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Heatmap: Cluster_107 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.4 0.46 0.25 0.05 -0.28 -0.48 -0.3 -0.54 -0.07 -0.42 0.38 0.06
0.48 -0.4 0.6 0.2 -1.03 -0.7 -0.56 -2.16 0.52 -0.29 0.73 0.35
0.37 0.36 -0.21 -0.08 -0.26 0.1 -0.21 -0.7 -0.66 0.02 0.14 0.57
0.19 0.19 0.16 -0.04 -0.08 -0.19 -0.29 -0.18 -0.15 0.05 -0.03 0.26
0.05 -0.05 0.06 -0.02 -0.06 -0.2 0.15 -0.25 0.0 -0.08 -0.03 0.32
0.28 0.03 0.1 0.0 -0.39 -0.46 -0.08 -0.28 0.06 -0.03 0.08 0.43
0.45 -0.12 0.25 0.0 -0.25 -0.48 -0.25 -0.32 -0.2 -0.27 0.18 0.57
0.3 0.1 0.16 0.05 -0.01 -0.27 -0.18 -0.22 0.12 -0.31 0.17 -0.05
0.28 -0.12 -0.03 -0.1 -0.33 -0.17 0.23 -0.42 -0.06 -0.27 0.02 0.63
0.29 -0.04 0.15 -0.15 -0.21 -0.09 -0.02 -0.08 -0.06 -0.27 -0.02 0.36
0.12 0.07 -0.07 -0.15 -0.08 -0.13 -0.32 -0.19 -0.13 0.2 0.23 0.31
0.08 0.06 -0.17 -0.02 -0.25 -0.38 -0.08 -0.2 0.14 0.03 0.19 0.43
0.17 -0.04 -0.05 0.02 -0.09 -0.07 -0.08 -0.16 0.03 -0.13 -0.02 0.34
0.33 0.08 0.16 -0.15 -0.07 -0.37 -0.07 -0.21 -0.09 -0.15 -0.06 0.4
0.0 -0.1 -0.02 -0.07 -0.06 -0.05 0.08 -0.05 0.06 -0.0 -0.05 0.22
0.36 -0.25 0.59 0.27 -0.57 -0.4 -0.12 -0.96 0.1 -0.44 0.35 0.27
0.3 0.04 0.2 -0.15 -0.13 -0.19 -0.06 -0.09 -0.28 -0.07 0.02 0.28
0.3 -0.01 0.2 -0.17 -0.16 -0.22 -0.09 -0.52 0.08 -0.17 -0.15 0.59
0.22 -0.16 -0.04 0.03 -0.4 -0.51 -0.28 -0.24 0.18 0.18 0.35 0.36
0.03 -0.08 0.19 0.04 -0.12 -0.03 -0.03 -0.22 -0.04 -0.12 -0.01 0.31
0.85 0.69 0.24 -0.73 -1.51 -1.48 -0.74 -0.86 -0.01 -0.32 0.16 1.02
0.14 0.37 0.1 -0.07 -0.29 -0.34 -0.33 -0.33 0.32 -0.07 -0.01 0.25
0.1 -0.04 0.59 -0.39 -0.4 -0.08 -0.31 -0.77 -0.12 -0.27 -0.19 0.97
0.63 -0.88 0.34 0.04 -1.29 -1.13 -0.59 -1.11 -0.2 -0.47 1.01 1.01
0.27 0.0 0.08 -0.11 -0.13 -0.31 -0.08 -0.37 0.04 0.02 -0.01 0.41
0.2 0.32 0.11 0.06 -0.25 -0.2 -0.2 -0.25 -0.01 -0.15 -0.04 0.26
0.6 -0.09 -0.02 -0.16 -2.33 -0.08 0.24 -1.52 -0.03 0.06 0.45 0.67
0.22 0.19 0.22 0.01 -0.16 -0.37 -0.23 -0.23 0.08 -0.16 0.16 0.11
0.33 -0.06 0.08 -0.1 -0.06 -0.39 -0.0 -0.41 0.05 -0.14 0.01 0.46
1.05 -0.64 0.02 0.45 -0.09 - 0.13 -3.11 -0.73 -0.48 0.3 1.14
0.12 -0.24 -0.11 -0.1 -0.28 -0.24 0.0 -0.23 0.06 0.01 0.4 0.39
0.33 0.14 0.18 -0.25 -0.56 -0.63 -0.25 -0.32 0.24 -0.07 0.23 0.48
0.76 -0.59 0.02 -0.48 -1.02 -0.29 -0.2 -1.42 0.24 -0.26 0.44 0.99
1.25 0.97 0.24 -0.82 -1.37 -1.32 -0.71 -0.51 -0.4 -0.61 -0.25 0.65
0.25 -0.09 -0.07 -0.11 -0.15 -0.33 -0.07 -0.13 -0.02 -0.01 0.17 0.39
0.24 0.53 0.33 -0.07 -0.48 -0.44 -0.38 -0.15 0.08 -0.18 -0.11 0.22
0.18 0.2 0.06 -0.07 -0.1 -0.12 -0.27 -0.07 -0.1 0.03 0.01 0.18
0.25 0.15 -0.12 -0.25 -0.13 0.04 -0.24 -0.23 -0.09 0.12 0.1 0.26
0.31 -0.35 -0.21 -0.14 -0.31 -1.1 0.21 -0.06 -0.22 0.13 0.28 0.72
0.31 -0.22 0.06 -0.29 -0.13 -0.29 0.06 -0.37 -0.0 -0.2 0.16 0.6
0.15 0.09 0.1 -0.03 -0.12 -0.14 -0.23 -0.3 -0.02 -0.0 0.12 0.29
0.66 0.57 0.32 -0.06 -0.51 -1.1 -1.08 -0.91 -0.06 -0.05 -0.07 0.74
0.69 -0.13 -0.03 -0.41 -0.63 -0.5 0.1 -1.1 -0.42 -0.35 0.2 1.11
0.17 0.21 0.11 -0.11 -0.25 -0.16 -0.01 -0.22 -0.05 -0.05 -0.06 0.29
0.25 -0.05 0.22 -0.02 -0.3 -0.25 -0.18 -0.28 0.07 -0.1 0.09 0.36
0.65 -0.26 -0.3 -0.28 -0.12 -0.51 -0.18 -0.4 -0.2 -0.44 0.54 0.71
0.71 0.11 -0.09 -0.89 -0.54 -0.24 -0.44 -0.45 0.11 0.19 0.19 0.52
0.44 -0.02 -0.01 -0.27 -0.41 -0.34 -0.12 -0.38 -0.09 -0.15 0.15 0.72
0.44 0.17 0.07 -0.22 -0.12 -0.3 -0.32 -0.13 -0.04 -0.29 0.19 0.31
0.36 0.09 0.17 -0.01 -0.16 -0.33 -0.17 -0.25 -0.11 -0.05 0.04 0.27
0.21 -0.07 0.15 0.14 -0.32 -0.41 -0.12 -0.19 0.14 -0.19 -0.02 0.45
0.43 0.35 0.3 -0.09 -0.42 -0.56 0.02 -0.21 -0.35 -0.13 -0.36 0.5
0.35 -0.5 -0.05 -0.4 -0.74 0.08 0.38 -0.86 -0.0 -0.03 -0.51 1.07
0.36 -0.06 -0.04 0.01 -0.16 -0.47 -0.15 -0.38 0.06 -0.05 0.13 0.49
0.41 0.15 0.35 -0.12 -0.71 -0.84 -0.39 -0.41 0.17 -0.01 0.23 0.47
0.45 0.55 0.42 -0.08 -0.68 -0.7 -0.61 -0.5 0.04 -0.22 0.24 0.29
0.25 0.03 0.02 -0.11 -0.26 -0.37 -0.23 -0.08 0.07 -0.05 0.28 0.28
0.29 0.06 0.26 0.01 -0.05 -0.12 -0.34 -0.54 0.01 -0.28 -0.13 0.51
0.25 -0.04 0.12 -0.08 -0.04 -0.2 -0.04 -0.2 -0.08 -0.1 -0.11 0.38
0.18 0.17 0.22 -0.01 -0.33 -0.48 -0.3 -0.36 0.28 -0.13 0.25 0.23
0.6 0.03 -0.26 -0.22 -0.9 -0.72 -0.17 -0.42 0.2 -0.15 0.27 0.8
0.01 0.29 0.05 -0.37 -0.74 0.11 -0.37 -0.45 0.23 0.01 0.11 0.61
0.42 0.12 0.18 -0.04 -0.17 -0.19 -0.3 -0.35 -0.21 -0.15 0.12 0.32
0.11 0.05 0.05 -0.1 -0.21 -0.31 0.04 -0.42 -0.06 -0.22 0.13 0.64
0.34 0.16 0.1 -0.03 -0.04 -0.37 -0.12 -0.24 -0.18 -0.26 0.12 0.32
0.63 -0.22 0.3 0.15 -0.87 -0.27 -0.23 -0.78 0.12 -1.2 0.54 0.56
0.33 -0.12 0.2 -0.09 -0.39 -0.25 0.4 -0.7 -0.27 -0.07 -0.38 0.73
0.29 -0.21 -0.31 -0.47 -0.34 -0.68 0.34 0.03 0.13 -0.1 0.14 0.63
0.15 -0.21 -0.14 -0.28 -0.1 -0.45 -0.18 -0.1 0.2 0.14 0.26 0.45
0.39 0.49 0.15 0.09 -0.07 -0.23 -0.32 -0.5 -0.16 -0.4 0.06 0.14
0.61 0.02 -0.08 -0.46 -0.42 -0.41 -0.19 -0.27 -0.18 -0.08 0.18 0.71
0.67 0.78 0.58 0.17 -0.52 -0.95 -0.8 -0.75 -0.08 -0.7 0.12 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.