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Heatmap: Cluster_54 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.07 -0.23 0.06 0.15 -0.24 -0.36 -0.17 -0.13 0.21 0.04 0.0 0.42
0.01 -0.4 0.21 -0.18 -0.12 -0.29 0.24 -0.01 0.32 0.06 0.09 -0.12
-0.31 0.03 0.18 -0.09 -0.24 -0.45 -0.05 -0.68 0.16 0.18 0.51 0.33
0.11 -0.3 0.08 0.08 -0.06 -0.38 0.03 -0.31 0.09 0.18 0.22 0.09
0.04 0.25 -0.31 0.07 -0.42 -0.42 -0.26 -0.06 0.25 -0.03 0.17 0.42
-0.07 -0.56 -0.11 -0.11 -0.17 -0.18 -0.04 -0.16 0.44 -0.05 0.2 0.49
-0.07 -0.19 -0.21 0.09 -0.13 0.07 0.1 0.01 0.03 0.1 0.11 0.06
0.06 0.03 -0.1 -0.05 -0.09 -0.11 -0.07 -0.0 0.2 0.01 0.13 -0.03
0.05 -0.12 -0.16 0.07 -0.05 -0.2 -0.01 -0.06 0.23 -0.03 0.13 0.1
0.45 -0.58 0.29 0.02 -0.86 -0.18 0.16 -0.65 0.13 0.01 0.2 0.37
0.05 -0.19 -0.0 -0.05 -0.14 -0.13 -0.07 -0.08 0.13 0.03 0.22 0.17
-0.21 -0.45 0.12 -0.2 -0.53 -0.05 -0.24 -0.05 0.5 0.1 0.35 0.28
-0.07 -0.09 -0.03 -0.06 0.01 0.05 0.01 -0.17 0.12 0.05 -0.08 0.2
0.0 -0.35 0.01 -0.09 -0.09 -0.15 -0.16 -0.16 0.3 0.04 0.2 0.3
0.07 -0.21 -0.16 -0.01 -0.29 -0.17 -0.12 -0.1 0.29 0.13 0.28 0.14
-0.01 -0.14 -0.11 0.17 -0.03 -0.15 0.05 -0.21 0.14 0.16 -0.01 0.07
0.06 0.02 -0.17 -0.09 -0.05 -0.11 -0.16 -0.05 0.21 0.07 0.13 0.09
0.0 -0.22 -0.02 0.13 -0.09 -0.22 -0.1 -0.07 0.27 0.04 0.09 0.12
-0.15 -0.21 0.1 -0.14 -0.17 -0.15 0.16 -0.01 0.28 -0.19 0.12 0.24
-0.01 -0.27 0.06 -0.03 -0.17 -0.05 0.08 -0.08 0.23 -0.11 0.12 0.16
-0.07 -0.01 -0.1 0.1 -0.23 -0.16 -0.16 -0.02 0.14 0.13 0.01 0.29
0.03 0.05 -0.01 0.05 -0.14 0.06 -0.03 -0.06 0.17 -0.2 0.03 0.02
-0.04 -0.06 -0.06 -0.1 -0.17 0.0 -0.03 0.03 0.16 0.08 0.11 0.05
-0.05 -0.06 -0.0 -0.01 -0.01 -0.17 -0.08 -0.04 0.14 0.04 0.08 0.14
-0.03 -0.2 0.19 -0.31 0.04 -0.11 -0.16 -0.07 0.11 0.08 0.3 0.06
0.17 -0.24 -0.08 -0.15 -0.15 0.13 -0.05 -0.13 0.38 -0.18 0.07 0.12
-0.1 -0.45 0.26 -0.05 -0.06 -0.76 0.23 0.16 0.43 -0.4 0.19 0.13
0.01 -0.45 -0.07 -0.09 -0.22 -0.01 0.05 0.01 0.4 0.02 0.16 0.04
0.3 -0.53 0.25 -0.46 -0.15 0.1 0.02 0.03 0.38 -0.35 -0.08 0.16
-0.04 -0.12 -0.02 -0.02 -0.2 0.08 0.04 -0.03 0.11 -0.01 0.05 0.14
-0.09 -0.47 0.04 0.31 -0.09 0.21 -0.04 -0.79 0.37 0.17 -0.1 0.11
-0.0 0.06 -0.13 -0.11 -0.15 -0.13 -0.13 -0.1 0.24 0.04 0.16 0.19
0.03 -0.21 -0.06 -0.07 -0.17 0.01 0.08 -0.2 0.18 0.01 0.09 0.24
-0.24 -0.05 0.18 0.04 -0.15 0.0 -0.06 -0.2 0.08 -0.1 0.11 0.29
0.04 0.17 -0.15 -0.06 -0.09 -0.13 -0.17 -0.04 0.18 0.07 0.1 0.03
-0.03 -0.27 0.24 0.1 -0.05 -0.02 -0.06 -0.18 0.11 -0.09 0.1 0.08
0.38 -0.44 -0.04 -0.18 -0.47 -0.1 -0.01 -0.06 0.19 0.08 0.15 0.26
-0.13 -0.49 -0.28 0.25 -0.33 -0.27 0.04 0.19 0.23 -0.13 0.48 0.13
0.06 -0.25 -0.01 0.03 -0.04 -0.1 0.02 -0.06 0.19 -0.02 0.07 0.07
0.29 -0.71 -0.2 0.06 -0.23 -0.87 -0.13 -0.54 0.37 -0.02 0.58 0.57
-1.83 - -0.06 -0.04 -1.41 0.12 1.07 -0.0 0.96 - 0.68 0.74
0.04 -1.67 0.33 0.94 -1.31 -0.56 -0.48 -1.48 0.92 -0.08 0.19 0.43
-0.09 -0.24 -0.21 -0.06 -0.22 -0.3 0.03 -0.23 0.38 -0.07 0.42 0.33
0.05 -0.28 -0.08 -0.06 -0.13 -0.24 -0.04 -0.07 0.16 0.09 0.3 0.19
0.19 -0.55 -0.2 0.26 -0.34 0.05 0.04 0.02 0.33 -0.19 0.26 -0.16
0.01 0.1 -0.1 -0.03 -0.21 -0.08 -0.08 -0.04 0.14 0.08 0.11 0.05
0.13 0.0 0.07 -0.03 -0.25 -0.16 -0.05 -0.11 0.06 -0.02 -0.02 0.32
-1.18 -0.84 0.31 0.44 -0.42 -1.9 0.22 -1.08 0.63 0.11 -0.45 1.26
0.02 0.18 -0.22 -0.11 0.06 -0.38 -0.26 0.1 0.37 0.08 0.07 -0.07
0.12 -0.08 -0.01 0.04 -0.19 -0.05 -0.28 -0.05 0.16 0.02 0.01 0.24
-0.0 -0.23 0.04 0.01 -0.02 0.02 -0.03 -0.16 0.25 0.03 0.04 -0.0
0.11 -0.15 -0.03 -0.01 0.07 -0.08 -0.02 -0.07 0.18 -0.06 0.01 0.02
-0.04 -0.27 0.02 0.06 -0.13 0.08 -0.14 -0.14 0.24 0.05 0.11 0.09
-0.28 -0.01 -0.1 0.08 -0.05 0.01 -0.1 0.06 0.02 0.08 0.0 0.23
0.04 -0.19 -0.03 0.02 -0.05 -0.01 -0.18 0.18 0.15 -0.24 0.15 0.08
-0.15 -0.06 0.05 0.1 -0.12 0.1 -0.04 -0.12 0.01 0.02 0.1 0.09
-0.11 -0.04 0.01 -0.01 -0.12 0.03 -0.02 -0.04 0.19 0.0 0.09 -0.01
-0.29 -0.87 0.17 -1.35 0.46 -2.24 0.43 0.19 0.59 -0.31 0.49 0.4
-0.13 -0.2 0.02 -0.03 -0.08 -0.03 -0.0 -0.03 0.17 0.13 0.08 0.07
0.07 -0.11 0.04 -0.13 -0.24 -0.05 -0.08 -0.54 0.23 0.0 0.31 0.27
-0.07 -0.13 0.04 0.01 -0.13 -0.09 -0.02 -0.0 0.04 -0.07 0.16 0.23
-0.02 -0.12 -0.1 -0.19 -0.12 0.05 -0.11 -0.08 0.34 -0.04 0.07 0.23
0.01 -0.54 -0.1 -0.27 -0.22 -0.05 0.1 -0.14 0.44 -0.02 0.09 0.4
-0.09 -0.13 0.08 -0.01 -0.1 -0.09 0.02 -0.06 0.19 -0.03 0.14 0.05
0.03 0.02 -0.03 0.04 -0.09 0.01 -0.17 -0.05 0.15 -0.04 0.03 0.09
-0.17 -0.19 0.08 -0.17 -0.18 -0.04 0.06 -0.13 0.24 0.09 0.16 0.15
-0.04 -0.16 -0.09 -0.1 -0.04 -0.01 0.04 -0.16 0.2 0.05 0.11 0.15
0.04 -0.11 -0.13 -0.11 -0.35 0.03 -0.08 -0.13 0.21 0.07 0.16 0.28
-0.12 -0.18 0.02 0.08 -0.1 -0.01 -0.0 -0.04 0.13 -0.06 0.08 0.15
0.02 -0.12 0.08 0.17 -0.14 -0.03 -0.14 -0.05 0.31 -0.12 0.07 -0.12
-0.1 -0.12 0.06 -0.03 -0.02 -0.27 -0.04 -0.11 0.28 0.02 0.19 0.05
-0.14 -0.24 0.1 -0.02 -0.09 0.16 -0.06 -0.1 0.23 -0.06 0.23 -0.1
-0.02 -0.35 -0.1 0.13 -0.06 -0.0 0.07 -0.32 0.26 -0.01 0.15 0.12
0.14 0.05 -0.11 -0.09 -0.19 -0.01 0.08 -0.18 0.16 -0.01 0.06 0.06
0.01 -0.22 -0.01 -0.05 -0.09 -0.03 0.04 -0.05 0.23 -0.03 0.09 0.06
-0.24 -0.21 0.05 -0.04 -0.26 -0.01 0.01 -0.05 0.29 0.16 0.11 0.08
0.27 -0.48 0.29 -0.1 -0.35 -0.78 -0.01 -0.42 0.77 -1.07 0.53 0.26
-0.0 -0.14 0.02 -0.04 -0.11 -0.21 -0.05 -0.03 0.19 0.02 0.19 0.1
0.07 -0.02 0.04 0.02 -0.09 -0.06 -0.21 -0.08 0.09 -0.01 0.11 0.12
0.14 -0.21 -0.03 -0.03 -0.13 -0.05 -0.04 -0.14 0.14 0.03 0.09 0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.