	0.25	0.1	0.14	0.07	0.18	0.25
MA_118377g0010	-0.06	-0.04	0.02	0.07	-0.1	0.03	-0.08	-0.07	0.17	-0.05	0.01	0.06
MA_120420g0010	-0.1	0.02	-0.04	-0.08	-0.16	0.01	0.14	0.04	0.2	-0.16	-0.05	0.13
MA_12709g0010	-0.02	-0.03	-0.04	0.17	0.05	-0.13	-0.07	-0.04	0.14	0.0	-0.03	-0.04
MA_1605g0010	-0.12	-0.25	0.08	0.16	-0.05	-0.01	-0.13	-0.25	0.31	0.03	0.12	0.01
MA_168127g0010	0.03	0.02	0.06	0.1	-0.26	-0.03	-0.03	-0.18	0.24	-0.13	-0.04	0.13
MA_16845g0010	0.03	-0.12	-0.02	-0.15	-0.54	-0.37	0.06	-0.16	0.3	-0.06	0.18	0.54
MA_17760g0010	-0.08	-0.2	-0.06	0.13	0.05	-0.1	-0.0	-0.08	0.14	0.05	-0.02	0.14
MA_19164g0010	-0.33	-0.25	-0.09	0.05	-0.11	-0.23	-0.17	-0.12	0.76	-0.16	0.26	0.02
MA_192667g0010	-0.25	-0.62	-0.24	-0.17	-0.04	0.07	0.28	-0.08	0.21	0.06	0.24	0.28
MA_193509g0010	-0.1	-0.15	-0.11	0.01	-0.11	-0.02	-0.04	0.03	0.11	0.11	0.05	0.18
MA_22632g0010	-0.23	-0.03	-0.07	0.21	-0.22	-0.15	-0.12	0.04	0.33	-0.17	0.24	0.04
MA_2296g0010	-0.1	0.01	-0.1	0.23	-0.26	-0.04	-0.15	-0.12	0.18	-0.06	0.07	0.25
MA_262988g0010	-0.06	-0.17	0.08	0.19	0.0	-0.09	-0.05	0.02	0.15	-0.15	-0.19	0.2
MA_32006g0010	-0.08	-0.04	0.04	0.1	0.01	-0.05	-0.13	-0.01	0.11	-0.08	-0.0	0.11
MA_40012g0010	0.13	-0.22	-0.04	0.12	-0.13	-0.17	-0.06	-0.15	0.33	-0.01	0.07	0.03
MA_41124g0010	-0.2	-0.01	-0.02	0.08	-0.13	-0.01	-0.19	-0.1	0.36	-0.0	0.11	0.02
MA_41847g0010	-0.13	-0.23	-0.12	0.01	-0.06	-0.02	0.01	0.14	0.22	0.01	0.08	0.05
MA_42352g0020	-0.04	0.05	0.02	0.13	0.08	-0.08	-0.1	-0.23	0.14	-0.09	0.08	-0.01
MA_4821g0010	-0.13	0.02	-0.03	0.14	-0.18	-0.02	0.01	-0.21	0.32	0.03	0.02	-0.04
MA_50635g0010	-0.16	-0.12	0.1	0.17	-0.11	0.0	-0.03	-0.02	0.13	-0.06	0.0	0.05
MA_51358g0010	-0.03	-0.07	-0.06	0.09	-0.16	-0.06	-0.16	-0.03	0.36	-0.03	0.11	-0.03
MA_57200g0010	0.14	-0.04	0.05	-0.12	-0.1	-0.21	0.09	-0.14	0.21	-0.23	0.08	0.18
MA_62342g0010	-0.06	0.03	0.04	0.04	0.02	-0.09	-0.11	-0.07	0.16	0.0	0.07	-0.04
MA_8320839g0010	0.03	-0.01	-0.08	0.08	-0.01	-0.32	0.18	-0.3	0.53	-0.4	-0.02	0.07
MA_8911g0010	-0.15	0.01	-0.05	0.11	-0.03	0.05	-0.06	0.06	0.12	-0.17	0.12	-0.03
MA_892865g0010	-0.13	-0.01	-0.14	0.16	-0.08	-0.04	0.31	0.1	0.33	-0.4	-0.15	-0.12
MA_932683g0010	0.03	-0.12	-0.06	0.05	-0.0	-0.24	-0.18	-0.15	0.34	0.1	0.14	0.0
MA_961480g0010	-0.04	-0.12	0.01	0.05	0.05	0.01	0.0	-0.05	0.15	-0.07	-0.1	0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.