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Heatmap: Cluster_80 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.09 0.02 0.07 -0.09 0.06 0.07 0.16 0.07 -0.11 -0.12 -0.24 -0.03
0.09 0.18 -0.15 -0.23 0.08 0.14 0.01 0.22 -0.39 0.11 -0.5 0.23
0.11 -0.0 -0.01 -0.02 0.14 0.09 0.13 0.06 -0.2 -0.08 -0.22 -0.07
0.06 -0.02 0.07 -0.42 0.08 0.05 0.07 0.22 -0.24 0.2 -0.48 0.22
0.07 0.17 0.1 0.06 0.03 -0.01 0.05 -0.0 -0.18 0.01 -0.27 -0.07
0.21 0.09 -0.12 -0.14 0.04 0.12 0.08 0.26 -0.05 -0.14 -0.55 0.04
0.13 0.28 0.3 0.02 0.05 0.11 -0.08 0.17 -0.51 -0.13 -0.61 -0.02
0.12 0.34 0.13 -0.13 0.07 0.1 -0.07 0.04 -0.56 -0.09 -0.2 0.06
0.06 0.08 0.0 -0.15 0.06 0.15 0.11 0.1 -0.15 0.1 -0.25 -0.19
0.04 0.16 0.07 0.1 -0.08 0.01 0.06 0.02 -0.03 -0.05 -0.28 -0.08
0.04 0.14 -0.05 -0.04 0.05 0.19 -0.04 0.11 -0.16 -0.17 -0.3 0.15
0.2 0.13 -0.03 -0.12 -0.01 -0.07 0.08 0.07 -0.28 -0.15 -0.21 0.28
0.01 0.11 0.01 -0.13 0.1 0.1 -0.06 0.21 -0.35 -0.01 -0.22 0.12
0.21 0.1 -0.04 -0.23 -0.0 0.03 0.15 0.08 0.0 -0.03 -0.27 -0.07
0.08 0.04 -0.22 0.06 0.19 0.06 -0.03 0.41 -0.34 -0.03 -0.1 -0.28
0.16 0.33 -0.06 -0.43 0.24 -0.11 0.06 0.49 -0.66 0.31 -0.76 -0.14
0.08 0.41 0.22 -0.31 0.31 0.02 -0.16 0.54 -1.07 0.15 -0.84 -0.16
0.07 0.11 0.03 -0.06 0.09 0.0 0.04 0.1 -0.21 0.06 -0.16 -0.12
0.06 0.02 0.02 -0.11 -0.03 0.03 -0.0 0.14 -0.14 -0.07 -0.12 0.17
0.22 0.12 -0.11 0.03 -0.12 0.08 0.07 0.08 -0.26 -0.07 -0.23 0.1
0.02 -0.1 -0.02 -0.29 -0.04 0.0 0.09 0.19 -0.14 0.15 -0.1 0.16
0.09 0.13 -0.03 0.09 0.08 0.05 0.03 0.03 -0.14 0.09 -0.25 -0.21
0.11 0.27 -0.02 -0.03 -0.06 0.0 0.04 0.1 -0.28 -0.1 -0.23 0.11
0.15 -0.05 0.15 -0.16 -0.01 0.06 0.09 0.24 -0.1 -0.22 -0.25 0.01
0.06 0.09 0.08 -0.11 0.09 0.11 -0.0 0.11 -0.22 -0.09 -0.21 0.05
0.07 0.1 0.04 -0.09 0.03 0.06 0.09 0.06 -0.29 0.07 -0.22 0.03
-0.0 0.08 -0.03 -0.13 -0.03 0.09 0.06 0.18 -0.13 0.06 -0.17 -0.03
-0.05 -0.03 -0.07 -0.12 -0.05 0.14 0.11 0.26 -0.04 0.09 -0.29 -0.03
0.16 0.1 0.05 -0.09 0.11 -0.02 0.09 0.12 -0.19 0.01 -0.32 -0.1
-0.02 0.1 -0.11 -0.09 0.03 0.15 -0.07 0.21 -0.06 0.09 -0.09 -0.19
0.13 0.26 0.07 -0.23 -0.15 0.18 0.34 0.24 -0.4 -0.12 -0.65 0.0
-0.01 0.22 0.0 0.05 -0.01 -0.09 -0.06 0.13 -0.23 -0.01 -0.03 -0.01
0.03 0.22 -0.0 -0.03 -0.03 0.16 0.06 0.16 -0.15 0.03 -0.39 -0.16
0.1 0.13 0.02 0.04 -0.04 0.09 -0.0 0.02 -0.19 -0.04 -0.12 -0.03
0.07 0.04 0.04 -0.26 0.03 0.08 0.06 0.21 -0.25 0.03 -0.34 0.18
0.07 0.04 -0.08 -0.13 0.07 0.01 0.15 0.19 -0.24 0.09 -0.22 -0.01
0.16 0.22 -0.01 0.0 0.11 0.16 -0.05 0.08 -0.31 -0.07 -0.44 -0.01
0.17 0.15 0.08 -0.15 -0.06 0.04 0.02 0.07 -0.17 -0.08 -0.46 0.26
0.18 0.01 0.09 0.02 0.13 0.01 0.13 0.13 -0.27 -0.17 -0.3 -0.06
-0.06 0.07 -0.05 -0.13 -0.13 0.06 0.05 0.25 -0.01 0.07 -0.19 -0.0
0.04 0.24 0.04 -0.02 0.03 0.12 0.03 0.15 -0.22 -0.08 -0.28 -0.12
0.17 0.16 0.09 -0.15 -0.04 0.02 0.12 0.12 -0.22 -0.03 -0.39 0.05
0.09 0.31 0.01 0.0 -0.02 0.13 -0.05 0.34 -0.43 0.04 -0.34 -0.31
0.09 0.22 0.06 0.04 0.0 0.03 0.05 0.17 -0.32 0.06 -0.35 -0.17
0.11 0.09 -0.03 0.01 -0.01 0.03 0.08 0.03 -0.16 -0.07 -0.16 0.06
0.18 0.12 0.06 -0.0 -0.03 -0.01 0.05 0.06 -0.18 0.03 -0.36 0.01
0.2 0.19 0.2 -0.02 -0.02 -0.08 0.04 0.08 -0.33 -0.07 -0.43 0.1
0.2 0.14 0.05 -0.05 0.08 0.02 0.12 0.05 -0.3 -0.02 -0.37 -0.03
-0.06 -0.16 -0.12 0.08 0.02 0.09 0.17 0.29 -0.19 -0.09 -0.24 0.11
0.18 0.0 0.06 -0.13 0.11 -0.02 0.08 0.1 -0.36 0.11 -0.25 0.03
0.21 0.16 -0.07 0.08 0.11 0.17 -0.03 0.1 -0.24 -0.29 -0.24 -0.08
0.07 0.22 -0.01 -0.09 0.04 0.11 0.06 0.03 -0.28 -0.04 -0.28 0.08
0.04 0.28 0.0 0.14 0.01 -0.11 0.09 0.11 -0.13 -0.08 -0.38 -0.08
-0.03 0.06 0.01 0.14 0.15 -0.22 0.11 0.11 -0.28 0.03 -0.17 0.01
0.24 0.36 0.09 -0.19 0.06 -0.04 0.08 0.03 -0.34 -0.14 -0.24 -0.04
0.1 0.03 0.16 -0.15 0.02 -0.0 0.09 0.11 -0.33 0.0 -0.35 0.2
0.15 0.27 -0.19 -0.83 -0.04 -0.16 -0.1 0.21 -0.2 0.39 -0.43 0.45
0.15 0.26 0.1 -0.17 0.04 0.02 0.04 0.18 -0.58 -0.04 -0.37 0.15
0.31 0.23 -0.06 -0.2 -0.1 0.13 0.03 0.29 -0.21 -0.23 -0.19 -0.16
0.12 0.34 0.05 -0.02 0.08 -0.04 -0.04 0.07 -0.37 -0.04 -0.31 0.02
0.4 1.0 0.66 1.11 -0.71 - - 0.23 -0.99 0.09 0.13 -0.99
0.05 0.09 -0.01 -0.04 0.05 0.01 -0.0 -0.05 -0.02 0.02 -0.11 -0.02
-0.05 0.37 0.18 0.3 0.26 -0.32 -0.42 0.19 -0.21 -0.13 0.04 -0.56
0.15 0.05 -0.06 -0.21 -0.07 -0.08 0.15 0.16 -0.09 0.16 -0.46 0.16
0.23 0.37 0.17 -0.03 -0.06 0.0 0.02 0.03 -0.52 -0.1 -0.54 0.15
0.16 0.2 0.14 -0.11 -0.02 0.05 0.06 0.04 -0.39 0.01 -0.32 0.06
0.17 0.08 0.03 -0.05 0.03 0.11 0.02 0.07 -0.15 -0.01 -0.25 -0.09
0.06 0.16 0.05 -0.02 -0.0 0.06 0.06 0.03 -0.16 -0.05 -0.34 0.09
0.06 0.04 0.1 -0.04 0.12 0.04 0.04 0.1 -0.32 0.04 -0.26 0.0
0.25 0.28 0.08 0.08 -0.01 -0.02 0.12 0.04 -0.54 -0.1 -0.44 0.03
0.18 0.13 -0.17 -0.03 0.15 0.15 -0.18 0.49 -0.25 0.06 -0.34 -0.47
0.31 0.19 0.03 -0.18 -0.16 -0.03 0.03 0.1 -0.36 0.02 -0.28 0.18
0.01 0.11 0.04 -0.03 0.09 0.04 -0.16 0.18 -0.18 0.05 -0.11 -0.07
0.15 0.03 0.14 0.0 0.03 -0.03 0.04 0.08 -0.25 -0.03 -0.32 0.1
0.2 0.09 -0.04 -0.11 0.07 -0.04 0.05 0.4 -0.45 0.09 -0.5 0.0
0.04 0.09 -0.1 -0.16 0.19 0.1 0.05 0.07 -0.29 0.15 -0.19 -0.03
0.03 0.19 0.02 -0.15 0.15 0.04 -0.05 0.19 -0.06 -0.0 -0.3 -0.14
0.12 0.21 0.01 -0.0 0.05 -0.2 0.05 0.05 -0.23 0.03 -0.21 0.05
0.07 0.16 0.01 0.03 -0.03 -0.07 0.09 0.29 -0.32 -0.07 -0.02 -0.24
0.08 0.08 -0.0 -0.09 0.02 0.03 0.04 0.1 -0.08 0.09 -0.2 -0.12
0.16 0.19 0.1 -0.44 0.15 0.04 0.14 0.1 -0.41 0.14 -0.43 0.04
0.04 0.16 0.04 -0.02 -0.04 0.03 -0.1 0.22 -0.38 0.09 -0.21 0.06
0.12 0.22 0.18 -0.03 0.11 -0.1 -0.0 0.08 -0.3 -0.07 -0.34 0.03
0.23 0.2 0.16 -0.19 0.01 -0.03 -0.04 0.17 -0.3 -0.21 -0.4 0.23
0.1 -0.03 0.04 -0.14 -0.09 0.14 0.05 0.13 -0.17 -0.06 -0.15 0.13
0.11 0.21 -0.02 -0.12 0.12 0.04 0.02 0.03 -0.08 0.19 -0.29 -0.31
0.13 0.17 0.0 -0.09 -0.03 0.28 0.1 0.15 -0.28 -0.05 -0.34 -0.17
0.08 0.12 0.08 0.01 0.02 0.06 0.05 -0.06 -0.19 0.02 -0.26 0.01
0.09 0.22 0.05 -0.11 0.07 0.01 -0.09 0.11 -0.34 0.14 0.02 -0.29
0.01 0.27 -0.07 -0.23 0.1 0.1 -0.14 0.24 -0.0 0.05 -0.26 -0.16
0.11 0.21 -0.1 0.01 -0.01 -0.04 0.04 0.09 -0.08 -0.0 -0.27 -0.02
0.15 0.29 0.03 -0.18 -0.02 0.03 0.12 -0.06 -0.25 -0.05 -0.36 0.18
0.07 0.07 0.04 -0.23 0.06 0.09 0.13 0.16 -0.33 -0.04 -0.25 0.12
-0.02 0.21 0.23 -0.03 0.09 -0.14 -0.01 0.05 -0.24 -0.18 -0.26 0.18
0.03 0.16 0.05 0.01 0.02 -0.01 0.07 0.11 -0.15 -0.01 -0.2 -0.13
0.01 0.19 -0.02 -0.15 0.13 -0.02 0.17 0.27 -0.44 -0.04 -0.36 0.11
0.11 0.06 0.07 -0.12 -0.01 -0.02 0.13 0.11 -0.21 -0.01 -0.26 0.07
0.18 0.26 0.2 -0.09 -0.0 -0.13 0.02 0.08 -0.4 0.05 -0.39 0.05
0.14 0.17 -0.03 -0.2 0.04 0.05 0.2 0.02 -0.08 -0.13 -0.22 -0.02
0.08 -0.04 0.03 -0.13 -0.03 -0.04 0.14 0.27 -0.29 0.11 -0.21 0.02
-0.0 -0.03 0.17 -0.01 -0.01 0.23 0.09 0.18 -0.48 -0.07 -0.56 0.27
0.17 0.12 0.08 -0.04 -0.02 0.03 0.03 0.02 -0.12 -0.07 -0.29 0.02
0.14 0.06 0.01 -0.08 0.04 0.03 0.06 -0.02 -0.07 0.07 -0.21 -0.06
0.15 0.27 0.12 -0.09 -0.06 0.01 0.02 0.24 -0.42 -0.02 -0.57 0.13
0.13 0.18 0.06 -0.18 0.1 0.1 -0.02 0.04 -0.13 0.07 -0.33 -0.11
0.1 0.15 0.08 -0.09 -0.0 0.02 -0.01 0.1 -0.27 -0.17 -0.27 0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.