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Heatmap: Cluster_46 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.92 -0.85 -0.34 0.25 0.17 0.15 0.45 0.05 0.31 0.31 -0.19 0.28
-1.33 -0.69 -0.25 0.24 0.23 0.52 0.5 0.71 0.07 0.15 -0.63 -0.99
-0.06 -0.26 -0.17 0.08 -0.04 0.03 -0.05 0.1 -0.11 0.18 0.17 0.07
-0.1 -0.13 -0.12 -0.21 -0.12 -0.09 0.21 0.21 0.11 0.08 -0.16 0.21
-0.81 -0.55 -0.11 0.09 0.34 0.33 0.07 0.46 0.38 -0.18 -0.3 -0.29
-0.22 -0.01 -0.07 -0.3 -0.17 0.12 -0.55 1.19 0.03 0.22 -0.51 -0.85
-0.73 -1.21 -0.52 -0.29 -0.2 0.05 0.71 0.36 0.4 0.21 -0.06 0.25
-0.1 -0.43 0.03 0.15 -0.01 -0.1 0.36 0.06 -0.16 0.2 -0.28 0.09
-0.84 -0.5 -0.37 0.01 0.36 0.42 0.13 0.26 0.39 -0.02 -0.11 -0.28
-0.44 -0.42 -0.51 0.08 0.29 0.3 0.25 0.23 0.07 0.24 -0.14 -0.32
-0.09 -0.37 -0.12 0.01 -0.01 0.04 -0.01 -0.08 0.06 0.03 0.2 0.24
-0.92 -0.62 -1.57 0.35 0.51 0.65 -0.87 1.43 -0.04 0.25 -0.44 -3.55
-0.92 0.39 0.05 -0.17 -0.01 0.58 -0.07 -1.3 0.03 0.02 -0.11 0.51
-0.17 -0.1 -0.0 -0.32 -0.12 0.16 0.12 0.2 -0.03 0.24 -0.13 0.05
-0.08 -0.34 0.21 0.23 -0.06 -0.0 -0.25 -0.11 0.29 -0.2 -0.09 0.23
-0.37 -0.77 -0.46 -0.21 -0.04 0.18 0.44 0.08 0.25 0.03 0.06 0.37
-0.47 -0.72 -0.18 -0.02 0.0 -0.07 0.48 0.12 0.34 0.07 0.01 0.08
-0.1 -0.17 -0.11 -0.08 -0.05 0.26 0.06 0.19 -0.07 0.13 -0.19 0.06
-0.63 -1.4 0.01 0.47 0.37 0.43 0.65 1.29 -1.9 -1.1 -0.4 -1.2
-0.28 -0.04 -0.25 -0.32 -0.01 0.17 0.18 0.59 -0.02 0.12 -0.16 -0.27
-0.25 -0.17 -0.23 -0.31 -0.03 0.21 0.32 0.46 -0.06 0.23 -0.16 -0.3
-0.23 -0.11 0.04 0.25 0.16 0.14 0.07 0.07 -0.09 -0.05 -0.25 -0.09
-0.21 -0.13 -0.25 -0.19 -0.06 0.13 0.26 0.08 0.16 0.12 0.04 -0.05
-0.15 -0.57 -0.27 -0.05 -0.15 0.04 0.15 -0.03 0.09 0.12 0.26 0.33
-0.3 -0.3 -0.22 -0.08 -0.01 0.19 0.06 0.17 0.09 0.15 -0.04 0.16
-1.14 -0.16 -0.22 0.21 0.32 0.24 0.02 0.3 -0.26 0.09 0.02 0.08
0.08 -0.04 0.05 -0.03 -0.04 0.16 0.07 0.15 -0.23 -0.08 -0.12 -0.01
-0.22 -0.26 0.02 0.18 0.04 -0.08 0.12 0.04 0.29 0.1 -0.19 -0.15
-0.13 -0.3 -0.09 0.04 -0.01 0.03 0.08 0.12 0.16 0.19 0.01 -0.17
-2.46 -0.53 -0.05 0.32 1.37 0.7 -1.07 1.18 0.34 -1.31 -2.02 -4.51
0.1 0.24 -0.22 -0.37 0.02 -0.04 -0.16 0.37 -0.06 0.26 0.25 -0.75
0.19 0.12 -0.14 0.07 0.3 0.16 0.21 0.32 -0.76 -0.3 -0.04 -0.54
-0.35 0.09 -0.18 -0.25 0.14 0.03 -0.12 0.5 0.26 -0.13 0.06 -0.31
-0.13 -0.01 -0.19 -0.09 -0.02 -0.03 0.01 0.17 0.24 0.05 0.08 -0.16
-0.71 -0.78 -0.18 0.08 0.84 0.43 0.57 -0.43 -0.0 -0.51 0.05 -0.37
-0.12 -0.19 -0.08 -0.35 -0.11 0.22 0.16 0.23 0.04 0.17 -0.14 0.03
-2.14 -0.43 -0.14 0.18 0.75 0.65 -0.48 0.76 -0.33 0.03 -1.14 0.09
-0.19 -0.25 -0.06 -0.1 -0.03 0.03 0.14 0.05 0.23 0.01 -0.0 0.12
-0.75 -1.73 0.04 0.07 0.3 0.19 0.63 -0.02 -0.29 0.23 -0.04 0.21
-0.2 -0.16 -0.12 0.02 0.03 -0.01 0.07 0.16 0.21 0.01 -0.06 0.01
0.06 -0.34 0.04 -0.02 -0.02 0.04 0.11 0.01 0.28 -0.16 -0.02 -0.05
-0.0 -0.1 -0.06 -0.01 -0.03 -0.06 0.21 0.26 -0.43 0.33 -0.14 -0.11
-0.5 -0.76 -0.56 0.05 0.42 0.35 0.26 0.29 0.21 0.18 -0.18 -0.36
-0.19 -0.2 -0.04 -0.02 0.11 -0.03 0.2 0.14 0.18 0.02 -0.25 -0.0
-0.25 -0.31 -0.1 0.18 0.16 0.14 0.05 0.14 0.05 0.02 -0.13 -0.06
-0.22 -0.03 -0.25 0.07 0.01 -0.15 -0.07 0.07 0.2 0.07 0.09 0.13
-0.34 -0.51 -0.38 0.02 -0.14 0.05 0.41 -0.15 0.11 0.01 0.12 0.46
-0.15 -0.07 -0.07 0.01 -0.04 0.01 -0.02 0.09 0.05 0.07 0.01 0.09
-0.29 -0.48 0.08 0.2 -0.12 -0.35 0.29 -0.02 0.09 0.13 0.06 0.2
-0.47 -0.26 -0.04 0.06 -0.01 0.11 0.18 0.12 0.09 0.17 0.0 -0.08
-0.64 -0.39 -0.29 0.13 0.23 0.43 0.12 0.21 0.24 0.04 -0.2 -0.25
-0.55 -1.36 0.02 -0.17 -0.16 0.06 0.26 0.34 0.11 -0.21 0.54 0.28
-0.15 -0.37 -0.06 -0.01 -0.05 0.0 0.12 0.04 0.15 -0.01 0.11 0.14
-0.53 -0.4 -1.03 0.2 0.6 0.06 0.04 0.93 -0.35 0.31 -0.11 -1.06
-0.18 -0.58 -0.37 -0.49 0.24 0.13 0.41 0.35 0.08 0.16 0.02 -0.15
-0.96 -1.12 -0.56 -0.66 0.22 0.66 0.58 0.14 -0.07 0.53 -0.14 0.09
-0.17 -0.64 -0.19 0.02 0.09 0.1 0.27 0.04 0.18 0.07 0.06 -0.02
-0.03 -0.09 -0.02 -0.02 -0.08 0.24 -0.01 0.21 -0.14 0.04 -0.19 0.02
-0.9 -0.16 0.45 0.29 0.51 0.37 -0.22 0.63 0.04 -0.85 -0.84 -0.49
-0.63 -0.14 -0.96 -0.1 -0.0 0.56 0.03 -0.13 -0.19 0.02 0.17 0.65
-0.19 -0.82 -0.12 -0.12 0.1 0.02 0.43 0.09 0.11 0.11 -0.13 0.2
0.01 0.03 0.19 0.16 0.16 0.1 -0.59 0.89 0.08 -0.18 -1.23 -0.63
-0.21 -0.02 -0.02 -0.03 -0.15 0.08 0.12 -0.06 0.17 -0.11 -0.02 0.18
-0.49 -1.1 -0.25 -0.09 0.65 0.11 0.22 0.37 -0.42 0.78 -0.87 -0.11
-0.0 -0.06 -0.11 0.04 -0.04 0.06 0.21 0.07 -0.13 -0.07 -0.01 0.02
-0.15 -0.14 -0.36 -0.3 0.01 0.02 0.19 0.23 0.02 -0.03 0.01 0.34
-0.26 -0.21 0.01 0.08 0.08 -0.04 0.22 0.05 0.11 -0.02 -0.19 0.08
-0.5 -0.03 0.12 -0.28 0.01 0.24 0.02 -0.41 0.08 0.13 0.09 0.29
-0.43 -0.26 -0.06 0.04 0.04 0.08 -0.01 0.18 0.18 0.18 0.02 -0.1
-0.05 -0.55 0.2 0.06 0.26 0.17 0.09 -0.36 0.29 -0.21 -0.0 -0.13
-0.12 0.16 -0.17 -0.08 0.09 0.3 -0.04 0.15 -0.1 0.1 -0.33 -0.07
-0.23 -1.02 -0.4 0.28 0.68 0.73 0.18 -0.56 0.03 -0.07 -0.25 -0.34
-0.04 -0.15 -0.14 0.19 0.16 -0.03 -0.01 0.33 0.2 -0.05 -0.21 -0.41
-0.76 -0.38 -0.2 0.11 0.37 0.34 0.22 0.32 0.15 0.01 -0.26 -0.37
-0.14 -0.31 0.08 0.01 -0.05 0.04 0.15 0.05 0.37 0.12 -0.38 -0.1
-0.08 0.08 -0.16 -0.17 -0.04 -0.11 0.32 0.01 -0.07 0.02 -0.09 0.2
-0.22 0.01 -0.08 -0.02 -0.01 -0.02 -0.02 0.06 0.13 0.14 0.0 0.01
-0.28 -0.59 -0.31 -0.09 0.13 0.18 0.46 0.31 0.21 -0.11 0.07 -0.34
-0.04 -0.26 0.02 -0.15 -0.09 0.14 0.21 0.12 -0.03 0.12 -0.13 0.03
-0.14 -0.35 -0.02 0.13 0.17 0.25 0.22 0.12 -0.14 -0.01 -0.25 -0.12
-1.4 -0.13 -0.37 -0.01 -0.79 0.83 1.22 0.71 -0.92 0.17 -1.24 -0.87
-0.02 -0.39 0.18 0.05 -0.08 0.05 -0.24 -0.05 0.53 -0.1 -0.12 -0.01
-0.2 -0.19 -0.31 -0.06 -0.17 0.26 0.28 0.1 -0.13 0.06 0.03 0.19
0.16 -0.61 -0.04 -0.18 -0.05 0.35 0.17 -0.25 0.14 0.29 0.06 -0.33
-0.19 -0.72 -0.36 -0.87 -0.38 0.27 0.52 0.06 -0.26 0.02 0.46 0.6
0.06 -0.27 -0.04 -0.19 0.06 -0.08 0.06 0.21 0.17 0.09 -0.13 -0.03
-0.18 -0.68 -0.24 -0.34 -0.15 0.09 0.58 0.25 0.15 0.09 -0.2 0.21
-0.23 -0.05 -0.3 -0.13 0.07 0.11 0.18 0.18 0.09 0.23 -0.17 -0.11
0.53 0.16 -0.66 -0.41 -0.11 -0.5 0.31 0.99 -0.34 -0.08 -0.09 -0.96
-0.13 -0.28 -0.16 0.04 0.05 0.12 0.23 0.05 -0.14 0.01 -0.04 0.16
-0.1 -0.42 -0.47 -0.09 0.01 0.31 0.18 0.54 -0.14 -0.07 -0.23 0.16
-0.26 -0.17 -0.3 -0.11 0.12 -0.05 0.14 0.17 0.1 0.09 0.07 0.08
-0.87 0.19 -0.33 0.23 0.51 0.51 -0.08 0.7 -0.08 0.11 -0.84 -1.57
-0.24 -1.03 -0.3 -0.21 0.1 -0.06 0.29 0.05 0.25 0.35 -0.05 0.35
-0.14 -0.16 -0.13 -0.11 0.11 0.11 0.19 0.32 0.08 0.04 -0.18 -0.24
-0.18 -0.71 -0.29 0.14 -0.14 -0.09 0.03 0.02 0.15 0.09 0.28 0.39
-0.37 -0.48 0.06 0.19 0.12 0.18 0.21 0.12 0.05 -0.01 -0.26 0.01
-0.14 -0.38 -0.25 -0.32 0.17 0.2 0.19 0.17 -0.03 0.35 -0.0 -0.15
-0.16 -0.4 0.1 -0.05 0.12 -0.02 0.14 0.22 0.16 -0.12 -0.01 -0.08
-0.35 0.12 -0.16 0.1 0.05 0.05 -0.08 0.18 -0.17 -0.09 0.24 -0.01
-0.34 -0.22 -0.36 0.01 0.34 0.15 0.16 0.3 -0.05 0.22 -0.2 -0.23
-0.32 -0.18 -0.02 0.13 -0.19 0.09 0.05 0.03 0.26 0.12 -0.08 0.03
-0.35 -0.28 -0.36 -0.19 0.27 0.38 0.18 0.47 -0.16 0.25 -0.23 -0.34
-0.83 -0.62 -0.24 0.12 0.5 0.39 0.57 -0.22 0.39 -0.21 -0.41 -0.21
-1.11 -0.42 0.05 0.03 -0.2 -0.12 -0.52 1.1 -0.58 0.96 -0.5 -0.35
-0.36 -0.3 -0.29 0.12 0.1 0.18 0.19 0.09 0.17 0.06 -0.08 -0.04
-0.34 -0.14 -0.14 -0.31 -0.18 0.69 0.18 0.77 -0.85 0.02 -0.62 0.06
-0.24 -0.53 -0.29 -0.23 -0.14 0.02 -0.03 0.04 0.1 0.16 0.34 0.49
-0.21 -0.36 -0.28 0.05 0.21 -0.08 0.21 -0.21 0.2 0.16 0.14 0.01
-0.15 0.09 -0.08 -0.03 0.03 -0.08 0.15 0.46 -0.22 0.04 -0.38 0.01
-0.64 -0.66 -0.41 -0.1 0.1 0.27 0.18 0.21 0.4 0.4 0.09 -0.39
-0.31 -0.25 -0.08 0.14 0.08 -0.01 0.09 0.03 0.22 -0.06 -0.1 0.14
0.0 -0.39 0.02 0.07 0.06 -0.13 -0.03 -0.07 0.04 -0.01 0.17 0.19
-0.05 -0.29 -0.12 -0.19 0.04 0.06 0.19 0.19 -0.01 0.06 -0.03 0.07
-0.82 0.09 0.04 -0.14 0.14 -1.51 0.58 0.3 -0.32 0.71 -0.34 0.02
-0.22 -0.22 -0.16 -0.03 -0.04 0.07 0.23 0.18 0.01 0.02 -0.12 0.19
-0.61 -0.21 -0.39 0.17 0.26 0.14 0.06 0.12 0.34 0.25 -0.07 -0.39
-0.11 -0.32 -0.09 -0.39 -0.15 0.0 0.4 0.23 -0.05 -0.04 0.06 0.26
-3.13 -1.69 -0.0 -1.38 0.62 0.67 0.19 1.72 0.25 -0.47 -1.24 -1.8
-0.38 -0.34 -0.04 0.16 0.19 0.28 0.15 0.19 0.03 0.07 -0.14 -0.37
-0.11 -0.48 0.13 0.02 0.57 0.26 0.11 0.47 -0.43 0.35 -0.74 -1.03
-0.47 -0.18 -0.26 0.38 0.5 0.33 0.35 -0.03 0.02 0.08 -0.51 -0.84
-0.4 -0.53 -0.01 0.04 0.06 0.16 0.44 0.16 0.24 -0.31 -0.4 0.19
-0.07 -0.47 -0.35 -0.3 0.02 0.18 0.36 0.42 0.09 0.26 -0.01 -0.49
-0.71 -0.08 -0.18 0.25 -0.02 0.11 0.0 0.33 0.42 0.14 -0.29 -0.33
-0.26 -1.3 -0.88 0.0 0.58 0.28 0.89 -0.29 0.14 0.17 -0.31 -0.3
-0.52 -0.58 0.03 0.22 0.03 -0.11 0.07 0.24 0.22 0.14 -0.08 0.08
0.25 -0.68 -0.13 -0.79 -0.02 -0.06 -0.01 0.13 0.3 0.24 -0.09 0.39
-0.6 -0.08 -0.15 -0.27 -0.03 0.51 0.72 0.62 -0.34 0.12 -0.56 -0.95
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-0.18 -0.01 0.24 -0.08 0.05 0.14 -0.06 -0.35 -0.01 0.0 0.15 0.04
-0.27 -0.38 -0.27 -0.07 0.08 0.03 0.18 -0.01 0.32 0.12 0.12 -0.02
-0.43 0.31 -0.48 -0.46 0.43 -0.5 0.38 0.43 -0.32 0.41 -0.48 0.03
-1.27 -1.28 -0.75 0.24 0.34 0.17 0.32 0.53 0.6 0.41 -0.3 -0.6
0.11 -0.56 -0.25 -0.03 -0.18 0.17 0.07 -0.25 0.23 0.18 -0.08 0.34
-0.36 -0.84 -0.31 -0.21 0.3 -0.2 0.3 0.17 0.32 0.22 0.17 -0.02
-0.29 -0.26 -0.25 0.12 0.19 0.15 0.15 0.27 0.16 0.01 -0.13 -0.3
-0.37 -0.46 -0.33 0.11 0.2 -0.03 0.14 0.04 0.05 0.25 -0.02 0.21
-0.09 -0.05 0.01 -0.17 -0.15 0.01 0.16 0.22 0.07 -0.06 -0.06 0.07
-0.64 0.25 -0.21 0.31 0.54 0.17 -0.25 0.83 -0.24 0.19 -0.97 -1.45
-0.01 -0.15 -0.08 -0.28 -0.43 0.2 0.21 0.09 0.11 0.1 0.24 -0.15
-0.66 -0.12 -0.06 -0.34 0.04 -0.01 0.22 0.83 -0.05 0.1 -0.52 0.02
- -0.74 -0.76 - -0.51 - 1.37 1.49 1.65 - -0.01 -0.79
0.05 -0.55 0.11 -0.29 0.04 0.07 0.11 0.07 0.02 -0.08 0.15 0.15
-0.19 -0.67 -0.46 -0.27 -0.19 0.32 0.44 0.37 -0.08 0.01 -0.08 0.33
0.12 -0.43 -0.3 -0.61 0.45 -0.04 0.02 1.09 -0.57 -1.49 -0.2 0.4
-0.86 -0.16 -0.5 -0.15 0.81 0.62 -0.89 0.66 -0.14 0.08 0.02 -0.86

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.