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Heatmap: Cluster_290 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.08 -1.33 -0.19 -0.17 -0.03 -0.4 -0.43 -0.13 0.52 0.18 0.57 0.53
0.62 -0.45 -0.2 -1.6 0.56 -0.04 -0.47 -0.18 -0.01 0.03 0.15 0.44
0.0 0.14 0.11 -0.24 0.17 -0.17 0.07 -0.1 -0.05 -0.06 0.11 -0.05
-0.15 0.1 0.11 0.02 -0.07 0.05 -0.1 -0.41 -0.22 0.17 0.45 -0.15
-0.23 -0.03 -0.03 -0.04 0.05 0.05 0.02 -0.04 0.04 0.04 0.13 0.02
- 0.93 0.79 0.78 0.92 - -0.13 - -0.48 -1.2 0.81 -0.08
0.4 -0.11 -0.41 0.09 -0.02 -1.01 0.13 0.09 0.44 0.02 0.04 -0.14
0.35 -2.07 0.26 -0.83 0.28 -0.28 -0.04 -0.15 0.5 -0.29 0.44 0.3
0.37 -0.27 -0.24 0.11 0.13 -0.17 0.06 -0.32 0.17 0.13 -0.07 -0.06
- -0.52 0.7 -0.07 0.79 -0.75 0.26 0.37 0.31 0.19 -1.25 0.14
0.22 0.45 0.29 -0.42 0.33 -0.12 -0.02 -0.12 -0.31 -0.27 -0.3 -0.04
-1.79 -0.73 0.2 0.47 0.98 -0.87 0.04 -2.37 -0.23 0.86 0.9 -1.8
0.05 -1.56 0.37 1.16 -0.82 -0.35 -0.09 -1.08 -0.37 -0.27 1.06 -0.62
0.18 0.17 0.25 -0.09 0.12 -0.5 -0.22 0.28 -0.16 -0.0 0.06 -0.27
0.86 -1.7 -0.36 -0.81 0.37 -1.56 -0.15 0.47 0.14 0.32 0.37 -0.05
0.05 -0.07 0.04 -0.1 0.05 -0.1 0.11 -0.05 0.19 -0.01 -0.04 -0.09
-0.4 -0.06 -0.08 -0.45 0.17 -0.31 0.24 0.01 0.1 0.19 0.34 -0.0
0.19 -0.44 -0.39 -0.27 0.34 -0.63 0.2 -0.6 0.78 -0.12 0.29 -0.1
0.44 -0.32 -0.33 0.04 0.05 -0.38 -0.27 -0.37 0.3 0.39 0.36 -0.33
0.21 0.35 0.36 -0.17 -0.04 -0.98 -0.77 0.0 0.05 0.18 0.24 -0.04
- - - 1.67 1.53 - - - - 1.29 1.8 -
-0.17 -1.0 0.4 0.13 0.46 0.01 -0.13 -0.54 0.55 -0.01 -0.96 0.31
0.33 -0.13 0.11 -0.05 -0.03 -0.3 -0.1 0.08 -0.11 0.07 0.14 -0.11
0.34 -0.17 0.01 0.26 -0.17 -0.72 0.14 -1.7 0.31 0.21 0.46 -0.03
0.64 -0.37 -0.29 -0.01 -0.0 -0.36 -0.01 -0.25 0.27 0.02 0.12 -0.1
1.12 0.57 0.66 -0.72 -0.89 0.52 -1.27 - 0.0 -2.12 1.26 -2.89
0.39 -0.06 -0.02 -0.59 0.27 -0.31 -0.39 0.07 -0.05 0.08 0.19 0.13
- - 1.14 -2.29 1.16 -1.13 -0.73 0.4 0.9 -1.03 -0.4 0.9
0.45 -0.44 0.07 -0.06 0.32 -0.25 -0.56 -0.72 0.23 0.07 0.61 -0.38
0.08 -0.72 0.24 0.59 0.3 -0.36 -0.23 0.18 -0.61 0.06 -0.09 0.02
-0.15 -0.29 0.01 0.03 0.13 -0.17 -0.02 0.12 0.11 -0.08 0.2 0.04
-0.04 -0.24 -0.01 -0.09 0.05 -0.08 -0.08 -0.04 0.02 0.18 0.17 0.1
-0.53 0.11 -0.93 -1.18 -0.06 -0.28 0.18 -0.22 0.38 0.28 0.75 0.37
-0.46 -0.3 0.93 -0.59 0.23 -0.67 -0.34 -0.19 -0.27 0.1 -0.19 0.71
1.02 -0.45 -0.13 0.29 -0.2 -0.48 0.52 -0.48 0.38 -0.01 -0.4 -1.67
-0.88 -4.33 -0.21 0.93 0.02 0.42 -1.5 -0.27 -0.05 -0.75 1.09 0.5
1.15 - - -1.16 1.51 0.77 -0.46 - 0.06 -0.68 0.35 0.14
-0.04 0.11 -0.1 -0.14 0.3 -0.69 0.34 0.12 0.13 0.17 0.03 -0.57
-0.15 -3.18 0.66 -0.56 0.19 -0.42 -0.29 -0.39 0.35 0.54 -0.14 0.7
0.19 -0.24 0.09 -0.1 0.15 -0.02 -0.02 0.02 0.03 -0.04 -0.05 -0.07
-0.32 -0.07 -0.1 0.02 0.09 -0.4 0.03 -0.21 0.32 0.1 0.38 -0.05
-0.01 -0.4 -0.01 -0.37 0.18 -0.02 -0.03 -0.21 0.25 0.17 0.05 0.23
0.58 -0.82 -0.88 -1.35 1.07 -1.43 -0.9 -0.86 -0.51 0.4 0.88 0.66
0.09 0.02 0.15 -0.04 0.02 -0.13 -0.08 0.05 -0.02 -0.09 0.04 -0.05
0.33 -0.38 -0.16 -0.32 -0.18 -0.14 -0.09 0.03 0.27 0.2 0.14 0.08
0.1 0.23 0.19 -0.09 0.51 -0.42 -0.01 0.04 -0.38 -0.06 0.12 -0.59
- - 1.53 1.73 1.6 - 1.46 - - - - -
0.14 -0.61 -0.85 0.68 0.27 -0.64 -0.14 -0.07 0.48 -0.08 0.02 0.05
0.85 -3.94 -0.41 -0.1 -0.37 -0.51 -0.18 -0.05 0.3 0.85 -0.52 0.49
0.14 0.02 0.05 -0.02 -0.03 -0.02 -0.16 -0.07 -0.03 0.09 0.09 -0.09
0.24 -0.54 -0.09 -0.46 0.02 -0.32 -0.24 -0.2 0.45 0.36 -0.06 0.4
0.55 -0.38 -0.27 0.02 0.08 -0.38 -0.15 -0.14 0.27 0.04 -0.13 0.19
-0.44 -0.14 0.08 -0.31 0.43 -0.33 -0.1 0.22 0.16 0.34 0.29 -0.6
-0.11 -0.22 -0.15 -0.27 0.06 -0.34 0.22 -0.38 0.51 0.27 0.19 -0.08
-0.85 -0.47 0.46 0.35 0.55 -0.35 -0.15 -0.36 0.7 0.2 0.06 -1.65
-0.79 -0.2 0.27 0.05 -0.02 -0.22 -0.03 -0.23 0.64 0.18 -0.06 -0.02
0.01 0.02 -0.0 0.03 0.11 -0.07 -0.14 0.1 0.04 0.17 -0.07 -0.25
- 1.47 - 1.01 -0.78 -1.58 - -1.26 -0.6 0.06 1.4 0.63
-1.3 0.2 0.94 -0.19 -0.07 -1.61 -0.55 -0.61 0.0 -0.97 1.15 0.38
-0.85 -1.7 0.98 -0.37 0.44 0.33 -0.26 0.59 -0.37 -0.39 -0.33 0.13
0.82 -0.21 0.02 -0.15 0.44 -1.46 -0.27 0.46 0.04 -0.12 0.24 -1.32
0.39 -0.4 -0.13 -0.45 -0.24 -0.03 -0.05 0.05 0.3 0.12 -0.1 0.28
-0.31 -1.37 0.12 0.33 0.68 0.25 -0.01 0.16 -0.36 0.54 -0.85 -0.37
0.66 -0.9 0.16 0.29 0.16 -1.0 -0.15 -0.36 0.34 -0.02 -0.04 0.03
0.68 -1.42 0.09 0.55 0.59 0.08 -0.17 -0.1 -0.06 -0.39 0.09 -1.66
1.45 - -1.04 -1.6 -1.9 - -0.81 -0.4 -0.5 1.2 1.39 0.3
0.29 -0.12 -0.4 -0.29 0.02 0.06 -0.14 -0.38 0.28 0.1 0.16 0.19
1.15 -0.68 0.34 - -0.43 0.34 -1.3 0.91 -1.68 -0.65 1.07 -0.84
0.73 - -0.62 - 0.73 -0.17 -0.17 - 0.96 -0.54 0.97 0.72
1.06 -2.02 -0.59 0.43 0.41 -0.64 -0.68 -1.19 0.47 -0.43 0.45 0.17
0.03 -0.3 0.1 -0.54 -0.3 0.1 0.03 0.26 0.19 0.12 0.03 0.1
0.05 -0.43 0.4 -0.04 0.33 -0.22 0.25 -0.33 0.14 0.09 -0.04 -0.55
-0.24 -0.2 0.29 -0.07 -0.24 -0.25 0.11 0.26 0.16 -0.07 -0.04 0.16
-0.08 -0.18 -0.16 -0.4 0.06 -0.26 0.25 -0.08 0.15 0.12 0.37 0.02
0.12 0.04 -0.12 -0.38 -0.14 -0.11 -0.31 0.09 0.16 0.04 0.21 0.24
0.19 0.08 0.04 -0.21 0.07 -0.12 -0.02 0.04 -0.02 0.13 -0.06 -0.2
0.01 -0.2 0.06 -1.89 -0.55 -0.51 -0.3 0.7 0.38 0.11 0.13 0.6
0.27 - 0.26 -0.04 -0.06 -1.61 -0.89 -1.07 -0.23 0.44 1.27 0.78
-0.11 -0.12 -0.21 -0.34 0.3 -0.84 0.38 -0.2 0.22 0.39 0.44 -0.48
-0.13 -0.35 -0.24 -0.48 -0.19 0.03 0.25 0.37 0.24 0.1 -0.1 0.23
0.14 -0.35 0.04 -0.14 0.01 -0.18 -0.01 -0.05 0.07 0.16 0.07 0.14
-0.62 -0.68 0.96 0.81 0.79 -0.42 0.72 -2.2 -0.11 -1.89 0.57 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.