Heatmap: Cluster_112 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.05 -0.11 -0.03 0.05 -0.17 -0.22 -0.07 -0.11 0.24 0.02 0.12 0.16
0.0 -0.04 0.13 -0.21 -0.24 -0.59 0.09 -0.15 0.53 -0.09 0.05 0.22
0.29 -0.1 -0.04 -0.41 -0.66 -0.93 -0.2 -0.19 0.42 0.37 0.18 0.54
0.72 -0.57 -0.59 -0.74 -0.47 -1.56 -1.55 -0.94 0.66 0.69 1.06 0.29
1.04 -0.13 -0.7 -0.67 -0.71 -0.54 0.09 -0.58 0.08 0.38 0.35 0.16
0.06 -0.1 -0.19 -0.25 0.06 -0.16 -0.13 0.05 0.06 -0.0 0.19 0.31
0.98 -0.58 -0.58 -0.52 -1.34 -0.93 -1.07 1.04 -1.26 0.55 -0.09 0.78
0.9 0.77 -0.57 0.05 -0.1 -3.38 -0.51 -2.06 -0.71 0.42 0.19 0.74
0.2 -0.24 -0.37 -0.09 -0.06 -0.41 -0.11 -0.34 0.09 0.03 0.52 0.42
0.02 -0.04 -0.02 0.05 -0.18 -0.24 -0.13 -0.19 0.24 0.05 0.18 0.16
0.01 -0.02 0.28 -0.12 -0.12 -0.15 -0.54 -0.39 0.0 -0.2 0.55 0.34
-0.0 -0.19 0.05 -0.11 -0.32 -0.1 -0.08 -0.14 0.3 0.17 0.13 0.16
0.28 0.06 -0.38 -0.06 -0.12 -0.55 -0.35 -0.35 0.12 0.07 0.5 0.37
0.2 0.13 0.12 -0.2 0.02 -0.36 -0.28 -0.2 0.02 0.12 -0.02 0.29
0.08 -0.19 -0.32 -0.14 -0.43 -0.27 -0.57 0.01 0.39 0.56 0.44 -0.03
0.01 -0.15 0.04 -0.25 0.26 -0.11 -0.13 -0.27 -0.08 0.03 0.47 0.01
0.21 -0.14 0.08 -0.11 -0.47 -0.48 -0.02 -0.14 -0.01 -0.02 0.15 0.61
0.27 -0.0 -0.7 -0.33 -0.04 -0.21 -0.27 -0.03 0.13 -0.04 0.37 0.47
0.18 0.05 -0.04 0.04 -0.23 -0.23 -0.16 -0.24 0.27 -0.16 0.16 0.24
0.12 0.05 0.08 0.08 -0.15 -0.22 -0.09 -0.07 -0.02 -0.0 0.08 0.11
0.05 0.02 -0.02 -0.02 -0.24 -0.23 -0.17 -0.16 0.25 0.04 0.14 0.24
0.13 -0.12 -0.04 -0.07 -0.13 -0.25 -0.17 -0.27 0.25 0.05 0.13 0.32
-0.07 -0.15 -0.05 0.12 -0.17 -0.14 -0.09 -0.04 0.14 0.06 0.25 0.06
0.35 -0.04 -0.2 -0.86 -0.84 -0.93 -0.52 -0.17 0.4 0.36 0.7 0.52
0.42 0.02 -0.44 -0.71 -0.84 -0.81 -0.52 -0.06 0.37 0.25 0.78 0.41
0.11 -0.1 0.08 -0.02 -0.12 -0.31 0.02 -0.34 0.15 -0.04 0.06 0.36
0.14 0.12 0.01 -0.06 -0.33 -0.32 -0.02 -0.24 0.28 -0.14 0.06 0.33
0.11 -0.2 0.05 0.16 -0.26 -0.12 -0.29 -0.2 0.25 0.06 0.33 -0.05
0.11 -0.17 0.02 0.02 -0.09 -0.19 -0.08 -0.09 0.11 0.14 -0.01 0.15
0.2 -0.09 -0.04 -0.06 -0.26 -0.27 -0.06 -0.13 0.16 0.05 0.14 0.25
-0.02 0.08 -0.08 -0.25 -0.1 -0.06 -0.04 -0.04 0.12 -0.0 0.05 0.27
0.35 0.34 -0.04 -0.24 -0.06 -0.37 -0.44 -0.43 -0.03 -0.37 0.33 0.51
0.12 0.04 -0.11 0.11 -0.34 -0.18 -0.08 -0.21 0.3 -0.02 0.11 0.14
0.15 -0.02 -0.03 -0.14 -0.33 -0.19 -0.2 -0.12 0.15 0.05 0.23 0.31
-0.03 -0.19 0.08 0.09 -0.45 -0.34 -0.22 -0.12 0.44 0.04 0.21 0.23
0.15 -0.01 -0.16 -0.17 -0.27 -0.24 -0.27 -0.29 0.24 0.11 0.39 0.29
0.13 -0.14 -0.03 -0.14 -0.32 -0.35 -0.32 -0.28 0.34 0.15 0.42 0.25
0.02 -0.13 0.06 -0.27 -0.42 -0.58 -0.39 -0.04 0.45 0.29 0.43 0.15
0.38 -1.54 -0.81 -0.17 -0.38 -0.19 -1.57 -1.38 -0.24 -0.38 1.53 1.01
0.13 0.06 0.17 -0.12 -0.23 -0.39 -0.4 -0.25 0.28 0.1 0.39 0.03
-0.02 -0.26 0.18 -0.02 -0.18 -0.14 0.16 -0.19 0.28 0.08 0.0 0.01
0.43 -0.07 -0.04 -0.1 -0.19 -0.76 -0.55 -0.46 0.36 0.11 0.41 0.28
0.15 -0.17 -0.31 -0.24 -0.17 -0.2 0.11 0.02 0.06 0.2 0.34 0.08
0.11 -0.03 -0.25 -0.26 -0.66 -0.2 -0.25 0.08 0.34 0.26 0.39 0.13
0.06 0.07 -0.03 0.0 -0.14 -0.02 -0.17 -0.17 0.1 0.0 0.09 0.17
0.28 -0.02 -0.01 -0.13 -0.58 -0.43 -0.3 -0.58 0.29 0.11 0.45 0.42
0.74 -0.23 -0.86 -1.31 -0.2 -0.73 -0.34 -0.38 0.07 0.83 0.49 0.32
0.3 0.03 -0.02 -0.26 -0.23 -0.08 -0.04 -0.22 0.07 -0.09 0.02 0.36
1.24 0.5 -1.12 -0.12 -1.78 -0.61 -0.45 -0.32 -0.2 0.36 -0.04 0.31
-0.09 -0.14 0.04 -0.13 -0.06 -0.09 0.04 -0.01 -0.03 0.19 0.09 0.14
0.23 -0.17 -0.19 -0.16 -0.34 -0.24 -0.15 -0.08 0.22 0.27 0.26 0.15
-0.0 -0.19 0.11 -0.06 -0.19 -0.2 -0.1 -0.11 0.4 0.05 -0.02 0.18
0.27 -0.28 -0.21 -0.31 -0.39 -0.14 -0.24 -0.32 0.25 0.21 0.53 0.25
0.05 0.02 -0.82 -0.57 -0.2 -1.16 0.16 -0.61 -0.18 0.82 0.63 0.51
-1.01 0.79 -1.12 -0.84 -1.38 -0.19 -2.14 -0.83 1.04 0.3 0.82 0.72
0.13 0.1 -0.06 -0.04 -0.14 -0.16 -0.18 -0.17 0.12 -0.05 0.11 0.26
0.67 -0.18 -0.58 -1.09 -0.81 -1.01 -0.74 -0.3 0.23 0.34 0.84 0.75
0.88 0.2 -1.03 -0.95 -1.37 -0.48 -0.08 -0.48 0.05 0.46 0.8 0.11
0.05 -0.1 -0.07 0.15 -0.17 -0.11 -0.1 -0.11 0.1 0.07 0.22 0.01
-0.09 0.1 -1.19 - -1.41 - -1.3 - 1.36 0.7 1.83 0.04
0.29 -0.15 -0.31 -0.12 -0.44 -0.69 -0.4 -0.72 0.04 -0.03 0.83 0.72
0.12 -0.05 -0.04 -0.28 -0.16 -0.53 -0.13 0.06 0.54 0.06 0.09 0.04
0.59 -0.5 -0.52 -0.64 -0.69 -1.28 -1.19 -0.97 0.67 0.66 1.0 0.36
-0.05 -0.09 0.01 -0.11 -0.09 -0.52 -0.06 0.06 0.44 0.08 0.08 0.08
0.07 0.43 -0.18 -0.15 -0.06 0.17 -0.15 -0.52 -0.01 -0.13 0.08 0.23
0.25 -0.64 -0.28 -0.56 -0.12 -0.58 0.4 0.34 0.18 0.32 0.15 -0.01
-0.05 -0.18 -0.05 0.03 -0.1 -0.03 -0.06 -0.01 0.27 0.03 0.09 0.01
0.11 -0.35 -0.3 0.24 -0.33 -0.9 -0.71 -0.5 0.51 0.03 0.88 0.27
0.07 -0.05 -0.01 -0.1 -0.18 -0.2 -0.07 -0.24 0.24 -0.03 0.38 0.06
0.47 -0.3 -0.06 -0.19 -0.27 -0.4 -0.23 -0.34 0.22 0.16 0.54 0.02
0.41 -0.45 -0.02 -0.04 -0.42 -0.48 -0.39 -0.08 0.34 0.3 0.1 0.3
0.19 -0.21 -0.16 -0.05 -0.19 -0.31 -0.25 -0.23 0.47 0.03 0.4 0.05
0.27 -0.19 -0.44 0.07 -0.67 -0.27 -0.4 -0.52 0.27 -0.04 0.75 0.43
0.15 -0.14 0.06 0.03 0.05 -0.34 -0.04 -0.22 0.1 0.05 0.24 -0.03
-0.16 0.12 0.01 -0.14 0.21 -0.38 0.02 -0.15 -0.08 0.14 0.01 0.27
0.09 -0.11 -0.13 -0.17 -0.27 -0.2 -0.2 0.03 0.11 0.04 0.44 0.19
0.09 -0.1 -0.0 0.05 -0.11 -0.12 -0.03 -0.14 0.08 -0.08 0.21 0.11
0.55 -1.0 -0.67 -0.19 -0.29 -0.96 0.3 -0.5 -0.07 -0.55 1.07 0.61
0.32 0.21 -0.14 -0.26 -0.23 -0.48 0.11 -0.2 -0.21 0.2 0.15 0.28
1.01 0.26 0.24 0.38 - - 0.1 1.33 -0.79 - -0.01 0.21
0.01 0.36 0.13 -0.27 0.13 -0.37 -0.68 -0.46 0.8 -0.05 0.3 -0.69
-0.13 -0.12 0.23 -0.09 -0.12 -0.1 0.1 -0.19 0.2 0.04 -0.01 0.12
0.48 0.14 -0.31 -0.78 -0.85 -0.43 -0.15 -0.2 0.14 0.23 0.49 0.46
0.05 -0.52 -0.33 -0.11 0.24 -0.52 -0.22 -0.57 0.37 -0.48 0.81 0.44
0.25 -0.57 -0.19 -0.85 -0.25 -0.04 0.66 0.03 0.38 0.03 -0.29 0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.