Heatmap: Cluster_170 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.54 -0.5 0.06 0.25 0.13 -0.25 0.09 -0.1 0.15 -0.01 0.35 0.09
-0.19 -0.53 -0.02 0.04 0.07 -0.27 0.3 -0.11 0.22 0.04 0.01 0.23
-0.16 -0.23 0.0 0.03 -0.25 0.02 0.21 -0.21 0.27 0.06 -0.13 0.26
-0.29 -0.39 -0.32 -0.21 -0.22 0.27 0.34 -0.06 0.17 0.05 -0.13 0.47
-0.03 -0.99 -0.11 -0.02 -0.03 -0.16 -0.05 -0.33 0.31 0.26 0.17 0.49
-0.05 -1.06 -0.21 -0.11 -0.32 0.05 0.39 -0.53 0.46 -0.04 0.19 0.52
-0.01 -0.48 0.12 0.19 -0.01 -0.11 0.15 -0.23 0.12 0.01 -0.01 0.13
0.03 -0.29 -0.09 0.13 -0.26 0.09 0.06 -0.01 0.13 0.01 0.01 0.12
0.05 -0.19 0.06 -0.14 -0.23 -0.07 0.08 -0.32 0.12 0.15 -0.02 0.37
-0.25 -0.46 -0.08 0.15 0.18 0.27 0.31 -0.16 0.01 -0.02 -0.41 0.22
-0.32 -0.01 0.05 -0.19 -0.3 -0.22 0.18 -0.13 0.34 0.0 0.27 0.14
-0.04 -0.29 -0.11 -0.04 -0.12 0.24 -0.01 -0.13 0.19 -0.03 0.06 0.17
-0.24 -0.5 -0.04 0.05 -0.18 0.05 0.28 -0.04 0.24 -0.06 0.0 0.26
-0.34 -0.45 -0.31 0.09 0.05 0.04 0.21 -0.13 0.39 0.22 -0.04 0.04
-0.39 -0.27 0.02 0.04 -0.01 0.05 0.21 0.11 0.28 -0.05 -0.14 0.04
-0.16 -0.22 -0.17 -0.12 -0.22 -0.04 0.33 -0.01 0.07 0.05 -0.08 0.41
-0.53 -0.64 -0.01 0.07 0.07 -0.13 0.37 0.03 0.34 0.03 -0.07 0.14
-0.19 -1.42 -0.43 -0.12 -0.28 0.21 0.5 -0.26 0.28 -0.59 0.46 0.67
-0.33 -0.53 -0.06 -0.02 -0.1 -0.1 0.28 0.02 0.32 0.25 -0.01 0.06
-0.15 0.05 -0.18 0.0 -0.13 0.12 0.07 -0.0 0.03 0.1 -0.03 0.09
-0.28 -0.38 0.09 0.08 0.03 0.03 0.17 -0.05 0.19 -0.24 0.06 0.18
-0.15 -0.29 0.05 0.25 -0.09 -0.04 -0.07 -0.25 0.29 0.04 -0.04 0.17
-0.27 -0.46 -0.02 0.13 -0.01 0.07 0.18 -0.09 0.16 -0.0 0.01 0.18
0.02 -0.03 -0.03 0.01 -0.15 -0.11 0.12 -0.06 0.1 -0.14 0.1 0.14
-0.44 -0.65 -1.19 -0.31 -0.35 -0.09 -0.28 -0.02 0.22 0.65 0.15 0.99
0.03 -0.06 -0.0 0.23 -0.4 0.01 0.08 -0.07 0.04 -0.04 -0.04 0.14
-0.52 -0.86 -0.7 0.22 -0.03 -0.14 0.2 -1.9 0.4 -0.03 0.44 1.01
-0.35 -0.67 -0.02 0.07 0.17 0.21 0.32 -0.33 0.33 -0.08 -0.17 0.2
-0.13 -0.53 0.16 0.16 0.01 -0.21 0.15 -0.25 0.21 -0.04 0.05 0.22
-0.49 -0.76 0.09 0.01 0.11 0.07 0.32 0.0 0.27 0.01 -0.02 0.08
-0.25 -0.55 0.03 0.06 -0.06 0.06 0.26 -0.25 0.18 -0.06 0.1 0.26
-0.27 0.02 -0.0 0.02 -0.19 0.12 0.1 -0.09 0.23 -0.1 0.02 0.05
-0.47 -0.57 -0.04 0.15 0.07 0.18 0.22 0.02 0.41 -0.12 0.12 -0.27
-0.05 -1.06 -0.01 -0.22 -0.05 -0.07 0.49 -0.33 0.3 0.15 0.04 0.28
-0.19 -0.35 -0.08 0.11 -0.23 0.19 0.15 -0.08 0.27 -0.09 -0.19 0.3
-0.04 -0.2 0.03 0.14 -0.01 0.01 0.15 -0.02 0.03 -0.12 -0.13 0.11
-0.15 -0.27 0.31 0.18 -0.19 -0.09 0.11 -0.3 0.26 -0.15 -0.06 0.18
-0.13 -0.2 -0.13 0.07 -0.18 0.01 0.18 -0.02 0.21 -0.15 0.18 0.09
-0.17 -0.49 -0.04 0.16 -0.07 0.22 0.28 -0.17 0.27 -0.07 -0.02 -0.07
-0.04 -0.29 -0.38 -0.3 -0.29 0.05 -0.06 -0.02 0.22 0.28 0.0 0.53
-0.9 -1.02 -0.33 0.12 0.27 0.2 0.35 0.04 0.48 0.24 -0.1 -0.12
-0.11 -0.07 -0.02 -0.02 -0.04 0.01 0.14 -0.04 0.11 -0.07 0.02 0.07
-0.18 -0.49 0.18 0.1 -0.02 -0.04 0.24 0.1 0.16 -0.19 -0.05 0.04
-0.61 -1.06 0.13 0.35 0.26 -0.18 0.72 -0.54 0.43 0.03 -0.36 -0.11
-0.54 -0.52 -0.39 0.31 0.34 -0.02 0.44 -0.15 0.34 -0.15 0.12 -0.23
0.05 -0.51 0.08 0.1 -0.03 0.12 0.14 0.06 0.0 -0.19 -0.21 0.23
-0.16 -0.3 0.01 0.22 -0.03 -0.0 0.11 -0.16 0.12 -0.06 0.09 0.09
-0.27 -0.19 0.22 0.26 -0.07 -0.18 0.16 -0.32 0.31 -0.13 -0.15 0.17
-0.34 -0.64 0.06 0.26 0.09 -0.01 0.21 -0.03 0.19 -0.24 -0.02 0.21
-0.11 -0.26 -0.02 0.08 -0.02 -0.03 0.11 -0.05 0.15 -0.14 0.07 0.15
-0.23 -0.27 -0.06 0.02 -0.08 0.1 0.2 0.18 0.16 -0.13 -0.09 0.12
-0.34 -0.29 -0.07 0.14 0.08 -0.08 0.14 -0.0 0.41 -0.08 -0.08 0.02
-0.01 0.04 0.02 0.12 -0.23 0.13 -0.1 -0.18 0.1 0.0 0.0 0.06
-0.42 -0.4 0.25 0.19 0.08 -0.24 0.26 -0.29 0.1 -0.09 0.03 0.28
-0.06 -0.57 0.05 -0.14 -0.02 -0.09 0.18 -0.23 0.05 0.15 0.11 0.38
-0.22 -0.27 -0.03 0.2 0.08 -0.03 0.03 -0.1 0.06 0.06 0.01 0.13
-0.35 -0.25 -0.11 -0.01 0.01 0.25 0.24 -0.03 0.13 -0.01 0.03 0.0
-0.02 -0.32 -0.03 0.03 -0.22 -0.21 0.18 -0.02 0.19 0.22 -0.22 0.28
-0.86 -2.24 -1.26 -1.88 -1.21 -0.47 1.32 -0.89 0.67 0.29 0.49 1.1
-0.16 -0.26 0.12 0.1 -0.12 -0.11 0.07 -0.17 0.13 0.03 0.1 0.19
-0.19 -0.25 0.1 -0.23 -0.1 -0.14 0.28 -0.04 -0.02 0.13 0.12 0.21
-0.22 -0.68 0.18 0.03 -0.15 -0.21 0.33 -0.27 0.57 -0.22 -0.36 0.48
-0.31 -0.49 0.03 0.25 0.02 0.01 0.13 -0.08 0.33 -0.02 -0.01 -0.04
-0.1 -0.4 -0.07 0.02 -0.14 0.05 0.25 -0.29 0.16 0.12 -0.07 0.31
-0.33 -0.34 0.02 -0.04 0.09 -0.08 0.21 -0.08 0.15 0.04 0.02 0.21
-0.2 -0.6 -0.07 -0.08 -0.02 0.03 0.19 0.02 0.31 0.02 -0.07 0.27
-0.59 -0.75 -0.04 0.36 0.1 -0.0 0.17 -0.13 0.32 -0.02 0.15 0.03
-0.67 -0.78 0.06 0.34 0.32 -0.26 0.09 -0.11 0.31 -0.01 0.3 -0.09
-0.18 -0.16 -0.15 0.06 -0.15 0.01 0.14 0.01 0.15 0.07 -0.07 0.19
-0.71 -0.59 -0.19 0.23 0.21 0.05 0.52 0.08 0.53 -0.25 -0.44 -0.06
-0.38 -0.56 0.03 0.32 0.2 -0.31 0.49 -0.32 0.14 -0.27 -0.01 0.27
-0.14 -0.32 0.02 0.15 -0.05 -0.07 0.11 -0.21 0.22 0.01 0.03 0.14
-0.4 -0.33 0.16 0.21 -0.09 0.16 -0.14 -0.23 0.42 -0.14 -0.01 0.16
-0.34 -0.17 0.06 0.17 0.15 0.01 0.08 -0.04 0.06 -0.08 -0.01 0.04
-0.05 -0.86 -0.17 -0.11 -0.23 -0.23 0.22 -0.01 0.24 0.27 0.28 0.27
0.02 0.0 0.0 0.03 -0.08 -0.06 0.12 -0.02 -0.03 -0.11 0.01 0.11
-0.43 -0.59 0.07 0.19 0.19 0.07 0.21 -0.02 0.44 -0.05 -0.06 -0.34
-0.11 -0.26 -0.24 -0.16 -0.22 0.23 0.01 -0.01 0.02 0.15 0.01 0.41
-0.43 -0.74 0.34 -0.02 -0.72 0.61 0.26 -0.09 0.22 -1.13 -0.15 0.7
-0.32 -0.19 -0.06 0.03 0.01 -0.06 0.11 0.05 0.24 0.2 -0.1 -0.0
-0.14 -0.23 -0.34 -0.08 -0.12 0.24 0.17 -0.18 0.08 0.05 -0.05 0.41
-0.42 -0.52 0.1 0.15 0.08 0.05 0.26 -0.03 0.26 -0.11 -0.1 0.08
-0.15 -0.7 -0.17 0.0 0.09 0.05 0.43 -0.03 -0.07 0.06 -0.15 0.34
-0.36 -0.65 -0.2 0.01 -0.05 0.33 0.25 -0.03 0.17 -0.06 0.03 0.27
-0.28 -0.4 0.14 0.27 0.05 0.03 0.18 -0.21 0.04 -0.09 -0.07 0.18
-0.71 - -0.52 0.85 0.51 - 1.69 - 0.32 -0.05 0.13 -0.11
-0.27 -0.26 0.0 0.17 0.19 0.06 0.24 0.11 0.02 -0.2 -0.33 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.