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Heatmap: Cluster_179 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- 0.3 0.28 1.24 0.63 -0.48 0.56 - -1.86 -0.9 0.5 0.3
-0.14 -0.1 -0.02 0.06 0.1 -0.06 -0.07 -0.04 0.23 -0.01 0.14 -0.13
0.55 -0.2 0.13 0.14 -0.06 -0.48 0.23 -0.19 -0.2 -0.18 0.2 -0.25
-0.16 0.05 0.04 0.25 0.3 -0.11 -0.32 -0.49 -0.01 -0.34 0.35 0.17
-0.17 -0.2 0.36 0.54 0.01 -0.64 -0.44 -0.81 0.64 -0.19 0.41 -0.35
-0.06 -0.15 0.05 0.42 0.2 0.0 -0.22 -0.0 0.02 -0.46 0.14 -0.13
-3.02 -0.11 0.63 0.76 -0.03 -0.18 -0.08 -0.59 0.01 -1.14 0.92 -0.18
0.01 -0.27 0.33 0.08 0.26 -0.24 -0.21 -0.09 0.38 -0.08 0.28 -0.88
0.09 0.02 0.1 0.18 0.18 0.09 0.1 -0.22 -0.25 -0.47 0.05 -0.03
-0.57 -0.24 0.17 0.61 0.22 0.0 -0.1 -0.29 -0.06 -0.45 0.41 -0.16
-0.09 -0.14 0.22 0.32 0.05 -0.21 -0.16 -0.1 0.22 -0.14 0.07 -0.16
-0.06 -0.15 -0.22 0.07 0.11 0.33 0.16 0.18 -0.35 -0.32 -0.17 0.23
0.19 -0.0 0.34 0.32 0.11 -0.14 -0.16 -0.39 0.14 -0.71 0.28 -0.37
-0.03 0.03 -0.05 0.09 -0.06 -0.1 -0.15 0.04 0.06 -0.03 0.36 -0.25
- - 1.43 0.76 - 0.5 - - 2.24 0.55 - -
0.3 0.26 0.61 0.6 0.51 -0.59 -0.54 -0.69 -0.02 -0.89 -0.1 -0.56
0.13 0.05 0.47 0.14 0.03 -0.11 -0.37 -0.25 -0.46 -0.44 0.63 -0.31
0.16 -0.04 0.48 0.3 0.02 -0.18 -0.27 -0.64 0.12 -0.46 0.15 -0.01
-0.16 -0.04 0.06 0.19 -0.02 -0.08 -0.1 -0.06 0.14 0.02 0.22 -0.23
0.0 -0.41 0.2 0.16 0.03 -0.24 0.02 -0.3 0.42 -0.21 0.45 -0.48
-0.23 0.16 0.22 0.57 0.35 -0.05 -0.33 -0.29 0.08 -0.26 -0.01 -0.62
-0.65 0.04 0.41 0.44 0.56 -0.49 -1.34 -0.58 0.39 -1.16 1.16 -1.32
-2.21 0.05 1.15 1.1 0.85 - -0.19 - 0.99 -1.0 0.28 -
-0.44 -0.5 0.01 0.14 0.15 0.16 -0.16 -0.19 0.43 0.15 0.32 -0.44
0.13 -0.03 0.32 0.26 -0.47 -0.42 0.12 -0.24 -0.11 -0.39 0.55 -0.11
-0.19 -0.12 -0.09 0.11 0.14 0.02 -0.09 -0.08 0.19 -0.08 0.35 -0.27
-0.09 -0.05 0.07 0.08 0.01 -0.18 -0.1 -0.09 0.21 -0.0 0.2 -0.13
-0.42 0.32 0.75 1.18 -1.52 -0.41 0.21 -2.2 -0.95 -0.16 0.19 0.03
0.44 0.22 0.44 0.9 1.25 0.2 -1.76 -0.33 -2.12 -0.8 -0.63 -2.37
-0.06 0.05 0.02 0.08 -0.01 -0.23 -0.25 -0.03 -0.03 0.01 0.35 0.01
-0.07 -0.04 0.17 0.33 0.13 -0.25 -0.2 -0.16 0.25 -0.12 0.13 -0.35
-0.26 -0.4 0.24 0.31 -0.02 -0.22 -0.25 -0.66 0.63 -0.25 0.61 -0.42
-0.18 0.07 0.36 0.45 0.21 0.04 -0.11 -0.37 -0.06 -0.48 0.03 -0.24
-0.01 0.06 -0.08 0.05 0.08 0.2 0.04 0.08 -0.34 -0.26 -0.03 0.12
-0.08 -0.08 -0.02 0.5 -0.04 -0.4 -0.29 -0.25 0.27 -0.07 0.53 -0.49
-0.08 -0.11 0.1 0.12 0.08 0.05 -0.13 -0.03 0.01 -0.05 0.18 -0.17
0.01 0.37 0.19 -0.23 0.09 0.02 -0.27 -1.75 -0.52 -0.03 0.47 0.53
-0.32 -0.06 0.18 0.32 0.03 0.12 -0.38 -0.33 0.26 -0.49 0.38 -0.03
-0.18 -0.26 0.39 0.76 0.37 -0.25 -0.17 -0.46 0.1 -0.23 0.04 -0.77
-0.08 -0.18 0.09 0.22 -0.03 -0.1 -0.05 -0.16 0.28 -0.04 0.19 -0.27
- - 1.6 - - 0.45 1.49 - 1.42 - 1.08 -
0.08 -0.36 0.41 0.24 0.49 -0.26 -0.15 -0.85 0.26 -0.28 0.16 -0.28
-0.08 -0.11 0.05 0.16 -0.01 -0.16 -0.08 -0.15 0.28 0.03 0.21 -0.22
-0.06 -0.2 0.05 0.08 0.06 -0.09 0.03 -0.17 0.14 -0.03 0.22 -0.1
0.01 -0.05 0.18 0.19 0.13 -0.15 0.07 -0.23 0.39 -0.26 0.11 -0.67
-0.05 -0.02 0.33 0.25 0.11 -0.11 -0.15 -0.26 -0.01 -0.28 0.08 -0.03
-0.04 0.34 0.33 0.12 0.16 -0.15 -0.22 -0.19 -0.02 -0.51 0.34 -0.48
0.05 -0.23 0.05 0.26 0.15 -0.58 -0.42 -0.6 0.14 0.06 0.62 0.03
-0.26 -1.17 0.43 0.71 -0.46 0.47 -0.47 -0.63 0.37 -0.66 0.22 0.23
0.05 0.15 0.48 0.41 0.08 -0.26 -0.46 -0.25 -0.21 -0.16 -0.09 -0.03
0.01 -0.02 0.27 0.36 0.11 -0.22 -0.22 -0.22 0.15 -0.39 0.17 -0.21
0.06 0.07 0.46 0.31 0.08 -0.22 -0.15 -0.36 -0.04 -0.2 -0.0 -0.24
-0.18 -0.12 0.16 0.12 0.1 0.06 0.01 -0.0 0.26 -0.23 0.08 -0.38
0.17 -0.32 0.2 0.61 0.27 -0.47 -0.24 -1.17 0.08 -0.44 0.61 -0.22
-0.98 -0.48 0.03 1.53 -1.57 - -1.96 -2.01 1.49 -0.33 0.83 -0.63
0.01 0.06 -0.01 0.1 0.07 0.09 -0.08 -0.03 -0.16 -0.03 0.06 -0.08
-0.05 -0.07 0.01 0.13 -0.01 -0.1 0.03 -0.23 0.28 -0.04 -0.02 0.02
- - 1.09 0.78 - 0.38 -0.44 -0.96 1.8 -0.6 0.56 -
-0.34 -0.34 0.46 0.46 0.09 -0.23 -0.25 -0.37 0.29 -0.28 0.4 -0.36
- - 0.77 1.16 1.07 - - - 0.64 0.61 1.53 -
-0.09 0.07 0.38 0.66 0.44 0.18 0.21 -0.48 -0.63 -0.85 -0.47 -0.25
-0.08 0.25 0.42 0.16 0.15 -0.61 -0.94 -0.45 0.08 -0.34 0.78 -0.26
0.21 -0.09 0.3 0.33 0.13 -0.58 -0.74 -0.44 -0.02 0.03 0.32 0.07
-0.48 -0.84 0.06 0.78 0.2 -0.11 -0.48 -0.62 0.12 -0.46 1.05 -0.66
-2.31 -0.28 0.88 0.83 -1.78 -0.82 0.17 0.58 -0.14 -1.03 0.24 0.38
0.05 -0.04 -0.01 0.09 -0.12 -0.2 -0.07 -0.18 0.33 -0.03 0.09 0.01
0.13 -0.05 0.15 0.13 -0.01 -0.11 -0.09 -0.14 0.08 -0.16 -0.04 0.05
-0.66 0.03 0.26 0.12 0.29 -0.04 -0.01 -0.19 -0.67 -0.16 0.37 0.23
0.43 -0.32 -1.3 0.95 0.07 -1.24 -0.45 -1.31 0.54 - 1.79 -
0.57 0.12 1.26 0.07 0.45 -1.14 -0.34 -0.29 -1.67 -0.31 -0.47 -0.51
-0.19 -0.13 0.35 0.59 0.13 -0.39 -0.25 -0.44 0.3 -0.12 -0.12 -0.1
0.12 0.24 0.52 0.01 -0.11 -0.71 -0.16 -0.6 -0.22 -0.33 0.67 -0.07
-0.28 -0.41 0.2 0.29 0.21 0.0 0.11 -0.28 0.35 -0.2 0.12 -0.4
-0.23 -0.19 -0.78 1.11 -0.9 0.05 -0.84 0.03 0.47 0.29 0.38 -1.09
0.65 -0.24 -0.39 0.21 0.23 -0.42 -0.39 -0.94 -0.45 -0.03 0.73 0.13
0.43 -0.03 0.74 0.32 0.11 -0.03 -0.44 -0.76 0.07 -1.5 0.21 -0.3
-0.03 0.19 0.14 0.2 0.12 -0.16 -0.11 -0.06 0.12 -0.17 0.04 -0.41
1.43 - - 1.01 0.92 - 0.49 - 0.49 - 1.38 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.