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Heatmap: Cluster_68 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.44 0.54 0.42 -0.38 -0.01 -0.45 -1.0 -0.02 -0.04 0.4 -0.39 -0.3
0.69 0.15 0.22 -0.18 -0.56 -0.51 -0.29 -0.44 -0.5 -0.0 0.21 0.53
- - - - - - - - - 2.49 2.68 -
- - 0.84 - 1.93 - - - - 2.02 - 1.23
0.19 0.35 0.12 -0.18 -0.24 -0.04 -0.48 -0.33 -0.54 -0.13 0.42 0.44
0.04 0.17 0.11 -0.36 -0.27 -0.99 -0.78 -1.21 -1.23 -0.3 0.89 1.35
0.34 0.42 0.17 -0.13 0.14 -0.43 -0.62 -0.25 -0.58 0.01 0.28 0.17
0.65 -0.32 0.45 -0.5 -0.74 -0.86 0.59 -0.17 -0.71 -0.21 -0.32 0.8
-0.44 -0.63 0.16 0.25 -0.01 -0.29 0.43 -0.53 0.0 -0.23 0.12 0.6
1.76 0.25 - 0.5 - - - - - 0.53 0.72 1.55
0.21 0.23 0.02 0.06 0.13 0.13 -0.2 -0.04 -0.2 0.08 -0.33 -0.22
0.07 0.23 0.24 -0.1 -0.36 -0.18 -0.3 -0.13 -0.44 0.1 0.25 0.34
0.31 -0.22 -0.07 -0.32 -0.25 -0.22 -0.07 -0.04 -0.04 0.11 0.07 0.5
0.07 0.2 0.01 0.01 0.04 -0.02 -0.14 0.13 -0.17 0.04 -0.01 -0.21
0.2 0.2 0.2 -0.45 0.07 -0.2 -0.64 0.03 -0.15 0.24 -0.08 0.27
1.25 - 0.33 -0.14 -0.11 -1.19 0.48 - -0.17 -0.1 0.06 0.88
0.4 0.01 0.89 -1.49 -0.07 -0.09 0.78 -0.56 -0.07 -0.63 -1.01 0.12
0.44 -1.27 0.99 -1.52 0.07 -0.79 0.32 -3.22 -0.74 -0.08 0.54 0.93
0.85 0.71 0.37 0.53 -0.11 -1.38 -1.15 -1.06 -0.68 0.21 -0.48 0.11
0.48 0.62 0.19 -0.03 -0.35 -0.65 -1.06 -0.74 -0.72 0.08 0.46 0.49
0.42 -0.1 0.02 -0.31 -0.2 -0.24 -0.06 -0.16 0.16 -0.3 0.11 0.41
0.3 0.65 0.08 -0.15 -0.08 -0.42 -0.86 -0.38 -0.75 -0.04 0.35 0.46
-0.1 0.07 -0.33 -0.44 0.01 0.27 0.16 0.33 -0.08 -0.25 0.11 0.05
0.44 0.53 0.39 0.37 -0.1 -0.35 -0.61 -0.56 -0.87 -0.22 -0.09 0.27
0.61 0.77 0.49 0.96 -0.45 0.25 - 0.05 -0.62 -1.71 -0.45 -0.35
0.74 0.52 -0.74 -0.96 0.05 -0.31 0.6 -0.0 -0.05 -1.24 -0.14 0.18
0.39 0.45 0.12 -0.09 -0.26 -0.36 -0.76 -0.95 -0.59 0.12 0.61 0.38
0.25 0.12 0.04 -0.06 -0.16 -0.11 -0.22 -0.05 0.1 0.03 -0.01 -0.01
1.52 - - - - - - - - 1.85 - 2.46
0.63 0.22 0.15 -0.58 -0.48 -0.51 -0.18 -0.85 -0.16 0.46 -0.34 0.67
0.77 0.12 -0.18 -0.53 -1.16 -0.6 -0.54 0.29 -0.28 0.1 -0.11 0.84
0.41 0.26 0.28 -0.14 -0.3 -0.17 -0.2 0.03 -0.43 -0.27 -0.16 0.35
0.18 0.28 0.23 0.15 -0.09 -0.31 -0.26 -0.2 -0.17 0.08 -0.24 0.17
0.06 -0.11 -0.11 0.19 -0.29 -0.61 -0.05 -0.16 -0.19 -0.05 0.27 0.66
0.28 0.19 -0.1 0.05 -0.2 -0.26 -0.43 -0.15 -0.33 0.14 0.28 0.28
0.03 0.08 0.24 -0.0 0.01 -0.18 0.03 -0.06 -0.3 -0.13 0.03 0.17
1.7 - - - - - - - - 2.03 2.22 -
-1.2 -0.69 -0.07 -0.43 0.07 0.11 -0.7 -1.48 -0.33 1.67 -0.72 0.65
- - 0.08 -2.52 - -0.77 0.48 0.38 -0.26 1.39 -0.22 1.67
0.2 - - 0.39 - - 0.22 - - 1.53 1.11 1.74
0.67 -0.01 0.23 0.02 -0.99 -0.09 0.17 -0.39 -0.67 -0.29 0.03 0.51
-0.84 - - - - - 0.77 - - 1.81 2.48 -0.6
0.04 -0.18 0.39 -0.27 0.15 -0.29 0.06 -0.07 -1.3 -0.06 0.28 0.54
- - - - - - - - - 2.48 - 2.68
0.05 -0.08 0.12 -0.04 -0.09 0.02 0.11 -0.07 -0.11 -0.13 -0.01 0.17
0.33 -0.09 -0.14 -0.14 -0.23 0.05 -0.23 -0.11 -0.42 0.29 0.21 0.25
0.15 0.49 0.17 -0.13 -0.44 -0.38 -0.59 -0.4 -0.34 0.15 0.23 0.54
0.65 0.63 0.03 -0.4 -0.22 -0.87 -0.7 -0.09 -0.78 0.36 -0.22 0.5
0.58 0.52 0.22 -0.09 -0.39 -0.41 -0.77 -0.61 -0.63 0.07 0.29 0.36
0.18 0.36 0.04 -0.33 -0.17 -0.35 -0.29 -0.06 -0.13 -0.22 0.23 0.44
-0.78 -0.58 -0.28 -0.16 -0.23 -0.79 0.49 0.22 -0.71 -0.5 0.89 0.89
0.18 0.3 0.04 -0.09 0.12 0.02 -0.16 -0.07 -0.38 -0.0 0.05 -0.11
0.73 -0.2 -0.52 -0.27 -0.57 -0.02 0.17 0.46 -0.05 -1.55 0.69 -0.2
0.05 0.94 -0.13 -0.4 0.12 -0.88 -0.87 -0.43 0.33 0.27 -0.27 0.22
0.08 -0.04 -0.27 0.43 0.0 -0.2 -0.07 -0.1 -0.73 0.12 0.32 0.14
-0.97 1.06 0.64 0.14 1.16 -1.75 -0.59 0.65 -0.31 -1.36 -1.72 -1.04
1.12 1.17 - - - - - - - - 1.03 2.47
-0.18 0.38 0.41 -0.45 -0.53 -0.42 0.07 -0.34 0.02 0.56 -0.22 0.18
0.17 0.84 0.38 -1.3 0.07 -0.12 -0.33 -1.85 -0.47 0.25 0.51 0.0
- 1.44 - -0.79 1.44 0.29 -0.97 0.36 - - -0.47 1.17
0.59 0.3 0.09 -0.16 -0.45 -0.51 -0.41 -0.13 -0.79 -0.08 0.44 0.41
0.22 0.05 -0.12 -0.04 0.09 -0.07 -0.21 -0.12 -0.24 0.18 -0.05 0.23
0.08 0.43 0.2 0.15 0.59 -0.86 -0.07 0.13 -0.89 -0.87 -0.09 0.28
0.27 -0.14 0.13 -0.16 -0.05 -0.15 -0.11 -0.36 0.02 0.02 0.15 0.26
-0.01 0.05 -0.01 -0.07 -0.17 0.02 0.05 0.11 -0.22 -0.17 0.1 0.26
0.24 -0.07 0.13 -0.03 -0.1 -0.13 -0.02 -0.02 -0.24 -0.26 0.07 0.31
0.36 0.34 0.11 0.08 0.1 -0.34 -0.51 0.02 -0.29 -0.1 -0.18 0.13
0.35 0.33 0.09 -0.39 -0.24 -0.35 -0.72 -0.11 -0.63 0.21 0.49 0.33
0.28 0.45 0.06 -0.28 -0.11 -0.47 -0.2 -0.08 -0.1 -0.2 0.11 0.28
-0.83 0.02 0.09 0.88 -0.51 -2.06 0.45 0.03 -1.38 0.3 -2.51 1.27
0.33 0.28 -0.08 -0.71 -0.12 -0.29 0.07 -0.04 -0.21 -0.17 0.21 0.37
0.26 0.34 0.15 -0.05 -0.09 -0.34 -0.51 -0.37 -0.38 0.09 0.36 0.19
0.9 -0.24 0.38 -0.95 -1.52 -0.21 -0.46 -0.96 0.07 0.59 -0.57 0.83
0.21 0.23 0.15 -0.12 -0.16 0.04 -0.54 -0.36 -0.33 0.15 0.12 0.33
0.33 -0.09 0.24 -0.17 0.06 -0.01 -0.07 -0.11 -0.01 0.07 -0.19 -0.17
0.84 - -0.56 - -0.16 0.2 0.92 - -0.62 -0.58 0.75 1.38
0.36 0.43 -0.13 -0.41 0.23 -0.28 -1.12 0.14 0.02 0.5 -0.68 0.14
0.91 0.52 0.22 -1.38 0.3 -1.71 -1.1 -0.97 -4.97 0.6 0.97 0.16
0.57 0.02 0.19 -0.16 -0.24 -0.09 -0.18 -0.14 -0.29 -0.32 -0.05 0.38
0.58 0.29 0.24 -0.27 -0.46 -0.14 -0.38 -0.25 -0.37 -0.15 0.07 0.39
0.43 0.48 0.07 -0.06 0.09 -0.25 -0.47 -0.59 -0.74 0.04 0.22 0.22
1.26 - 0.65 -1.58 0.4 -1.43 1.03 - - 0.49 -0.03 0.67
2.14 0.19 - - - - - - - 1.47 - 1.89
- -0.16 -0.05 -0.01 - - -0.19 - -0.28 1.16 -0.31 2.14
0.29 0.24 -0.02 -0.38 0.08 -0.15 -0.11 -0.27 0.21 -0.29 0.28 -0.08
0.82 -0.58 0.57 -0.24 -0.47 -0.02 0.09 -0.33 -0.99 -0.81 0.27 0.47
1.21 - -0.66 0.67 0.53 -0.59 -0.38 -0.66 -0.75 -0.47 - 1.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.