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Heatmap: Cluster_234 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.42 -0.36 0.75 -0.16 -1.0 -1.13 0.4 -0.06 0.6 0.57 -0.5 -0.06
-0.1 -0.09 -0.18 -0.21 -0.05 0.16 0.04 0.05 -0.06 -0.01 0.14 0.23
0.08 -0.24 -0.01 -0.24 0.2 -0.13 0.17 -0.09 -0.01 0.09 0.03 0.08
0.07 -0.11 -0.03 -0.04 -0.01 0.02 -0.04 -0.11 0.14 0.12 0.05 -0.08
-0.16 -0.33 -0.12 0.15 -0.12 -0.06 0.01 0.4 0.03 0.31 -0.04 -0.24
0.18 -0.49 -0.25 -0.01 0.15 -0.12 -0.01 0.14 -0.47 -0.01 0.26 0.35
-0.17 -0.14 0.05 -0.05 -0.03 0.02 -0.04 -0.03 0.06 0.09 0.0 0.21
0.07 -0.27 0.0 -0.24 0.08 -0.07 0.21 -0.07 0.04 0.06 0.11 0.02
-0.27 -0.16 -0.12 -0.1 -0.03 0.14 0.05 0.1 -0.16 0.21 0.07 0.17
-0.1 -0.02 -0.07 -0.11 0.01 0.09 -0.04 -0.14 -0.01 -0.06 0.09 0.29
-0.12 -0.16 -0.05 0.06 -0.08 -0.12 -0.15 -0.16 0.18 0.16 0.29 0.06
-0.36 -0.28 -0.05 -1.29 -0.32 -0.47 0.19 0.05 0.06 0.77 0.64 0.04
0.06 0.0 -0.09 -0.05 -0.01 -0.06 0.02 0.18 -0.27 -0.03 -0.22 0.36
-0.08 -0.36 0.09 -0.0 0.04 -0.07 0.28 -0.19 0.04 -0.02 0.09 0.09
0.17 -0.48 -0.1 0.34 0.43 -0.93 0.28 -0.34 0.09 -0.12 -0.38 0.42
-0.1 -0.12 -0.19 -0.08 0.2 0.14 -0.19 -0.06 -0.0 0.11 0.06 0.17
0.09 -0.51 -0.02 0.1 -0.25 0.16 0.24 -0.23 0.14 -0.19 0.11 0.19
-0.17 -0.58 -0.11 -0.44 -0.08 -0.27 0.31 -0.27 0.54 0.14 0.25 0.25
-0.2 -0.39 0.15 -0.49 -0.46 0.05 0.23 -0.09 0.22 0.11 0.15 0.39
-0.13 -0.0 -0.04 -0.05 -0.21 -0.05 0.11 -0.04 0.1 0.21 0.03 0.03
-0.04 -0.04 -0.06 0.0 -0.04 -0.03 0.05 0.04 -0.15 0.12 -0.1 0.21
0.07 -0.23 0.03 -0.11 0.09 -0.15 0.15 -0.02 0.07 -0.1 0.1 0.05
0.16 -0.18 -0.14 -0.54 -0.33 -0.62 0.16 -0.52 0.25 0.09 0.43 0.62
-0.71 -2.74 -0.5 0.28 -1.57 -1.38 -0.63 0.85 0.06 0.3 1.36 0.37
-0.76 -0.71 -0.12 -0.41 -0.05 0.07 0.34 0.48 -0.15 0.42 -0.12 0.36
-0.01 -0.46 -0.75 -2.2 0.25 -0.89 0.43 -1.85 0.74 0.79 0.61 0.25
0.11 -0.4 -0.63 -0.88 -0.36 -0.02 0.16 0.57 0.34 0.63 0.12 -0.5
-0.08 -0.11 -0.13 0.0 -0.13 0.05 0.06 0.06 -0.05 0.04 -0.02 0.27
0.24 -0.67 -0.06 -0.22 -0.09 -0.42 -0.04 -0.6 0.29 0.42 0.45 0.16
-0.28 0.69 - -1.51 -0.08 0.14 -0.32 -0.34 -1.88 1.49 0.9 -0.69
0.18 -0.29 0.04 -0.37 -0.44 -0.56 0.23 -0.66 0.33 0.29 0.26 0.44
-0.95 -0.73 -0.75 -0.02 0.69 - 1.29 -0.82 1.32 -0.92 0.72 -
- - - 0.77 0.87 1.82 1.57 - - - 0.99 -
-0.16 -0.39 0.01 0.22 -0.31 -0.19 -0.27 -0.56 0.15 0.36 0.37 0.36
-0.91 -0.46 -0.53 -0.53 -1.19 -0.12 1.1 -1.49 0.78 -0.04 0.05 0.82
-0.01 -0.17 -0.06 -0.01 0.06 -0.04 -0.02 0.05 -0.05 0.19 0.08 -0.06
-0.02 -0.14 0.0 -0.05 0.0 0.02 0.05 -0.07 -0.02 0.03 0.11 0.08
-0.5 -0.15 -0.2 0.07 -0.0 0.01 0.14 -0.05 -0.28 0.37 0.3 0.07
0.07 -0.2 0.01 -0.11 -0.19 0.06 0.04 0.07 -0.04 0.13 0.09 0.04
- - 0.63 - - 1.82 0.89 0.71 -0.41 -0.2 -0.01 -0.29
0.07 -0.66 -0.65 -1.01 -0.03 -0.11 0.06 -0.0 0.68 0.24 -0.16 0.64
0.02 -0.5 0.05 -0.2 -0.41 -0.5 -0.24 0.15 0.15 0.34 0.11 0.58
-0.77 -1.45 0.0 -0.73 -0.72 -1.22 -0.26 -0.18 0.53 1.01 0.73 0.67
-0.4 -1.44 -0.22 -0.62 -0.6 0.46 -0.28 0.7 -0.75 0.86 -0.0 0.56
0.2 -0.64 -0.03 0.06 -0.43 -0.55 -0.9 -1.06 0.39 0.22 0.85 0.56
-0.28 -0.07 0.02 -0.22 -0.03 0.01 -0.21 0.03 0.05 0.2 0.02 0.36
-0.3 - - - -0.23 - 1.08 1.41 -0.2 1.63 0.68 -
-0.04 -1.11 -0.41 0.3 0.02 -0.63 -0.07 -0.12 0.29 0.8 0.29 -0.2
-0.08 -0.47 -0.44 -0.21 0.25 -0.02 0.22 -0.03 0.17 0.35 0.03 -0.02
-0.36 -0.67 -0.41 -0.4 -0.94 -0.71 -0.16 -0.19 0.15 0.67 0.84 0.75
0.69 -2.22 -1.08 - 1.01 0.46 0.22 - -2.24 0.59 1.53 -0.87
-0.11 -0.41 0.11 -0.15 -0.03 0.13 -0.02 -0.3 -0.14 0.05 0.26 0.41
-3.24 -0.05 -2.96 -0.1 -0.1 -1.82 0.59 0.73 -0.39 1.07 1.11 -1.14
-0.32 - -0.16 - 0.14 1.09 0.17 -0.11 - 1.4 0.59 -0.19
-0.01 -0.45 0.1 -0.45 -0.35 -0.09 0.46 -0.34 -0.05 0.39 0.21 0.19
-0.18 -0.28 0.02 -0.25 -0.1 0.05 0.05 -0.36 0.28 0.13 0.16 0.3
- - 0.49 - - - - 0.31 1.27 2.19 1.24 -
-0.42 0.0 -0.29 -0.69 0.29 0.03 -0.3 0.32 0.15 0.11 0.37 0.04
-0.12 -0.39 -0.35 0.77 0.21 0.56 0.17 -0.09 -2.1 0.33 -0.22 -0.34
-1.14 -0.74 0.08 -1.39 0.24 -0.12 0.13 0.16 0.46 0.36 0.22 0.47
- - - - - 1.88 0.42 - - 1.33 2.16 -
-0.22 -0.65 -0.02 -0.05 0.22 -0.53 0.09 -0.07 0.23 0.45 -0.0 0.19
0.03 -2.05 -0.91 -0.48 -0.15 0.56 1.49 - 0.31 -0.17 0.58 -0.54
-0.02 -0.4 0.07 -0.09 -0.13 0.1 0.26 -0.23 0.08 -0.08 0.12 0.19
0.13 -0.47 0.19 -0.09 0.11 0.11 -0.29 -0.18 -0.56 0.13 0.07 0.5
-0.03 -0.57 -0.08 -0.35 -0.25 -0.76 0.3 -0.21 -0.1 0.65 0.49 0.24
- - - -0.07 0.84 - - 0.87 1.63 1.02 0.54 -0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.