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Heatmap: Cluster_230 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.16 0.24 0.26 -0.16 0.02 -0.42 -0.23 -0.37 0.13 -0.5 0.05 0.47
0.06 0.08 0.08 0.14 -0.18 -0.31 -0.09 -0.09 0.11 0.08 -0.04 0.11
0.2 -0.03 0.01 0.07 -0.21 -0.4 -0.03 -0.16 0.13 -0.01 -0.23 0.48
-0.18 -0.44 -0.05 0.03 0.16 -0.54 0.07 -0.44 0.21 0.09 0.06 0.61
0.2 -0.15 0.12 0.03 -0.04 -0.42 0.16 -0.53 -0.24 -0.38 0.34 0.53
0.41 0.3 0.05 -0.01 -0.18 -0.31 0.16 -0.37 -0.2 -0.66 -0.68 0.76
-0.25 -0.71 0.16 0.05 -0.08 -0.62 0.54 -0.41 0.19 0.17 -0.28 0.57
-0.16 -0.19 -0.02 0.05 -0.03 0.09 -0.11 -0.07 0.02 0.02 0.03 0.3
0.03 -0.2 -0.09 -0.06 -0.02 0.07 0.01 0.12 -0.05 -0.01 -0.09 0.24
-0.12 -0.35 0.09 -0.05 -0.0 -0.11 0.19 0.03 0.01 -0.12 0.04 0.3
-0.27 -0.27 -0.1 -0.11 -0.03 -0.12 0.03 0.16 0.05 0.25 -0.08 0.35
-0.1 0.34 -0.61 -0.23 -0.69 -0.6 -0.43 -0.39 0.69 0.28 0.36 0.47
-0.18 -0.17 0.06 0.12 -0.11 -0.04 -0.09 -0.07 -0.04 0.08 0.11 0.28
-0.04 0.01 -0.11 -0.05 -0.14 0.06 0.04 -0.01 -0.1 0.12 -0.03 0.21
-0.0 -0.03 0.08 0.01 -0.04 -0.07 -0.08 -0.15 0.02 0.03 0.02 0.18
-0.0 -0.15 -0.01 -0.05 -0.14 -0.11 0.1 -0.1 0.02 0.02 0.14 0.23
0.14 -0.48 -0.6 0.23 -0.51 -0.15 0.2 -0.89 0.08 0.27 0.26 0.67
-0.09 -0.11 0.12 0.11 -0.08 -0.07 -0.03 -0.09 -0.03 0.07 -0.03 0.19
-0.08 -0.03 0.02 0.02 -0.09 -0.06 -0.02 -0.06 0.04 0.1 -0.02 0.16
-0.06 -0.14 -0.17 -0.13 -0.07 -0.08 0.14 -0.01 -0.04 0.22 -0.05 0.31
-0.08 0.52 -0.27 -0.09 -0.89 -0.93 -0.06 -1.39 0.36 0.07 -0.2 1.17
0.01 -0.06 -0.03 -0.08 0.04 -0.28 0.14 -0.12 0.01 0.19 -0.12 0.21
-0.17 -0.28 -0.19 -0.1 -0.01 0.01 -0.17 -0.31 0.47 0.12 0.04 0.37
-0.37 -1.29 -0.49 -1.69 0.29 -0.1 -0.52 -0.53 0.62 -1.91 1.03 1.26
-0.12 -0.07 -0.07 -0.06 0.06 -0.55 0.05 -0.18 0.29 -0.05 0.15 0.34
-0.06 -0.24 -0.37 -0.24 -0.1 -0.11 0.09 -0.32 0.31 -0.0 0.13 0.6
0.07 0.19 -0.36 0.06 -0.07 -0.82 -0.03 -0.38 0.31 0.09 0.06 0.46
0.27 -0.4 -0.35 -0.3 -0.12 -0.25 -0.26 0.04 0.24 0.45 0.25 0.1
-0.1 0.05 0.03 0.01 -0.07 -0.03 -0.03 -0.08 0.01 0.06 0.0 0.13
0.37 0.02 0.06 0.24 -0.2 -0.71 -0.43 -0.17 -0.05 -0.32 0.17 0.57
-0.59 0.35 -1.11 0.62 -0.9 -1.33 -0.23 -1.12 0.68 -0.05 0.21 1.06
- - - - - - - - 1.8 2.17 - 2.01
0.3 0.09 0.36 0.28 -0.15 -0.64 0.09 -0.41 -0.0 -0.8 -0.35 0.58
-0.04 -0.04 -0.05 -0.04 0.06 0.11 -0.08 -0.24 0.21 -0.25 0.01 0.26
-0.18 -0.08 0.03 -0.13 -0.05 -0.4 0.06 -0.12 -0.03 0.26 0.2 0.3
-0.0 0.1 -0.48 -0.02 0.11 -0.08 -0.19 -0.04 -0.12 0.14 0.2 0.25
0.16 -0.13 0.1 -0.08 -0.14 -0.16 -0.11 -0.14 0.19 -0.07 -0.06 0.34
0.01 0.24 -0.18 0.05 -0.2 0.1 0.1 -0.74 -0.1 -0.43 -0.16 0.77
-0.14 -0.0 -0.28 -0.16 -0.26 0.13 0.17 0.17 -0.31 -0.03 0.16 0.37
-0.41 -0.38 0.27 -0.52 0.42 - -0.93 - 0.75 0.85 -2.19 1.59
-0.33 0.2 -0.63 0.11 -1.03 -0.85 -0.18 -0.59 0.73 0.29 -0.02 0.91
-0.11 -0.07 -0.04 0.01 -0.03 0.05 -0.05 -0.14 0.01 0.05 0.01 0.27
-2.68 -2.56 -2.44 -2.41 - -2.26 -2.59 -2.13 2.51 2.09 -0.88 -2.48
-0.13 -0.11 -0.11 0.07 -0.12 0.01 -0.05 -0.3 0.11 0.17 -0.14 0.44
-0.07 -0.19 -0.09 0.05 -0.12 -0.17 0.12 -0.08 -0.12 0.21 0.05 0.32
-0.18 0.02 -0.76 -0.04 -0.25 -0.09 0.35 -0.14 -0.85 -0.88 0.79 0.81
- - - - 0.84 - 0.87 - 1.87 2.24 - -
-0.14 -0.49 0.15 -0.14 -0.1 -0.16 0.33 -0.33 0.16 0.13 -0.01 0.35
-0.14 -0.17 0.11 0.1 0.1 -0.23 0.12 -0.13 0.07 -0.05 -0.17 0.29
0.02 -0.27 -0.02 0.1 -0.08 -0.27 0.1 -0.09 0.09 -0.03 0.04 0.32
-0.12 0.05 -0.12 -0.05 -0.11 0.11 0.0 0.0 -0.11 0.08 -0.0 0.22
-0.27 -0.62 -0.03 -0.28 0.03 -0.61 -0.49 -0.67 0.03 0.57 -0.02 1.15
0.1 0.02 -1.36 0.27 -0.6 -0.68 0.24 -1.1 0.45 -0.32 -0.14 1.21
0.58 -0.02 -0.06 0.31 -0.22 -0.62 0.56 -0.29 -0.46 -1.45 -0.24 0.66
- - - - - - - - 2.39 2.76 - -
0.15 -0.23 -0.47 -0.17 -0.11 -0.25 -0.18 -0.69 0.26 -0.27 0.26 0.95
-0.13 -0.09 -0.12 -0.13 -0.22 -0.05 0.12 -0.01 -0.22 0.08 0.04 0.54
-0.01 -0.13 -0.18 -0.12 -0.0 0.07 0.02 -0.12 -0.06 -0.11 0.17 0.37
0.08 -0.69 -0.58 0.24 -0.6 -0.41 -0.46 0.22 -0.53 -0.24 0.91 0.81
-0.12 0.0 -0.02 -0.16 -0.27 -0.1 -0.12 -0.11 0.21 -0.16 0.29 0.4
- - - - - - 1.43 - 1.43 1.8 - 1.64
0.43 0.17 0.31 -0.07 -0.05 -1.19 -0.12 -0.36 0.09 -0.62 -0.34 0.79

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.