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Heatmap: Cluster_117 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.74 0.56 1.03 - 0.48 0.55 1.34 -0.79 - - - -0.23
-0.13 1.06 - 0.25 0.35 - - 0.92 -0.03 - 0.47 1.19
-0.68 0.44 0.22 0.23 -0.04 0.75 -0.94 -1.39 0.8 -0.31 -0.89 0.05
-0.01 0.15 -0.01 -0.12 0.12 -0.13 0.1 -0.04 0.02 -0.03 -0.1 0.02
0.08 0.11 -0.02 -0.16 -0.02 0.09 0.19 -0.07 -0.09 0.07 -0.33 0.07
0.62 0.2 0.22 -0.02 0.15 -0.61 0.62 -0.1 0.09 -0.13 -1.88 -0.55
-0.06 0.03 0.03 0.08 0.03 -0.0 -0.1 -0.02 -0.02 0.1 0.07 -0.16
0.54 -0.38 -0.03 -0.41 0.49 -0.12 -0.01 -0.29 -0.65 -0.15 0.57 -0.17
-0.24 0.11 -0.13 0.23 0.1 0.14 -0.07 -0.18 0.05 0.09 0.12 -0.33
0.57 1.33 -0.83 - 0.72 - -1.99 -0.46 0.57 1.33 - -0.3
-0.06 0.03 0.22 0.28 -0.08 -0.39 -0.34 -0.01 -0.13 0.17 0.22 -0.1
0.2 0.54 -0.52 0.01 0.28 -0.27 0.32 -1.07 -0.88 0.21 -0.3 0.49
0.27 0.75 -0.76 -0.78 0.78 -0.58 0.41 -0.13 -0.59 0.17 -0.3 -0.48
0.16 -0.14 0.02 -0.36 -0.19 0.05 -0.04 0.03 0.28 0.13 -0.36 0.24
0.22 0.06 -0.11 -0.1 0.16 -0.1 -0.03 0.04 -0.07 0.1 -0.19 -0.04
-0.03 0.2 0.27 0.08 0.04 -0.2 -0.09 0.0 -0.24 0.01 -0.04 -0.09
-0.06 -0.06 -0.03 -0.05 0.01 -0.09 0.15 0.07 -0.01 -0.02 0.05 0.03
0.67 1.01 -0.7 -0.67 0.87 - 0.96 -0.62 0.26 -1.47 -1.96 -0.12
0.33 0.23 0.45 -0.68 -1.09 0.32 -1.72 0.22 -2.34 0.48 0.79 0.1
-0.03 0.91 0.14 0.28 0.27 0.02 -0.11 -0.07 -1.03 -1.04 -0.18 -0.21
0.19 0.07 -0.18 -0.29 -0.06 0.11 0.28 -0.06 -0.16 0.01 -0.44 0.34
0.45 0.69 -0.43 -0.06 0.61 -1.37 -0.13 -0.84 -2.68 0.72 -0.93 0.69
-0.03 0.76 0.92 0.05 -0.02 -0.54 -0.33 0.17 -0.83 -0.34 -0.82 -0.15
-0.47 0.13 -0.05 1.03 -0.55 -0.58 -1.08 0.8 -0.92 -0.08 0.6 -0.7
0.3 0.01 -0.01 -0.01 0.47 -0.1 0.04 -0.56 -0.24 0.12 0.02 -0.32
0.08 0.22 0.02 0.12 0.01 -0.08 -0.08 -0.17 -0.19 -0.04 -0.02 0.07
0.23 0.26 -1.65 0.49 -0.53 -0.84 -0.39 -2.6 0.5 -2.48 1.06 1.03
0.2 -2.52 0.06 -0.6 0.5 -0.04 0.17 0.25 0.55 0.1 -0.67 0.14
0.22 -0.22 0.21 -0.49 -0.17 -0.3 -0.43 -0.04 0.28 0.04 -0.1 0.61
0.27 -0.73 -1.07 -1.37 0.18 0.65 0.1 0.58 0.61 0.74 -1.47 -0.96
0.27 -0.1 0.07 -0.19 -0.15 0.05 0.03 -0.01 0.16 -0.09 -0.27 0.13
0.48 0.21 -0.13 -0.44 0.22 -0.42 0.04 -0.13 -0.42 -0.06 0.32 -0.01
0.08 -0.16 -0.03 -0.27 0.04 -0.09 0.23 -0.0 0.1 -0.03 -0.01 0.08
0.33 -0.26 0.07 -0.13 -0.01 0.03 0.1 -0.42 0.08 0.04 0.13 -0.11
0.1 -0.31 0.01 0.11 0.14 -0.03 0.01 0.02 0.07 -0.06 -0.1 -0.02
0.52 -0.07 0.43 0.51 -0.83 0.35 0.42 0.55 -0.23 -1.64 -1.72 -0.47
0.18 0.43 1.14 -0.23 -0.17 -2.26 -1.34 0.12 -0.96 0.02 0.69 -0.43
0.42 -0.4 0.45 -0.75 0.58 -1.1 0.29 0.27 0.07 -0.6 -0.47 0.18
-0.18 0.14 0.49 0.29 0.03 -0.32 -0.73 -0.2 0.24 -0.37 0.24 -0.07
0.23 0.0 -0.04 0.0 0.24 -0.08 0.24 -0.01 0.04 -0.09 -0.43 -0.25
-0.04 0.43 0.24 0.1 -0.01 -0.03 0.01 0.0 -0.3 -0.25 -0.21 -0.1
0.45 1.02 -2.22 0.02 0.0 -2.03 -0.39 -0.54 -0.14 -1.59 0.19 1.2
0.06 0.14 0.02 -0.19 0.15 -0.14 -0.16 0.19 0.18 0.09 -0.36 -0.12
0.06 0.31 -0.01 0.1 -0.01 -0.08 0.05 0.02 -0.28 0.06 -0.31 -0.02
0.65 -1.53 -1.05 -2.6 0.5 0.14 0.29 -0.35 1.06 -0.69 0.44 -0.23
0.35 -0.01 0.27 0.28 0.53 -0.54 -0.33 0.24 -2.03 0.17 0.38 -0.94
0.22 0.26 0.14 -0.03 0.17 -0.12 -0.01 0.04 -0.14 -0.23 -0.29 -0.13
-0.01 -0.41 -0.13 -0.03 -0.01 0.16 0.15 0.2 0.2 0.04 -0.29 -0.01
0.01 0.29 0.13 0.09 0.07 -0.06 -0.05 -0.03 -0.23 -0.29 -0.08 0.05
-0.8 0.81 -1.41 -0.06 0.05 -0.49 -0.67 0.57 0.49 -0.02 -0.81 0.6
0.69 0.65 -0.08 -1.6 1.25 -1.54 0.47 -0.4 0.38 -1.28 -0.37 -2.32
0.37 0.37 1.06 0.5 0.49 0.25 -1.6 -0.81 -1.72 0.09 0.08 -
0.9 - -0.26 - 0.81 -1.07 0.07 -0.32 1.23 0.87 0.07 -
0.28 0.25 0.07 -0.14 0.17 -0.38 -0.05 -0.34 -0.09 0.16 -0.39 0.23
0.16 -0.34 -0.01 0.7 0.46 -0.8 0.85 0.3 0.04 -0.51 -1.27 -1.53
0.24 -0.28 -0.0 -0.39 0.02 0.14 0.05 0.05 0.24 -0.05 -0.04 -0.13
0.56 -0.03 0.03 -0.25 0.49 -1.78 -0.38 -0.07 -0.1 0.18 -0.77 0.69
0.15 -0.35 0.1 -0.06 0.03 -0.13 0.22 -0.08 0.07 -0.06 -0.01 0.06
0.05 0.09 -0.0 -0.26 -0.1 0.01 0.23 0.01 -0.03 0.02 -0.31 0.2
- 1.26 - 0.42 -1.01 0.85 - 1.03 0.02 0.57 -0.49 -0.47
0.68 1.01 - - - 0.96 0.79 0.66 0.62 0.67 - -
0.18 0.04 -0.14 -0.13 -0.12 -0.21 0.14 -0.09 0.03 -0.19 0.15 0.25
0.93 - -0.3 - - 0.29 1.23 -2.07 1.03 0.35 -0.32 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.