Heatmap: Cluster_70 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.04 0.21 0.17 0.12 0.14 0.0 0.22 0.05 0.28 0.0 0.0 0.24
1.55 1.34 1.4 1.33 1.8 1.56 1.61 1.59 1.86 1.85 2.2 1.97
3.38 2.95 3.48 3.31 2.73 2.87 3.32 2.56 3.34 2.28 2.85 3.81
0.81 0.27 1.9 1.4 1.53 0.74 1.2 0.57 1.27 0.93 1.14 1.9
15.06 17.41 15.67 17.94 16.04 13.18 12.54 12.95 19.62 13.99 13.29 18.27
4.48 4.34 4.63 7.94 5.8 3.31 5.49 4.26 5.13 4.54 2.96 4.02
0.26 0.47 0.3 0.44 0.47 0.38 0.28 0.33 0.51 0.41 0.22 0.47
6.52 3.42 6.94 7.21 5.74 3.43 6.8 4.09 7.47 4.63 5.93 7.4
0.34 0.22 0.17 0.22 0.59 0.23 0.21 0.2 0.29 0.2 0.19 0.41
10.53 7.74 10.41 10.17 9.67 8.26 11.23 9.18 12.19 8.54 8.87 13.0
0.54 0.58 0.8 1.14 1.08 0.5 0.67 0.63 0.86 0.59 0.39 0.63
1.17 1.46 0.99 0.6 2.22 0.68 0.9 1.1 1.26 0.82 1.13 1.36
0.56 0.3 0.53 0.82 0.73 0.26 0.44 0.35 0.59 0.31 0.76 0.62
116.92 131.49 102.89 114.63 115.95 107.72 111.86 127.39 132.27 111.37 132.5 95.45
0.42 0.39 0.28 0.72 0.83 0.45 0.47 0.41 0.9 0.43 0.45 0.74
2.95 2.75 3.23 2.95 3.05 2.64 2.48 2.78 2.69 2.27 2.49 3.23
18.75 10.28 29.03 30.61 18.45 6.63 20.37 10.03 23.49 8.59 17.46 18.44
0.15 0.3 0.03 0.16 0.04 0.23 0.17 0.15 0.38 0.09 0.07 0.18
0.06 0.06 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03 0.06 0.08 0.06 0.03 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.7 0.3 0.69 0.76 0.53 0.22 0.19 0.2 0.36 0.13 0.45 0.46
0.02 0.06 0.0 0.08 0.02 0.0 0.02 0.01 0.05 0.04 0.03 0.09
0.85 0.64 0.63 1.22 0.96 0.78 0.79 0.94 1.19 0.77 0.3 0.73
2.26 2.98 2.75 2.82 2.31 1.39 1.73 1.65 1.82 2.01 1.18 3.11
0.15 0.09 0.02 0.04 0.1 0.0 0.05 0.02 0.05 0.06 0.01 0.07
0.01 0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.03 0.17 0.17 0.12 0.08 0.04 0.03 0.24 0.0 0.03
2.39 4.28 6.37 1.75 5.5 2.4 3.82 2.88 1.91 3.72 2.33 3.44
0.0 0.06 0.0 0.0 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.04 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.03 0.07
71.83 67.34 46.96 32.14 83.89 84.45 41.0 49.07 76.76 59.01 49.29 34.57
1.62 1.46 0.69 0.33 0.97 0.94 0.14 0.55 1.17 0.74 0.93 0.38
3.66 3.57 3.61 3.63 4.18 3.9 3.85 4.44 4.06 3.75 4.16 4.26
5.72 4.26 5.05 6.07 5.18 5.32 4.18 5.5 4.87 5.24 4.87 5.36
0.01 0.02 0.05 0.04 0.04 0.04 0.08 0.04 0.08 0.05 0.02 0.1
0.55 0.42 0.73 0.58 0.44 0.3 0.58 0.41 0.73 0.47 0.48 0.87
0.0 0.23 0.0 0.0 0.17 0.0 0.06 0.07 0.12 0.0 0.11 0.09
0.37 0.25 0.77 0.67 0.53 0.0 0.43 0.1 0.73 0.06 0.45 0.58
2.1 1.9 2.91 2.37 2.56 1.95 3.23 2.12 2.95 1.9 2.58 2.51
0.0 0.03 0.0 0.03 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.03 0.04
36.09 38.52 36.38 39.52 39.1 39.31 40.3 36.61 31.05 41.47 24.93 47.3
4.26 5.14 4.34 5.49 6.58 4.64 5.66 9.91 5.22 5.96 4.68 6.98
0.08 0.11 0.05 0.06 0.04 0.02 0.02 0.0 0.11 0.04 0.05 0.05
6.15 5.49 6.02 5.58 5.6 5.9 5.29 4.18 5.02 4.81 4.4 6.34
8.0 7.86 8.41 7.41 7.51 7.31 6.49 7.25 8.93 7.42 7.87 6.69
0.78 0.43 0.31 1.56 1.04 1.21 1.26 1.31 1.03 0.57 0.1 0.71
0.4 0.43 0.07 0.07 0.47 0.07 0.28 0.0 0.26 0.21 0.21 0.24
1.37 1.74 1.56 0.2 1.43 0.92 0.61 1.33 1.51 1.38 0.49 0.6
3.43 3.58 3.13 3.35 3.81 3.39 3.43 3.27 3.41 3.19 3.63 3.88
0.61 0.29 0.56 0.54 0.45 0.34 0.32 0.5 0.32 0.29 0.59 0.62
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
1.57 1.09 0.98 2.14 1.84 1.01 1.67 0.96 2.36 1.26 1.11 1.99
0.89 0.93 1.18 1.21 1.31 0.58 0.83 0.78 0.7 0.63 0.51 0.44
0.0 0.0 0.02 0.0 0.89 0.02 0.0 0.0 0.01 1.14 0.0 0.02
2.52 1.92 1.91 2.82 2.86 1.04 2.91 2.02 3.21 1.55 2.39 3.34
0.12 0.23 0.35 0.02 0.37 0.21 0.02 0.08 0.14 0.12 0.06 0.07
95.33 100.59 98.68 89.78 98.64 101.14 80.91 96.26 113.36 107.54 97.12 69.53
0.3 0.36 0.1 0.21 0.15 0.09 0.06 0.09 0.19 0.07 0.14 0.15
1.43 0.39 2.66 3.09 2.52 0.33 1.65 0.47 2.01 1.17 1.69 2.56
0.9 0.24 0.77 0.85 0.55 0.07 0.5 0.8 0.45 0.43 0.77 0.82
0.03 0.0 0.02 0.02 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.03
0.01 0.13 0.19 0.04 0.16 0.06 0.12 0.03 0.03 0.08 0.06 0.02
0.04 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.05
0.95 1.68 2.48 1.01 1.78 0.72 1.1 1.11 0.93 1.48 0.87 1.08
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)