Heatmap: Cluster_236 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.16 0.38 0.22 0.06 -0.32 -0.31 -0.31 -0.53 0.15 -0.27 0.3 0.4
0.05 0.06 0.22 -0.06 -0.28 0.01 -0.4 -0.18 0.08 0.14 0.29 -0.08
-0.11 0.05 -0.03 -0.09 -0.03 0.13 -0.06 -0.02 0.09 0.25 -0.08 -0.14
-0.27 0.09 -0.19 0.12 -0.04 0.2 -0.08 0.25 0.03 -0.14 -0.18 0.12
-0.09 0.01 0.12 0.03 0.05 -0.03 -0.5 0.29 0.1 0.03 -0.24 0.09
-0.11 -0.61 0.06 0.15 -0.07 0.09 -0.63 -0.3 -0.04 -0.01 0.52 0.48
0.16 0.75 -0.11 -0.18 -0.78 -1.26 -0.5 -0.25 0.49 0.13 -0.03 0.45
0.15 0.35 -0.21 -0.12 -0.03 0.05 -0.25 0.07 -0.14 -0.11 0.03 0.1
0.05 -0.03 0.06 -0.59 -0.06 0.44 -0.6 0.46 -0.05 -0.11 0.11 -0.08
0.1 0.05 -0.08 0.25 -0.03 0.27 -0.53 0.05 -0.16 -0.34 0.04 0.19
-0.13 0.2 -0.13 0.18 -0.0 -0.1 -0.08 0.13 -0.14 0.07 0.12 -0.18
-0.07 0.57 0.15 -0.28 0.19 -0.62 0.06 -0.39 0.1 -0.18 -0.12 0.23
0.05 0.18 -0.17 -0.02 -0.18 0.02 -0.22 0.12 -0.02 0.1 0.17 -0.1
-0.07 0.01 -0.07 0.1 -0.11 0.26 -0.17 0.24 0.03 -0.13 -0.09 -0.07
-0.02 0.18 -0.02 0.2 -0.01 0.15 -0.13 -0.07 -0.09 -0.2 -0.12 0.05
0.16 0.41 0.39 0.13 -0.76 0.1 -0.49 -0.47 -0.41 -0.74 0.43 0.44
0.02 0.11 -0.1 0.06 0.19 -0.23 -0.2 -0.03 -0.14 0.04 0.09 0.11
0.04 0.12 0.02 0.25 -0.03 -0.13 -0.23 0.23 -0.1 -0.22 -0.12 0.06
0.15 -0.04 0.06 0.44 -0.28 0.19 -0.14 0.09 -0.41 -0.25 -0.11 0.08
-0.01 0.07 0.1 -0.0 -0.17 -0.01 -0.17 -0.07 0.01 -0.12 0.08 0.25
-0.3 0.16 0.07 -0.28 0.15 0.07 0.11 -0.01 0.17 0.01 -0.14 -0.11
0.35 -0.14 0.2 -0.09 0.03 0.07 -0.27 -0.32 -0.46 -0.08 0.15 0.32
0.03 0.21 -0.07 0.02 0.06 -0.09 -0.09 0.15 -0.08 0.03 -0.06 -0.16
0.12 0.17 0.47 -0.09 -0.46 0.1 -0.95 -0.88 -0.13 -0.45 0.56 0.57
0.07 0.19 0.01 0.1 0.09 -0.21 -0.21 0.09 -0.15 -0.03 0.02 -0.03
0.09 0.21 0.2 0.1 -0.03 -0.15 -0.45 -0.16 -0.09 -0.17 0.06 0.24
-0.25 -0.55 0.28 0.14 -0.3 0.23 -0.18 -0.36 -0.2 0.06 0.31 0.44
0.31 0.04 -0.12 0.39 0.17 0.24 -0.7 0.51 -0.71 -0.69 -0.09 -0.02
-0.06 0.18 0.07 -0.02 0.02 -0.29 -0.35 0.14 -0.11 0.06 0.14 0.13
-0.76 0.76 0.04 0.56 -1.35 -1.4 -1.65 0.04 -0.11 -0.06 0.33 0.96
0.07 0.18 -0.02 0.09 0.06 -0.05 -0.16 -0.08 -0.09 -0.08 -0.05 0.1
-0.09 0.12 0.13 0.26 -0.01 0.03 -0.12 -0.02 -0.07 -0.22 -0.06 0.01
-0.07 -0.1 0.08 -0.01 -0.43 0.15 0.19 -0.82 -0.07 0.16 0.57 -0.06
0.38 0.6 -0.38 -0.88 -0.77 0.75 - 0.34 -0.13 0.03 0.33 0.19
0.07 0.07 -0.24 -0.18 -0.24 -0.09 0.01 0.04 0.08 -0.15 0.3 0.22
0.04 0.25 -0.07 -0.15 0.12 -0.09 -0.27 0.2 0.01 0.0 -0.38 0.2
1.33 0.79 -0.79 -0.12 0.02 -0.69 -1.95 -0.18 - 0.52 0.4 -0.43
-0.07 0.29 0.03 0.25 -0.37 0.03 -0.7 0.1 -0.79 -0.03 0.36 0.37
0.29 -0.0 -0.05 -0.18 -0.17 0.02 -0.2 -0.24 -0.01 0.1 0.22 0.12
-0.25 0.72 -0.04 -0.51 -0.1 0.1 -0.17 0.05 0.37 -0.81 -0.21 0.23
0.42 0.03 -0.16 -0.03 0.09 0.26 -0.01 0.23 -0.49 -0.21 -0.16 -0.19
0.07 -0.04 -0.13 -0.04 -0.12 -0.16 -0.02 0.26 -0.0 -0.01 0.01 0.13
0.1 0.18 -0.16 -0.01 -0.22 -0.12 -0.0 0.03 0.05 -0.15 0.01 0.23
0.15 -0.04 0.15 0.03 -0.13 0.05 -0.13 -0.09 -0.07 -0.06 0.15 -0.05
0.11 -0.12 0.07 0.21 -1.86 -0.27 0.39 -1.33 -0.58 0.2 1.09 0.05
0.42 0.52 -0.24 -0.05 -0.92 0.42 -1.3 -0.67 0.05 0.04 0.27 0.31
0.34 0.84 -0.47 0.42 -0.21 -0.54 0.08 0.05 -2.42 0.1 0.28 -0.39
0.18 0.22 -0.14 0.01 0.2 -0.22 -0.31 0.13 -0.18 0.04 0.03 -0.07
-1.06 0.27 -0.0 -0.76 0.58 -0.02 -0.08 -1.0 0.76 0.58 -0.28 -0.33
-0.12 0.03 0.06 0.18 0.04 -0.04 -0.2 -0.07 -0.22 0.0 0.08 0.18
0.27 0.09 0.08 0.19 -0.27 0.18 -0.39 0.05 -0.19 -0.23 -0.01 0.07
-0.01 0.16 -0.12 0.14 0.05 -0.01 -0.47 0.02 0.09 -0.08 -0.0 0.12
-0.17 0.47 0.31 -0.27 -0.6 0.3 -0.31 0.95 0.07 -0.61 0.03 -1.73
0.05 0.74 0.5 -1.83 0.4 -2.62 -0.5 -3.97 0.97 0.7 0.39 -1.1
0.09 0.08 -0.11 -0.17 -0.08 0.04 0.07 -0.09 0.11 -0.05 0.12 -0.04
0.29 0.21 0.12 -0.02 -0.11 0.03 -0.01 0.12 -0.29 -0.28 0.07 -0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.