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Heatmap: Cluster_120 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.29 -0.1 0.06 0.22 0.07 -0.39 -0.07 -1.31 0.37 0.24 0.02 -0.02
-0.75 -0.94 0.72 -0.2 -0.04 -0.58 0.4 -1.43 0.14 -0.31 -0.09 1.13
0.08 -0.42 -0.71 -0.97 0.2 -1.16 0.51 -0.06 0.0 0.36 0.31 0.65
-0.01 0.06 -0.09 0.05 -0.06 -0.16 -0.18 -0.14 -0.01 0.02 0.37 0.05
-0.02 0.28 0.26 0.33 0.15 -0.19 -0.37 -0.41 -0.12 -0.22 0.01 0.06
-0.12 -1.08 1.05 -0.11 0.27 -0.46 0.16 -0.69 -0.97 -0.11 -0.22 0.72
-0.07 -0.06 -0.08 -0.05 0.04 -0.14 0.03 -0.16 0.12 0.06 -0.06 0.31
0.08 -0.15 0.13 0.05 0.03 -0.01 -0.05 -0.07 -0.23 -0.06 0.12 0.11
-0.49 -0.26 0.16 0.79 -0.34 -0.5 -0.44 -0.13 0.11 -0.71 0.43 0.51
-0.2 -0.59 -0.08 0.0 0.36 -1.21 0.16 -0.5 0.11 0.31 0.13 0.65
-0.42 -0.46 -0.31 -0.29 -0.22 -0.33 -0.02 -0.93 0.47 -0.02 0.64 0.84
-0.33 -0.44 -0.49 0.33 -0.29 -0.13 -0.76 -1.32 -0.42 -0.1 1.13 0.93
-0.01 -0.04 0.01 0.23 -0.02 -0.14 -0.04 -0.2 -0.08 -0.07 -0.01 0.3
0.06 -0.97 0.11 0.16 0.33 -0.99 0.12 -0.28 0.18 -0.17 0.34 0.36
-0.62 -0.49 0.17 0.25 -0.14 -0.21 0.41 -1.29 -1.41 -0.3 0.91 0.8
-0.56 -0.36 0.42 0.54 -0.16 -0.24 -0.57 -0.57 0.11 -0.32 0.27 0.66
-0.2 -0.63 -0.11 0.13 0.23 -0.1 0.35 -0.18 -0.06 -0.14 0.24 0.21
0.1 0.65 -0.18 -1.42 1.42 -0.72 -1.06 -0.27 -2.73 -1.68 1.34 -0.92
-0.57 -0.02 0.5 0.44 -0.54 -0.55 0.01 -0.81 -0.58 -0.78 0.84 0.66
0.11 -0.39 0.35 0.26 0.05 -0.12 0.01 -0.32 0.01 -0.57 0.07 0.25
-0.16 -0.18 0.45 0.21 0.1 -0.08 -0.17 -0.28 -0.33 -0.26 0.14 0.31
-0.12 0.02 0.14 0.11 0.16 -0.38 -0.14 -0.65 -0.03 -0.01 0.38 0.25
-0.14 -0.09 -0.01 -0.02 0.2 -0.33 -0.09 -0.0 0.15 -0.46 0.44 0.14
-0.46 -0.6 0.05 -0.12 -0.73 0.05 -0.88 -0.05 0.13 0.08 0.42 1.02
-0.24 -0.22 0.25 0.27 -0.14 -0.26 0.01 -0.27 0.08 -0.11 0.11 0.33
0.14 -0.13 1.0 -0.13 0.12 -1.53 -0.34 -0.64 -0.28 -0.13 -0.15 0.65
-0.38 0.13 0.56 0.17 0.03 -0.45 -0.18 -0.61 -0.37 -0.22 -0.0 0.7
0.48 -0.35 0.28 -0.01 -0.12 -0.41 0.09 -0.55 -0.22 0.33 0.01 0.09
0.08 -0.42 0.08 -0.04 -0.01 -0.03 0.08 0.01 -0.03 -0.14 0.26 0.06
0.11 -0.08 0.25 -0.14 -0.22 -0.03 -0.08 -0.53 0.19 -0.12 0.21 0.24
-0.14 -0.49 -0.94 -0.11 -0.3 -1.22 -0.12 -0.96 -0.07 0.58 0.97 0.89
-0.14 0.08 0.06 0.12 0.03 -0.32 -0.09 -0.36 0.09 -0.07 0.2 0.26
0.49 -0.78 0.45 -0.03 0.26 0.09 -1.47 -0.54 -0.1 -1.22 0.81 0.3
0.22 -0.24 0.26 0.03 0.08 0.09 0.06 -1.37 0.46 -0.13 -0.11 0.01
-1.12 - 0.63 1.01 - - - - -1.09 - 2.25 1.45
0.16 0.5 0.25 0.24 -0.18 -0.77 -0.59 -0.68 -0.4 -0.11 0.01 0.72
-0.07 -0.37 0.32 0.04 0.19 -0.14 0.22 0.01 -0.28 -0.2 -0.15 0.24
-0.02 -0.52 0.23 0.44 0.01 -0.79 0.28 -0.61 -0.14 -0.03 -0.13 0.61
0.11 -0.1 0.5 0.52 -0.58 -0.52 -0.8 -0.51 0.19 -0.79 0.09 0.78
0.17 0.4 0.3 0.3 -0.12 -0.77 -0.49 -0.7 -0.48 -0.08 -0.13 0.74
-0.56 -0.72 0.46 0.49 0.81 -0.57 0.15 -1.13 -0.89 -1.23 0.52 0.62
-0.05 -0.14 0.81 0.28 -0.16 -0.21 -0.08 -0.49 -0.02 -0.58 -0.2 0.3
-0.19 -0.36 0.53 0.26 -0.06 -0.26 -0.14 -0.67 -0.39 -0.11 0.36 0.48
0.08 -0.3 0.48 -0.19 -0.18 -0.79 -0.15 -0.86 0.39 -0.24 0.56 0.39
0.03 -0.06 -0.32 0.31 -0.49 -0.79 0.28 -0.43 -0.35 0.03 0.51 0.58
-0.12 -0.1 0.17 0.2 -0.1 -0.15 -0.02 -0.4 0.13 -0.13 0.13 0.27
-0.71 -0.64 -0.29 0.47 -0.19 -0.5 0.37 -0.06 -1.02 0.17 0.74 0.51
0.61 0.01 1.43 - 1.14 - - - -0.29 - 1.91 -
- -1.13 0.7 1.0 -1.01 - 0.88 - - - 1.85 0.98
-0.89 -0.38 -0.03 -0.92 0.06 -0.91 -0.04 -0.73 0.38 0.45 0.67 0.82
-0.45 -0.4 -0.05 0.69 0.04 -0.57 0.26 -1.18 -0.65 -0.91 0.86 0.68
0.05 -0.07 -0.11 0.12 -0.12 -0.31 -0.02 -0.01 -0.29 -0.07 0.22 0.43
-0.5 -0.6 -0.47 -0.73 0.45 -0.31 0.1 0.24 0.34 0.47 0.2 0.13
0.11 -0.5 -0.1 0.07 -0.69 -0.62 0.48 -0.43 -1.41 0.65 0.79 0.2
0.67 -1.44 -2.32 0.31 -1.26 0.17 0.39 -1.02 -0.26 0.78 0.64 0.19
-0.39 0.16 0.31 0.46 -0.21 -0.09 -0.26 -0.53 -0.16 -0.4 0.01 0.59
-0.06 -0.49 -0.13 0.02 0.02 0.0 0.3 -0.11 -0.07 -0.19 0.28 0.26
-0.02 -0.11 0.02 0.13 0.01 -0.13 -0.13 -0.14 -0.25 -0.01 0.27 0.26
-0.36 0.19 0.68 0.34 0.12 -1.29 -0.71 -0.7 -0.62 -0.0 0.08 0.83
-0.09 -0.25 0.07 -0.03 0.04 -0.02 0.12 0.04 -0.02 0.02 0.09 0.01
0.3 0.35 -0.7 0.31 -0.69 0.08 -0.46 -1.54 -0.44 -0.61 0.93 0.67
0.38 -0.47 0.97 0.32 -0.67 -0.65 -0.38 -0.67 -1.21 -0.02 -0.29 0.9
-0.2 -0.08 0.2 0.15 -0.19 -0.04 -0.15 -0.09 -0.17 -0.19 0.01 0.55
0.06 -0.07 0.06 0.02 -0.02 -0.09 -0.04 -0.08 -0.01 0.02 0.09 0.05
-0.38 -0.23 1.08 -0.01 -0.61 -0.27 -1.31 -1.17 -0.86 -0.68 0.5 1.24
-0.04 - 1.52 0.51 0.49 -1.75 0.46 -1.82 -0.0 - -0.8 0.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.