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Heatmap: Cluster_240 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.28 -0.52 0.28 0.08 -0.1 -0.03 -0.07 -0.21 0.15 -0.22 0.33 0.33
0.01 0.06 0.08 -0.12 -0.14 0.12 -0.14 -0.1 0.05 -0.11 -0.13 0.34
- 0.54 -0.17 -0.72 -0.69 0.99 -0.89 0.24 0.12 0.63 -0.18 0.27
-0.62 -0.17 0.38 -0.22 -0.28 0.28 -0.02 0.15 -0.19 -1.43 -0.09 0.98
-0.08 0.09 0.14 -0.06 -0.12 0.26 0.02 -0.02 -0.22 -0.06 -0.06 0.05
-0.01 0.18 -0.05 0.12 -0.18 0.12 -0.05 -0.11 -0.08 -0.09 -0.12 0.19
-0.16 0.08 -0.09 0.02 0.03 0.17 -0.05 -0.13 -0.0 -0.09 -0.09 0.27
-0.3 0.09 0.18 -0.46 0.06 0.38 -0.17 0.18 -0.27 0.14 -0.16 0.11
-0.22 -0.33 0.07 -0.2 0.05 0.12 0.06 -0.08 0.04 0.09 -0.25 0.47
-0.16 0.04 0.03 -0.06 -0.06 -0.01 -0.03 -0.17 0.07 0.21 -0.02 0.12
-0.81 0.37 -0.1 0.36 0.53 -0.16 -0.55 -0.92 0.06 -1.17 0.76 0.23
-0.01 -0.01 0.07 -0.01 0.01 0.08 -0.09 -0.17 0.06 -0.13 -0.09 0.24
-0.02 -0.01 0.25 0.64 -0.37 0.22 -0.43 -1.19 -0.86 -0.37 -0.68 1.14
0.02 -0.24 -0.41 0.24 0.01 0.45 0.14 -0.49 -0.17 -0.08 0.06 0.2
- 0.61 0.59 - - 0.71 - - 0.36 - 1.33 1.83
-0.08 -0.09 -0.04 -0.04 0.04 0.08 -0.06 -0.04 0.0 0.1 0.06 0.05
-0.33 -0.15 -0.35 0.36 -0.29 0.47 -0.26 0.12 -1.51 -0.45 0.33 0.83
-0.28 -0.43 0.0 -0.62 0.22 0.56 -0.98 0.09 0.08 0.25 0.33 0.1
0.03 0.0 -0.01 -0.11 -0.11 0.14 0.03 -0.04 -0.02 -0.04 -0.1 0.18
0.08 0.12 -0.0 0.09 -0.04 -0.06 -0.04 -0.11 -0.07 -0.04 -0.03 0.07
0.0 -0.06 0.03 -0.13 -0.05 0.03 0.01 -0.06 0.0 -0.03 0.1 0.14
-1.12 -0.94 - -0.92 -1.12 2.02 - 1.59 - 0.25 0.13 -0.58
0.98 0.97 - -0.79 - 0.85 -1.07 - -0.02 0.11 0.63 0.67
-0.15 -0.11 0.06 0.1 0.05 0.05 -0.03 -0.13 0.04 0.01 -0.04 0.12
-0.35 0.15 -0.01 -0.48 -0.3 0.14 -0.41 0.64 -0.01 0.17 -0.09 0.15
-0.35 0.11 0.34 -0.22 0.25 -0.22 -0.04 -0.22 0.52 -0.03 -0.4 -0.07
0.64 0.22 0.33 0.23 -0.21 -0.35 -0.08 -1.23 0.17 0.07 -0.12 -0.46
0.29 -0.09 0.02 -0.07 -0.06 0.23 -0.0 0.11 -0.35 -0.14 -0.14 0.08
-0.44 0.24 0.09 0.07 -0.51 0.03 -0.02 -0.26 0.27 0.1 0.12 0.08
0.32 -0.28 0.02 -0.23 -0.62 0.3 -1.22 -0.52 0.02 -0.02 0.63 0.6
-0.15 -0.21 0.21 -0.02 -0.43 0.1 0.11 -0.03 -0.08 -0.05 0.24 0.18
0.02 -0.05 -0.02 -0.25 -0.36 -0.02 0.09 -0.21 0.18 -0.04 0.03 0.46
0.12 0.04 0.01 -0.49 0.18 -0.5 0.38 -0.09 0.11 -0.39 -0.71 0.7
- - - - - 2.46 - - - - 2.7 -
-0.61 0.69 0.57 -0.47 0.24 0.19 -0.44 -1.29 -0.52 0.26 0.54 -0.52
-0.17 -0.19 -0.09 0.02 0.13 0.14 -0.13 -0.11 -0.02 0.13 0.07 0.14
0.1 0.43 - - 0.55 1.38 - 1.57 - - 1.35 -
-0.03 -0.05 -0.01 -0.1 -0.37 0.15 -0.03 -0.03 -0.03 -0.08 0.11 0.35
0.32 0.54 0.24 0.22 -0.7 -0.44 -0.07 -1.15 0.62 -0.47 -0.16 0.05
0.02 0.09 - 0.84 -1.08 1.36 - 0.52 0.05 - 1.39 -
-0.73 - -1.53 -1.5 -1.29 0.91 -1.67 - - 1.26 1.46 1.56
0.26 -0.34 -0.34 -0.01 -0.52 -0.08 0.06 0.3 0.08 -0.06 0.22 0.17
0.05 -0.12 -0.06 -0.11 -0.18 0.11 0.15 0.07 -0.12 0.05 -0.14 0.24
0.74 1.14 -0.35 - - -0.23 1.34 - -0.39 - -0.61 1.35
- - - - - 2.48 - 2.68 - - - -
-0.08 0.01 0.0 0.15 -0.01 0.02 -0.1 -0.18 0.15 -0.16 0.07 0.09
-0.12 -0.03 -0.01 -0.06 -0.19 0.07 0.06 0.08 -0.06 0.07 -0.05 0.19
0.23 0.03 0.19 -0.14 -0.47 -0.28 -0.15 -0.15 0.18 -0.03 0.11 0.27
-0.22 -0.79 1.1 -0.25 -2.12 0.7 -0.25 0.68 -0.55 -1.2 0.11 0.13
-0.1 0.16 -0.15 0.0 0.13 0.15 -0.06 -0.22 -0.05 -0.35 0.13 0.23
-0.29 0.81 0.79 - -0.17 0.54 -2.44 1.06 -2.42 0.67 -1.64 -0.01
0.23 -0.04 0.35 -0.34 -0.36 0.57 -0.05 -0.09 -0.11 -0.51 -0.26 0.21
0.08 0.01 0.13 -0.28 -0.02 0.06 0.23 -0.16 -0.19 -0.13 -0.08 0.24
-1.56 -2.03 -0.99 0.2 0.36 0.66 -1.3 0.64 -0.19 0.63 0.2 0.45
-0.0 0.44 -0.31 0.29 0.2 -0.16 -0.3 -0.64 -0.25 -0.07 -0.1 0.48
-0.26 0.52 0.19 -0.63 0.24 0.72 -0.93 -0.04 -0.38 0.36 -0.46 -0.25
- - - - - 1.24 - 1.43 - - 0.86 2.36
-0.04 -0.07 0.46 0.19 -0.58 -0.2 0.04 -0.39 0.34 -0.25 -0.2 0.32
-0.01 0.11 -0.01 0.09 0.07 -0.11 -0.15 -0.11 0.1 -0.14 0.02 0.1
-0.04 0.04 -0.04 -0.08 -0.05 0.08 -0.0 -0.0 -0.04 0.0 0.07 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.