Heatmap: Cluster_44 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.41 0.25 0.1 0.24 0.09 0.05 0.19 0.13 0.77 0.06 0.23 0.18
0.06 0.08 0.05 0.08 0.07 0.08 0.15 0.14 0.14 0.03 0.04 0.08
0.06 0.06 0.07 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.1 0.02 0.03 0.05
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.02 0.06 0.14 0.18 0.02 0.04 0.02 0.06 0.06 0.0 0.09 0.07
71.39 58.5 45.89 43.97 54.68 47.08 38.78 47.07 33.97 29.15 17.95 46.58
0.48 0.47 0.58 0.65 0.48 0.53 0.48 0.47 0.77 0.66 0.53 0.64
1.25 2.55 1.43 1.42 1.56 2.14 1.73 1.23 2.22 1.83 0.81 1.92
225.3 190.75 208.9 274.82 200.21 147.77 123.15 132.63 220.3 118.71 110.12 142.99
0.65 1.63 0.26 0.46 0.39 0.6 0.44 1.1 0.98 0.44 0.66 0.33
2.89 2.36 2.39 2.47 2.75 2.73 2.69 2.58 3.09 3.47 2.38 2.59
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.03
0.04 0.07 0.03 0.02 0.03 0.0 0.05 0.02 0.08 0.02 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.02
0.2 0.08 0.2 0.17 0.17 0.09 0.03 0.17 0.19 0.14 0.09 0.2
0.62 0.36 0.36 0.32 0.39 0.23 0.48 0.39 0.35 0.5 0.32 0.31
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 0.81 0.96 0.81 0.65 0.67 0.57 1.01 0.72 0.74 0.66 1.04
13.81 12.97 14.25 11.87 11.85 13.72 13.3 15.05 11.98 14.61 12.69 16.42
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02
4.29 2.92 3.48 3.38 3.65 3.95 3.25 3.54 3.46 3.52 3.77 4.11
69.17 71.02 74.2 79.04 72.34 72.64 63.82 67.75 72.36 67.6 71.11 65.54
0.0 0.1 0.08 0.1 0.06 0.0 0.14 0.19 0.22 0.06 0.01 0.02
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.25
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.07 0.07 0.04 0.13 0.11 0.0 0.03 0.16 0.15 0.09 0.0
0.09 0.0 0.03 0.02 0.09 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.04 0.02
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.04 0.0 0.0
0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.13 0.13 0.1 0.17 0.21 0.08 0.02 0.13 0.19 0.04 0.18 0.12
0.15 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
1.14 0.4 0.75 0.78 1.09 1.13 0.89 0.9 1.02 1.28 0.67 0.98
2.14 2.57 2.75 2.15 2.87 1.99 2.42 1.25 2.95 1.13 2.12 1.89
11.26 12.67 11.97 11.39 11.53 11.5 10.87 11.68 11.94 10.82 11.17 11.18
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.17 0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.13 0.02 0.08 0.02 0.02 0.05 0.0 0.05 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.06 0.16 0.29 0.14 0.08 0.0 0.11 0.36 0.27 0.03 0.17 0.36
1.66 0.54 1.27 1.1 1.05 0.98 0.84 1.03 1.44 1.58 0.92 1.62
0.39 0.74 0.54 0.51 0.45 0.65 0.15 0.42 0.35 0.25 0.06 0.27
0.2 0.2 0.27 0.1 0.11 0.04 0.09 0.14 0.08 0.35 0.11 0.55
0.04 0.05 0.0 0.02 0.19 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.06 0.02
0.25 0.15 0.24 0.12 0.2 0.15 0.13 0.12 0.18 0.03 0.07 0.06
0.32 0.13 0.19 0.0 0.41 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
2.96 2.71 3.29 2.26 1.76 2.57 3.09 2.26 2.76 3.35 2.28 4.01
20.69 21.47 26.28 30.46 24.13 22.58 18.01 21.39 21.68 19.5 18.57 15.01
0.1 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.65 0.85 0.74 0.43 0.53 0.78 0.51 0.62 0.76 0.68 0.94
47.68 40.34 40.38 39.36 42.74 37.36 27.66 35.31 34.94 23.78 15.48 31.37
0.03 0.0 0.02 0.12 0.08 0.04 0.0 0.06 0.19 0.06 0.0 0.0
0.03 0.11 0.03 0.0 0.08 0.04 0.03 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0
2.98 5.53 4.91 4.07 5.81 4.88 1.67 5.44 3.18 2.82 3.18 3.4
0.0 0.16 0.13 0.04 0.08 0.0 0.08 0.13 0.21 0.11 0.0 0.12
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02
0.18 0.29 0.22 0.18 0.2 0.06 0.15 0.16 0.22 0.04 0.24 0.2
0.18 0.14 0.34 0.12 0.15 0.11 0.14 0.0 0.15 0.31 0.04 0.28
1.94 2.7 2.65 2.19 1.76 1.25 1.83 1.79 2.75 1.96 2.32 2.62
0.56 0.56 0.68 0.69 0.62 0.27 0.74 0.56 0.69 0.62 0.38 0.46
1.78 1.55 1.74 2.29 1.95 1.95 1.75 1.21 1.86 1.56 1.41 0.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
0.18 0.29 0.15 0.08 0.03 0.0 0.0 0.17 0.08 0.1 0.06 0.04
0.16 0.07 0.03 0.0 0.1 0.0 0.14 0.07 0.0 0.03 0.0 0.03
0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.04 0.0 0.0
0.18 0.18 0.13 0.07 0.02 0.05 0.02 0.08 0.38 0.08 0.09 0.04
0.99 0.48 0.49 0.7 0.81 0.28 0.14 0.79 0.71 0.78 0.77 1.43
1.45 2.31 3.02 2.2 2.08 1.35 1.59 2.59 2.31 1.55 2.6 2.49
0.04 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.05
0.04 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02
3.84 3.28 4.26 3.99 5.15 3.89 3.29 3.61 4.98 3.7 3.76 5.55
0.01 0.07 0.0 0.06 0.03 0.0 0.06 0.03 0.06 0.03 0.0 0.02
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)