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Heatmap: Cluster_174 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.37 -0.08 -0.12 0.14 0.18 0.74 -0.12 -0.08 -0.35 -0.3 0.17 -0.22
-0.07 0.21 -0.18 0.46 -0.11 0.29 -0.83 0.4 -0.71 -0.32 0.53 -0.41
0.09 0.61 -0.44 -0.89 0.1 0.32 -1.55 0.43 -0.29 0.2 0.11 0.1
-0.06 0.0 0.03 -0.06 0.08 0.09 0.07 0.16 -0.36 -0.67 -0.11 0.53
-0.14 0.05 -0.06 0.14 -0.11 0.15 -0.17 0.02 0.19 -0.03 0.05 -0.15
-0.27 -0.15 -0.11 0.15 0.09 0.03 -0.02 -0.08 0.05 -0.04 0.12 0.17
-0.21 0.24 -0.01 0.45 0.14 0.36 -0.82 -0.34 0.23 -0.81 0.12 0.04
-0.32 -0.4 0.07 0.12 0.2 0.32 -0.19 0.12 -0.1 -0.23 0.27 -0.07
-0.25 0.11 0.0 0.14 0.08 0.15 -0.2 -0.1 0.1 -0.09 -0.03 0.02
-0.98 -0.85 -0.04 0.36 0.68 0.41 -0.36 -0.02 0.25 -0.13 0.34 -0.68
-0.13 -0.88 0.27 0.67 0.71 -0.11 -1.57 -0.13 -0.37 -0.29 0.68 -0.45
-0.13 -0.56 0.09 0.11 0.06 0.22 -0.13 -0.14 -0.0 0.01 0.2 0.1
-0.14 0.14 0.08 0.17 -0.03 0.21 -0.34 0.0 0.04 -0.06 -0.01 -0.14
0.15 0.0 0.08 0.13 -0.12 0.16 -0.22 -0.24 0.11 -0.3 0.15 -0.01
-0.06 0.08 -0.06 0.07 0.06 0.01 -0.14 0.07 -0.01 0.09 -0.02 -0.13
-0.39 0.35 0.4 0.18 0.08 -0.11 -0.51 0.08 0.06 -0.92 0.48 -0.31
-0.86 0.56 -0.32 -0.25 0.35 1.16 -0.21 -0.33 0.16 -1.09 -0.65 -0.11
-0.62 0.32 -0.79 -0.06 0.25 0.94 -0.16 0.18 -0.48 -0.89 0.17 0.07
0.22 -0.28 -0.47 -0.1 -0.51 0.29 -0.14 -0.13 0.42 0.05 0.27 0.02
-0.43 0.55 0.15 -0.36 -0.23 0.66 0.12 -0.04 -0.21 0.21 -0.74 -0.31
0.01 0.09 -0.01 0.1 -0.02 0.1 -0.17 -0.0 0.02 -0.08 -0.01 -0.05
-0.09 -0.1 -0.06 0.08 0.09 0.16 -0.34 -0.17 0.15 -0.04 -0.07 0.27
-0.62 -0.03 0.06 0.34 0.23 0.14 -0.17 0.01 -0.0 -0.28 0.32 -0.29
-0.39 -0.69 0.06 0.88 0.04 0.39 -0.6 -0.73 -0.06 -0.87 0.66 0.05
-0.71 0.09 -0.04 0.5 -0.33 0.49 -0.54 -0.6 -0.25 0.2 0.47 0.02
0.08 -0.11 -0.06 0.02 -0.04 0.05 0.02 -0.02 -0.01 0.06 0.03 -0.04
-0.26 0.16 0.17 -0.31 -0.01 0.61 -0.13 0.45 -0.13 -0.57 -0.11 -0.32
-1.03 -0.97 1.64 -0.64 -0.57 1.48 -0.41 -0.81 0.1 - 0.47 -
-0.03 -0.19 -0.08 -0.0 0.03 -0.04 -0.32 -0.12 0.4 0.09 0.25 -0.16
0.01 -0.08 -0.17 -0.04 -0.09 0.29 -0.16 -0.02 0.15 -0.03 0.11 -0.03
-0.96 -0.29 -0.69 0.55 -0.27 0.09 -0.06 0.22 0.41 -0.3 0.52 -0.02
0.2 0.53 - 0.58 1.44 1.9 - 0.55 - - - -
-0.03 -0.02 0.04 0.13 0.03 0.14 -0.23 -0.04 -0.01 -0.19 0.03 0.1
0.18 0.05 -0.08 0.39 -0.18 -0.19 -0.43 0.02 0.03 0.08 0.11 -0.15
-0.82 0.4 -0.12 0.41 -0.14 0.14 -0.17 -0.25 -0.16 0.05 0.44 -0.23
-0.29 -0.02 -0.11 0.16 0.09 -0.03 0.1 0.06 -0.33 -0.24 0.01 0.44
-0.57 0.13 -0.05 0.16 -0.21 -0.09 -0.2 -0.14 0.17 0.1 0.42 0.05
-0.33 0.13 0.15 0.29 0.01 0.14 -0.13 -0.03 0.03 -0.35 -0.03 -0.02
-0.56 0.12 -0.03 0.22 -0.15 0.28 -0.17 -0.0 0.06 -0.16 0.31 -0.13
-0.03 -0.18 0.36 0.65 0.17 0.0 -1.37 -2.03 -0.53 -0.3 0.18 0.92
-0.35 0.57 -0.6 -0.18 -0.86 1.26 -1.75 -0.06 0.29 -0.11 0.09 -0.38
-0.39 -0.29 0.57 0.03 0.3 0.5 -0.16 -0.11 -0.35 0.07 -0.12 -0.54
-0.07 -0.13 -0.04 0.15 0.05 -0.01 -0.04 -0.01 0.04 -0.01 0.22 -0.18
0.03 0.03 -0.1 0.03 -0.13 0.27 -0.16 -0.06 0.14 0.09 -0.06 -0.14
0.09 -0.31 0.02 0.1 -0.05 -0.03 -0.13 -0.09 0.19 -0.01 0.24 -0.08
-0.6 -0.04 0.32 0.71 0.64 0.39 -0.34 -0.26 -0.11 -1.03 0.01 -0.79
-0.59 -0.48 0.24 0.34 0.13 0.29 -0.05 -0.22 -0.2 -0.37 0.65 -0.3
0.0 -1.04 0.55 0.19 0.56 0.99 0.56 -0.18 -1.45 -1.48 -0.06 -1.27
-1.02 -0.22 -0.11 0.16 -0.11 0.21 -0.24 0.29 0.17 -0.22 0.65 -0.17
-0.04 -0.03 -0.05 0.01 -0.15 0.01 -0.06 -0.09 0.17 -0.03 0.15 0.08
-0.12 0.25 -0.12 0.02 0.02 0.21 -0.2 -0.12 0.04 0.04 -0.06 -0.04
- -0.13 -0.25 -1.5 1.58 2.17 0.3 - 0.21 - - -
0.27 1.17 - -0.77 0.71 1.68 - 0.04 -1.18 - 0.21 -1.07
-0.14 -0.04 -0.12 0.14 -0.05 0.03 -0.16 -0.17 0.24 -0.02 0.14 0.09
-0.02 0.2 0.16 -0.37 0.21 0.36 -0.27 -0.69 0.41 -0.01 0.15 -0.62
-0.88 -0.14 0.6 0.46 -0.23 0.41 -0.18 0.3 -0.09 -0.24 -0.44 -0.25
- - 1.39 - 1.68 2.63 - - - - - -
0.18 -0.22 0.07 0.36 0.13 -0.14 -0.21 -0.34 -0.31 0.08 -0.1 0.29
-0.64 -0.02 0.07 0.27 0.32 0.14 -0.22 -0.01 0.11 -0.38 0.36 -0.36
-0.34 0.09 0.31 0.16 -0.01 -0.42 -0.41 0.05 0.01 -0.24 0.63 -0.23
-0.2 0.94 -1.9 0.88 0.35 1.06 -0.61 -1.74 -1.11 -0.02 -0.46 -0.69
-0.27 0.05 -0.02 0.11 0.07 0.07 -0.09 0.01 0.11 0.1 -0.01 -0.18
-0.11 -0.41 -0.03 -0.54 0.06 0.33 0.21 -0.52 0.68 -0.13 0.27 -0.35
-0.1 -0.12 0.09 0.27 -0.03 -0.06 -0.3 -0.32 -0.12 0.01 0.31 0.21
0.04 0.04 0.35 0.31 -0.51 0.41 -0.59 -0.25 -0.1 -1.44 0.39 0.37
-0.36 -0.02 0.09 0.15 0.26 0.11 -0.02 -0.03 0.18 -0.13 -0.05 -0.3
0.02 -0.16 -0.05 0.1 -0.13 -0.06 -0.21 -0.03 0.28 -0.01 0.23 -0.08
-0.09 -0.12 -0.23 0.32 0.06 0.07 -0.09 -0.02 -0.15 0.05 0.01 0.11
-0.31 0.85 -0.71 -1.34 0.76 1.2 -0.16 -1.91 - 0.37 0.21 -0.34
-0.24 -0.19 -0.37 0.31 -0.03 0.21 -0.3 -0.05 0.22 0.22 0.08 -0.06
-0.28 0.19 0.12 0.2 -0.09 0.0 -0.5 0.08 -0.23 -0.19 0.25 0.23
0.04 0.36 0.43 0.63 0.03 0.32 -0.65 -0.42 -0.1 -1.45 -0.36 0.07
-0.28 0.13 -0.1 0.19 -0.01 0.09 -0.09 0.05 -0.48 -0.19 0.21 0.29
0.97 0.18 - 1.38 1.25 1.98 - - - - - -
-0.73 -0.73 0.02 0.5 0.49 0.35 -0.52 0.37 -0.04 -0.55 0.11 -0.06
-0.78 0.8 0.17 -0.08 0.49 0.39 -1.47 0.62 -0.1 -1.19 -0.11 -0.53
-0.32 0.06 0.29 0.06 0.09 0.21 0.02 -0.04 -0.11 -0.25 -0.04 -0.08
- - - - 2.61 2.56 - - - - - -
-0.88 0.5 0.11 -0.3 -0.09 0.83 -0.46 0.42 0.36 -0.59 -0.29 -0.71
0.08 0.07 0.04 0.41 0.16 -0.04 -1.04 -0.66 -0.34 -0.39 0.68 0.23
0.15 -0.96 -0.41 0.04 0.39 0.41 -0.36 -0.66 -0.02 -0.29 1.01 -0.45
0.05 0.6 0.05 -1.54 1.33 1.49 -1.11 - -2.98 -0.31 -0.83 -0.35
-0.09 0.01 -0.13 0.06 -0.0 -0.02 0.03 -0.21 0.09 -0.08 0.25 0.05
-0.6 0.71 0.06 -0.52 0.05 1.05 0.65 -0.98 0.39 -0.08 -1.54 -2.38
-0.07 0.3 -0.76 0.22 -0.94 0.62 -1.56 -0.3 -1.02 0.51 0.61 0.5
0.51 1.71 -0.0 - 0.97 1.78 - - - - - -0.14
-0.64 0.82 -0.29 -0.19 -0.18 1.19 0.04 -0.46 -0.68 -1.07 0.44 -0.98
-0.7 -0.14 0.29 0.18 -0.39 0.22 -0.07 -0.36 0.32 -1.06 0.88 -0.17
-0.57 -1.28 -0.1 0.35 0.49 0.36 0.26 -0.23 0.12 -0.94 0.79 -0.64
-0.7 -0.14 0.26 0.86 0.28 -0.22 -0.28 -0.54 -0.19 -0.13 0.08 0.04
-0.04 0.01 0.05 0.1 0.03 -0.06 -0.06 0.11 -0.31 -0.02 0.1 0.02
0.01 0.13 0.06 0.2 -0.05 0.15 -0.26 -0.23 0.02 -0.11 0.01 0.02
-0.15 -0.12 -0.15 0.16 -0.03 0.14 -0.15 -0.03 -0.11 0.03 0.13 0.22
-0.06 0.36 -0.13 0.2 0.24 0.11 -0.71 -0.1 -0.19 0.11 0.1 -0.22
0.1 0.45 -0.1 -0.01 0.53 -0.16 -0.38 -0.16 -0.42 0.54 -1.03 -0.1
0.02 -0.17 0.33 0.26 -0.19 0.02 -0.17 -0.01 -0.2 -0.18 -0.14 0.27
-1.61 1.04 -0.27 -0.2 0.32 1.28 -0.49 -0.08 -0.75 -0.43 -0.23 -1.35
-0.12 0.02 0.02 0.15 0.01 0.01 -0.13 -0.08 0.06 0.02 0.05 -0.04
-0.06 0.06 -0.23 -0.21 0.07 0.28 0.07 -0.44 0.18 0.02 -0.08 0.19
- 0.47 - -0.45 1.4 2.35 - 1.1 - - - -
-0.1 0.18 -0.02 0.01 -0.08 0.05 -0.08 -0.1 0.06 0.03 0.02 0.02
0.5 0.72 -0.25 - 1.44 1.95 - - - -0.47 - -0.33
-0.09 0.12 0.01 0.0 -0.07 0.05 -0.02 -0.16 0.06 0.04 0.08 -0.04
-2.29 -0.16 -0.49 0.23 1.94 0.7 0.06 -2.08 -0.23 - -0.06 -1.1
0.06 -0.15 -0.05 0.31 -0.14 0.24 -0.2 -0.19 0.05 -0.27 0.15 0.07
0.65 0.65 -0.62 0.15 0.3 0.23 -0.81 -0.31 -0.24 0.04 -0.46 -0.49
-0.08 0.03 -0.04 0.14 -0.11 0.11 -0.18 -0.02 0.14 0.0 0.07 -0.1
0.05 0.5 0.21 -0.74 0.69 0.01 -0.83 0.06 -0.44 0.34 -0.09 -0.69
0.05 0.04 -0.21 0.33 -0.21 0.28 -0.42 -0.45 -0.34 -0.14 0.12 0.57
-0.03 -0.09 -0.17 0.04 -0.06 0.25 -0.07 0.01 0.23 -0.04 -0.04 -0.09
-0.15 0.26 0.05 0.54 0.16 -0.02 -0.63 -0.33 0.06 -0.59 0.2 0.03
-1.39 -0.48 -3.43 0.88 -0.67 0.98 -0.78 0.19 -0.54 -0.25 0.34 0.89
-0.02 -0.03 -0.11 0.12 -0.06 0.19 -0.23 -0.06 0.0 0.05 -0.03 0.14
-0.34 -0.24 0.94 0.54 0.69 0.4 -0.55 0.33 -0.83 -1.7 -0.31 -1.13
-1.5 -2.41 -1.17 0.61 -0.33 1.08 -0.6 1.31 -0.39 - 0.61 0.19
0.07 0.08 0.28 -0.35 -0.22 0.31 -0.11 0.05 0.28 -0.69 0.04 -0.06
0.33 1.08 -1.09 -0.06 0.79 1.74 -0.23 -0.28 -1.13 - - -
-0.07 -0.04 0.02 0.04 -0.08 0.3 -0.21 0.17 -0.17 -0.06 -0.11 0.13
0.29 0.94 0.11 -0.27 -0.15 1.74 -2.63 -2.17 -2.72 0.24 -2.13 -0.38
-0.37 0.2 0.01 -0.25 0.06 0.01 -0.06 -0.02 0.05 -0.45 0.41 0.2
- 1.36 - 2.69 - 1.59 - - - - - -
-0.36 0.16 0.37 0.25 -0.07 0.85 -0.59 0.38 -0.81 -1.05 0.08 -0.34
0.26 0.54 0.17 0.16 0.02 0.67 0.17 0.01 -0.82 -0.35 -1.07 -0.86
0.17 0.0 -0.17 0.2 -0.07 0.12 -0.0 -0.4 -0.1 -0.22 -0.03 0.33
-0.33 -0.04 0.55 0.43 0.06 0.31 -0.1 -0.21 -0.17 -0.28 -0.21 -0.41
-0.4 -0.39 -0.07 -0.31 -0.08 0.25 -0.08 -0.27 0.77 -0.12 0.44 -0.27
-0.51 -0.21 0.4 0.49 -0.01 0.52 -0.77 0.34 0.11 -0.24 -0.35 -0.47
-0.58 -0.36 -0.03 0.12 0.53 0.53 0.31 0.45 0.15 -0.91 -0.33 -0.85
-0.42 0.05 0.12 0.25 -0.0 -0.06 -0.39 -0.62 0.12 -0.03 -0.23 0.72
-0.45 -0.0 0.18 0.28 0.24 0.22 -0.2 0.06 0.14 -0.17 -0.2 -0.32
0.07 0.01 0.05 0.11 -0.27 0.1 -0.18 0.03 -0.24 0.04 0.09 0.1
0.32 0.53 -0.51 - 0.78 1.74 -0.65 -0.46 0.36 - -0.15 -
0.24 -2.05 0.41 0.77 -0.28 1.03 -1.61 -0.47 -2.6 0.1 0.97 -1.25
-0.58 0.17 -0.15 0.57 -0.14 0.14 -0.51 0.55 -0.31 -0.3 -0.26 0.23
-0.54 -0.07 -0.04 0.06 0.09 0.24 0.02 -0.19 -0.54 -0.21 0.31 0.5
0.0 -0.08 -0.04 0.03 0.05 0.06 -0.18 -0.18 0.04 0.08 0.04 0.14
-0.74 0.39 -0.0 0.04 0.12 0.24 -0.1 -0.5 0.11 0.22 0.02 -0.17
-0.23 -0.21 -0.04 0.26 -0.21 -0.04 -0.2 0.03 0.23 0.09 0.29 -0.11
-0.24 0.17 0.44 0.45 0.02 -0.04 -0.63 -0.01 -0.31 -0.78 0.35 0.02
-0.41 0.32 0.45 0.44 0.17 0.24 -0.46 -0.02 -1.12 -1.81 0.29 0.37
0.07 0.52 0.12 0.69 -0.2 0.45 -0.9 -0.06 -0.28 -0.65 -0.12 -0.51
-0.2 0.14 -0.07 0.7 0.06 0.25 -0.36 -0.2 -0.44 -0.5 0.31 -0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.