Heatmap: Cluster_202 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.09 0.0 0.0 0.03 0.15 0.04 0.0 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0
1.01 1.4 1.25 1.7 1.42 2.22 0.87 1.0 1.67 0.91 1.18 1.24
59.41 54.59 59.57 50.42 55.67 62.48 61.57 55.24 65.66 53.28 62.13 72.08
0.15 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.03 0.03 0.07 0.07 0.0
0.0 0.0 0.2 0.24 0.21 0.05 0.05 0.06 0.0 0.0 0.3 0.12
13.3 17.0 17.32 16.49 17.05 17.51 11.7 16.2 20.98 15.26 14.58 18.22
11.27 7.53 9.36 6.41 7.89 10.99 6.74 8.68 10.31 7.18 8.96 7.92
5.4 5.52 5.78 5.72 4.72 5.72 5.86 5.42 6.05 5.45 5.67 6.35
0.16 0.36 0.41 0.2 0.16 0.04 0.17 0.33 0.15 0.04 0.07 0.44
15.05 16.5 16.74 17.8 16.79 16.28 15.63 15.31 15.07 15.23 14.23 16.98
16.8 16.31 12.93 9.62 8.02 15.46 13.71 18.12 15.28 13.3 18.34 14.34
2.68 2.12 1.82 2.16 2.04 2.2 1.44 1.9 2.33 1.74 1.58 1.21
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.28 0.38 0.15 0.15 0.25 0.33 0.27 0.31 0.23 0.3 0.31 0.23
0.78 0.55 1.02 0.58 0.74 0.39 0.34 0.4 0.84 0.95 0.6 0.75
0.73 1.4 1.11 1.07 0.76 0.98 0.89 1.05 1.35 1.33 1.2 1.43
0.98 0.72 1.41 1.46 1.15 1.63 1.07 1.67 0.64 0.96 0.87 1.5
0.77 1.03 1.13 0.75 0.82 0.62 0.49 0.46 0.49 0.24 0.52 0.71
0.06 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04
13.1 7.97 18.44 8.62 14.54 12.19 9.96 13.81 8.07 10.69 9.16 5.9
12.19 15.86 12.18 14.59 11.64 7.43 11.89 10.2 9.82 10.5 7.96 8.86
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.03 0.12
0.0 0.02 0.07 0.0 0.07 0.02 0.05 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02
1.1 1.53 1.32 1.39 1.08 1.25 1.32 1.64 1.36 1.27 1.22 1.47
0.82 0.4 0.43 0.61 0.69 0.8 0.43 0.71 0.66 0.52 0.78 0.86
0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.16 0.08 0.27 0.63 0.27 0.4 0.16 0.98 0.15 0.19 0.14 0.18
5.1 6.93 6.07 6.25 8.44 9.9 4.1 6.34 7.61 5.8 5.59 9.17
4.47 4.01 5.06 4.77 5.04 5.56 5.0 4.32 5.63 5.05 5.21 5.68
4.19 2.79 2.95 3.42 2.7 3.24 3.69 4.02 4.17 3.02 3.14 5.17
0.61 0.48 0.54 0.52 0.53 0.55 0.51 0.6 0.86 0.52 0.75 0.9
2.55 2.72 2.71 2.18 3.15 2.95 2.98 2.45 5.42 1.45 2.81 4.68
1.94 2.03 2.16 2.14 2.27 2.19 2.15 1.87 2.45 2.09 2.17 2.04
6.63 7.25 7.03 7.55 6.64 6.15 6.2 7.6 6.91 6.68 6.97 6.17
1.38 1.23 1.5 1.62 0.73 0.79 1.1 0.64 0.99 1.15 1.05 1.37
0.03 0.0 0.05 0.04 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.05 0.05 0.13 0.04 0.11 0.0 0.02 0.06 0.06 0.05 0.06
189.98 188.52 154.15 209.07 198.83 183.69 173.4 216.1 189.62 194.57 208.97 209.54
7.93 7.65 10.62 9.92 8.0 6.87 7.75 4.71 8.58 7.53 5.95 6.78
0.27 0.23 0.37 0.64 0.37 0.34 0.28 0.41 0.12 0.11 0.62 0.52
0.34 0.22 0.39 0.29 0.08 0.06 0.08 0.14 0.12 0.18 0.11 0.12
6.09 6.99 6.34 7.12 7.02 7.39 7.99 9.2 7.69 7.27 6.41 6.83
2.49 2.61 4.17 5.26 4.06 4.15 2.82 4.95 2.88 3.99 2.69 1.83
0.89 0.64 0.96 0.72 0.52 0.65 0.47 0.51 0.76 0.58 0.99 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.03 0.11 0.0 0.09
0.06 0.02 0.03 0.02 0.04 0.04 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.03
2.05 3.25 1.51 3.57 2.09 2.5 3.1 3.3 3.35 2.72 2.72 4.1
0.06 0.16 0.1 0.2 0.17 0.13 0.11 0.1 0.13 0.07 0.09 0.07
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
17.91 15.07 16.44 15.22 15.95 15.25 14.88 15.23 15.3 16.23 13.92 14.17
73.54 62.91 70.23 60.48 65.2 63.84 56.42 63.52 57.11 57.57 62.59 58.49
1.58 0.65 1.21 0.31 0.23 0.23 0.26 0.24 0.27 0.44 0.38 0.52
0.16 0.25 0.39 0.34 0.18 0.42 0.37 0.28 0.34 0.24 0.35 0.41
0.21 0.53 1.02 0.19 0.92 0.19 0.45 0.59 0.34 0.48 0.49 0.45
0.18 0.07 0.08 0.09 0.02 0.02 0.0 0.08 0.04 0.09 0.02 0.02
0.21 0.0 0.03 0.04 0.1 0.27 0.0 0.08 0.13 0.07 0.11 0.12
0.18 0.5 0.61 0.64 0.64 0.25 0.43 0.19 0.14 0.2 0.06 0.29
0.88 0.28 0.59 0.46 0.73 1.25 0.34 0.52 0.39 0.66 0.85 1.09
11.26 12.31 15.88 12.49 10.38 10.55 11.63 11.97 12.8 8.81 14.38 10.67
3.9 4.21 3.41 6.13 3.39 4.86 4.4 9.16 4.43 6.87 6.32 4.17
2.36 2.88 2.64 2.29 2.36 2.58 1.13 1.48 3.17 1.07 1.55 3.02
0.07 0.16 0.03 0.22 0.2 0.59 0.04 0.22 0.33 0.13 0.2 0.43
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.19 0.02 0.16 0.1 0.16 0.16 0.12 0.13 0.11 0.11 0.2
16.35 13.46 19.11 19.16 13.23 10.82 13.53 14.48 13.59 12.56 13.01 12.76
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.26 1.23 1.47 1.09 0.9 1.11 0.3 0.72 0.73 0.49 1.02 1.06
0.06 0.03 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.04
58.0 79.12 64.7 78.28 70.09 82.83 66.07 57.6 62.79 57.79 64.79 70.59
2.08 1.73 2.74 2.7 2.31 1.8 2.04 2.24 2.08 2.57 3.11 2.88
1.46 1.09 0.73 0.81 1.1 1.38 0.56 0.32 1.33 0.73 1.08 0.96
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.06 0.0
4.2 3.53 2.79 4.44 4.81 4.31 3.8 6.01 4.47 4.15 3.72 5.69
0.89 0.54 1.28 0.91 0.61 0.43 0.36 0.89 0.6 0.44 0.85 0.72
1.91 2.05 2.98 2.59 1.8 2.06 1.7 2.17 2.65 1.44 2.92 2.27
34.24 45.86 36.44 46.36 38.82 48.45 40.76 34.28 37.22 33.55 36.34 36.49
6.34 6.51 6.82 6.36 6.87 5.92 7.27 7.81 7.38 4.82 4.75 7.17
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.01 0.04 0.0
0.2 0.54 0.22 0.47 0.3 0.35 0.34 0.21 0.14 0.36 0.84 0.36
0.15 0.17 0.3 0.22 0.24 0.2 0.1 0.38 0.2 0.14 0.07 0.19
1.58 1.46 1.45 1.32 1.24 1.53 1.5 1.43 1.57 1.05 1.55 1.36
2.33 2.31 2.91 2.91 2.83 3.11 2.38 2.14 2.77 2.14 2.59 2.23
0.62 0.54 0.83 0.55 0.47 0.23 0.37 0.48 0.36 0.33 0.42 0.44
0.39 0.37 0.58 0.58 0.26 0.42 0.11 0.21 0.34 0.19 0.33 0.41
67.96 68.05 70.36 76.08 69.92 72.53 62.17 62.51 64.69 55.04 65.39 73.38
0.27 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.34 0.79 0.68 0.52 0.5 0.2 0.05 0.27 0.21 0.15 0.52
4.05 3.68 4.36 5.1 3.88 3.49 4.14 4.07 4.62 3.52 3.98 3.14
12.03 11.66 10.83 12.52 10.98 9.65 10.0 7.98 6.67 8.05 6.98 7.97
0.59 0.45 0.44 0.67 0.24 0.15 0.29 0.39 0.37 0.79 0.37 0.66
0.01 0.05 0.08 0.02 0.06 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02
0.36 0.3 0.37 0.56 0.33 0.49 0.21 0.46 0.39 0.33 0.37 0.26
0.46 0.97 1.11 0.88 0.86 0.39 0.49 0.76 0.39 0.3 0.28 0.53
0.49 0.14 0.1 0.48 0.43 0.53 0.22 0.35 0.5 0.65 0.34 0.87
0.06 0.05 0.02 0.07 0.03 0.05 0.02 0.0 0.06 0.0 0.08 0.02
3.96 3.86 2.92 3.38 3.83 3.83 4.24 3.79 4.07 4.79 3.81 4.03
7.99 11.22 8.79 8.92 8.29 9.88 10.03 11.49 8.85 10.4 9.54 10.49
0.13 0.07 0.14 0.0 0.02 0.0 0.07 0.05 0.0 0.03 0.23 0.02
0.12 0.14 0.2 0.37 0.14 0.22 0.23 0.2 0.06 0.08 0.23 0.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)