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Heatmap: Cluster_187 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.09 -0.18 -0.02 -0.31 -0.34 0.24 0.2 0.12 -0.16 0.05 -0.21 0.33
0.03 -0.03 0.02 0.33 -0.14 0.02 0.21 -0.22 -0.46 0.27 -0.6 0.28
0.25 0.12 0.1 -0.04 -0.54 0.28 0.1 -0.17 -0.18 0.34 -0.85 0.16
0.16 0.05 0.04 -0.12 -0.02 0.04 0.17 0.13 -0.42 -0.05 -0.23 0.13
0.01 -0.2 0.2 -0.11 -0.39 0.12 0.23 0.06 -0.32 -0.08 0.05 0.25
-0.03 0.03 -0.0 0.09 -0.04 0.12 0.08 0.05 -0.2 -0.04 -0.39 0.23
0.1 -0.09 0.01 0.19 -0.13 -0.22 0.07 -0.07 -0.19 0.05 -0.09 0.29
0.17 -0.33 0.13 0.16 -0.11 -0.0 -0.0 0.08 -0.25 -0.29 -0.21 0.45
0.08 0.09 -0.02 -0.15 -0.05 0.04 0.08 0.06 -0.18 0.05 -0.21 0.16
0.25 0.1 0.1 -0.4 -0.11 -0.09 -0.03 0.35 -0.2 0.05 -0.32 0.12
0.08 0.04 -0.03 -0.23 -0.06 0.09 0.22 0.23 -0.3 -0.03 -0.29 0.16
0.04 -0.03 0.12 -0.16 -0.43 0.06 -0.06 -0.17 0.01 -0.04 -0.02 0.5
0.02 -0.05 -0.01 -0.05 -0.19 0.23 0.1 0.15 -0.26 -0.07 -0.17 0.21
-0.03 -0.15 0.13 -0.02 -0.18 -0.09 0.24 -0.07 -0.23 -0.09 -0.22 0.52
-0.0 0.05 0.01 0.0 -0.03 0.01 0.02 0.16 -0.27 0.08 -0.08 0.02
-0.02 0.07 -0.01 -0.16 -0.0 -0.06 -0.18 0.12 -0.04 0.06 -0.16 0.31
-0.02 -0.03 0.02 -0.1 -0.2 -0.01 0.16 0.09 -0.21 0.05 -0.07 0.25
0.09 -0.09 -0.02 -0.18 -0.06 0.1 0.07 0.13 -0.12 0.09 -0.24 0.17
-0.03 0.08 0.1 0.01 -0.08 -0.02 0.03 0.15 -0.17 -0.01 -0.19 0.09
0.04 0.12 -0.02 -0.14 -0.14 0.08 0.32 0.2 -0.37 -0.14 -0.32 0.21
0.12 0.02 0.02 -0.02 -0.06 -0.06 0.07 0.13 -0.32 0.05 -0.07 0.06
0.19 0.08 -0.13 -0.45 -0.21 0.08 0.16 0.2 -0.21 -0.07 -0.31 0.42
0.2 -0.26 0.1 -0.32 -0.4 -0.01 -0.16 -0.43 -0.1 0.07 -0.2 0.92
0.35 0.1 0.08 -0.15 0.16 -0.24 0.05 0.15 -0.55 -0.22 0.04 0.02
-0.05 0.05 0.02 -0.03 -0.1 -0.12 0.02 -0.07 -0.1 0.05 0.01 0.28
0.08 0.09 0.1 0.11 0.11 0.12 -0.04 -0.0 -0.2 -0.17 -0.26 -0.0
0.06 0.19 0.06 -0.33 -0.27 0.22 0.18 0.25 -0.65 -0.05 -0.34 0.33
0.05 -0.22 0.07 -0.06 0.05 0.01 0.08 -0.05 -0.19 -0.07 -0.19 0.4
-0.09 0.09 0.08 -0.09 -0.01 -0.15 0.16 0.33 -0.4 0.14 -0.29 0.08
0.07 0.07 0.23 -0.09 -0.02 -0.02 0.04 0.09 -0.45 0.09 -0.09 -0.02
-0.03 -0.01 0.02 -0.12 -0.05 -0.02 0.04 0.01 -0.15 0.09 -0.25 0.38
0.07 0.08 -0.07 -0.37 -0.15 0.06 -0.06 0.22 -0.38 -0.14 -0.15 0.6
0.02 0.04 -0.0 0.06 -0.08 0.05 0.07 0.1 -0.1 -0.05 -0.28 0.13
0.2 0.01 0.11 0.0 -0.19 0.11 0.02 0.15 -0.5 -0.06 -0.14 0.14
0.01 -0.01 0.24 -0.36 0.09 0.33 0.01 -0.15 -0.41 0.0 -0.33 0.34
0.05 0.52 -0.15 0.41 0.36 0.06 -0.01 -0.2 -0.64 -0.56 -0.16 -0.15
0.51 -0.82 -0.68 0.18 -0.47 -0.51 0.29 -0.73 -0.03 -0.4 -0.55 1.37
0.1 -0.07 -0.07 -0.1 -0.08 0.12 0.11 0.01 -0.29 0.01 -0.04 0.23
0.06 -0.02 0.03 -0.21 0.0 0.11 0.1 0.04 -0.13 0.07 -0.22 0.11
0.29 -0.33 0.17 -0.29 0.06 0.18 0.2 -0.13 -0.51 -0.11 -0.45 0.52
0.02 0.17 0.01 -0.28 -0.21 -0.16 0.03 0.08 -0.27 0.07 -0.1 0.46
0.17 -0.0 -0.09 -0.18 -0.09 0.24 0.07 0.05 -0.32 -0.21 -0.15 0.36
0.04 0.09 0.05 -0.05 0.04 0.07 0.06 -0.08 -0.18 0.12 -0.2 -0.01
0.04 0.16 -0.16 -0.17 0.02 0.23 -0.0 0.16 -0.35 0.01 -0.17 0.13
0.08 0.07 0.0 -0.1 -0.01 0.06 0.17 0.15 -0.24 -0.03 -0.29 0.05
0.05 0.0 0.02 -0.22 0.01 0.22 0.03 0.22 -0.3 0.08 -0.4 0.14
0.07 -0.0 0.07 -0.08 -0.31 0.01 -0.19 -0.18 -0.1 0.03 -0.05 0.56
0.11 -0.15 0.07 -0.14 0.02 0.15 0.13 0.18 -0.15 -0.05 -0.4 0.12
-0.01 0.08 -0.06 -0.08 0.0 -0.01 -0.1 0.11 -0.23 0.09 -0.08 0.23
0.05 0.07 0.01 -0.43 -0.16 0.23 0.2 0.24 -0.46 0.0 -0.29 0.29
0.16 -0.28 0.02 -0.09 -0.3 0.07 0.2 0.01 -0.25 -0.14 0.08 0.35
-0.03 -0.04 0.09 -0.19 -0.09 0.13 0.1 -0.1 -0.19 -0.07 -0.26 0.48
-0.02 -0.03 -0.04 -0.07 0.01 -0.08 -0.04 0.12 -0.18 0.17 -0.08 0.18
-0.03 0.11 0.05 -0.24 -0.11 0.1 0.0 0.2 -0.25 0.07 -0.17 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.