Heatmap: Cluster_115 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.09 0.0 0.16 0.19 0.02 0.14 0.06 0.09 0.17 0.12 0.23 0.15
0.03 0.03 0.1 0.12 0.12 0.04 0.0 0.0 0.05 0.09 0.1 0.14
0.55 0.56 0.81 0.7 0.53 0.66 0.59 0.58 0.63 0.63 0.95 0.76
1.99 1.38 1.67 1.6 1.4 1.43 1.33 1.47 2.46 1.56 2.76 1.8
0.06 0.07 0.28 0.39 0.23 0.13 0.25 0.17 0.27 0.11 0.6 0.31
2.07 1.34 2.49 1.5 1.48 1.71 1.43 1.22 1.93 1.4 3.16 2.57
0.06 0.09 0.34 0.28 0.37 0.23 0.23 0.27 0.25 0.26 0.42 0.46
0.06 0.07 0.45 0.4 0.89 0.07 0.29 0.0 0.57 0.18 1.6 0.43
0.07 0.05 0.02 0.06 0.07 0.04 0.0 0.04 0.02 0.04 0.08 0.02
0.01 0.12 0.52 0.19 0.08 0.33 0.14 0.24 0.2 0.09 0.41 0.17
23.71 21.03 21.53 23.26 20.9 24.52 22.35 21.84 24.03 24.26 25.64 28.07
0.05 0.03 0.07 0.06 0.06 0.04 0.03 0.06 0.03 0.04 0.13 0.07
0.04 0.07 0.59 0.27 0.06 0.02 0.2 0.11 0.22 0.08 0.82 0.25
12.24 8.81 13.33 13.05 12.47 12.77 11.62 12.6 12.32 12.66 10.96 14.58
0.03 0.02 0.1 0.09 0.04 0.02 0.08 0.04 0.11 0.03 0.21 0.24
0.24 0.16 0.25 0.15 0.35 0.14 0.09 0.17 0.17 0.31 0.25 0.29
0.25 0.15 0.74 0.22 0.41 0.33 0.28 0.01 0.45 0.36 2.14 0.77
0.27 0.2 0.47 0.39 0.29 0.4 0.58 0.24 0.46 0.06 1.37 0.76
0.78 0.61 0.91 0.74 0.65 0.8 0.7 0.35 0.69 0.57 1.28 1.41
0.02 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0
0.86 0.69 0.98 0.62 1.13 0.87 0.82 1.08 0.78 0.93 0.91 1.01
1.47 1.19 2.0 1.7 1.17 1.2 0.97 0.86 1.42 1.1 2.37 2.09
3.05 4.64 6.82 7.18 5.57 5.35 5.3 7.45 3.29 5.87 8.11 7.56
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.02 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03
1.17 0.72 1.26 2.13 1.4 1.25 1.2 0.87 1.13 1.38 2.13 1.47
0.44 0.23 0.51 0.34 0.51 0.48 0.24 0.33 0.25 0.43 0.58 0.38
0.02 0.07 0.16 0.0 0.02 0.04 0.07 0.01 0.12 0.0 0.25 0.08
0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.4 0.64 2.92 1.69 0.66 1.0 0.85 1.3 1.78 0.82 4.55 1.36
0.19 0.28 1.66 1.04 0.43 0.39 0.17 0.12 0.94 0.21 1.9 1.05
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
1.04 1.16 1.87 1.13 1.22 1.09 1.36 1.09 1.92 1.74 1.57 1.71
0.09 0.39 0.35 0.28 0.35 0.29 0.16 0.19 0.36 0.07 1.3 0.64
0.04 0.14 0.16 0.22 0.1 0.11 0.06 0.05 0.03 0.03 0.38 0.19
0.34 0.25 1.04 1.06 0.6 1.37 0.54 0.87 0.44 0.55 1.04 1.04
4.05 4.12 8.64 5.92 4.6 5.12 4.83 2.94 5.99 3.09 14.39 6.68
4.2 5.61 10.98 9.98 6.64 4.93 4.8 5.97 7.53 5.97 16.18 11.07
0.79 0.66 1.61 1.84 1.37 1.02 1.32 1.03 1.17 1.1 2.36 1.86
0.77 0.63 1.5 0.81 0.77 0.88 0.66 0.61 0.91 0.9 2.15 1.67
0.84 0.94 0.97 1.1 0.73 0.85 0.46 0.8 0.85 0.69 1.23 0.94
0.82 1.01 1.56 0.72 1.07 0.69 1.17 0.46 0.48 1.04 2.17 1.82
0.19 0.18 0.37 0.34 0.03 0.21 0.32 0.01 0.19 0.17 0.63 0.63
0.0 0.0 0.07 0.23 0.06 0.0 0.07 0.0 0.03 0.03 0.14 0.1
0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02
0.15 0.05 0.19 0.08 0.07 0.06 0.03 0.11 0.09 0.08 0.18 0.09
0.4 0.36 0.63 0.28 0.68 0.08 0.2 0.26 0.36 0.5 0.86 0.38
3.53 3.63 3.88 3.14 4.51 3.0 3.68 3.07 3.7 4.5 3.98 5.11
0.21 0.47 1.21 0.58 0.44 0.36 0.99 0.54 0.87 0.62 2.12 1.42
0.78 1.2 1.24 1.04 1.27 0.76 0.77 0.85 1.23 0.88 1.48 0.96
0.53 0.44 1.06 0.94 1.06 0.55 1.09 0.53 1.09 0.72 1.99 1.36
1.57 1.05 1.91 1.75 1.59 1.97 1.49 1.62 1.84 1.69 2.05 2.11
0.61 0.33 0.8 1.01 0.66 0.53 0.46 0.42 0.65 0.39 1.03 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.22 0.22 0.43 0.12 0.33 0.17 0.23 0.32 0.29 0.31 0.36 0.3
0.62 0.57 0.96 1.15 0.84 0.53 0.51 0.52 0.84 0.6 1.24 0.98
0.0 0.11 0.26 0.03 0.35 0.02 0.02 0.08 0.23 0.11 0.36 0.14
3.63 2.73 4.1 2.27 2.82 1.39 2.26 2.5 2.14 3.2 3.41 3.27
0.09 0.04 0.26 0.29 0.36 0.28 0.21 0.32 0.22 0.36 0.89 0.31
0.46 1.19 1.92 0.95 1.34 1.21 1.03 0.67 1.06 0.99 1.95 2.12
0.14 0.21 0.55 0.12 0.15 0.13 0.3 0.29 0.29 0.1 0.24 0.17
0.04 0.02 0.21 0.07 0.02 0.1 0.06 0.18 0.09 0.01 0.11 0.07
0.05 0.0 0.16 0.0 0.0 0.11 0.29 0.05 0.09 0.06 0.4 0.1
0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.0 0.0 0.23 0.16
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)