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Heatmap: Cluster_130 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.16 -0.02 0.13 0.01 -0.0 0.01 0.17 -0.24 0.04 -0.21 -0.12
0.22 0.34 0.31 -0.12 0.29 0.1 -0.14 0.16 -0.92 -0.13 -0.68 0.03
0.78 0.8 0.04 0.14 -0.73 -0.55 -0.1 0.08 -0.26 -0.41 -0.02 -0.82
0.26 0.85 0.17 0.66 0.21 -0.22 0.3 0.03 -1.02 -0.58 -1.1 -1.32
0.61 -0.14 -0.18 -0.05 0.22 0.35 -1.35 -1.4 0.66 0.43 -1.12 0.17
0.77 0.6 0.34 -0.17 -0.13 -0.24 -3.52 0.65 -0.92 0.12 -0.38 -0.28
0.98 1.7 0.14 1.18 - - - - - - 1.23 0.11
0.6 0.31 -0.47 0.45 0.02 0.0 -0.46 0.36 -0.59 0.03 -0.62 -0.35
0.24 0.2 0.18 -0.16 0.05 0.09 -0.17 0.19 -0.72 -0.05 -0.16 0.07
0.23 0.25 0.11 0.37 0.26 -0.4 -0.4 -0.1 -0.22 -0.2 0.06 -0.24
0.81 -0.08 0.18 -0.14 -0.49 0.41 -0.16 0.07 0.31 -0.36 -0.56 -0.77
0.28 0.36 -0.1 -0.2 -0.26 -0.36 -0.05 0.16 -0.1 0.1 0.05 -0.05
0.23 0.34 -0.1 -0.15 -0.26 -0.22 -0.19 0.06 -0.07 0.05 0.19 -0.03
0.2 0.53 -0.08 -0.06 0.06 -0.05 -0.18 0.06 -0.41 -0.12 -0.12 -0.04
0.12 0.04 -0.16 -0.09 0.03 0.0 -0.12 -0.21 0.15 -0.02 -0.03 0.22
0.29 0.32 0.26 -0.3 0.23 -0.16 -0.43 -0.02 -0.11 -0.23 0.22 -0.36
1.1 1.09 -0.59 0.26 -0.32 0.0 -0.52 -1.23 -0.82 0.3 -0.27 -1.61
0.32 0.78 0.58 0.7 -0.13 -0.57 -0.39 -0.2 -0.72 -1.07 -0.25 -0.38
0.09 0.65 0.38 0.84 0.28 -1.51 -0.69 -0.19 -0.96 -0.32 0.22 -0.43
0.32 0.43 -0.0 -0.19 -0.29 -0.42 -0.06 0.2 -0.32 0.06 0.02 -0.01
0.33 0.67 0.22 -0.15 -0.06 -0.7 -0.25 -0.13 -0.51 0.24 -0.22 -0.0
0.16 0.28 0.05 0.08 -0.05 -0.14 -0.19 0.05 -0.05 -0.09 -0.09 -0.11
1.08 1.27 0.22 -0.22 -0.91 -1.97 -1.03 -0.96 -0.22 -0.54 0.57 -0.71
0.29 0.4 -0.07 -0.17 -0.26 -0.38 -0.11 0.14 -0.24 0.07 0.03 0.1
0.13 0.4 0.16 0.25 0.11 -0.26 -0.35 -0.15 -0.26 -0.18 -0.01 -0.04
0.32 0.69 0.27 0.25 -0.47 -0.82 -0.59 -0.06 -0.01 -0.06 -0.13 -0.03
0.17 0.24 0.05 0.09 0.06 -0.04 -0.03 -0.1 -0.31 -0.11 -0.2 0.09
0.16 0.27 -0.2 -0.05 -0.25 -0.12 -0.2 0.14 -0.06 -0.01 0.25 -0.07
0.16 0.08 -0.09 -0.1 -0.12 -0.1 -0.08 -0.0 0.05 0.06 0.04 0.07
0.24 -0.04 -0.02 0.19 -0.03 -0.02 -0.08 -0.04 -0.07 -0.1 -0.09 0.0
1.47 1.8 - - - - - - - 1.46 - 1.59
0.96 0.4 0.38 0.52 -1.21 -1.3 0.52 0.08 0.03 -1.44 -0.53 -0.75
0.09 0.4 0.19 0.08 0.16 -0.19 -0.25 -0.27 -0.15 -0.34 0.29 -0.26
1.04 2.29 - - - - -1.43 -1.56 -1.51 0.55 -0.63 0.91
-0.12 0.59 -0.55 0.03 0.14 -0.25 -0.27 -0.14 -0.02 0.15 0.06 0.08
0.15 0.19 -0.07 -0.03 0.01 -0.12 -0.1 -0.03 -0.17 0.11 -0.17 0.17
0.29 0.94 -0.32 -3.08 -3.49 0.8 -3.14 1.09 -1.69 0.71 0.5 -0.96
0.15 0.18 0.45 -0.21 -0.35 0.22 -0.08 -0.03 -0.03 -0.26 0.12 -0.41
-0.05 0.06 0.14 0.2 0.31 -0.03 -0.32 -0.19 -0.01 -0.24 0.19 -0.2
0.58 0.6 -0.09 0.94 -0.26 -0.71 -0.02 -0.63 -1.77 -0.32 -0.27 0.18
0.65 0.6 0.11 0.3 -0.43 -0.73 -0.41 -0.31 0.09 -0.31 -0.05 -0.22
0.47 1.22 -0.46 -0.09 0.24 -0.63 -0.41 0.04 -0.95 -0.54 -0.22 -0.1
0.18 0.09 0.08 -0.36 -0.27 0.07 -0.06 0.2 0.06 -0.07 0.33 -0.46
0.18 0.35 -0.17 -0.11 -0.26 -0.18 -0.21 0.11 -0.08 0.03 0.22 -0.04
0.14 0.17 -0.07 -0.05 -0.17 -0.31 -0.09 -0.02 0.29 0.05 -0.12 0.09
1.64 0.78 -0.58 -1.63 -1.34 -0.98 -0.59 -0.93 -1.03 0.53 -0.04 0.23
0.42 0.71 0.1 -0.19 -0.13 -0.41 -0.37 -0.21 -0.18 -0.11 0.09 -0.14
0.16 0.34 -0.02 -0.27 -0.2 -0.36 -0.0 0.02 -0.04 0.22 0.15 -0.16
0.12 0.07 0.16 0.34 0.25 -0.33 -0.47 -0.01 -0.06 -0.11 0.04 -0.22
0.35 0.27 -0.15 -0.1 -0.07 -0.24 -0.16 -0.03 0.08 0.06 0.07 -0.23
0.63 0.75 0.2 -0.2 0.11 -0.28 -0.66 -0.54 -0.69 -0.12 0.53 -0.91
0.53 0.62 -0.24 0.39 -0.29 -1.07 -0.76 -0.67 -0.11 0.3 0.08 0.17
-0.09 0.37 -0.41 -3.59 -0.49 0.51 -0.37 0.55 -0.72 0.74 0.58 -0.35
0.43 0.45 0.4 0.77 0.07 -1.43 0.14 -0.42 -0.58 -0.8 -0.06 -0.35
0.72 0.4 0.15 0.08 0.01 -0.26 -0.7 -0.1 -0.52 -0.33 0.29 -0.38
0.08 0.23 0.03 -0.03 -0.07 -0.12 -0.14 0.04 0.16 -0.02 0.02 -0.23
0.06 0.24 0.14 0.27 -0.1 0.01 -0.33 -0.04 -0.04 -0.03 -0.03 -0.28
-0.01 0.12 -0.05 0.2 -0.13 -0.28 0.01 0.02 0.01 -0.01 0.08 -0.02
0.13 0.27 -0.05 -0.17 -0.01 0.34 -0.23 0.01 0.05 -0.22 -0.13 -0.14
0.15 0.49 0.15 0.21 0.07 -0.33 -0.47 -0.03 -0.44 -0.07 0.07 -0.08
0.91 0.66 0.23 -0.12 -0.47 -0.77 -0.69 -0.23 -1.64 0.43 0.02 -0.03
0.16 0.28 -0.16 0.01 -0.11 -0.12 -0.27 0.05 -0.16 0.14 -0.02 0.09
0.62 0.26 -0.14 -0.18 -0.29 -0.02 -0.26 -0.23 -0.48 0.3 -0.13 0.16
-0.05 -0.03 0.09 0.42 0.23 -0.11 0.0 -0.09 -0.1 -0.35 -0.34 0.16
0.59 0.49 -0.01 0.31 -0.45 -0.63 -0.57 -0.29 0.17 -0.11 -0.08 0.0
0.17 0.47 0.26 0.15 0.22 -0.19 -0.3 -0.28 -0.42 -0.1 -0.01 -0.27
0.14 0.43 0.08 0.22 0.08 -0.23 -0.41 -0.09 -0.13 -0.15 0.0 -0.13
0.08 0.34 -0.02 -0.44 -0.24 -0.46 0.0 0.13 -0.27 0.23 0.42 -0.07
0.08 0.47 0.14 0.14 0.27 -0.33 -0.16 -0.08 -0.36 -0.07 -0.45 0.05
0.25 0.27 -0.0 0.05 0.01 -0.18 -0.22 0.06 -0.06 -0.04 -0.05 -0.18
0.72 0.4 -0.22 -0.13 0.25 -0.18 -0.24 -0.26 -0.36 -0.98 -0.01 0.29
0.45 0.25 0.16 -0.09 -0.23 -0.32 -0.17 -0.07 0.05 -0.1 -0.19 0.08
1.88 1.71 -1.94 -1.9 0.65 -1.82 -0.43 -1.62 - -1.7 -2.19 0.09
0.27 0.48 -0.2 -3.08 -2.84 0.86 -1.95 1.22 -1.24 0.62 0.5 -1.03
0.03 0.2 -0.06 0.15 -0.08 -0.05 -0.09 0.19 -0.16 0.03 -0.15 -0.07
0.87 1.56 0.66 -2.31 0.56 -1.62 0.24 -1.25 -2.96 -0.49 -0.03 -2.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.