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Heatmap: Cluster_253 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.23 -0.46 0.08 0.3 -0.04 0.06 0.06 0.29 -0.28 -0.06 0.06 0.03
-0.53 -1.17 0.29 0.81 -0.37 -0.04 -1.04 1.35 -2.94 0.8 0.14 -2.83
-0.06 -0.07 -0.13 -0.12 0.09 -0.1 -0.01 -0.05 -0.1 0.11 0.08 0.3
-0.13 -0.29 -0.47 0.19 -0.26 0.01 0.46 0.03 0.25 -0.08 -0.16 0.19
-0.22 0.36 0.16 0.72 0.68 -0.73 -0.43 0.14 0.06 -0.8 -1.21 0.01
-0.21 -0.3 -0.31 0.36 0.24 -0.9 -0.39 0.02 -0.17 0.41 -0.17 0.69
-0.88 0.37 0.22 0.88 0.46 -0.35 0.41 -0.26 -0.88 0.19 -0.47 -1.25
0.08 -0.07 0.07 0.07 0.06 -0.05 0.08 0.14 -0.05 -0.32 -0.16 0.1
-0.06 -0.12 -0.03 -0.13 0.03 0.15 0.06 0.13 -0.16 0.16 -0.1 0.02
0.11 -0.33 -0.08 0.12 -0.01 0.05 -0.02 0.04 0.04 -0.08 0.01 0.1
-0.08 -0.21 -0.07 0.1 0.14 -0.03 0.08 0.04 -0.15 0.06 -0.02 0.1
0.09 -0.21 -0.07 0.05 -0.05 0.18 0.24 0.15 -0.09 -0.17 -0.49 0.2
-0.03 0.12 -0.12 0.19 0.13 -0.02 -0.24 -0.13 0.06 -0.04 -0.28 0.25
0.02 -0.04 -0.02 0.04 0.13 -0.32 0.01 -0.07 0.05 0.07 0.06 0.02
0.12 -0.0 -0.07 0.27 0.23 -0.03 0.07 -0.53 -0.08 -0.16 -0.16 0.17
0.03 -0.13 0.02 0.08 0.0 0.01 0.07 -0.03 -0.18 -0.06 0.02 0.15
-0.16 -0.56 0.05 -0.01 0.06 0.02 0.35 0.34 -0.09 -0.16 0.03 -0.08
-0.42 0.1 0.67 0.33 0.26 -0.25 0.18 0.15 -0.88 -0.49 -0.12 -0.21
-0.08 -0.03 0.03 0.07 -0.01 -0.23 -0.02 -0.11 0.12 0.09 0.04 0.07
-0.08 0.12 0.15 0.19 -0.08 0.14 -0.09 0.04 -0.26 -0.09 -0.14 0.02
- -0.04 -1.14 0.72 1.72 -1.02 1.45 0.61 -1.27 - - -1.06
- -1.18 -0.35 -1.31 - 1.43 1.85 -0.54 -1.58 -0.52 0.4 0.03
-0.01 -0.13 -0.03 0.19 0.06 -0.14 0.12 -0.05 0.09 -0.07 -0.14 0.05
0.1 -0.37 0.04 0.37 0.04 -0.28 0.25 -0.06 0.03 -0.43 -0.27 0.31
-2.85 -0.01 -0.46 -1.12 1.29 0.1 0.35 0.82 -0.19 0.32 -0.37 -2.1
0.04 -0.03 0.09 -0.02 -0.05 0.04 0.09 -0.08 -0.02 0.04 -0.29 0.14
-0.1 -0.46 0.07 0.09 0.41 -0.24 0.0 0.0 -0.05 -0.01 0.14 -0.03
-0.37 -0.19 -0.18 0.04 0.27 0.09 0.35 0.23 -0.35 -0.07 -0.36 0.28
-0.13 0.12 -0.1 0.3 0.48 -0.21 0.18 -0.13 -0.21 0.01 -0.21 -0.34
0.03 -0.19 0.03 0.0 -0.12 0.03 0.02 0.14 0.0 -0.09 0.05 0.07
-0.03 -0.03 -0.04 -0.0 0.04 -0.34 0.21 0.08 -0.05 0.24 -0.14 -0.02
-0.1 0.12 -0.2 0.04 0.16 -0.07 -0.1 -0.16 0.12 0.1 -0.09 0.11
-0.32 0.02 -0.13 0.27 0.05 0.13 0.2 -0.2 -0.06 -0.05 -0.03 0.01
- - - 1.5 1.6 -0.05 1.28 - - -0.07 - 0.84
-1.23 -1.58 0.76 0.91 0.53 -1.3 -0.57 0.91 -0.0 -0.51 -0.82 0.01
-0.24 0.12 -0.16 0.1 0.23 0.02 -0.05 0.01 -0.08 -0.07 -0.08 0.12
-0.11 -0.29 -0.43 0.19 0.97 0.2 0.18 -1.02 -0.78 0.43 0.32 -1.12
-1.34 0.92 0.82 1.46 -0.34 -1.06 1.13 - - - 0.39 -1.22
-0.17 -0.13 0.02 0.11 0.02 0.05 0.33 -0.07 -0.05 -0.07 -0.2 0.06
-0.3 -0.02 -0.0 0.15 0.34 0.02 0.09 -0.09 0.01 -0.11 -0.16 -0.04
-0.03 -0.17 -0.16 -0.02 0.09 0.1 0.21 0.16 -0.23 -0.06 -0.17 0.18
-0.08 0.08 -0.11 0.03 0.08 -0.14 -0.15 -0.08 0.09 0.08 0.12 0.04
0.27 -0.17 -0.09 0.37 -0.14 -0.51 0.16 -0.08 0.04 -0.28 0.1 0.12
-0.87 0.25 - 1.77 1.55 -0.59 0.74 - -0.84 - 0.04 -
- - - - 2.77 - 1.44 1.31 - - - -
-0.01 0.3 -0.26 0.31 0.02 -0.11 -0.34 0.03 -0.1 -0.08 -0.13 0.21
-0.24 -0.21 0.04 -0.02 0.01 -0.08 0.09 -0.1 0.24 0.05 -0.04 0.17
-0.24 -0.36 -0.32 -0.11 0.43 -0.09 0.16 -0.17 0.43 -0.02 -0.15 0.17
-0.01 -0.49 0.04 0.33 0.29 -0.04 0.25 0.06 -0.17 -0.16 -0.29 -0.02
-0.12 -0.26 -0.0 0.25 0.27 -0.27 0.49 -0.61 -0.18 -0.37 0.26 0.13
-0.13 -0.2 -0.04 -0.02 -0.08 0.03 0.29 -0.15 0.14 0.07 -0.18 0.18
0.08 -0.03 0.07 -0.06 -0.01 -0.12 -0.18 -0.07 -0.11 0.04 0.1 0.24
-0.12 0.0 -0.12 0.24 0.21 0.08 0.25 0.12 0.04 -0.12 -0.41 -0.34
0.11 -0.12 0.0 -0.02 -0.03 0.06 0.17 0.03 -0.15 -0.38 0.06 0.16
-0.05 -0.29 -0.03 0.29 -0.19 -0.12 0.27 -0.16 0.12 -0.21 -0.16 0.35
1.46 - -0.66 1.58 - - 0.49 -0.84 0.21 - 0.91 -0.69
-1.3 0.04 -0.5 0.36 0.4 0.0 0.11 0.46 -0.28 0.24 0.11 -0.5
0.11 -0.13 -0.2 0.45 0.46 -0.24 0.17 -0.24 -0.14 -0.35 -0.47 0.22
-0.21 -0.05 0.2 0.28 0.05 0.15 -0.04 0.26 -0.36 -0.24 -0.1 -0.09
-0.09 -0.7 -0.36 0.83 0.8 -0.93 0.1 0.02 0.66 -1.03 -0.78 -0.18
-0.19 -0.32 0.09 0.25 -0.02 -0.05 -0.19 0.21 -0.21 0.18 0.01 0.12
-0.1 -0.65 -0.04 0.17 0.39 -0.18 0.53 -0.56 0.1 -0.24 -0.05 0.18
-0.4 - -1.22 1.08 0.91 0.51 1.14 0.28 -0.76 -2.39 -1.47 -0.25
-0.02 -0.01 -0.01 0.05 0.09 -0.03 -0.03 -0.13 0.03 -0.09 -0.04 0.16
0.09 -0.39 0.0 -0.02 -0.22 0.06 0.43 -0.11 0.04 0.04 -0.49 0.32
-0.23 -0.06 0.05 0.3 0.01 -0.42 -0.14 -0.03 -0.01 0.18 -0.05 0.26
-0.01 -0.17 0.08 -0.08 0.03 0.02 -0.14 0.14 -0.01 0.09 -0.3 0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.