Heatmap: Cluster_223 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.1 0.06 0.07 0.07 0.0 0.14 0.09 0.06 0.03 0.03 0.04 0.08
0.07 0.14 0.12 0.05 0.16 0.12 0.1 0.08 0.14 0.05 0.04 0.27
1.34 0.77 1.48 1.62 1.31 1.03 1.68 1.58 4.4 1.74 1.27 0.98
3.04 3.3 3.81 2.75 3.04 3.98 3.77 3.52 4.07 3.91 3.18 4.68
3.98 4.0 4.17 4.41 3.94 3.99 4.24 4.18 4.91 3.99 3.09 4.58
0.12 0.26 0.03 0.14 0.47 0.44 0.03 0.03 0.21 0.32 0.11 0.48
3.1 1.93 3.19 2.58 2.25 2.63 3.58 3.53 2.7 2.55 3.31 4.84
0.15 0.08 0.14 0.11 0.23 0.28 0.13 0.21 0.16 0.22 0.26 0.45
5.46 5.03 5.6 6.28 6.32 6.51 5.9 7.05 7.41 7.28 5.2 6.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.03 0.39 0.19 0.11 0.39 0.33 0.11 0.06 0.18 0.31 0.01 0.12
0.04 0.03 0.08 0.04 0.1 0.0 0.07 0.04 0.13 0.02 0.0 0.11
0.0 0.02 0.07 0.04 0.12 0.08 0.02 0.0 0.11 0.09 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0
1.64 2.0 2.52 2.52 1.99 2.22 1.46 1.37 1.16 1.26 1.81 1.92
56.35 57.4 58.66 58.6 56.7 52.76 58.2 56.44 60.9 58.12 67.02 62.48
8.12 8.04 8.89 8.84 9.22 9.96 8.23 10.22 8.54 9.22 8.58 9.21
6.92 5.44 5.44 5.1 5.14 5.66 6.07 5.81 4.46 4.77 4.38 8.23
9.07 6.84 8.84 8.72 7.86 7.4 8.66 7.68 7.55 6.85 9.04 9.91
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.1
0.11 0.03 0.21 0.04 0.0 0.12 0.0 0.1 0.25 0.09 0.0 0.21
13.57 13.0 14.05 12.57 12.21 11.5 12.71 11.14 15.33 12.03 12.78 13.63
0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.12 0.0 0.08 0.03 0.0 0.02 0.15
0.16 0.16 0.14 0.05 0.25 0.18 0.18 0.04 0.34 0.2 0.12 0.15
2.69 2.56 3.71 3.77 3.63 4.39 3.23 3.05 3.19 3.58 3.41 4.41
0.15 0.15 0.17 0.06 0.18 0.22 0.07 0.04 0.14 0.14 0.0 0.28
0.64 0.47 0.51 0.3 0.42 0.49 0.23 0.45 0.29 0.38 0.41 0.49
0.01 0.05 0.0 0.0 0.08 0.16 0.02 0.03 0.02 0.06 0.02 0.1
0.16 0.11 0.17 0.07 0.19 0.08 0.07 0.05 0.0 0.1 0.02 0.47
0.46 0.31 0.33 0.38 0.29 0.72 0.49 0.39 0.46 0.47 0.33 0.55
0.52 0.15 0.77 0.58 0.97 0.35 0.34 0.29 1.08 0.8 0.37 0.27
8.9 10.81 12.13 9.86 11.44 13.27 8.91 9.95 10.19 10.51 8.39 10.41
0.48 0.37 0.25 0.35 0.38 0.94 0.32 0.33 0.78 0.2 0.68 0.87
0.86 0.67 1.08 0.51 0.83 0.98 0.84 0.68 0.9 1.07 0.44 0.64
0.21 0.75 0.72 0.87 0.77 0.59 0.41 0.32 0.32 0.39 0.29 0.38
89.98 76.29 78.96 72.92 77.04 111.11 55.99 78.33 87.16 79.67 106.33 111.51
0.02 0.04 0.02 0.0 0.03 0.1 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.34 0.41 0.22 0.25 0.14 0.12 0.24 0.11 0.12 0.24 0.11 0.44
0.15 0.42 0.12 0.22 0.3 0.15 0.16 0.13 0.13 0.21 0.11 0.27
0.87 0.49 1.08 0.64 0.48 1.28 1.08 0.83 0.84 0.58 1.33 1.77
0.12 0.08 0.38 0.24 0.14 0.32 0.15 0.13 0.26 0.41 0.76 0.38
1.1 1.97 1.61 1.75 1.67 0.89 2.38 1.47 1.74 1.33 4.08 2.48
0.13 0.23 0.12 0.18 0.19 0.17 0.04 0.13 0.14 0.11 0.06 0.2
0.02 0.05 0.0 0.02 0.06 0.08 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.13
0.1 0.0 0.0 0.21 0.2 0.31 0.0 0.0 0.1 0.1 0.19 0.23
0.09 0.21 0.25 0.21 0.25 0.42 0.29 0.31 0.28 0.09 0.28 0.51
0.03 0.23 0.02 0.1 0.14 0.02 0.0 0.04 0.03 0.04 0.06 0.11
0.03 0.03 0.07 0.03 0.27 0.0 0.07 0.07 0.14 0.11 0.07 0.03
0.59 0.58 0.59 0.59 0.38 0.64 0.61 0.68 0.46 1.27 0.56 0.81
0.22 0.12 0.19 0.32 0.27 0.35 0.15 0.25 0.17 0.19 0.33 0.5
0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.08 0.04
11.91 12.91 14.27 12.84 12.26 12.71 13.45 13.16 20.19 15.82 14.91 13.31
1.52 1.68 0.71 1.25 0.91 2.25 0.4 0.33 1.54 2.31 2.9 2.91
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
0.3 0.47 0.67 0.39 0.45 1.05 0.0 0.63 0.4 0.04 1.05 1.21
0.28 0.64 0.36 0.54 0.41 0.22 0.17 0.42 0.47 0.44 0.31 0.86
0.15 0.15 0.14 0.43 0.12 0.24 0.13 0.22 0.49 0.35 0.67 0.42
0.12 0.04 0.17 0.37 0.14 0.41 0.03 0.41 0.2 0.34 0.25 0.53
0.19 0.15 0.1 0.0 0.23 0.12 0.06 0.35 0.43 0.3 0.08 0.22
0.06 0.02 0.03 0.08 0.14 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.08
1.42 1.73 1.98 1.65 1.75 1.44 1.9 1.32 2.79 1.68 1.5 1.71
0.01 0.18 0.02 0.04 0.25 0.08 0.26 0.05 0.25 0.2 0.0 0.11
0.09 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.05 0.15 0.51 0.09 0.04 0.0
0.34 0.19 0.27 0.46 0.33 0.53 0.26 0.21 0.39 0.51 0.64 0.49
3.85 3.99 2.82 2.49 2.64 3.14 3.28 2.04 2.85 3.2 2.42 4.8
4.16 6.86 7.01 6.65 5.38 5.1 5.58 5.87 7.38 6.14 5.55 5.64
0.55 0.69 1.16 0.73 1.03 1.0 0.54 0.98 1.03 0.88 1.28 1.38
8.56 12.34 14.56 10.23 9.14 11.93 9.82 9.59 7.77 6.06 10.38 14.18
2.49 4.44 2.65 1.68 3.15 3.93 2.58 2.57 2.66 2.66 3.67 4.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.11
1.08 0.75 1.02 0.98 1.02 0.9 1.05 0.66 1.34 1.22 2.02 1.86
1.11 0.72 0.93 0.82 1.18 1.39 0.73 1.27 0.95 1.39 0.54 1.39
0.56 0.49 0.55 0.45 0.38 0.55 0.52 0.32 0.21 0.67 0.33 0.37
1.77 1.78 1.57 1.08 1.15 1.4 1.43 0.83 0.97 1.35 1.16 1.69

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)