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Heatmap: Cluster_58 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.02 -0.18 -0.01 -0.14 -0.26 0.08 0.08 -0.66 0.67 -0.11 0.26 -0.12
0.03 0.08 -0.1 -0.07 -0.04 -0.07 -0.19 -0.3 0.35 -0.07 0.2 0.08
-0.33 -1.04 -0.7 -0.08 0.35 0.41 0.74 -0.15 0.03 -0.92 0.24 0.34
-0.07 -0.25 -0.06 -0.1 0.05 -0.19 0.06 -0.13 0.23 0.16 0.14 0.08
-0.52 -1.5 0.09 -0.97 -0.28 -0.13 0.32 -0.01 0.51 0.23 0.55 0.41
0.09 -0.36 -0.18 0.1 -0.24 0.14 0.04 -0.35 0.47 0.03 0.09 -0.04
-0.01 -1.07 -0.12 0.11 -0.43 0.29 -0.08 -0.06 0.41 0.03 0.01 0.38
-0.06 -0.07 0.06 0.12 -0.04 0.07 -0.15 0.03 0.03 -0.03 -0.04 0.07
0.06 -0.03 -0.06 0.13 -0.0 -0.09 -0.04 -0.01 0.06 -0.04 -0.04 0.04
0.16 -0.42 -0.03 0.1 -0.01 -0.33 -0.6 -0.47 0.68 -0.01 0.4 -0.0
0.1 -0.01 -0.19 -0.1 0.02 -0.22 -0.03 -0.08 0.15 0.03 0.27 -0.01
-0.14 -0.16 -0.13 0.21 0.05 0.08 0.03 0.09 0.01 -0.08 -0.09 0.07
0.4 -1.29 0.24 0.15 -0.04 -0.8 -0.12 -0.39 0.07 0.42 0.32 0.18
-0.15 -0.02 -0.06 -0.0 -0.44 -0.12 0.01 0.13 0.11 0.08 -0.07 0.39
0.11 -0.1 0.02 -0.02 -0.04 -0.01 -0.11 -0.17 0.15 -0.0 0.17 -0.04
-1.31 -1.07 0.54 0.08 -0.06 -0.43 -0.67 -1.54 1.12 -0.12 0.64 0.35
-0.11 -0.24 -0.04 0.0 -0.23 -0.07 -0.01 0.14 0.17 -0.03 0.11 0.22
-0.05 -0.01 -0.03 -0.05 -0.08 0.07 -0.0 -0.1 0.12 0.01 0.1 0.02
0.02 -0.62 -0.05 -0.19 -0.0 -0.31 -0.06 -0.38 0.7 0.04 0.43 -0.06
-0.12 -0.44 0.04 0.01 -0.41 0.03 0.07 -0.05 0.24 0.17 0.03 0.25
-0.27 -0.78 0.02 0.2 -0.3 0.01 0.66 -0.3 0.27 -0.69 0.46 0.01
-0.04 -0.15 0.0 -0.05 -0.1 0.04 0.04 -0.11 0.09 0.12 0.11 0.02
-0.05 -0.06 -0.06 -0.12 -0.28 -0.09 0.04 -0.06 0.02 0.1 0.01 0.45
0.1 -0.1 0.15 0.13 -0.4 0.04 0.12 -0.15 0.08 -0.24 -0.12 0.27
-0.02 -0.09 -0.17 0.07 -0.04 0.07 -0.03 -0.12 0.21 0.05 -0.07 0.1
0.16 0.09 -0.15 -0.73 -0.32 -0.06 0.1 -0.69 0.48 0.08 0.31 0.23
-0.12 -0.77 -0.62 0.16 -0.2 0.32 0.15 0.1 0.4 -0.13 0.17 0.12
0.2 -0.41 0.02 0.22 -0.1 -0.01 -0.16 -0.27 0.29 -0.01 0.12 -0.06
0.13 -0.22 -0.03 0.01 -0.16 0.06 0.07 -0.03 0.18 -0.06 0.06 -0.04
-0.18 -0.08 0.17 -0.17 -0.31 0.07 0.01 -0.13 0.18 0.06 -0.0 0.28
-0.3 -0.18 -0.15 -0.14 -0.04 0.11 0.1 0.1 0.05 0.01 0.2 0.17
-0.08 -0.31 0.15 0.0 -0.05 -0.01 -0.08 -0.21 0.31 -0.06 0.21 0.03
0.02 -0.22 -0.01 0.08 -0.13 0.04 0.02 -0.03 0.07 -0.01 0.05 0.08
0.33 0.14 -0.41 -0.34 -0.03 -0.35 0.11 -1.11 0.6 -0.19 0.65 -0.25
0.16 -0.12 -0.16 -0.1 -0.16 -0.24 -0.02 -0.64 0.52 -0.0 0.61 -0.32
-0.07 -0.5 0.19 0.02 -0.18 -0.07 -0.15 -0.52 0.39 0.01 0.34 0.21
0.09 -0.39 0.06 0.17 -0.38 0.07 -0.1 -0.07 0.26 -0.02 0.01 0.17
-0.22 -0.4 0.17 0.15 -0.17 -0.4 -0.37 0.03 0.09 -0.05 0.41 0.42
-0.15 -0.17 -0.18 -0.18 -0.04 0.05 0.01 -0.05 0.23 0.17 0.2 0.01
0.02 -0.05 -0.12 0.05 0.06 -0.09 0.01 0.01 0.02 -0.04 0.09 0.04
0.1 -0.41 0.05 0.13 -0.34 -0.01 -0.03 -0.14 0.28 0.01 0.04 0.18
0.22 -0.21 -0.1 0.11 -0.14 -0.12 -0.07 -0.05 0.05 -0.03 0.1 0.18
0.06 -0.16 -0.07 0.05 0.01 -0.04 -0.02 -0.02 0.04 0.02 0.09 0.02
-0.32 -0.4 -0.32 -0.17 -0.19 0.17 0.12 0.14 0.17 0.39 0.19 -0.03
-0.08 -0.24 -0.32 -0.12 0.07 -0.0 -0.03 -0.34 0.41 -0.02 0.21 0.26
0.01 -0.47 0.29 0.07 -0.05 -0.01 0.39 -0.41 0.0 -0.18 0.06 0.06
0.35 -0.37 -0.3 -0.24 -0.16 -0.12 -0.01 -0.66 0.69 -0.29 0.76 -0.46
-0.08 -0.01 -0.19 0.12 -0.1 0.06 -0.42 -0.52 0.35 0.11 0.48 -0.09
-0.04 -0.2 -0.36 -0.1 0.04 0.04 0.03 -0.13 0.43 0.11 0.26 -0.27
-0.06 -0.23 -0.13 -0.06 0.03 0.03 -0.05 -0.02 0.18 0.16 0.11 -0.02
0.1 -0.02 0.04 0.19 -0.06 -0.33 -0.26 -0.49 0.29 -0.05 0.16 0.23
-0.03 -0.28 0.23 0.09 -0.08 -0.02 -0.05 -0.41 0.13 -0.06 -0.09 0.38
0.06 -0.25 0.0 0.0 0.0 -0.01 0.0 0.04 0.05 -0.03 0.11 -0.01
0.21 -0.1 -0.04 0.16 0.03 -0.3 0.14 -0.38 -0.02 -0.23 0.17 0.19
-0.05 -0.14 -0.02 -0.01 -0.13 -0.06 -0.0 0.05 0.02 0.08 -0.01 0.23
-0.1 -0.14 -0.1 -0.05 0.06 -0.22 -0.13 -0.11 0.22 0.21 0.23 0.02
0.13 -0.15 0.05 0.36 -0.12 0.11 0.18 -0.29 -0.1 -0.21 0.06 -0.15
0.01 -1.55 -0.42 0.36 -0.38 -0.35 0.9 0.14 -1.05 0.33 -0.17 0.54
0.0 -0.94 -0.3 0.45 -0.45 -0.12 0.31 0.06 0.19 -0.26 -0.14 0.57
-0.78 -0.35 0.21 0.24 -0.46 -0.13 -0.02 -0.64 0.81 -0.36 0.57 0.01
0.09 -0.32 -0.01 0.03 -0.22 0.17 -0.14 -0.09 0.38 0.02 0.01 -0.04
-0.1 -0.5 -0.23 0.17 -0.15 0.32 0.38 -0.1 -0.06 -0.31 0.2 0.12
-0.04 -0.45 0.09 -0.03 -0.26 0.18 0.08 -0.25 0.25 -0.15 0.03 0.34
0.03 -0.58 0.03 0.06 0.17 -0.01 0.2 -0.22 0.19 -0.36 0.22 0.05
-0.24 -0.66 -0.37 -0.17 0.0 -0.59 0.16 -0.39 0.23 0.38 0.52 0.49
-0.27 -0.23 0.19 -0.07 -0.13 0.03 -0.13 -0.23 0.19 0.19 0.02 0.29
0.04 -0.2 -0.12 -0.36 -0.08 0.14 0.01 -0.08 0.19 0.04 0.26 0.05
0.04 -0.32 -0.19 -0.24 0.09 0.25 0.1 -0.21 0.19 -0.16 0.27 0.04
-0.04 -0.1 0.19 0.14 -0.21 -0.1 0.06 0.02 -0.04 -0.14 -0.01 0.17
-0.06 -0.45 0.01 0.15 -0.51 -0.1 0.28 0.12 0.19 -0.02 -0.01 0.2
0.18 -0.79 0.02 0.08 -0.31 -0.36 0.08 -0.09 0.15 0.33 -0.25 0.52
-0.02 -0.39 0.08 -0.24 -0.15 -0.01 0.14 -0.32 0.34 0.1 0.23 0.05
0.28 -0.44 0.27 0.16 -0.57 -0.07 -0.14 -0.3 0.36 0.07 0.14 -0.1
0.23 -0.54 0.35 -0.56 -0.09 0.07 0.06 -0.12 0.16 -0.02 0.33 -0.18
-1.24 -1.46 -0.1 -0.08 -0.25 0.13 -0.2 -0.65 0.83 0.63 -0.07 0.7
-0.19 -0.1 0.05 -0.04 -0.44 0.04 -0.01 0.24 0.48 0.03 0.02 -0.31
-0.17 -0.16 -0.08 -0.05 -0.22 0.09 0.02 -0.35 0.38 0.02 0.23 0.12
0.14 -0.32 -0.03 0.01 -0.23 -0.21 0.04 -0.11 0.14 -0.26 0.27 0.37
-0.69 -0.13 0.08 0.16 -0.02 -0.02 0.05 -0.66 0.4 0.02 0.32 0.1
-0.02 -0.4 -0.09 0.56 -0.53 -0.68 -0.05 -0.59 0.3 0.34 0.29 0.23
0.13 -0.43 0.04 0.1 -0.06 -0.23 -0.01 -0.02 0.09 -0.22 0.11 0.36
-0.17 -0.04 0.28 -0.3 0.11 0.59 -0.08 -1.42 -0.46 -0.3 1.11 -0.97
0.03 -0.19 0.09 0.17 -0.13 -0.21 -0.08 -0.28 0.22 0.09 0.05 0.14
-0.09 -0.65 -0.48 0.3 0.33 -0.78 -0.21 -0.15 0.46 -0.13 0.52 0.2
0.05 -0.17 0.25 0.41 -0.32 0.36 -0.33 -0.29 -0.02 -0.48 -0.04 0.24
-0.18 -0.71 -0.75 -0.07 -0.03 0.18 0.03 -0.6 0.33 0.56 0.41 0.15
-0.32 -0.15 0.13 0.42 0.05 -0.5 -0.37 -0.91 0.69 -0.1 0.18 0.19
-0.07 -0.41 -0.41 -0.01 -0.22 0.13 0.07 0.2 0.23 -0.03 -0.08 0.36
0.01 -0.15 -0.01 0.07 -0.07 0.02 0.09 -0.23 0.16 0.09 -0.09 0.06
-0.04 -0.24 -0.03 0.1 -0.11 -0.03 0.1 0.13 -0.08 -0.06 0.03 0.18
0.27 0.29 -0.4 -0.85 -1.05 0.14 0.06 -0.61 -0.05 0.01 0.66 0.51
-0.26 -0.07 0.22 0.41 0.0 -0.29 -0.37 -0.14 -0.04 -0.11 0.25 0.18
0.06 -0.41 -0.07 0.26 -0.26 0.11 0.17 -0.17 0.38 -0.19 0.15 -0.23
0.35 -0.98 0.06 0.33 0.03 0.39 -0.8 -0.73 0.11 -0.27 0.83 -0.47

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.