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Heatmap: Cluster_63 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.13 -0.56 -0.48 0.25 -0.61 -0.56 -0.3 -0.77 0.3 0.59 0.84 0.33
-0.16 -0.26 -0.55 -0.76 -0.35 -0.23 -0.47 0.08 -0.11 0.31 0.9 0.62
0.09 -0.44 -0.43 -0.5 -0.55 -0.86 -0.97 -0.6 0.09 -0.17 1.15 1.12
-0.41 -1.01 -3.5 -0.12 -0.53 -1.85 -0.85 -1.49 -0.55 0.64 1.63 1.34
-0.26 -0.46 -0.76 -0.36 -1.25 -0.27 -0.26 -0.32 0.25 0.56 0.98 0.63
-0.09 -0.41 -0.35 -0.05 -0.23 -0.44 -0.27 -0.33 0.15 0.46 0.64 0.38
0.09 -0.23 -0.2 -0.17 -0.34 -0.25 -0.29 -0.27 0.12 0.15 0.56 0.45
-0.18 -0.31 0.0 -0.69 -0.23 -0.88 -0.01 -0.44 0.36 0.34 0.28 0.85
-0.13 -0.58 -0.26 -0.23 -0.29 -0.28 0.19 -0.43 0.17 0.25 0.38 0.66
0.27 -0.23 -0.44 -0.26 -0.58 -0.43 -0.83 -0.98 -0.09 0.05 0.89 1.04
0.39 -0.18 -0.41 -0.33 -0.15 -0.76 -0.64 -0.92 -0.06 0.01 0.79 0.93
0.17 -0.21 -0.23 0.01 -0.16 -0.48 -0.48 -0.61 -0.03 0.05 0.59 0.72
-0.14 -0.03 -0.0 0.04 -0.18 -0.07 0.05 -0.11 0.25 -0.22 0.21 0.12
0.2 -0.04 -0.22 -0.04 -0.32 -0.44 -0.35 -0.43 0.05 0.16 0.53 0.46
-0.46 -0.07 -1.48 -0.46 -0.37 0.29 -0.79 -0.13 -0.72 0.29 0.99 0.94
-0.08 -0.13 -0.07 -0.02 -0.12 -0.16 -0.03 -0.14 0.19 0.1 0.18 0.22
-0.12 -0.37 -0.62 -0.68 -0.46 -0.67 -0.43 -0.26 0.37 0.36 0.82 0.81
0.04 -0.42 -0.42 -0.08 -0.55 -0.69 -0.88 -0.69 -0.41 0.65 1.09 0.69
0.26 -0.61 -0.44 -0.23 -0.44 -0.5 -0.36 -0.39 -0.02 0.47 0.62 0.73
-0.02 0.01 -0.29 -0.07 -0.39 -0.53 -0.03 -0.37 0.3 0.23 0.39 0.4
-0.14 0.01 -0.29 -0.16 -0.85 -0.68 -0.32 -0.63 0.42 0.37 0.66 0.61
-0.04 -0.08 0.0 0.01 -0.26 -0.26 -0.01 -0.01 0.1 0.02 0.12 0.32
-0.12 -0.31 -0.17 0.11 -0.03 -0.17 -0.19 -0.0 0.04 -0.04 0.34 0.38
0.08 -0.41 -0.29 -0.2 -0.56 -0.3 -0.02 -0.36 0.48 0.45 0.24 0.39
0.03 -0.57 -0.75 -0.38 -0.45 -0.21 -0.41 -0.3 -0.04 0.48 0.93 0.6
-0.13 -0.97 -1.05 -0.21 -0.88 -0.9 -1.27 -1.06 0.6 -0.33 1.51 1.07
0.01 -0.05 -0.15 -0.06 -0.28 -0.09 -0.03 -0.1 0.17 0.09 0.13 0.28
-0.08 -0.24 -0.24 -0.16 -0.3 -0.2 -0.12 -0.19 0.31 0.21 0.36 0.4
-0.16 -0.22 -0.12 -0.32 -0.25 -0.37 -0.16 -0.31 0.42 0.18 0.26 0.62
-0.13 -0.04 -0.05 0.08 -0.1 -0.17 -0.09 -0.1 0.25 -0.01 0.16 0.13
-0.07 -0.05 -0.11 -0.04 -0.18 -0.26 -0.16 -0.24 0.29 0.17 0.25 0.24
0.17 -0.2 -0.25 -0.18 -0.43 -0.38 -0.11 -0.25 0.12 0.19 0.29 0.62
-0.22 -0.3 -0.26 -0.15 -0.31 -0.22 -0.28 -0.22 0.23 0.25 0.49 0.56
0.1 -0.81 -1.2 -0.66 -0.34 -0.42 -0.4 -0.23 0.31 0.35 1.3 0.21
-0.02 -0.45 -1.0 -0.48 -0.51 -0.22 -0.55 -0.14 0.43 0.28 1.1 0.26
-0.09 -0.1 -0.22 -0.07 -0.82 -0.58 -0.26 -0.55 0.4 0.32 0.62 0.55
-0.02 -0.98 -1.47 0.02 -0.29 -0.59 -0.47 -0.48 0.34 -0.06 1.39 0.45
0.07 -0.16 -0.35 -0.09 -0.37 -0.23 0.02 -0.49 0.25 0.04 0.34 0.58
0.11 -0.47 -0.42 -0.28 -0.34 -0.54 -0.17 -0.53 0.37 0.62 0.46 0.45
-0.24 -0.18 -0.37 -0.28 -0.6 -0.33 -0.1 -0.31 0.4 0.25 0.37 0.74
0.05 -0.24 -0.2 0.07 -0.16 -0.31 -0.24 -0.42 0.08 0.35 0.31 0.43
0.08 -0.67 -0.44 -0.38 -0.77 -0.36 -0.01 -0.28 0.37 0.14 0.51 0.84
-0.01 -0.32 -0.34 -0.13 -0.45 -0.55 -0.01 -0.21 0.51 0.05 0.4 0.52
0.14 -0.05 -0.3 -0.21 -0.37 -0.31 -0.15 -0.16 0.18 0.28 0.27 0.4
-0.11 -0.65 -0.97 -1.14 -1.14 -1.23 -1.98 -1.77 -0.61 0.7 1.49 1.57
0.0 -0.4 -0.3 -0.23 -0.59 -0.41 -0.14 -0.24 0.35 0.3 0.39 0.66
-0.05 -0.17 -0.11 -0.25 -0.66 -0.12 -0.05 -0.11 -0.05 0.2 0.47 0.52
0.09 -0.16 -0.2 -0.14 -0.32 -0.44 -0.19 -0.3 0.28 0.17 0.48 0.38
-0.19 -0.03 -0.24 -0.16 -0.54 -0.44 0.04 -0.15 0.37 0.26 0.22 0.48
-0.07 -0.17 -0.19 -0.05 -0.18 -0.13 -0.05 -0.05 0.28 0.11 0.14 0.27
0.01 -0.05 -0.09 0.03 -0.27 -0.19 -0.04 -0.17 0.18 -0.0 0.24 0.25
-0.03 -0.34 -0.0 0.02 0.04 -0.27 -0.26 -0.28 0.05 0.31 0.34 0.21
-0.64 -1.25 -0.19 -0.03 -0.17 -0.47 -0.81 -0.38 0.05 0.42 1.21 0.55
-0.15 -0.29 -0.18 -0.16 -0.21 -0.17 0.01 -0.18 0.24 0.13 0.29 0.46
0.15 -0.12 -0.06 -0.18 -0.4 -0.8 -0.34 -0.4 0.19 0.35 0.46 0.55
0.06 -0.18 -0.07 -0.05 -0.33 -0.22 0.04 -0.17 0.32 0.0 0.15 0.29
0.03 -0.14 -0.19 -0.09 -0.27 -0.18 0.01 -0.12 0.15 0.08 0.18 0.39
0.11 -0.02 -0.23 -0.16 -0.5 -0.34 -0.06 -0.18 0.28 0.25 0.2 0.38
0.12 -0.08 -0.21 -0.05 -0.34 -0.22 -0.06 -0.2 0.26 0.11 0.24 0.26
-0.27 -0.63 -0.6 -2.37 0.05 -1.14 -1.33 -0.27 -0.12 0.15 1.54 1.01
0.0 -0.12 -0.42 -1.11 -0.61 -1.47 -0.11 -0.19 -0.04 0.49 1.08 0.64
0.03 -0.15 -0.15 -0.03 -0.2 -0.12 -0.08 -0.07 0.15 0.1 0.18 0.25
0.09 -0.1 -0.08 -0.04 -0.36 -0.2 -0.13 -0.08 0.19 0.2 0.16 0.21
0.0 -0.36 -0.2 -0.14 -0.3 -0.15 -0.11 -0.14 0.31 0.2 0.24 0.39
-0.11 -0.33 -0.13 -0.19 -0.2 -0.16 -0.0 -0.03 0.35 0.2 0.16 0.26
-0.19 -0.47 -0.46 -0.25 -0.02 -0.47 -0.79 -0.32 -0.28 0.35 1.07 0.63
0.43 -0.67 -0.54 -0.15 -0.42 -0.91 -0.69 -1.25 0.01 0.25 1.14 0.78
-0.32 -0.67 -0.87 -0.25 -0.38 -0.22 -0.28 -0.18 0.24 0.67 0.99 0.14
-0.29 -0.33 -1.13 -0.28 -0.02 0.01 -1.05 -0.58 0.01 0.52 1.31 0.05
0.11 -0.09 -0.14 -0.16 -0.2 -0.82 -0.32 -0.49 -0.06 0.25 0.59 0.65
0.08 -0.74 -0.44 -0.17 -0.24 -0.71 -0.36 -0.79 0.07 0.14 0.91 0.92
0.03 -0.12 -0.12 -0.07 -0.08 -0.06 -0.05 -0.08 0.11 0.06 0.14 0.19
-0.11 -0.25 -0.22 -0.04 -0.29 -0.06 -0.06 -0.03 0.25 0.18 0.27 0.2
-0.06 -0.22 -0.21 -0.11 -0.4 -0.25 -0.03 -0.14 0.28 0.24 0.2 0.45
0.08 0.06 -0.19 -0.05 -0.63 0.0 -0.44 -0.36 0.08 0.19 0.53 0.33
0.11 -0.43 -0.44 -0.58 -0.58 -0.38 -0.17 -0.07 0.26 0.51 0.63 0.4
-0.18 -0.36 -0.34 -0.13 -0.42 -0.2 -0.18 0.1 0.23 0.35 0.54 0.21
0.05 -0.49 -0.37 0.16 -0.16 -0.67 -0.43 -0.99 0.18 0.19 0.8 0.67
0.13 -0.02 0.11 -0.06 -0.09 -0.33 -0.16 -0.24 0.09 -0.01 0.19 0.27
0.2 -0.4 -0.53 -0.19 -0.25 -0.75 -0.46 -0.45 -0.06 0.57 0.52 0.8
-0.07 -0.42 -0.19 -0.04 -0.16 -0.17 -0.01 -0.28 0.07 0.17 0.44 0.4
0.14 0.08 -0.12 -0.32 -0.31 -0.2 -0.41 -0.3 -0.24 0.17 0.65 0.42
0.09 -0.21 -0.14 -0.07 -0.37 -0.13 -0.18 -0.24 0.28 0.17 0.2 0.39
-0.07 -0.06 -0.15 -0.26 -0.23 -0.29 0.06 -0.13 0.29 0.11 0.17 0.39
-0.34 -0.64 -0.26 0.16 -0.34 -0.49 -0.45 -0.85 0.45 0.08 0.8 0.73
0.28 -0.45 -0.66 -0.08 -0.13 -0.05 -0.27 -1.01 0.2 0.39 0.73 0.2
0.04 -0.24 -0.15 -0.29 -0.41 -0.28 -0.2 -0.36 0.28 0.26 0.48 0.45
0.02 -0.14 -0.25 -0.16 -0.32 -0.51 -0.28 -0.39 0.15 0.33 0.5 0.56
0.28 -0.08 -0.1 -0.3 -0.16 -0.66 -0.43 -0.69 0.33 0.0 0.72 0.37
-0.19 0.05 -0.17 -0.24 -0.45 -0.19 -0.01 -0.01 0.17 0.16 0.19 0.47
-0.07 -0.2 -0.36 -0.15 -0.34 -0.35 -0.09 -0.47 0.18 0.16 0.57 0.61
-0.04 -0.22 -0.5 -0.6 -0.27 -0.51 -0.01 -0.22 0.34 0.29 0.35 0.72
-0.16 -0.18 -0.13 -0.13 -0.27 -0.2 -0.11 -0.07 0.27 0.24 0.21 0.36
0.51 -0.29 -0.67 -0.29 -0.66 -1.04 -0.18 -0.88 0.45 0.17 0.87 0.53
-0.15 -0.33 -0.27 -0.18 -0.31 -0.08 -0.11 -0.08 0.25 0.18 0.37 0.43
-0.02 -0.24 -0.58 -0.63 -0.44 -0.58 -0.25 -0.39 0.26 0.52 0.5 0.85
0.23 -0.23 -0.33 -0.05 -0.22 -0.34 -0.2 -0.27 0.03 0.25 0.27 0.53
-0.05 -0.04 -0.23 -0.12 -0.15 -0.18 -0.12 -0.13 0.3 0.06 0.27 0.26
0.16 -0.14 -0.03 -0.06 -0.12 -0.29 -0.29 -0.9 -0.0 0.02 0.73 0.35
0.08 -0.09 -0.16 0.02 -0.13 -0.23 -0.08 -0.34 0.2 0.13 0.17 0.29
0.13 -0.53 -1.01 -0.22 -1.08 -0.24 -1.02 -0.49 -0.22 0.09 1.29 0.99
-0.06 -1.31 -1.43 -1.4 -0.41 0.22 -1.05 -0.42 0.28 0.42 1.26 0.84
0.23 -0.16 -0.1 -0.3 -0.14 -0.52 -0.32 -0.72 0.26 -0.13 0.73 0.49
-0.08 -0.22 -0.21 -0.37 -0.49 -0.21 0.02 -0.16 0.1 0.22 0.44 0.57
-0.02 -0.29 -0.87 -0.19 -0.37 -0.16 -0.6 -0.06 0.51 0.07 1.0 0.01
0.1 0.01 -0.14 -0.26 -0.57 -0.35 -0.27 -0.2 0.26 0.19 0.37 0.49
-0.15 -0.62 -1.01 -0.04 -0.51 -0.47 -0.77 -0.19 0.04 0.12 1.2 0.76
-0.02 -0.16 -0.07 -0.09 -0.17 -0.09 -0.11 -0.09 0.1 0.07 0.2 0.34
-0.05 -0.06 -0.21 -0.08 -0.19 -0.2 0.02 -0.12 0.29 0.1 0.07 0.32
-1.44 -0.56 -1.6 -0.52 0.26 0.26 -1.27 -0.83 -0.07 0.61 1.28 0.73
-0.1 -0.13 -0.12 -0.1 -0.28 -0.2 0.08 -0.3 0.31 0.15 0.17 0.34
-0.09 -0.33 -0.25 -0.29 -0.36 -0.44 -0.26 -0.51 0.25 0.35 0.55 0.7
-0.15 -0.71 -0.87 -0.39 -1.05 -0.37 -0.2 -0.55 0.17 0.59 1.1 0.67
0.08 -0.1 -0.2 -0.08 -0.25 -0.24 -0.02 -0.18 0.22 0.1 0.19 0.34
-0.12 -0.09 -0.01 -0.04 -0.26 -0.18 -0.0 -0.05 0.21 0.05 0.13 0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.