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Heatmap: Cluster_213 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.75 0.04 -1.57 0.06 -0.08 0.41 0.83 -0.25 1.56 -0.06 -2.85 -1.57
0.51 -0.47 -0.02 0.3 -0.03 0.01 -0.13 0.19 -1.4 0.07 -0.03 0.25
0.05 0.1 0.11 -0.01 -0.11 0.23 0.12 -0.09 -0.11 -0.25 -0.27 0.13
0.09 0.16 0.03 -0.15 -0.33 -0.12 0.09 0.02 -0.09 -0.03 -0.05 0.29
0.15 0.05 0.06 0.08 -0.11 -0.06 0.02 -0.13 -0.04 -0.18 -0.22 0.3
0.13 0.0 -0.0 -0.01 -0.23 -0.04 0.09 0.06 -0.03 -0.09 -0.19 0.26
0.07 0.05 0.1 0.13 -0.0 -0.13 -0.06 -0.07 -0.08 -0.05 -0.07 0.08
0.03 -0.02 -0.15 0.08 -0.38 0.23 0.27 -0.16 -0.32 -0.34 -0.04 0.52
-0.15 -0.08 -0.32 0.05 -0.02 -0.08 0.16 0.35 0.22 -0.16 -0.39 0.23
0.02 0.06 0.07 0.06 -0.1 -0.06 0.04 -0.19 -0.08 -0.1 0.1 0.16
0.04 -0.15 0.1 -0.03 0.06 0.04 0.04 -0.04 -0.25 0.02 -0.08 0.2
-0.08 0.09 -0.01 0.08 -0.05 -0.02 -0.17 0.14 -0.02 -0.06 -0.06 0.13
-0.01 0.04 0.07 -0.18 -0.04 0.11 0.1 -0.05 -0.15 -0.09 -0.18 0.29
0.13 -0.11 0.07 -0.12 -0.41 -0.2 -0.26 -0.21 0.34 0.09 0.04 0.41
0.01 0.08 0.02 -0.12 -0.09 -0.01 0.12 0.01 -0.1 -0.05 -0.1 0.19
0.07 -0.25 0.09 -0.17 -0.1 0.2 0.22 -0.12 0.0 0.09 -0.48 0.27
-0.09 0.08 -0.05 -0.15 -0.13 -0.11 0.08 0.02 0.1 0.02 -0.12 0.28
0.1 0.15 -0.02 -0.01 0.03 -0.1 -0.06 -0.03 -0.19 -0.04 -0.06 0.2
-0.02 0.03 -0.03 0.03 -0.01 0.16 -0.1 -0.01 -0.02 -0.12 -0.12 0.18
0.01 -0.01 0.16 0.13 -0.07 -0.15 0.12 -0.19 -0.21 -0.6 0.07 0.48
-0.07 0.08 0.07 0.12 -0.02 -0.0 -0.08 -0.02 0.03 -0.14 -0.07 0.07
-0.06 -0.03 -0.06 -0.12 -0.1 0.07 0.16 -0.05 0.04 0.03 -0.14 0.22
-0.42 -0.92 0.58 -0.15 -1.95 0.33 0.94 -1.76 -0.03 -1.44 0.66 0.74
-0.04 0.1 0.05 0.43 -0.06 -0.08 -0.16 -0.26 -0.05 -0.16 -0.03 0.13
-0.24 0.17 0.09 -0.02 0.13 -0.06 0.07 0.09 -0.18 -0.1 -0.06 0.05
0.32 -0.12 0.62 -0.21 0.01 -0.3 -0.28 -0.3 -0.55 -0.01 0.22 0.19
-0.15 0.14 -0.05 -0.03 -0.1 0.09 0.03 -0.05 0.09 -0.07 -0.16 0.2
1.1 - -0.47 0.14 -0.8 0.14 -1.2 0.59 -0.27 1.36 -1.32 -0.69
-0.05 0.13 -0.04 -0.01 -0.08 -0.11 -0.09 0.14 -0.06 -0.05 0.02 0.16
-0.05 0.18 -0.12 -0.01 0.05 -0.1 -0.02 -0.2 -0.28 -0.01 0.1 0.34
-0.03 0.01 0.13 0.07 -0.08 -0.17 -0.09 0.0 -0.02 -0.11 0.02 0.23
0.19 -0.6 0.46 -0.38 -0.41 -0.53 -0.66 0.45 -0.5 0.25 0.15 0.68
-0.09 -0.09 0.25 0.01 -0.37 0.26 -0.15 0.05 -0.0 -0.14 -0.27 0.36
-0.96 0.17 0.54 -1.41 0.57 -1.67 0.14 0.69 -0.97 -0.55 -1.04 1.22
0.0 0.05 0.13 0.02 -0.21 0.03 0.19 0.11 -0.21 -0.23 -0.15 0.18
- - - - - - 2.63 - 2.54 - - -
-0.86 -1.44 0.43 -0.53 -1.09 -1.11 0.07 -0.0 0.58 0.45 0.07 1.1
0.09 0.16 0.0 -0.04 -0.1 0.21 0.14 -0.07 -0.35 -0.0 -0.21 0.08
-0.03 -0.64 0.55 -0.62 1.15 0.41 -0.05 -0.73 -1.11 -0.48 0.41 -0.65
- 0.63 -0.94 -0.61 - 0.17 0.87 -0.05 1.4 -1.16 -1.24 0.88
0.0 - 1.32 -0.77 - - -0.86 0.28 0.02 -0.63 0.53 1.61
0.08 0.13 0.24 -0.14 -0.01 -0.1 -0.18 -0.0 -0.12 0.09 -0.11 0.05
-0.03 0.09 0.01 0.07 0.0 0.02 0.12 -0.0 -0.13 -0.06 -0.12 0.02
-0.81 0.08 -0.79 -0.2 -1.05 -0.07 -0.08 0.37 0.21 -0.12 0.43 0.87
-0.04 0.02 -0.01 -0.04 -0.01 0.06 0.1 -0.11 -0.01 0.03 -0.11 0.1
-0.07 -0.15 0.05 -0.08 0.07 0.01 0.04 -0.04 -0.02 0.04 -0.04 0.17
0.01 -0.09 0.16 -0.04 -0.51 -0.12 -0.15 0.01 0.24 0.02 0.09 0.24
0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 -0.1 -0.04 0.01 -0.04 -0.07 -0.06 0.18
0.81 - -0.83 - 0.25 - 1.35 - 1.54 1.6 - -
-1.53 - 0.22 -0.22 - - 0.58 1.17 1.12 -1.19 - 1.71
-0.25 0.35 0.31 -0.04 -0.28 0.48 -0.26 0.31 0.05 -0.22 -1.37 0.13
0.17 -0.13 -0.12 -0.16 -0.1 -0.21 0.1 -0.4 0.06 0.11 0.02 0.46
0.25 -0.14 0.12 -0.15 -0.19 0.05 -0.1 -0.37 0.08 0.05 0.01 0.26
0.13 -0.06 0.64 -2.87 1.62 0.69 -0.85 0.07 -1.21 -1.37 -1.38 -0.43
0.13 -0.13 0.03 0.01 -0.08 0.1 -0.01 -0.04 -0.21 -0.0 0.0 0.14
0.04 0.04 0.05 0.04 0.05 0.01 -0.12 0.0 -0.07 -0.06 -0.06 0.07
0.18 0.03 0.16 -0.02 -0.08 0.05 0.02 -0.08 -0.36 -0.24 -0.08 0.3
-0.06 0.19 -0.02 0.02 -0.36 0.13 0.09 -0.17 -0.01 -0.1 -0.06 0.23
-0.11 0.02 0.25 -0.02 -0.2 0.03 0.02 0.01 -0.02 -0.3 -0.09 0.29
0.45 -0.42 -0.41 0.19 0.03 0.97 -0.53 0.46 -2.19 -0.31 -0.26 0.12
0.04 0.1 0.77 -0.07 0.79 -1.54 -0.33 -1.31 -0.61 -0.33 0.08 0.55
-0.2 -0.08 0.08 0.03 0.11 0.01 0.0 0.14 -0.11 -0.19 -0.04 0.2
-0.03 0.09 -0.1 0.04 0.01 0.04 0.01 -0.02 -0.05 -0.12 -0.14 0.22
-0.04 0.12 0.03 0.16 -0.17 0.07 0.01 -0.07 -0.07 -0.08 -0.07 0.08
0.21 -0.25 0.16 0.49 -0.34 -0.51 -0.99 -1.55 0.63 0.13 0.07 0.53
0.01 0.06 0.05 0.06 0.01 -0.02 -0.06 -0.0 0.0 -0.17 -0.07 0.11
0.72 -0.35 -0.39 -0.25 -0.42 -0.88 -0.03 -0.72 0.62 -0.07 0.21 0.52
-0.0 0.05 0.03 0.25 0.08 -0.1 -0.06 -0.16 0.07 -0.11 -0.12 0.03
-0.28 -0.1 -0.16 -0.03 0.18 0.11 0.04 0.19 -0.12 -0.06 -0.43 0.45

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.