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Heatmap: Cluster_56 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- 2.08 - - - 2.03 - - 1.88 - - -
-0.16 -0.46 0.49 0.5 0.91 0.36 -0.2 0.44 -2.39 -0.81 0.03 -1.4
- - - - - - - 2.32 0.87 - 2.37 -
-0.01 -0.17 0.03 0.32 0.3 -0.11 -0.15 -0.76 0.16 -0.1 0.22 -0.01
-0.02 0.1 0.29 0.59 -0.21 0.27 -0.22 -0.4 -0.23 -0.07 -0.41 -0.05
-0.19 -0.14 0.13 0.02 -0.25 0.45 -0.01 0.14 -0.09 -0.13 -0.13 0.06
- - - - - - - 2.92 - - 2.15 -
-0.23 -0.0 0.44 0.58 -0.18 -0.37 -0.64 -0.7 0.03 0.37 -0.2 0.27
-1.12 0.72 -0.28 0.44 -1.67 0.84 0.1 - 0.8 -1.68 -2.17 1.18
-0.41 0.21 -0.69 0.36 0.6 0.09 -0.49 0.19 -0.5 0.35 -0.37 -0.0
0.23 0.24 -0.2 0.3 -0.07 -0.6 0.16 -0.04 -0.47 0.13 -0.29 0.28
-0.07 -0.0 0.08 0.02 0.35 0.02 0.03 -0.14 -0.21 -0.07 -0.0 -0.07
-0.85 0.08 0.55 0.22 -0.65 0.22 0.26 -1.14 0.45 0.06 -0.58 0.3
-0.15 -0.24 0.07 0.2 0.12 0.09 0.09 -0.14 -0.08 -0.15 0.14 -0.03
-0.0 -0.23 -0.05 -0.05 0.07 0.17 0.07 0.22 -0.19 -0.3 0.13 0.07
-0.08 -0.05 0.02 0.48 0.37 -0.29 0.12 -0.18 -0.73 0.12 -0.09 -0.05
-0.04 -0.07 0.19 -0.07 -0.24 0.05 -0.13 0.15 0.09 -0.11 -0.15 0.26
-0.07 -0.26 0.02 0.18 0.04 0.09 -0.05 -0.18 -0.02 0.04 0.1 0.07
-0.17 -0.03 -0.06 0.25 -0.16 0.12 -0.27 -0.17 0.14 0.43 -0.41 0.1
0.06 -0.12 0.45 0.54 0.05 -0.36 -0.41 -0.05 -0.42 -0.17 -0.05 0.11
-0.05 0.17 -0.11 -0.05 -0.19 -0.06 -0.18 -0.08 0.03 -0.1 0.35 0.16
-0.42 -0.02 0.38 -0.55 -0.48 -0.02 -0.44 0.48 0.44 0.47 -0.61 0.06
-0.88 0.7 -0.77 0.63 0.07 0.38 -0.2 0.06 -1.02 -0.0 -0.21 0.1
-0.47 -0.3 0.05 -0.08 0.08 0.45 0.37 -0.1 0.26 -0.76 -0.07 0.14
0.18 0.09 -0.36 0.23 0.24 -0.02 -0.38 0.43 -0.28 0.02 0.15 -0.7
-0.32 0.59 -0.01 0.45 0.08 0.31 -0.24 -0.09 -0.18 -0.55 0.08 -0.68
0.03 0.1 -0.68 0.44 0.37 0.17 -0.65 0.28 -0.41 0.38 -0.15 -0.53
-0.37 -0.32 0.07 0.2 0.44 0.42 -0.0 -0.12 0.13 -0.31 0.03 -0.52
0.28 0.18 -0.84 0.43 0.68 -1.72 -0.34 -1.79 0.63 0.46 0.37 -0.87
-0.17 0.05 -0.19 0.26 -0.04 -0.04 0.01 0.1 -0.09 -0.01 0.01 0.05
-0.73 -0.64 0.46 0.52 0.22 -0.37 -0.42 0.4 -1.04 0.33 -0.51 0.57
-0.67 -0.65 0.37 0.97 0.64 -0.45 0.48 -0.72 -0.24 -0.32 -0.24 -0.52
0.32 0.25 -0.18 -0.09 0.07 -0.2 0.23 -0.07 -0.21 -0.4 -0.13 0.23
- 1.57 - 1.82 0.97 0.8 - - - 0.85 - -
-0.33 -0.08 -0.44 -0.17 0.32 -0.28 -0.51 -0.05 -0.13 0.33 0.35 0.54
-0.36 -0.07 -0.11 0.26 -0.14 0.16 0.09 0.04 0.24 0.21 -0.23 -0.25
0.18 -1.38 -0.39 -0.65 0.82 -2.88 -1.85 0.7 -0.16 0.3 1.11 0.0
0.3 -0.48 0.26 0.46 0.11 -0.0 -0.59 -0.46 0.03 0.14 -0.28 0.09
0.05 0.11 -0.04 0.14 0.02 -0.03 -0.16 -0.13 -0.09 -0.07 -0.05 0.19
-0.07 -0.27 0.02 0.44 0.31 -0.07 0.18 -0.44 -0.46 0.18 0.02 -0.12
0.64 -1.87 -0.89 1.28 0.95 0.4 0.43 0.42 - -1.13 -0.32 -
- 1.11 - - 0.58 1.19 - - 0.97 0.21 -0.63 1.19
0.31 -0.02 0.02 0.16 0.42 -0.14 -0.0 0.04 -0.37 0.01 -0.29 -0.37
-0.01 0.04 -0.04 0.2 0.33 0.15 -0.02 -0.16 0.02 -0.18 -0.23 -0.2
-0.16 0.05 0.03 0.21 0.1 -0.03 0.03 -0.28 -0.08 0.15 0.07 -0.17
-1.59 0.03 0.24 0.53 0.16 1.21 -0.14 0.19 0.47 -2.03 -0.89 -1.44
-0.35 0.02 -0.04 0.08 -0.08 0.06 -0.21 -0.14 0.34 0.39 -0.33 0.07
-0.49 -0.45 0.4 0.42 0.85 -0.38 -0.97 -1.19 0.14 -0.19 0.55 -0.09
-0.2 0.11 0.02 0.09 -0.05 0.12 -0.08 -0.01 0.19 0.08 -0.12 -0.21
- -0.99 -2.7 -0.07 -0.59 -2.63 0.12 1.52 -0.07 0.13 1.07 0.55
-0.77 0.29 0.3 0.24 0.09 0.51 -0.11 0.01 -0.04 -0.58 -0.29 -0.16
-0.6 0.13 -0.13 0.53 -0.17 -0.18 -0.35 0.29 -1.33 0.21 -0.52 0.89
0.21 -0.21 -0.0 0.7 0.05 -0.57 -0.81 -0.05 -0.34 -0.13 0.36 0.17
0.41 -1.16 0.14 -2.16 -0.49 1.31 0.58 -0.29 -0.77 0.2 -1.83 0.45
-0.17 -0.36 0.09 0.76 -0.68 0.24 0.02 -0.92 -0.17 -0.35 0.41 0.29
-0.17 0.43 -1.2 -0.16 0.16 -0.09 -0.15 0.08 0.26 0.22 -0.29 0.31
-0.17 -0.27 -0.03 0.32 0.68 0.35 -0.18 -0.18 -0.22 -0.14 -0.29 -0.3
-0.39 0.08 -0.07 0.17 -0.13 0.18 -0.35 0.01 -0.0 0.54 -0.48 0.13
-2.07 0.11 0.47 0.84 -0.7 -0.09 0.52 -0.13 -0.68 -0.52 0.31 0.06
-0.35 0.16 -0.17 -0.11 0.3 -0.37 -0.79 0.01 -0.43 0.37 0.52 0.29
-0.5 -0.16 0.03 0.49 0.27 -0.32 0.06 -0.42 0.12 0.35 -0.04 -0.26
0.34 0.07 -0.25 0.19 -0.05 -0.16 -0.01 -0.1 -0.2 -1.01 -0.08 0.68
-0.94 0.26 -0.18 0.06 -0.08 0.01 -0.23 0.35 0.82 0.1 -1.05 -0.06
-0.06 -0.52 -0.13 0.43 0.8 0.77 0.13 0.4 -1.4 -0.8 -0.11 -1.57
-0.2 -0.05 0.17 -0.05 -0.05 0.28 -0.09 0.22 0.15 -0.11 -0.01 -0.4
-1.12 0.36 - -0.85 0.84 - - 1.31 - -1.05 1.59 0.96
-0.18 -0.27 0.01 0.28 -0.27 -0.08 -0.36 0.12 -0.09 0.53 0.05 -0.01
0.07 -0.43 0.25 -0.12 0.18 -0.02 -0.02 -0.28 -0.05 0.06 0.14 0.08
-0.15 0.08 -0.44 0.4 0.14 -0.13 -0.68 0.45 0.11 0.06 0.21 -0.54
-1.3 -0.15 0.02 0.82 0.93 -0.55 0.12 0.13 -0.27 0.27 -0.53 -1.24
-0.59 0.1 0.07 0.37 -0.2 -0.07 -0.06 0.11 -0.28 0.09 0.03 0.21
-0.26 -0.48 0.06 0.28 0.07 -0.05 -0.67 -0.17 -0.34 0.34 0.5 0.24
-0.1 0.27 -0.38 0.33 0.3 -0.29 0.09 0.03 -0.26 0.09 -0.15 -0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.