Heatmap: Cluster_110 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.02 0.27 0.16 0.13 0.0 0.21 -0.84 0.01 -0.51 -0.68 -0.01 0.61
-0.49 0.38 -0.23 0.03 0.3 0.51 -1.28 0.06 -0.43 -1.51 0.61 0.45
0.21 0.18 0.38 -0.35 -0.29 -0.16 0.37 -0.2 -0.51 -1.07 0.14 0.55
0.04 -0.02 -0.08 -0.02 -0.08 -0.17 0.03 -0.01 0.16 -0.17 0.12 0.16
-0.51 -0.23 0.53 0.01 -0.43 -1.37 -0.27 -0.5 0.38 -0.26 0.73 0.62
0.45 -0.6 0.57 -0.08 -0.35 -0.81 -0.26 -0.67 -0.01 -0.29 0.02 0.92
0.05 0.12 0.12 -0.14 -0.15 0.18 0.18 0.18 -0.09 -0.12 -0.19 -0.23
-0.0 -0.09 0.19 -0.12 0.11 0.18 -0.21 -0.16 0.05 -0.05 -0.09 0.12
0.1 0.56 0.57 0.72 -0.89 - -0.63 0.03 -2.27 0.24 0.76 0.05
-0.73 -0.78 -0.75 -0.78 -0.69 -1.15 -0.41 0.74 0.15 0.0 1.56 0.11
-0.21 -0.37 0.14 -0.29 -0.62 -0.58 0.22 0.07 0.39 -0.1 0.53 0.29
0.1 0.03 0.09 -0.17 -0.42 0.01 0.08 -0.15 -0.04 -0.04 0.02 0.36
-0.04 0.01 0.26 -0.12 0.06 0.1 -0.13 -0.12 0.05 -0.13 -0.14 0.14
-0.07 -0.0 -0.02 0.04 -0.02 -0.02 -0.08 -0.01 0.02 0.04 0.12 -0.0
0.1 -0.67 -0.2 -0.67 0.32 -0.17 -1.6 -0.36 -0.04 0.08 1.14 0.4
0.5 0.44 -0.43 0.51 -0.14 -0.49 -1.03 -0.68 -0.38 -0.34 -0.88 1.16
0.13 -0.44 0.27 0.1 0.14 -0.09 -0.3 -1.29 -0.12 0.0 0.33 0.54
0.41 0.04 0.42 -0.98 -0.38 -0.04 0.14 -0.45 -0.59 -0.51 0.64 0.37
2.08 - - - - 1.36 - - - 1.08 - 1.62
-0.02 0.34 -0.28 0.1 -0.06 -0.54 -0.14 0.08 -0.27 0.17 -0.04 0.4
0.15 -0.07 0.08 -0.1 -0.04 -0.01 0.12 -0.17 -0.01 -0.14 0.05 0.1
-0.05 0.53 -0.02 0.29 0.07 -0.18 -0.45 -0.36 -0.49 -0.06 -0.21 0.49
-0.22 0.05 -0.02 -0.06 -0.27 -0.16 0.17 0.11 0.07 -0.08 -0.03 0.32
0.09 -0.09 -0.01 -0.36 0.04 -0.01 0.15 -0.04 0.03 -0.2 0.07 0.23
-0.57 -0.14 0.69 -0.57 -0.05 0.05 0.03 -0.18 0.49 -0.22 0.01 -0.05
-0.07 -0.04 0.11 0.05 -0.06 -0.02 -0.05 -0.1 0.17 -0.19 0.01 0.16
-0.75 -0.11 -2.5 -0.77 -0.49 -1.3 -0.69 0.87 -0.13 0.95 0.98 0.41
-0.23 -0.11 0.09 0.03 -0.16 0.0 -0.09 0.0 0.01 0.02 0.31 0.04
0.09 -0.05 0.22 -0.02 -0.11 0.11 -0.12 -0.3 0.13 -0.04 -0.14 0.13
-0.12 -0.17 0.33 -0.1 -0.82 -0.55 0.15 0.08 -0.18 -0.05 0.57 0.33
0.11 0.03 0.11 -0.07 0.11 0.03 -0.13 0.01 -0.09 -0.11 -0.18 0.13
-0.01 -0.03 0.02 -0.15 -0.04 0.03 0.01 0.02 0.07 0.05 -0.03 0.05
0.06 -0.02 0.28 -0.05 -0.13 -0.48 0.12 0.27 -0.26 -0.23 0.04 0.22
0.87 - -1.12 - - 0.16 -0.8 -0.19 0.55 0.97 0.95 0.84
-0.82 -0.2 -0.06 -0.83 -0.1 -0.45 0.3 0.18 0.63 0.28 -0.03 0.35
0.16 -0.24 0.08 -0.31 0.09 0.27 0.03 -0.41 -0.25 0.05 -0.01 0.34
-0.31 -1.43 -1.42 -0.12 0.05 0.03 -0.45 -0.23 1.11 0.33 0.9 -0.72
-0.1 -0.92 -0.94 1.12 0.33 -0.82 - -1.13 -0.97 0.26 0.39 1.34
0.92 0.1 0.93 -0.8 -0.64 -0.73 -1.95 0.23 0.3 -1.72 0.06 0.4
-0.12 0.48 -0.16 -0.75 0.0 0.09 -0.87 -0.36 0.3 -0.38 0.35 0.61
-0.02 -0.22 -0.26 -0.08 -0.47 -0.01 -0.0 0.12 0.22 -0.25 0.6 0.08
1.21 - - - - 1.57 - - - - - 2.75
- 1.26 - - - - - - 0.87 2.33 1.46 -
0.21 -0.03 0.42 -1.01 -0.13 -0.63 0.09 0.35 -0.03 -0.27 0.18 0.25
- 0.04 -0.9 1.03 -1.63 -0.22 0.85 -0.52 - 0.13 0.17 1.32
0.13 0.0 -0.04 0.16 -0.44 -0.12 -0.03 0.05 0.07 0.03 0.01 0.08
0.28 0.53 - - - - - 1.33 0.38 - 1.88 0.89
- 0.59 - -0.41 - - 0.41 0.36 - 2.1 0.92 -0.07
-0.05 -0.56 0.16 -0.32 0.37 -0.61 0.25 0.19 0.16 0.07 -0.02 0.02
0.11 0.26 0.23 0.12 -0.66 -0.22 -0.56 -0.33 0.16 0.15 -0.03 0.37
-0.16 -0.07 0.46 -0.78 -0.27 -0.18 -0.01 0.19 0.11 -0.15 0.39 0.08
-0.1 -0.1 -0.07 -0.29 0.06 -0.09 0.05 0.01 0.14 0.09 0.1 0.14
-0.28 - 0.33 -0.61 0.11 -0.97 - -0.42 0.86 1.57 0.75 -1.12
-0.11 0.03 -0.0 0.06 0.05 0.74 -1.16 -0.14 -0.46 -0.76 0.06 0.66
-0.13 -0.08 0.16 0.35 -0.31 -0.92 -0.44 0.09 -0.51 0.25 0.22 0.63
0.19 0.64 -0.19 0.29 0.19 -0.22 -0.17 -0.81 0.02 -0.14 0.19 -0.54
-2.13 - - 0.81 -1.6 1.57 - - 0.05 -0.88 -2.15 2.3
- 0.53 0.36 0.5 - - 0.31 - 0.23 1.92 0.73 -
0.59 - 1.35 -0.86 -0.16 0.87 - - - -0.09 -0.5 1.59
- - - - - 2.45 - - - - - 2.71
0.57 - - 1.12 - 2.18 - - - - - 1.93
-1.05 -1.96 0.35 -0.23 0.19 0.2 -1.36 -0.07 0.71 0.13 0.79 0.04
-0.27 -0.26 -0.32 0.12 -0.25 0.02 0.27 -0.3 0.35 -1.13 0.66 0.35
-0.66 -0.52 1.1 0.6 -0.81 1.12 0.44 -0.01 -0.63 -0.28 -2.33 -2.0
-0.59 -0.23 -0.68 -0.55 -0.68 -0.09 -0.2 0.59 0.4 -0.39 0.95 0.3
-0.04 0.3 1.35 -0.7 0.12 -0.23 -0.86 -0.56 -1.62 -0.57 0.26 0.33
-0.41 -0.17 -0.64 -0.28 0.71 -0.55 -0.5 -0.11 0.16 -1.03 1.22 0.01
-0.09 -0.67 -0.24 -0.49 -0.97 0.89 -1.13 -0.36 -0.03 -0.3 -0.01 1.32
0.09 0.68 0.44 0.52 -1.06 -0.78 0.25 -1.86 -0.21 -1.73 0.11 0.83
0.02 0.0 -0.02 0.07 -0.03 -0.05 0.03 -0.03 0.02 -0.15 -0.02 0.14
0.25 - - 0.96 0.82 0.62 -0.98 0.05 - -0.13 -0.14 1.14
- 0.04 1.45 -0.1 - 1.68 0.81 - - -0.3 0.61 -
-0.89 -0.05 -0.16 -0.12 0.92 0.74 -0.45 -0.62 0.18 -0.84 -0.03 0.07
0.14 -1.22 0.55 -0.66 0.32 -1.09 0.7 -0.0 0.05 -0.35 0.04 0.23
-0.18 -0.23 -0.16 0.02 0.03 -0.16 0.06 -0.44 0.38 -0.0 0.22 0.25
-0.1 0.08 0.07 0.01 -0.35 0.18 -0.58 0.04 0.13 -0.14 -0.06 0.46
0.4 0.03 -0.55 0.69 -1.83 -1.77 0.59 -3.08 -0.23 -0.26 0.51 1.03
-0.37 -0.38 0.23 0.2 -0.82 -0.37 -0.03 -0.04 0.34 -1.72 0.54 0.87
0.47 -0.1 0.66 -0.02 - 0.54 0.56 - -0.19 -0.02 0.39 0.03
1.01 0.15 - 0.8 -1.58 -0.26 0.72 -1.6 -1.45 0.15 - 1.34
0.12 -0.12 -0.44 -1.74 -1.35 0.53 -1.93 0.22 0.39 -0.51 1.3 0.29
- -0.23 - - 0.18 2.0 -0.18 - - - 0.63 1.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.