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Heatmap: Cluster_81 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.03 0.16 0.19 0.5 0.16 0.14 -0.06 0.02 -0.39 -0.26 -0.41 -0.4
-0.31 -0.13 0.38 0.37 0.3 -0.2 -0.47 -0.05 0.0 0.14 -0.17 -0.12
0.05 0.1 -0.01 0.06 0.24 0.05 0.09 0.21 -0.29 -0.06 -0.41 -0.16
-0.2 0.05 0.07 0.07 0.28 0.27 0.07 0.42 -0.3 0.03 -0.41 -0.77
-0.02 0.11 -0.11 -0.07 0.11 0.08 -0.12 0.03 -0.09 0.2 -0.23 0.04
0.01 -0.21 -0.13 -0.3 0.01 -0.21 0.22 0.44 -0.33 0.43 -0.01 -0.19
-3.04 -0.06 -0.5 0.46 0.9 0.63 0.29 0.82 -0.1 -0.47 -1.05 -1.72
0.15 0.06 0.04 -0.04 -0.03 0.06 0.13 0.13 -0.23 0.09 -0.27 -0.17
0.7 0.6 0.32 -0.29 -0.31 0.11 0.28 0.24 -0.92 -0.05 -1.35 -0.68
0.02 0.07 0.21 -0.02 -0.04 0.25 0.05 0.19 -0.45 -0.08 -0.28 -0.07
-0.43 -0.07 0.1 0.21 0.37 0.35 0.25 0.3 -0.38 -0.16 -0.57 -0.45
-0.26 0.19 0.06 0.48 0.62 0.34 0.07 0.41 -1.1 -0.07 -1.25 -0.85
0.15 0.59 -0.75 0.75 -0.71 0.59 -0.32 1.72 -1.57 -1.9 -3.27 -2.38
0.09 0.14 0.1 0.02 0.17 -0.08 0.05 0.18 -0.2 -0.02 -0.38 -0.17
0.12 0.2 0.1 -0.07 -0.01 -0.04 0.08 0.01 -0.12 0.05 -0.14 -0.24
-0.48 0.5 0.95 0.65 0.62 0.22 -0.5 0.19 -1.33 -0.88 -1.25 -1.09
0.03 0.06 0.08 -0.06 0.17 0.16 -0.05 0.05 -0.14 -0.02 -0.17 -0.15
0.05 0.17 0.01 -0.16 0.07 0.16 0.06 0.13 -0.16 -0.08 -0.16 -0.16
-1.26 0.08 0.43 0.51 0.58 0.7 -0.14 0.88 -0.95 -0.47 -1.59 -1.65
-2.29 -0.34 -0.27 0.74 0.88 0.7 0.38 0.84 -0.33 -0.33 -1.99 -3.28
-0.15 0.02 0.17 0.52 0.32 0.22 -0.07 -0.07 -0.15 -0.34 -0.32 -0.51
-0.03 0.3 0.21 0.25 0.32 0.01 -0.04 -0.01 -0.36 -0.27 -0.43 -0.2
-0.42 0.05 0.44 -0.06 0.61 0.44 0.65 0.74 -2.21 -0.51 -2.3 -0.6
0.98 -0.13 0.1 -0.28 0.21 0.28 0.08 0.36 -1.7 0.07 -0.73 -0.86
0.06 0.18 -0.08 -0.05 -0.09 0.21 -0.01 0.09 -0.06 -0.13 -0.1 -0.07
0.17 0.13 0.36 0.38 0.41 0.36 0.02 -0.09 -0.55 -0.5 -0.57 -0.82
0.07 0.06 0.06 0.33 -0.01 -0.06 0.01 0.06 -0.08 -0.13 -0.24 -0.17
0.34 0.0 0.13 -0.55 -0.01 0.02 0.14 0.43 -0.25 -0.02 -0.23 -0.32
-0.18 0.03 -0.02 -0.12 0.14 0.31 0.11 0.5 -0.4 0.03 -0.44 -0.26
0.02 -0.14 0.07 -0.1 0.12 0.17 0.14 0.16 -0.15 -0.06 -0.17 -0.13
0.09 0.57 0.35 0.87 0.44 0.16 -0.51 0.14 -1.44 -0.9 -0.75 -0.78
0.01 0.22 -0.12 0.12 0.17 0.35 -0.04 0.16 -0.02 -0.07 -0.4 -0.67
-0.11 0.36 0.32 0.57 0.4 0.09 -0.07 -0.12 -0.38 -0.51 -0.66 -0.52
-0.15 0.41 0.39 0.46 0.41 0.05 -0.07 -0.07 -0.39 -0.41 -0.66 -0.58
-0.56 0.02 0.63 1.52 1.25 - -0.82 -0.48 -1.0 -1.14 -1.22 -0.23
-0.21 -0.06 0.22 -0.13 -0.04 1.0 -0.12 0.85 -0.98 -0.75 -0.82 -0.44
-0.1 -0.16 0.34 0.45 0.0 -0.24 0.22 0.06 -0.12 -0.02 -0.26 -0.43
-0.33 -0.39 -0.85 -0.49 0.55 0.11 0.33 0.48 0.3 0.55 -0.4 -0.92
-0.04 0.09 0.2 -0.11 0.16 0.16 -0.05 0.09 -0.14 -0.07 -0.24 -0.14
-0.34 0.07 0.22 0.29 0.22 -0.0 -0.22 -0.02 0.03 -0.09 -0.27 -0.03
-0.77 -0.07 -0.47 0.11 0.57 0.6 0.47 0.46 -0.36 -0.01 -0.89 -0.8
-0.39 -0.16 -0.02 0.14 0.66 0.42 0.1 0.05 -0.1 -0.12 -0.39 -0.7
-0.55 0.81 -0.85 -0.19 0.81 0.7 -0.39 0.9 -0.59 -0.59 -0.51 -3.47
-0.29 0.46 0.27 0.41 0.4 -0.06 0.01 0.12 -0.59 -0.14 -0.62 -0.54
0.08 0.05 0.08 -0.04 0.11 0.2 0.07 0.13 -0.25 -0.07 -0.28 -0.18
0.2 0.23 -0.09 -0.38 0.06 0.44 -0.02 0.43 -0.1 -0.08 -0.53 -0.55
-1.67 0.91 -0.25 0.51 0.62 0.55 -0.21 1.19 -1.59 -1.41 -1.05 -2.31
-0.08 0.51 0.22 0.11 0.26 0.4 -0.14 0.24 -0.59 -0.18 -0.68 -0.72
-0.02 0.33 -0.05 -0.16 0.07 0.38 0.23 0.34 -0.62 -0.04 -0.65 -0.23
-0.13 0.25 0.26 0.47 0.54 -0.11 0.08 0.17 -0.46 -0.33 -0.62 -0.81
-0.04 0.28 0.05 -0.03 0.34 0.17 0.15 0.29 -0.12 -0.48 -0.29 -0.71
0.1 0.1 0.1 -0.08 0.1 0.07 0.18 0.51 -0.5 -0.05 -0.41 -0.46
0.16 0.24 -0.14 -0.07 0.05 0.27 0.05 0.1 -0.03 -0.03 -0.34 -0.42
-0.89 0.02 0.41 0.74 0.57 0.58 0.06 0.54 -1.12 -0.69 -1.95 -0.65
-0.01 0.19 0.23 0.21 0.15 -0.05 -0.16 -0.13 0.0 -0.26 -0.17 -0.11
-0.44 -0.04 0.27 0.48 0.36 -0.04 -0.05 0.04 -0.14 -0.15 -0.33 -0.26
0.89 1.09 0.14 0.11 -2.03 0.43 -1.71 1.05 -0.56 -1.15 -1.1 -1.77
0.02 0.82 -0.15 0.37 0.25 0.46 -0.2 0.64 -1.21 -0.84 -1.18 -0.76
-0.26 0.33 -0.04 0.14 0.19 0.4 0.02 0.68 -0.69 -0.09 -1.06 -0.46
0.1 0.33 0.08 -0.18 0.08 0.22 -0.02 0.22 -0.45 -0.13 -0.44 -0.04
-0.24 -0.4 -0.07 0.57 0.39 0.39 0.06 0.01 0.24 -0.58 -0.3 -0.66
-0.76 1.19 -1.14 0.23 0.7 -0.34 -0.24 0.76 -0.05 -0.22 -1.72 -1.23
0.09 0.41 0.22 0.02 0.22 0.1 -0.02 0.37 -0.69 -0.4 -0.53 -0.23
0.23 -0.22 -0.42 -0.12 0.22 0.39 -0.08 0.32 -0.09 0.35 -0.33 -0.69
-0.27 -0.26 -0.22 -0.13 0.31 0.27 -0.16 0.29 0.17 0.18 -0.17 -0.23
-0.34 -0.51 -0.84 -0.15 0.76 0.69 0.04 0.0 -0.26 0.55 -0.4 -0.61
-0.72 0.19 0.35 1.06 0.85 -0.11 0.15 0.15 -1.09 -1.06 -1.54 -0.65
-0.03 0.37 0.51 0.47 0.05 -0.2 -0.49 -0.16 0.33 -0.91 -0.14 -0.51
-0.27 -0.04 0.08 0.07 0.28 0.24 0.35 0.66 -0.49 -0.2 -0.85 -0.53
0.09 0.41 -0.05 1.41 -0.41 -1.8 -0.22 0.33 -1.96 0.24 0.21 -2.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.