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Heatmap: Cluster_57 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.41 -0.7 -0.57 0.55 0.34 -1.57 0.13 0.67 0.57 -3.14 -0.93 1.06
0.57 0.55 0.07 -0.14 -0.44 -1.7 -1.08 0.48 0.93 -0.35 -0.87 -0.1
0.28 0.29 -0.08 -0.06 0.07 -0.1 -0.07 -0.04 -0.15 -0.26 -0.14 0.14
-0.03 -0.59 -0.19 0.01 -0.32 -0.43 -3.07 0.23 0.62 0.58 0.33 0.43
0.1 -0.02 0.26 -1.65 -0.56 0.38 0.38 0.03 0.1 0.66 0.13 -1.36
- 0.83 -0.94 0.24 0.14 -0.19 -0.17 0.31 -0.08 -0.27 0.61 0.14
0.0 -0.06 0.56 -1.31 -0.11 0.45 0.17 0.38 0.36 -0.23 -0.13 -1.32
-0.28 0.4 0.41 -1.34 -0.02 0.34 -0.51 0.83 0.33 -0.41 -0.32 -0.77
-0.25 0.34 0.1 0.48 -0.15 -0.24 -0.44 0.22 -0.72 -0.39 0.61 -0.16
0.42 0.19 -0.04 -0.2 -0.01 -0.28 0.04 -0.14 -0.16 -0.28 0.06 0.23
0.23 -0.15 -0.3 -0.15 -0.62 -0.87 0.55 0.29 -0.16 0.2 0.22 0.15
0.06 0.27 0.02 0.21 -0.1 -1.37 0.16 0.1 -0.45 -0.18 0.02 0.53
0.36 0.12 -0.54 -0.12 -0.88 -1.03 0.28 0.28 -1.09 0.01 0.44 0.79
0.15 0.18 0.13 -0.23 -0.07 0.05 0.17 0.06 -0.14 -0.11 -0.15 -0.12
-0.19 -0.54 0.6 -0.37 -0.36 -3.7 0.71 0.5 -1.35 1.18 -0.26 -0.41
0.35 -0.0 -0.02 -0.19 0.07 -0.17 0.26 -0.23 -0.03 -0.05 -0.01 -0.08
0.01 -0.12 0.1 0.05 -0.15 -0.03 0.08 0.06 -0.18 -0.16 -0.01 0.29
-0.44 0.93 -0.57 0.86 0.21 -1.33 0.07 -0.23 0.98 -0.44 -2.83 -0.8
-0.08 -0.1 0.12 0.06 -0.13 -0.11 -0.03 0.07 0.03 -0.19 0.12 0.19
0.01 -0.01 0.06 0.16 -0.08 -0.19 0.03 0.11 0.16 -0.16 -0.14 -0.01
0.11 0.13 -0.09 -0.04 0.09 -0.11 0.03 0.04 -0.06 -0.01 -0.11 -0.01
-0.2 -0.14 -0.1 -0.13 -0.47 0.0 0.29 0.12 0.36 -0.13 -0.01 0.2
-2.93 -0.21 0.01 -0.37 -0.3 -0.94 0.89 0.41 1.09 0.01 -0.51 -0.22
0.25 -0.13 1.03 0.12 -1.9 -2.03 0.17 -1.34 0.67 -0.32 0.18 0.29
0.21 -0.07 0.47 -0.15 -0.73 -0.91 0.31 -1.04 0.4 -0.37 0.89 -0.33
- 1.01 0.62 0.31 -0.71 0.85 -1.1 0.44 - 1.28 - -0.88
0.75 0.64 -0.83 -0.4 -0.03 - -1.17 0.46 -0.19 -1.67 0.8 0.76
-0.47 0.32 0.32 0.72 -0.72 0.44 0.03 -2.24 -0.39 0.74 0.04 -1.05
0.16 0.45 0.38 -0.5 0.41 -0.53 -0.78 0.44 1.22 - -0.9 -0.56
-1.62 0.64 0.63 0.43 -1.14 -1.27 -0.44 -0.3 0.44 0.18 -0.64 0.75
0.1 -0.05 0.26 -0.01 -0.63 -0.29 -0.12 -0.12 0.42 -0.4 0.21 0.28
0.24 0.08 -2.05 -0.2 0.67 -2.86 0.25 -0.32 0.78 0.22 0.52 -0.69
0.06 0.02 0.22 0.04 -0.03 0.13 0.01 -0.14 0.01 -0.11 -0.14 -0.11
0.23 0.35 0.09 0.1 -0.14 -0.65 0.12 -0.28 0.29 -0.19 0.03 -0.25
-0.93 -0.55 0.01 0.07 0.6 0.55 -0.46 0.23 -0.07 0.55 -0.25 -0.75
0.18 0.08 0.24 -0.09 -0.2 0.18 0.2 -0.06 0.08 -0.08 -0.29 -0.4
0.28 -0.03 0.22 0.61 -1.4 0.53 0.74 -0.87 0.79 -0.9 -1.22 -1.36
0.5 0.41 0.07 0.09 0.09 -0.58 -0.05 -0.29 -0.03 -0.27 -0.0 -0.29
-1.25 -0.56 -0.49 -1.94 -0.36 0.14 0.76 0.36 1.1 -1.03 -0.51 0.79
0.49 -0.09 -0.09 -0.07 0.39 -0.03 -0.22 -0.03 -0.21 -0.13 -0.13 -0.09
0.03 0.09 0.36 -0.08 -0.49 -1.23 0.54 0.42 -0.97 0.68 0.07 -0.75
0.52 0.46 -0.1 -0.03 0.41 -0.36 0.33 -0.22 -0.08 -0.82 -0.04 -0.82
0.1 -0.05 -0.17 -0.17 0.1 0.1 0.28 -0.38 0.2 -0.02 -0.08 -0.05
-0.16 -0.1 0.01 - 1.08 - 0.16 0.88 0.46 - 0.76 0.03
0.21 0.1 -0.12 0.03 -0.26 -0.11 -0.05 -0.03 -0.51 0.14 0.21 0.22
0.29 -0.46 -0.1 -0.74 -0.83 - 1.23 0.58 0.11 1.21 -1.04 -2.04
-0.28 -0.15 -0.1 -0.46 -0.26 0.32 -0.22 -0.74 0.49 0.69 0.31 -0.3
1.06 0.03 -0.48 0.38 -1.83 -0.83 0.98 -0.09 0.98 - -1.33 -0.41
-0.77 -1.4 -0.55 0.12 -1.74 0.24 0.56 0.24 0.64 0.1 0.77 -0.34
0.32 0.28 0.22 0.48 - - 0.71 -0.09 0.06 0.85 -0.06 -0.76
-0.57 0.52 0.6 -1.15 -0.2 0.35 0.17 0.49 0.28 -0.19 -0.16 -1.9
0.4 -0.09 0.3 -0.26 -0.43 -0.49 0.23 -0.09 0.34 -0.15 0.18 -0.32
-0.46 -0.65 0.53 0.4 -0.78 -1.11 -0.2 -0.23 0.37 -0.74 0.88 0.45
0.03 -0.23 -0.32 -0.16 -0.2 0.01 -0.09 -0.25 0.43 0.11 -0.06 0.48
0.6 -1.02 -0.22 -0.8 0.04 0.75 0.05 0.15 -0.15 -0.1 -0.11 -0.08
0.3 -0.12 0.01 0.35 -0.11 0.06 0.01 -0.32 -0.12 0.14 -0.19 -0.13
-0.57 -0.73 0.21 -0.47 0.2 0.37 -0.24 -0.09 0.09 -0.68 0.54 0.56
0.25 -0.54 -0.01 -0.24 -0.02 0.09 0.12 0.2 -0.34 -0.17 -0.27 0.58
0.35 0.63 0.22 -0.11 0.04 -0.44 -0.34 -0.49 0.31 0.01 -0.73 -0.05
0.43 0.51 -0.15 0.46 -2.93 -1.46 -0.1 0.12 0.6 0.89 -0.11 -2.96
0.45 -0.15 0.16 -0.19 -0.43 -0.25 -0.2 -0.12 -0.21 0.11 0.0 0.51
0.75 -0.24 -0.23 0.22 -0.8 -0.49 -0.11 -0.42 -0.98 0.5 0.14 0.56
0.14 -0.15 0.08 0.4 0.07 -1.56 0.05 -0.25 0.22 0.18 0.04 0.04
0.33 0.05 -0.09 0.15 0.26 -0.48 0.01 0.01 -0.17 -0.07 -0.2 0.02
0.11 0.03 -0.11 0.22 -0.04 -0.69 -0.08 -0.02 0.19 -0.04 0.31 -0.11
-0.27 - -0.11 0.03 - 1.14 - - 1.35 0.06 0.63 0.91
0.2 -0.12 0.53 0.75 -1.78 -1.36 0.37 0.26 -0.26 -0.22 0.46 -0.81
0.72 - -0.11 0.26 0.18 - 1.36 - 0.85 1.45 - -
0.54 - 0.7 - - 2.52 - - - 0.87 0.45 -
-0.47 0.04 -0.26 0.12 0.47 0.2 -0.06 0.22 -0.1 -0.27 -0.11 -0.03
1.02 0.79 0.84 0.32 - -0.57 -0.9 0.28 0.2 -0.94 -1.02 -0.69
0.33 0.27 0.16 -0.19 -0.05 -0.49 0.07 -0.03 0.08 0.04 -0.29 -0.1
-0.48 -0.69 0.0 -0.39 -0.59 0.5 0.3 0.17 0.31 -0.22 0.31 0.17
-0.43 0.62 0.49 0.24 0.18 0.34 -0.44 0.13 -0.25 -0.35 -0.43 -0.89
0.27 0.7 -1.87 - 1.08 - 0.31 0.31 1.17 -0.83 -0.13 -0.79
0.18 0.14 -0.09 0.04 -0.12 -0.22 0.1 -0.01 0.25 -0.12 0.08 -0.35
0.18 -0.27 -1.22 -0.41 0.11 -1.44 -0.48 0.13 0.52 0.59 0.17 0.62
-1.01 0.24 -0.4 -0.45 0.69 -0.12 0.1 -0.15 -0.15 0.58 0.01 -0.12
0.0 0.06 - - 1.23 - 0.11 1.25 0.04 -0.0 -0.09 0.25
0.19 0.11 0.03 -0.02 0.08 -0.26 0.03 -0.15 0.02 -0.13 0.13 -0.1
0.36 0.39 0.51 -0.04 -2.0 -2.31 0.77 0.24 -0.04 0.46 -0.29 -0.96

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.