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Heatmap: Cluster_241 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.13 0.83 0.95 0.66 0.26 -0.16 -1.11 -1.58 -0.78 -0.97 -0.06 -0.55
0.29 0.24 -0.06 0.34 -0.17 -0.37 -0.33 -0.31 0.1 -0.17 0.06 0.13
0.77 0.45 0.37 0.6 -1.97 -1.46 0.15 -2.11 0.25 -0.59 -0.09 0.46
0.01 0.55 0.25 -0.07 -0.44 -0.44 0.15 -0.19 -0.21 0.09 -0.35 0.28
0.08 0.16 0.22 0.32 0.08 -0.15 0.02 -0.42 -0.14 -0.23 0.14 -0.27
-0.09 0.64 0.2 0.67 -0.27 -0.09 0.3 -1.05 -0.29 -0.54 -0.1 -0.26
0.12 -0.09 0.14 0.09 -0.01 -0.19 0.08 -0.12 -0.08 -0.12 -0.02 0.15
-0.05 -0.04 0.21 0.2 0.05 0.07 -0.02 -0.2 0.14 -0.13 -0.01 -0.32
-0.42 1.42 -0.19 0.19 0.06 - 0.68 - 1.24 0.64 - -
-0.05 0.55 0.35 0.65 0.19 -0.51 -0.18 -0.45 0.14 -0.75 -0.16 -0.55
0.03 -0.08 0.12 -0.03 -0.03 -0.11 0.06 -0.04 -0.08 -0.03 -0.08 0.23
0.06 0.11 0.48 0.1 -0.13 -0.3 -0.72 -0.21 0.04 -0.23 0.25 0.19
0.2 -0.19 0.27 -0.11 -0.04 -0.44 0.27 -0.4 0.13 -0.21 -0.3 0.47
0.11 -0.0 0.06 -0.09 0.13 -0.17 -0.17 0.05 0.14 -0.02 0.12 -0.21
0.22 0.22 0.09 0.05 -0.18 -0.23 0.02 -0.45 0.04 -0.27 -0.1 0.37
0.03 0.35 0.94 0.37 0.07 -0.81 -0.63 -0.78 -0.36 0.05 -0.03 -0.23
-1.78 1.57 0.6 0.76 -2.28 -2.46 -0.53 -0.28 -0.75 -1.53 0.26 0.57
0.08 0.06 -0.13 -0.04 0.09 -0.19 -0.15 0.05 -0.02 0.19 -0.08 0.08
0.24 0.27 -0.03 -0.25 0.2 0.28 -0.47 0.26 0.03 -0.32 -0.25 -0.26
0.2 0.12 0.07 -0.04 0.05 -0.02 -0.32 -0.01 -0.45 0.03 -0.05 0.27
-0.04 -0.24 0.2 0.0 0.05 -0.12 0.11 0.06 0.0 0.16 -0.28 0.02
0.37 0.39 0.38 0.22 -0.11 -0.41 -0.02 -0.81 -0.08 -0.04 -0.03 -0.35
-0.11 0.03 -0.19 0.14 -0.09 -0.03 0.02 -0.25 0.05 0.11 -0.07 0.31
0.44 -0.23 0.15 -0.04 -0.38 -0.19 -0.2 -0.15 0.31 0.01 0.21 -0.16
0.6 0.17 0.19 -0.11 -0.41 -0.3 -0.06 -0.33 0.28 -0.32 -0.03 -0.03
0.16 0.12 0.31 0.15 -0.02 -0.51 0.05 -0.1 -0.27 -0.01 0.02 -0.06
-1.01 0.68 -0.63 0.41 - 0.62 0.52 0.66 -1.88 -0.17 -0.23 0.44
0.46 -0.23 0.57 -0.97 -0.9 -3.03 0.69 -0.1 0.7 -0.45 0.26 0.04
0.07 -0.04 -0.05 0.09 0.02 0.02 -0.01 -0.07 0.02 -0.03 -0.03 -0.0
-1.46 1.1 -0.28 -0.75 0.16 0.71 -3.0 -2.81 0.69 -0.27 -0.79 1.02
0.01 0.02 0.08 0.16 -0.28 -0.17 0.01 -0.03 -0.1 0.01 0.04 0.19
-0.38 -0.53 0.31 0.06 -0.04 -0.25 -0.01 0.06 0.34 0.11 -0.3 0.33
0.84 -0.1 0.14 -0.23 -0.19 -1.18 0.1 -0.58 -0.17 -0.14 0.09 0.49
0.3 -0.2 0.41 -0.48 0.14 -0.31 0.04 0.16 0.03 -0.13 -0.23 0.02
0.44 0.25 0.32 -0.11 0.07 -0.2 -0.16 -0.26 0.01 -0.35 0.1 -0.4
- 2.09 2.07 - - - - - - - 1.82 -
- 1.29 - - 0.51 1.51 0.13 - 0.13 0.1 1.01 -
0.43 0.6 0.64 -0.58 1.45 - - - 0.64 1.08 - -1.0
0.11 0.55 0.31 0.79 -0.19 -1.12 -0.44 -0.25 0.07 -0.64 0.14 -0.36
0.1 -0.6 0.2 -0.25 -0.0 0.17 0.05 -0.32 0.12 0.18 -0.14 0.26
1.8 0.99 - - - - - 1.28 0.84 1.21 - -
-0.81 0.51 0.53 -1.61 0.72 -1.53 -1.78 0.01 -1.78 -0.6 1.1 0.88
0.21 1.1 -1.03 -0.73 0.84 0.74 - -0.8 0.59 -2.45 0.13 -0.33
-0.29 -0.77 0.28 0.47 0.13 -1.01 -0.46 -0.06 0.59 0.12 -0.03 0.2
0.12 0.01 0.1 0.15 -0.01 -0.25 -0.04 -0.16 -0.02 -0.12 -0.04 0.2
0.02 0.17 -0.04 0.02 -0.04 -0.1 0.02 0.08 0.06 -0.01 -0.2 -0.02
0.33 0.41 -0.06 -0.27 0.15 0.08 -0.66 -0.16 0.08 -0.22 0.24 -0.25
0.03 0.12 0.44 0.09 -0.45 -0.14 0.05 -0.04 -0.15 0.01 -0.52 0.27
0.07 0.25 0.37 -0.01 0.06 -0.29 -0.23 -0.17 -0.05 -0.07 0.03 -0.08
-0.55 0.04 0.94 0.55 -0.01 -0.74 0.09 0.15 0.26 -0.61 -0.61 -0.67
0.08 0.09 0.53 0.18 -0.07 -0.34 0.01 -0.02 -0.21 -0.24 -0.32 0.09
0.18 0.06 -0.11 0.42 -0.16 -0.55 -0.4 -0.91 0.42 -0.58 0.41 0.45
0.11 -0.15 0.56 0.23 0.13 -0.45 -0.2 -0.25 0.28 0.04 -0.66 -0.05
- 2.16 - - - - - 1.95 - - 1.88 -
0.07 0.08 0.26 0.21 0.05 -0.25 -0.08 -0.02 -0.12 0.02 -0.25 -0.06
0.05 0.0 0.39 -0.94 -0.23 -0.44 0.4 0.37 -0.01 0.17 0.02 -0.31
0.81 0.46 0.4 0.67 -0.03 - -1.27 0.15 -1.73 1.2 - -0.22
0.34 -0.72 -1.02 -0.01 0.89 1.0 -2.66 -2.29 -0.72 -0.83 0.91 0.46
0.25 0.26 0.14 0.14 -0.39 -0.63 -0.17 -0.6 -0.17 -0.63 0.57 0.53
-1.62 1.18 1.13 -1.31 0.12 - 0.28 - -0.63 - 0.76 1.12
0.22 -0.17 -0.12 0.12 0.24 0.41 -0.34 0.06 -0.06 -0.36 -0.1 -0.1
0.2 0.0 0.19 -0.06 -0.12 -0.19 0.24 -0.14 0.01 -0.12 -0.05 -0.05
0.48 0.72 0.42 0.22 -1.07 -0.09 0.09 -1.36 -0.1 0.2 -0.67 -0.19
0.04 -0.04 -0.03 0.04 -0.0 -0.02 0.09 0.02 -0.13 -0.09 0.04 0.06
0.19 -0.07 - -1.06 1.15 -1.2 0.1 0.08 0.89 -0.41 0.85 -2.06
0.1 0.14 0.18 -0.04 -0.1 0.01 -0.01 -0.01 0.03 -0.12 -0.33 0.08
-0.16 -0.09 0.03 0.27 -0.07 -0.25 -0.08 -0.33 0.2 -0.53 0.22 0.47
0.85 -0.98 0.9 -0.68 -0.06 -1.11 0.58 -0.31 -0.87 -0.33 -1.17 0.75
0.11 0.24 0.1 0.53 0.1 -0.12 -0.06 -0.36 -0.18 -0.41 -0.04 -0.18
0.07 0.28 0.67 -0.62 0.32 -1.5 0.62 -0.82 0.26 -0.71 -0.24 0.19
0.04 -0.13 0.2 0.02 -0.17 0.06 0.02 -0.03 -0.11 -0.0 -0.38 0.36
1.96 -0.41 - 0.84 0.84 - -0.56 0.51 -0.46 - -0.06 -
0.3 0.55 0.39 0.74 0.59 0.31 -0.55 -1.13 -0.66 -0.88 -1.43 -0.15
-0.26 1.93 1.51 - - - -0.23 1.87 - - - -
-0.01 -0.05 0.33 -0.09 -0.16 -0.23 0.01 -0.09 -0.02 -0.04 -0.21 0.4
0.23 -0.33 0.1 -0.25 0.05 -0.11 0.14 -0.26 0.16 0.04 -0.25 0.32
-0.01 0.04 -0.08 -0.38 -0.19 0.06 0.29 -0.19 -0.16 0.08 0.17 0.22
0.58 0.18 0.39 -0.16 -0.04 -0.94 0.22 -0.55 -0.34 -0.39 -0.12 0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.