Heatmap: Cluster_104 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.18 0.0 0.15 0.11 0.19 0.0 0.3 0.21 0.23 0.08 0.31 0.17
0.05 0.16 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.09 0.08 0.02
0.1 0.0 0.0 0.12 0.11 0.04 0.04 0.03 0.21 0.44 0.0 0.1
0.31 0.21 0.31 0.84 0.38 0.38 0.8 0.48 0.37 0.64 0.32 0.62
1.76 2.06 1.28 1.34 1.61 0.53 2.12 1.09 1.53 2.39 1.53 1.73
0.57 0.46 0.37 1.12 0.73 0.8 0.59 0.19 0.6 1.02 0.9 0.75
5.97 4.7 5.97 5.25 6.03 4.75 6.34 4.05 6.82 5.71 5.81 6.27
21.01 21.26 24.79 23.09 26.13 23.78 24.08 24.46 23.6 25.42 25.62 24.52
1.48 2.43 1.39 1.31 1.9 2.59 1.33 1.22 2.29 2.77 2.54 1.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11
4.97 8.66 4.4 4.72 6.72 4.38 8.02 6.25 6.33 7.44 6.27 7.79
0.0 0.34 0.2 0.4 0.62 0.0 0.23 0.33 0.07 0.61 0.48 0.18
5.16 6.18 7.76 4.61 5.34 3.04 7.52 5.82 5.93 5.6 7.47 6.76
3.57 4.03 4.74 3.32 3.41 2.57 4.83 3.21 3.75 3.6 3.51 5.01
0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.04 0.06 0.02 0.11 0.07 0.03 0.05
1.65 1.15 1.69 1.81 2.01 1.37 2.48 1.12 1.56 2.05 1.66 1.9
1.45 1.53 2.04 2.16 1.73 1.49 2.21 1.38 1.42 1.83 2.57 1.32
1.69 1.73 2.05 1.98 1.97 1.46 1.91 1.32 1.38 1.94 2.39 1.37
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
1.43 0.98 1.39 1.13 0.99 0.96 1.22 1.32 1.05 0.82 1.06 1.33
0.12 0.0 0.07 0.07 0.14 0.0 0.08 0.27 0.06 0.0 0.0 0.2
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0
0.57 0.67 0.87 0.9 1.41 0.97 1.1 0.39 0.44 0.96 0.91 0.64
1.76 0.73 1.21 0.94 0.9 0.61 0.87 0.2 1.46 2.13 1.12 1.94
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.08 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.16 0.0 0.04
0.72 0.6 0.46 1.26 1.42 0.84 1.25 0.88 0.51 1.15 0.83 0.73
0.0 0.05 0.02 0.07 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.12 0.09 0.02
0.09 0.11 0.24 0.15 0.0 0.12 0.0 0.17 0.04 0.12 0.43 0.3
0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.08 0.11 0.02
0.25 0.19 0.14 0.71 0.27 0.32 0.56 0.34 0.5 0.81 0.87 1.12
18.11 22.49 20.3 16.92 16.49 16.78 16.89 20.76 15.02 16.92 15.16 21.0
1.87 1.79 2.18 2.95 1.71 1.33 2.72 1.81 2.88 2.32 2.86 2.46
9.78 7.61 9.02 9.06 9.25 8.38 12.92 7.93 11.94 11.85 10.55 10.19
0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.17 0.0
4.12 4.27 4.29 3.69 3.86 3.64 4.26 4.69 3.65 4.71 3.61 4.18
0.28 1.29 1.42 1.53 1.78 0.58 1.66 0.95 0.73 2.25 1.31 1.33
1.11 0.58 0.13 0.39 0.79 0.52 0.84 1.47 0.35 0.45 0.25 1.12
0.03 0.0 0.05 0.09 0.05 0.05 0.04 0.05 0.03 0.12 0.14 0.08
0.84 1.09 1.22 1.19 0.99 0.0 1.46 0.95 1.36 1.78 0.86 1.66
0.12 0.38 0.1 0.02 0.04 0.06 0.23 0.4 0.13 0.31 0.06 0.36
0.63 0.8 0.92 0.41 0.7 0.83 1.12 1.32 1.35 1.36 0.59 1.25
3.83 1.7 2.88 3.06 3.19 3.01 4.66 4.08 2.93 3.19 3.17 3.64
2.59 3.52 3.3 2.32 3.34 2.89 2.83 2.65 3.41 3.54 3.36 3.25
0.03 0.12 0.27 0.06 0.08 0.04 0.02 0.07 0.03 0.01 0.23 0.11
0.21 0.32 0.2 0.13 0.07 0.07 0.09 0.06 0.0 0.33 0.24 0.18
0.56 0.45 0.88 0.4 0.73 0.71 0.78 0.79 0.58 0.33 0.53 0.46
26.82 16.43 15.17 20.62 25.77 22.87 12.57 39.36 24.91 14.63 32.4 30.08
0.46 0.21 0.42 0.61 0.42 0.38 0.5 0.21 0.66 0.68 0.47 0.41
4.12 4.32 4.95 6.28 5.14 4.44 4.57 2.88 5.74 4.57 6.71 5.46
1.69 1.77 1.67 2.77 2.2 1.24 1.97 1.72 1.45 1.94 1.9 1.38
3.8 3.62 4.82 3.4 4.45 2.47 4.39 3.52 3.78 4.52 4.75 5.53
4.11 3.15 3.99 4.76 3.75 3.92 4.41 2.81 4.4 5.3 3.46 5.44
0.66 1.27 0.63 0.8 0.96 0.19 1.4 1.05 1.11 1.57 1.08 0.8
36.29 39.7 37.22 34.16 32.31 33.65 33.5 36.74 34.72 33.96 31.89 41.37
247.04 227.4 234.62 218.11 246.9 213.54 238.33 261.97 239.74 246.82 233.85 257.45
0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.04 0.0 0.03 0.03 0.1 0.11 0.0
0.07 0.0 0.0 0.14 0.04 0.12 0.03 0.04 0.08 0.29 0.18 0.0
0.93 1.21 1.47 1.3 1.32 0.78 1.62 1.0 0.92 1.47 1.61 1.17
3.31 2.93 3.18 3.22 2.99 3.16 3.42 2.95 3.52 3.71 3.17 3.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02
0.1 0.08 0.07 0.25 0.12 0.35 0.06 0.2 0.45 0.38 0.35 0.09
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
2.05 3.14 1.16 2.35 1.38 1.25 2.04 1.91 1.03 2.26 3.26 1.56
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0
2.22 3.89 2.86 2.59 1.61 1.87 2.56 3.21 1.45 5.36 3.37 7.79
0.0 0.0 0.02 0.05 0.07 0.02 0.02 0.07 0.02 0.06 0.06 0.02
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
4.78 3.86 4.78 5.02 4.77 4.21 6.7 6.19 4.25 4.86 4.89 6.61
0.69 1.41 1.76 1.85 1.25 0.52 2.25 0.7 1.25 1.9 1.22 2.31
0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0
0.04 0.0 0.05 0.02 0.0 0.06 0.02 0.06 0.06 0.04 0.16 0.09
10.0 9.2 13.36 12.09 12.45 11.71 12.83 11.8 10.6 12.83 12.27 13.76
0.1 0.3 0.21 0.21 0.04 0.06 0.02 0.09 0.11 0.32 0.32 0.23
0.15 0.55 0.37 1.26 0.44 0.16 0.82 0.31 0.24 1.27 0.54 0.63
0.75 0.62 1.05 1.21 1.31 1.2 0.99 1.06 1.29 1.13 1.13 1.21
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.09 0.06 0.0 0.05

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)