Heatmap: Cluster_16 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.13 0.0 0.0 0.11 0.05 0.64 0.14 0.18 0.13 0.27 0.08 0.07
0.28 3.94 0.68 0.99 1.33 18.95 2.85 1.23 1.21 1.28 1.09 0.84
0.06 0.33 0.03 0.22 0.19 2.18 0.16 0.07 0.06 0.18 1.15 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.12 0.0 0.07 0.14 0.0 0.39 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
2.23 4.5 3.41 2.93 6.24 18.48 6.2 3.3 5.73 4.78 7.28 5.08
0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.24 0.0 0.07 0.0 0.04 0.03 0.0
1.27 2.24 1.36 1.72 1.88 3.78 1.49 1.2 1.84 1.66 2.33 1.72
0.36 1.48 0.71 0.41 1.28 12.88 1.82 1.22 0.58 0.45 4.07 0.34
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.78 2.61 3.08 1.94 2.81 11.18 4.67 4.09 3.57 3.06 7.05 3.09
1.07 2.97 2.01 1.91 3.58 10.34 4.56 2.16 3.7 3.14 5.79 3.74
2.21 7.44 4.22 4.97 10.47 30.94 11.74 6.8 7.99 8.39 17.46 7.87
2.82 5.57 3.34 3.36 5.19 10.84 6.11 3.93 5.61 5.44 6.8 6.21
0.04 0.36 0.17 0.17 0.23 0.67 0.43 0.2 0.35 0.17 0.28 0.24
2.53 7.47 4.2 3.51 6.84 22.33 7.51 4.24 7.14 6.02 9.15 8.82
1.12 3.26 1.45 1.48 3.0 6.67 3.8 2.41 3.13 3.07 4.29 4.16
0.2 0.4 0.19 0.11 0.16 0.84 0.05 0.21 0.28 0.21 0.34 0.23
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.24 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.18 0.24 1.06 0.63 0.48 2.59 0.44 0.06 1.16 0.25 1.05 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.23 4.77 3.65 3.89 4.94 16.03 5.63 3.48 3.31 4.39 5.83 5.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.58 7.27 9.18 7.82 9.37 12.81 9.28 6.24 6.55 9.07 10.06 7.46
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.27 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.22 0.42 0.12 1.21 0.17 0.06 0.2 0.28 0.58 0.32
0.03 0.2 0.0 0.22 0.08 0.52 0.25 0.08 0.13 0.09 0.14 0.11
0.05 0.07 0.03 0.07 0.02 0.16 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.01 0.0 0.07 0.0 0.02 0.08 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.11 0.1 0.02 0.02 0.18 0.05 0.01 0.05 0.1 0.14 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.16 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.08 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.02 0.06 0.04 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.18 0.35 0.46 0.16 0.52 1.0 0.47 0.17 0.36 0.24 0.21 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.69 1.05 0.61 0.71 1.32 3.91 0.8 0.64 0.78 1.41 1.6 0.21
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.22 0.02 0.05 0.09 0.02 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
1.94 1.9 2.3 2.46 3.42 5.79 4.89 2.07 3.44 3.31 4.88 3.2
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.03 0.03 0.1 0.36 0.14 0.09 0.15 0.04 0.13 0.1
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.12 0.02 0.01 0.0 0.06 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.1 0.03 0.05 0.06 0.2 0.13 0.06 0.06 0.07 0.04 0.09
0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 0.32 0.06 0.0 0.13 0.0 0.0 0.07
0.01 0.04 0.1 0.08 0.08 0.26 0.02 0.03 0.01 0.06 0.09 0.02
0.09 0.0 0.05 0.07 0.0 0.52 0.09 0.0 0.09 0.04 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.03 0.07 0.08 0.36 0.03 0.0 0.06 0.08 0.16 0.14
0.08 0.0 0.0 0.0 0.1 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.07 0.08 0.21 0.69 0.0 0.0 0.1 0.04 0.04 0.15
0.13 0.24 0.15 0.22 0.1 0.4 0.11 0.23 0.22 0.26 0.22 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.32 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04
0.03 0.02 0.0 0.02 0.02 0.12 0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0
0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.18 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.06 0.05 0.12 0.06 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)