Heatmap: Cluster_216 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.08 -0.54 -0.15 -0.05 0.09 -0.18 0.08 -0.14 0.33 0.13 0.13 0.2
-0.34 -0.17 -0.09 0.09 0.0 0.02 0.03 0.15 0.16 -0.03 0.24 -0.16
-0.13 -0.16 -0.04 -0.04 -0.08 -0.12 -0.0 0.04 0.21 0.09 0.17 0.02
-0.17 -0.02 -0.1 -0.05 0.01 -0.05 0.07 -0.02 0.14 0.08 0.27 -0.24
-1.96 -2.36 0.83 -0.4 -1.54 -0.44 -0.07 0.74 0.6 -1.73 1.45 -0.4
-0.88 -0.46 -0.29 0.37 0.37 -0.49 -0.07 0.13 0.59 0.25 -0.07 -0.13
-0.12 -0.29 -0.4 0.17 -0.06 0.32 -0.13 -0.28 0.23 0.1 0.12 0.15
-0.13 -0.06 -0.15 0.03 -0.04 -0.09 -0.14 -0.05 0.2 -0.02 0.33 0.04
-0.14 -0.02 -0.11 0.05 0.07 0.06 -0.09 -0.16 0.23 -0.0 0.12 -0.07
-0.17 -0.32 -0.05 -0.56 -0.12 0.1 -0.34 -0.12 0.4 -0.16 0.58 0.32
-0.01 -0.23 -0.08 -0.09 -0.15 -0.15 0.01 -0.03 0.23 0.17 0.27 -0.02
-0.25 -0.14 -0.08 -0.0 -0.01 -0.05 -0.07 0.0 0.28 0.19 0.22 -0.2
-0.12 -0.22 -0.1 -0.0 -0.11 -0.11 -0.0 -0.07 0.28 0.09 0.21 0.07
-0.26 -0.18 -0.16 0.12 0.06 -0.2 -0.08 -0.13 0.24 0.02 0.35 0.08
-0.2 -0.54 -0.39 -0.11 -0.56 -0.1 0.3 -0.08 0.66 -0.03 0.39 0.13
-0.42 0.18 -0.46 0.1 -0.15 -1.07 -0.09 -0.32 0.38 0.14 0.78 0.11
-0.1 -0.1 -0.11 -0.02 -0.13 -0.11 -0.01 -0.02 0.24 0.13 0.21 -0.03
-0.1 -0.09 -0.08 0.02 -0.06 -0.06 -0.15 -0.08 0.24 0.06 0.2 0.05
-0.89 -0.66 -0.45 -0.6 0.06 0.14 -0.86 0.06 0.41 0.16 1.2 -0.07
-0.41 -0.05 0.47 -0.47 0.1 -1.36 0.04 -1.01 0.5 0.19 0.39 0.41
-0.4 -0.24 -0.37 0.24 0.26 0.21 0.08 0.06 0.17 -0.22 0.18 -0.18
-0.08 0.07 -0.08 -0.04 0.04 -0.34 0.02 -0.14 0.14 0.04 0.19 0.1
-0.17 -0.25 -0.06 0.1 -0.23 0.19 -0.38 -0.07 0.33 0.13 0.2 0.03
-0.03 -0.47 -0.49 -0.06 0.11 0.16 -0.04 -0.11 0.08 0.25 0.08 0.31
-0.31 -0.12 -0.2 0.05 -0.09 -0.0 -0.02 -0.02 0.3 0.12 0.21 -0.04
-0.48 -0.25 -0.41 -0.17 0.81 -1.11 -1.63 -0.35 1.01 0.45 -0.08 0.19
-1.07 -0.43 -0.69 0.16 -0.74 0.62 -1.56 0.79 0.16 -1.47 0.83 0.66
-0.19 -0.73 -0.65 -0.25 0.14 -0.37 0.9 0.45 0.12 -0.08 0.49 -1.02
-0.2 -0.24 -0.11 0.07 -0.03 0.0 -0.05 -0.05 0.35 0.04 0.14 -0.03
-0.21 -0.23 -0.26 -0.04 -0.02 -0.06 0.04 0.1 0.13 0.19 0.21 0.07
0.04 -0.57 -0.24 -0.26 0.3 -0.3 0.21 -0.5 0.37 0.01 0.33 0.19
-0.51 -0.44 -0.25 -0.29 -0.28 -0.2 -0.45 -0.22 0.75 0.4 0.71 -0.04
-0.18 -0.25 -0.04 0.15 -0.12 -0.19 -0.01 -0.05 0.32 0.01 0.28 -0.06
-0.79 -0.85 -0.17 0.12 0.66 -2.98 -0.29 -0.99 0.33 0.24 0.86 0.69
0.35 -1.23 -0.6 0.21 0.4 -0.35 0.21 -1.11 0.17 0.24 0.09 0.48
0.32 -0.41 -0.26 0.04 0.03 -0.13 0.23 -0.24 0.11 0.29 -0.08 -0.09
0.02 -0.27 -0.08 -0.05 -0.15 -0.12 -0.07 -0.06 0.26 0.04 0.33 0.04
-0.2 -0.26 -0.04 -0.01 -0.08 -0.2 0.06 -0.31 0.27 0.06 0.31 0.23
-0.2 -0.23 -0.02 -0.06 0.01 -0.5 -0.04 -0.17 0.52 0.01 0.39 0.01
-3.62 -0.06 -2.39 0.84 0.05 -1.68 -0.29 -0.15 0.97 0.38 1.21 -1.55
-0.11 -0.1 -0.09 -0.07 0.02 -0.04 -0.09 -0.0 0.29 0.02 0.24 -0.13
-0.21 -0.1 0.24 -0.12 0.24 -0.88 0.19 -0.47 0.19 0.09 0.12 0.3
- -0.32 - 0.17 - 0.91 - -0.4 1.68 -0.38 1.35 -0.13
-0.15 -0.12 -0.16 -0.13 -0.11 -0.24 -0.2 -0.06 0.39 0.01 0.43 0.15
-0.2 -1.21 0.07 0.21 0.19 -0.22 -0.14 0.0 0.58 0.37 -0.25 -0.05
-0.3 -0.34 -0.29 -0.1 0.0 -0.02 -0.0 0.16 0.31 0.24 0.24 -0.1
-0.13 -0.06 -0.22 0.07 -0.28 -0.11 0.05 -0.04 0.22 0.16 0.18 0.06
-0.18 -0.02 -0.2 -0.21 -0.31 0.04 -0.13 -0.01 0.3 0.23 0.41 -0.12
-0.14 -0.47 -0.71 0.39 -0.16 -1.49 -0.88 -1.1 1.28 -0.36 1.45 -1.99
-1.13 -0.61 -0.21 -0.22 0.19 -0.61 -0.15 -0.97 0.99 0.44 0.71 -0.05
-0.1 -0.05 -0.1 -0.09 -0.04 -0.2 -0.03 -0.02 0.25 0.04 0.25 -0.0
-0.21 -0.11 -0.24 -0.07 -0.04 -0.04 -0.19 -0.04 0.39 0.16 0.23 0.01
-0.26 -0.83 -0.19 0.03 0.35 -0.48 0.23 -0.64 0.75 -0.03 0.19 0.14
-0.41 -0.95 -0.28 0.29 -0.03 0.14 -0.33 0.14 0.73 0.64 -0.17 -0.75

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.