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Heatmap: Cluster_50 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.59 -2.82 -0.4 0.09 -0.29 -0.04 -0.22 -0.62 0.58 -0.69 0.78 0.48
-0.25 0.96 -1.01 0.0 -1.79 0.48 0.76 -0.1 -0.07 - 0.3 0.28
0.4 0.02 0.29 -0.64 -0.61 0.87 0.68 0.23 -0.26 -0.53 -1.27 -0.75
-1.75 0.1 -0.98 0.35 0.26 1.07 - - 1.32 -1.38 -0.13 0.83
-0.04 0.13 -0.52 0.17 -0.17 0.67 -0.08 0.44 -0.7 0.3 -0.67 -0.23
0.04 0.04 -0.03 -0.21 -0.06 0.11 0.12 0.14 0.1 0.02 -0.34 0.01
0.04 0.5 0.25 0.2 - -0.03 0.73 -0.03 -0.27 -1.52 0.17 0.37
0.24 -0.07 -0.95 0.45 0.05 0.71 -0.22 0.06 -0.39 -0.62 -0.1 0.09
0.09 -0.01 -0.01 0.0 -0.03 0.01 0.16 -0.02 -0.11 -0.11 0.01 0.01
-0.15 -0.23 -0.45 -0.64 0.2 -0.25 0.2 0.23 0.11 0.26 0.57 -0.31
0.16 -0.12 -0.12 -0.06 0.18 0.07 0.05 0.07 0.03 -0.18 -0.15 0.02
0.29 -0.06 0.04 -0.25 0.0 0.35 0.21 -0.18 -0.27 0.01 -0.46 0.09
0.11 0.01 0.05 0.01 -0.03 0.02 0.0 -0.04 -0.07 -0.07 -0.03 0.03
-2.17 0.36 -0.38 -1.98 1.44 1.39 -0.1 0.76 -0.46 - -2.27 -0.83
0.14 -0.07 0.23 -0.13 -0.23 0.31 0.14 0.02 -0.13 -0.45 -0.5 0.38
-0.04 -0.21 -0.0 0.02 0.02 0.07 0.1 -0.22 -0.19 0.12 0.05 0.22
0.37 -0.43 -0.49 -0.26 0.14 -0.84 -0.69 0.23 0.58 0.09 0.59 -0.14
0.11 0.01 -0.07 0.08 -0.06 -0.01 0.21 0.06 -0.09 -0.2 -0.13 0.03
0.9 -0.61 - - -0.25 -0.38 1.0 -0.18 - 1.2 0.25 0.58
-0.0 -0.48 -0.41 0.1 0.12 -0.17 0.04 0.01 0.09 0.13 0.2 0.19
0.18 0.78 -0.03 -0.07 -0.31 -0.79 -0.03 0.0 -0.45 -0.61 0.49 0.08
0.16 0.13 -0.15 -0.09 -0.09 0.07 -0.08 0.05 -0.01 -0.09 0.07 -0.01
0.06 0.02 0.08 -0.1 -0.03 0.24 0.15 0.07 -0.15 -0.05 -0.19 -0.15
0.15 0.31 0.04 -0.14 -0.19 0.33 -0.22 0.29 -0.32 -0.25 -0.16 -0.05
0.04 0.41 -0.14 -0.26 -0.05 0.3 -0.17 0.13 -0.26 -0.4 -0.17 0.3
0.04 0.0 -0.1 -0.0 -0.11 0.03 0.13 0.02 -0.14 -0.01 -0.0 0.13
-0.34 -0.22 0.42 -0.23 -0.56 0.38 1.21 0.39 - -0.37 0.24 -0.73
-0.09 -0.47 -1.23 -0.25 0.54 -1.42 0.31 0.4 0.05 0.19 0.64 -0.07
-1.31 -1.14 -0.28 0.72 -0.04 0.22 0.31 -0.91 0.77 -0.9 0.3 0.38
0.24 -0.1 0.45 - 1.02 0.65 -1.19 -1.09 -0.32 -1.31 0.2 0.73
-0.56 0.38 0.6 0.04 -0.91 -0.17 -0.08 0.07 -0.26 -0.41 -0.19 0.68
-2.05 0.31 0.32 -1.85 - 1.22 -0.24 -0.2 1.43 -0.88 -0.32 -0.15
-0.09 0.0 -0.15 -0.29 0.42 0.39 -0.33 0.03 0.1 -0.41 0.21 -0.16
0.09 -0.22 0.22 -0.15 -0.74 0.73 -0.12 0.05 0.27 -0.96 0.21 -0.11
0.36 -0.04 0.2 -0.2 0.16 0.72 0.09 0.37 -0.14 -1.42 -0.6 -0.6
-1.29 -0.67 -0.67 0.07 -0.17 1.2 -1.51 1.0 0.75 -1.31 0.61 -3.05
0.18 -0.1 -0.06 -0.22 0.23 -0.21 -0.02 -0.06 -0.12 0.09 0.02 0.18
0.45 0.01 0.39 -0.26 0.18 0.74 0.13 0.44 -0.33 -2.17 -0.83 -0.64
0.19 0.35 -0.35 -0.05 -0.26 -0.13 -0.13 0.06 0.01 0.28 -0.46 0.23
0.13 0.11 -0.0 0.07 0.0 0.11 -0.22 -0.18 0.03 -0.21 0.03 0.06
0.51 0.27 -0.26 -0.08 -0.7 0.01 -0.27 0.28 -0.08 -0.12 -0.3 0.33
-0.08 0.07 -0.11 -0.15 -0.17 0.08 0.02 -0.02 0.03 -0.02 0.11 0.18
-0.26 -0.77 0.54 -0.26 0.76 0.22 -0.37 -0.51 0.41 -0.42 0.64 -1.61
-0.11 0.99 -1.48 -1.1 1.42 0.76 -1.54 -1.43 -0.12 - -0.74 0.73
0.01 -0.07 -0.05 -0.06 -0.04 0.14 0.05 0.08 -0.02 -0.03 -0.13 0.11
-0.11 0.1 0.24 -0.38 0.01 1.12 -1.6 -0.27 0.11 - 0.97 -0.6
-0.5 -0.3 -0.09 0.14 -0.11 0.5 0.62 -0.58 -0.19 -0.2 0.37 -0.23
-0.19 -0.4 -0.11 -1.03 0.25 -0.33 0.3 -0.11 0.13 0.31 0.33 0.29
- 0.3 0.21 -0.39 - 1.37 -0.34 0.63 0.85 -0.56 0.14 -1.53
0.03 0.07 0.21 -0.08 -0.34 0.28 -0.13 0.24 -0.21 -0.25 0.12 -0.07
1.52 -0.19 -1.33 -1.19 -2.42 1.73 -1.52 0.44 -2.5 -1.4 -1.77 0.44
0.05 0.08 0.07 -0.01 -0.06 -0.01 0.1 0.03 -0.12 -0.05 -0.03 -0.07
0.12 - -0.68 -1.25 0.13 0.73 0.19 0.36 0.69 0.19 0.37 -0.66
0.07 -1.64 -0.37 -0.19 -0.94 1.24 0.32 -0.53 0.29 -1.06 0.14 0.44
0.35 -3.08 -1.1 0.22 -0.07 -1.15 -0.89 -0.13 1.07 0.11 1.16 -0.5
-1.07 -0.91 -1.21 0.16 0.62 1.14 -0.01 -0.62 0.93 -0.25 -1.69 -0.02
0.1 -0.06 -0.03 -0.2 -0.46 0.26 0.2 -0.03 -0.07 -0.07 0.18 0.04
-0.13 0.01 0.21 -0.29 -0.34 0.07 0.32 0.09 -0.16 -0.03 0.05 0.06
-0.31 -1.17 -2.53 -0.78 0.64 -1.54 0.6 0.18 0.13 0.81 1.05 -0.93
-0.56 0.14 -0.03 -0.24 0.16 0.11 0.1 0.34 -0.37 -0.4 -0.04 0.43
0.0 -0.25 0.14 0.17 0.36 -0.89 0.05 -0.05 -0.05 0.25 0.36 -0.6
-0.38 -0.11 -0.62 0.72 -0.1 0.67 0.13 -1.01 0.1 -1.85 0.5 0.18
0.2 0.4 -0.2 0.19 0.12 0.26 -0.27 -0.1 -0.11 -0.79 0.22 -0.32
-0.38 -0.33 1.1 -0.07 -0.46 0.41 -1.46 -0.27 0.26 -0.22 0.48 -0.64
-0.82 -1.78 0.04 0.84 0.63 -0.13 0.39 - 0.66 0.47 -0.27 -0.39
0.1 -0.07 0.19 -0.01 -0.1 0.06 0.44 0.01 -0.3 -0.07 -0.14 -0.27
0.91 -0.32 -1.16 - 1.23 0.04 0.12 - 0.56 0.33 - 0.75
-0.5 -0.53 -0.47 0.26 -0.2 0.67 0.07 -0.08 0.01 -0.33 0.34 0.22
- - - - - 2.39 0.93 - 1.51 - - 0.98
-0.27 0.11 0.01 0.07 -0.21 0.2 0.22 -0.12 -0.19 0.09 -0.14 0.12
0.24 -0.01 -0.03 -0.28 -0.34 0.31 0.31 -0.16 0.06 -0.61 -0.27 0.41
-0.01 -0.1 0.07 -0.06 0.03 -0.05 -0.12 0.2 -0.11 0.02 0.03 0.07
-0.3 -1.01 -0.43 -0.63 -0.12 -0.11 0.63 -0.03 -0.2 0.66 0.69 -0.21
0.86 - 1.05 - - 0.72 1.85 - -1.01 -1.15 0.95 -
-0.03 0.07 -0.38 -0.32 -0.01 0.36 0.06 0.36 0.02 -0.8 0.0 0.28
0.28 0.45 0.34 -0.64 -0.79 -2.73 0.68 0.31 -0.98 -0.16 0.43 0.25
0.39 -0.13 0.17 -0.22 0.05 0.8 0.21 0.45 -0.11 -1.9 -0.56 -0.7
0.16 0.15 -2.13 -0.32 1.21 0.99 -1.22 0.1 -0.29 -0.65 -0.38 -0.48
0.95 -0.64 0.41 -0.49 -0.12 0.32 0.68 -0.22 -0.54 -0.68 -0.44 -0.51
0.06 -0.07 0.02 -0.05 -0.08 0.17 0.06 -0.03 0.02 -0.02 -0.11 0.01
-0.12 0.33 -0.15 -0.01 -0.18 0.27 -0.45 -0.17 -0.13 0.29 -0.05 0.16
0.34 -0.32 -0.4 -0.2 0.1 0.29 0.32 0.15 -0.13 -0.67 0.22 -0.09
0.31 0.4 -0.06 -0.1 -0.36 -0.12 0.07 0.14 -0.61 -0.1 0.16 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.