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Heatmap: Cluster_121 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.9 -0.32 0.26 0.41 0.24 0.07 0.26 -0.24 0.05 -0.2 0.08 -0.16
-0.01 -0.5 0.08 -0.1 -0.15 -0.05 -0.09 0.13 0.28 -0.03 0.06 0.22
-4.11 0.15 0.66 1.95 0.28 -0.51 0.52 -0.66 - -1.52 -2.19 -0.29
-2.9 -0.17 -2.66 0.75 2.02 -0.17 -2.72 -0.23 0.11 -0.35 0.25 -2.7
-0.2 -0.45 0.21 0.3 -0.02 0.1 0.19 -0.19 0.3 -0.23 -0.13 -0.09
-0.5 -0.35 0.29 0.34 -0.15 0.25 -0.01 -0.51 0.59 -0.46 -0.21 0.19
-0.47 -0.38 0.73 -0.58 0.27 -0.38 0.56 -0.4 -0.06 -0.68 0.31 0.2
-0.22 -0.12 -0.09 0.05 -0.06 0.09 0.03 -0.12 0.23 -0.01 0.15 -0.01
-0.34 -0.1 0.04 0.21 -0.16 0.15 -0.02 -0.24 0.38 -0.05 0.06 -0.06
-0.46 -0.52 -0.01 0.48 0.06 0.03 0.2 -0.09 0.32 -0.23 0.04 -0.16
0.11 -0.14 0.01 0.11 -0.03 0.22 -0.04 0.05 0.07 -0.05 -0.29 -0.1
0.0 -0.28 -0.18 0.08 -0.19 0.04 -0.14 0.02 0.21 0.19 0.03 0.13
-0.38 -0.56 0.21 0.53 0.2 -0.18 -0.29 0.11 0.27 -0.44 0.15 -0.03
-0.06 -0.18 0.03 -0.23 -0.15 0.16 -0.07 -0.1 0.02 0.09 0.03 0.37
0.05 0.0 0.15 -0.04 -0.19 0.08 0.03 -0.03 -0.04 -0.08 0.03 0.0
-0.05 0.09 0.11 -0.22 0.07 -0.26 -0.08 -0.36 0.3 -0.2 0.02 0.39
-0.39 -0.33 0.02 0.32 -0.08 0.02 0.01 0.14 0.44 -0.0 0.05 -0.47
-0.09 -0.36 0.03 -0.01 -0.15 -0.08 -0.0 0.03 0.06 0.2 0.07 0.22
-0.29 -0.21 -0.03 0.27 0.01 -0.16 -0.05 -0.01 0.28 0.13 -0.03 -0.02
-0.38 -0.14 - 1.61 0.91 0.26 - - 0.96 -1.01 -0.43 0.01
-0.05 -0.15 0.06 0.08 -0.05 -0.0 -0.11 -0.15 0.19 -0.04 0.1 0.07
-0.35 0.17 0.36 0.18 -0.42 0.25 -0.09 -0.13 0.25 -0.39 -0.4 0.22
-0.64 -0.27 -0.38 0.65 0.57 -0.27 0.47 -0.56 0.18 -0.19 -0.3 -0.02
-0.2 0.01 0.04 0.35 0.0 -0.01 -0.08 -0.06 0.24 -0.25 -0.04 -0.12
-0.35 -0.55 -0.08 0.2 0.18 0.38 -0.09 -0.17 0.37 -0.13 -0.0 -0.04
-0.32 -0.35 0.06 0.42 0.58 0.4 -0.41 -0.17 -0.23 -0.47 0.15 -0.15
-0.24 -0.11 -0.0 -0.09 -0.01 -0.1 -0.01 0.14 -0.02 -0.06 0.06 0.36
-0.95 0.05 -0.42 1.07 0.51 -0.44 -0.5 -0.53 0.56 -0.33 -0.11 -0.24
-0.21 -0.01 0.27 0.22 -0.14 -0.11 0.08 -0.11 0.21 0.01 -0.23 -0.09
-0.45 -1.01 -0.34 0.65 0.6 0.06 -0.18 -0.37 0.13 0.35 -0.09 -0.17
-0.23 -0.13 0.01 0.24 0.04 0.02 0.0 -0.23 0.13 -0.07 0.03 0.11
-0.25 -0.1 0.02 0.01 -0.16 -0.04 0.18 -0.06 0.13 -0.01 -0.02 0.22
-1.05 -1.57 -0.57 0.74 0.85 0.07 -0.18 -0.25 0.19 0.21 0.34 -0.5
0.25 -0.29 0.3 0.52 0.05 -0.07 -0.26 -0.28 -0.36 -0.29 0.24 -0.14
-0.78 -0.57 -0.06 0.4 0.36 0.38 0.23 0.12 0.0 -0.28 -0.0 -0.33
-0.21 0.22 0.01 -0.31 -0.3 -0.19 -0.08 -0.56 0.16 0.0 0.06 0.75
-0.65 -0.21 0.13 0.33 -0.06 0.09 0.28 0.19 0.21 -0.29 0.06 -0.42
-0.63 -0.23 0.16 0.4 0.12 0.41 0.14 -0.27 0.25 -0.37 -0.36 -0.02
-0.63 -0.0 0.16 0.49 0.06 0.04 0.36 0.02 0.07 -1.04 0.17 -0.3
-0.19 0.0 0.04 0.14 -0.23 -0.03 -0.06 -0.4 0.38 -0.08 0.08 0.18
-0.21 0.19 0.45 0.17 -0.13 -0.03 -0.16 -0.21 0.14 -0.17 0.05 -0.29
-0.73 0.13 0.28 0.38 -0.34 0.1 0.06 -0.46 0.56 -0.45 0.03 -0.11
0.09 -0.34 0.44 -0.27 -0.16 -0.27 0.36 -0.57 0.13 -0.13 -0.05 0.38
-0.08 -0.08 0.17 -0.02 -0.05 -0.04 0.05 -0.07 0.06 -0.05 0.05 0.04
-0.34 -0.04 0.11 0.11 -0.21 -0.07 -0.39 0.27 0.29 0.13 -0.17 0.12
-0.54 -0.5 0.14 0.21 -0.29 0.2 0.25 0.13 0.36 0.0 -0.2 -0.09
-0.53 -0.2 0.29 0.92 0.44 0.12 0.41 -0.11 -0.93 -1.0 -0.45 -0.19
-0.46 -1.13 -0.06 0.23 0.77 -0.19 -0.54 -0.23 0.28 0.17 0.59 -0.48
-1.07 -0.68 -0.37 1.64 -0.02 0.03 0.66 0.45 -0.34 -1.14 -1.32 -1.21
-0.46 -0.02 0.08 0.71 0.31 0.06 -0.09 0.05 -0.31 -0.39 -0.12 -0.25
-0.67 -0.4 0.03 0.32 -0.16 0.12 0.36 0.02 0.45 -0.07 -0.05 -0.33
-0.13 -0.02 0.23 -0.04 -0.03 -0.09 -0.13 -0.33 0.21 -0.06 0.2 0.08
-0.13 -0.39 -0.03 0.13 -0.19 0.16 0.09 0.18 0.31 0.02 -0.21 -0.09
0.1 -0.24 0.21 0.39 -0.03 -0.24 -1.07 -0.72 0.53 -0.84 0.83 -0.11
-0.22 0.14 0.0 0.44 -0.48 -0.13 0.17 0.24 0.1 -0.76 0.15 -0.04
0.03 -0.08 0.21 0.09 0.01 0.17 -0.02 -0.16 -0.02 -0.11 -0.08 -0.08
-1.24 -0.28 0.4 0.5 0.05 -0.25 0.06 -0.38 0.42 -0.01 -0.0 0.01
0.08 0.04 0.1 -0.06 -0.22 0.09 0.09 0.07 -0.12 -0.1 -0.09 0.06
-0.12 -0.45 -1.62 1.05 -0.42 1.25 0.1 -0.62 0.56 -0.29 -2.03 -0.82
0.23 -0.26 -0.2 -0.28 -0.23 0.08 -0.05 -0.07 0.02 0.21 -0.16 0.49
-0.2 0.24 0.28 -0.05 -0.31 0.15 0.15 0.03 0.12 -0.46 -0.16 0.02
0.24 -0.19 -0.05 0.63 0.32 0.12 -0.74 -0.7 -0.22 -0.77 0.65 -0.21
-1.39 -2.14 -0.09 1.13 0.73 0.2 -0.69 0.28 0.06 -0.41 0.34 -0.84
-0.49 -0.46 -0.36 0.63 0.65 0.04 -0.19 0.34 -0.1 -0.37 -0.23 -0.1
-1.03 0.25 0.58 0.74 -0.11 -0.2 -0.16 -0.54 -0.31 0.18 0.03 -0.28
-0.17 -0.39 -0.16 0.39 0.23 -0.02 0.17 0.09 0.16 -0.21 -0.2 -0.08
0.02 -0.46 0.35 0.06 -0.32 0.01 -0.08 -0.3 0.29 -0.15 0.1 0.24
-1.23 -1.53 -0.16 1.13 0.98 0.13 -0.38 -0.06 -0.03 -0.81 0.2 -0.59
-0.19 0.01 0.16 0.17 -0.3 0.08 -0.13 -0.07 0.16 -0.11 -0.02 0.14
-0.34 0.08 -0.09 0.5 0.05 0.05 -0.11 -0.06 0.08 -0.09 -0.12 -0.09
-0.05 -0.09 -0.01 0.06 -0.12 0.01 -0.0 -0.02 0.12 -0.0 -0.01 0.11
-0.2 -0.07 0.08 0.01 -0.33 0.09 -0.03 -0.33 0.3 0.0 0.21 0.12
-1.83 -2.57 -0.01 1.25 0.32 0.18 -1.02 -0.2 -0.34 -0.34 0.96 -0.14
-0.25 0.22 0.21 -0.04 -0.12 0.11 -0.27 -0.63 0.38 0.12 0.17 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.