Heatmap: Cluster_136 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.43 0.02 -0.34 -0.38 -0.25 -0.61 -0.21 -0.1 0.17 0.28 0.3 0.27
0.17 -0.04 -0.16 -0.22 -0.18 -0.2 0.03 0.07 0.1 0.06 0.13 0.18
-0.12 -0.09 -0.33 -0.61 0.01 -0.09 0.12 0.37 0.29 0.13 0.17 -0.09
-0.07 -0.01 -0.01 -0.08 -0.17 -0.12 -0.03 0.19 0.07 0.04 0.06 0.09
0.04 -0.04 -0.11 -0.28 -0.12 0.11 0.06 0.11 0.11 0.01 0.04 0.02
-0.12 0.0 -0.35 -0.71 0.04 0.43 -0.52 0.44 -0.22 0.02 0.24 0.26
0.06 -0.04 -0.06 -0.08 -0.03 0.05 -0.08 0.1 0.1 -0.03 0.06 -0.07
0.53 0.1 -0.1 -0.17 -0.05 -0.09 -0.01 -0.01 0.06 -0.11 -0.14 -0.16
0.13 0.0 -0.17 -1.33 -0.6 -0.2 -0.27 0.21 0.55 0.32 0.42 0.08
0.08 0.01 -0.23 -0.41 -0.12 -0.18 0.05 0.09 0.03 0.23 0.18 0.13
0.18 0.04 -0.1 -0.13 -0.1 -0.07 0.0 0.08 -0.0 -0.04 0.05 0.07
0.08 0.02 -0.05 -0.27 -0.21 -0.21 -0.02 -0.08 0.06 0.12 0.18 0.28
-0.58 -0.09 -0.6 -1.26 0.5 0.27 -0.06 0.96 -0.42 -0.19 -0.16 0.34
-0.03 -0.14 -0.01 -0.04 0.04 -0.1 0.06 0.02 -0.05 0.09 0.15 -0.01
0.18 -0.01 -0.07 -0.47 -0.37 -0.17 0.08 0.22 0.3 0.07 0.14 -0.1
0.22 -0.14 0.04 -0.59 0.03 0.22 0.06 0.37 -0.14 -0.1 -0.04 -0.18
0.34 0.32 0.24 -0.12 -0.13 -0.51 -0.27 0.06 -0.15 -0.01 0.01 -0.02
0.06 0.05 -0.13 -0.27 -0.19 -0.05 -0.02 -0.01 0.12 0.14 0.13 0.1
0.03 0.04 -0.05 -0.28 -0.09 -0.04 0.11 0.25 -0.05 -0.12 0.02 0.11
0.13 -0.1 -0.6 -0.49 0.32 0.13 -0.49 0.26 -0.09 -0.31 0.5 0.24
-0.01 -0.07 0.08 -0.17 -0.0 -0.15 -0.14 -0.03 0.2 0.19 0.04 0.0
0.35 0.29 -0.27 -0.51 -0.54 -0.38 0.23 0.25 0.0 -0.02 0.08 0.14
-0.24 0.14 0.11 -0.11 0.07 -0.06 0.04 0.12 -0.05 -0.06 0.02 -0.03
0.02 0.09 -0.1 -0.27 -0.05 -0.07 -0.08 0.18 0.02 0.04 0.03 0.13
0.0 0.04 -0.2 -0.09 0.04 -0.02 0.07 0.35 -0.06 -0.1 -0.1 -0.01
-1.34 - - - 1.04 -0.65 0.91 1.56 0.6 -0.56 0.14 -0.35
0.31 0.05 -0.27 -0.64 -0.38 -0.18 0.01 0.11 0.12 0.22 0.24 0.12
0.28 0.37 -0.11 -0.35 -0.49 -0.61 -0.21 -0.21 0.34 0.12 0.13 0.29
0.0 0.05 -0.13 -0.37 -0.18 -0.16 0.12 0.13 0.09 0.19 0.18 -0.02
0.45 0.08 0.04 -0.29 -0.19 -0.48 -0.05 0.17 -0.0 0.04 -0.12 0.13
- - -0.19 - - - - 2.22 0.7 1.36 1.19 -
-0.02 0.26 0.28 -0.23 0.1 -0.05 -0.21 -0.13 0.06 0.05 -0.05 -0.18
-0.01 -0.23 -0.02 -0.34 0.05 -0.14 0.14 0.14 -0.07 0.22 0.23 -0.08
0.06 0.03 -0.07 -0.27 -0.04 -0.06 0.08 0.1 0.1 0.06 0.02 -0.04
-0.21 -1.95 0.08 -0.75 -0.28 -1.12 0.94 -0.38 -0.69 1.18 0.69 -0.42
0.42 -0.14 -0.37 -0.28 -0.33 -0.24 -0.14 0.02 0.12 0.1 0.3 0.27
-0.01 0.0 -0.04 -0.15 -0.03 0.05 0.0 0.11 -0.01 0.0 0.03 0.02
-0.33 -0.21 -0.17 -0.11 -0.08 0.0 -0.05 0.06 0.18 0.41 0.32 -0.24
0.36 -0.01 -0.29 -0.35 -0.22 -0.23 -0.06 0.08 0.14 0.35 0.14 -0.14
-0.02 -0.01 -0.09 -0.11 -0.08 0.09 0.01 0.1 -0.08 0.03 0.09 0.04
0.2 0.09 -0.18 -0.2 -0.26 -0.4 -0.16 -0.01 0.33 0.09 0.1 0.21
0.46 0.38 0.3 -0.45 -0.46 -0.65 -0.35 0.25 -0.08 0.04 0.07 -0.0
0.11 0.06 -0.08 -0.28 -0.07 -0.24 -0.01 0.15 0.18 0.02 0.06 0.03
0.44 0.1 -0.33 -0.11 -0.21 -0.13 0.05 0.02 0.09 0.09 0.1 -0.29
0.15 -0.01 -0.13 -0.09 -0.14 -0.13 0.05 0.06 0.1 0.08 -0.02 0.05
0.18 0.13 0.1 -0.35 -0.28 0.01 0.13 0.22 -0.09 -0.01 0.04 -0.2
0.2 -0.05 -0.26 -0.33 0.0 -0.07 -0.06 0.01 0.2 0.27 0.14 -0.19
0.69 0.05 -0.38 -0.53 -0.22 -0.38 -0.13 -0.01 0.26 0.04 0.12 0.08
0.08 -0.04 0.02 -0.47 -0.36 -0.2 -0.02 0.26 0.07 0.21 0.19 0.09
-0.46 0.23 0.17 -1.44 -0.25 -0.41 0.12 0.65 0.16 0.33 0.03 -0.05
0.28 -0.24 -0.25 -0.32 -0.19 -0.18 -0.07 0.06 0.16 0.2 0.33 0.02
-0.02 -0.01 -0.2 -0.08 -0.18 -0.21 0.04 0.13 0.15 0.14 0.15 0.02
0.3 -0.02 -0.22 -0.37 -0.3 -0.12 -0.16 0.28 0.14 -0.07 0.17 0.19
0.56 -0.03 -0.33 -0.42 -0.32 -0.34 -0.18 0.07 0.19 0.28 0.29 -0.15
0.16 -0.17 -0.11 -0.14 -0.16 -0.2 -0.08 0.09 0.12 0.13 0.2 0.07
-0.03 -0.37 0.01 -0.3 -0.04 -0.39 0.01 0.24 0.12 0.24 0.25 0.07
0.35 -0.09 -0.34 -0.3 -0.13 -0.12 -0.07 -0.01 -0.04 0.14 0.26 0.18
-0.03 -0.17 -0.17 -0.25 -0.24 -0.12 -0.19 -0.1 0.24 0.47 0.35 -0.03
0.38 0.24 0.03 -0.29 -0.28 -0.23 -0.06 0.26 -0.07 -0.09 -0.04 -0.04
0.26 -0.03 0.01 0.0 -0.01 -0.08 -0.16 0.01 0.12 0.06 -0.05 -0.19
0.29 -0.28 -0.77 -1.2 -0.64 -0.23 0.15 0.46 0.04 0.37 0.44 0.36
0.14 -0.05 -0.14 -0.19 -0.19 -0.12 -0.07 0.11 0.05 0.17 0.14 0.07
0.01 -0.0 0.0 -0.19 -0.13 -0.17 -0.01 0.13 0.13 0.07 0.1 0.01
0.11 0.07 -0.08 -0.25 -0.13 -0.12 -0.05 0.15 0.2 0.14 -0.01 -0.1
0.34 -0.16 -0.16 -0.44 -0.21 -0.23 0.06 0.23 0.18 0.19 0.07 -0.08
0.28 0.02 -0.22 -0.37 -0.23 -0.13 0.01 0.16 0.1 0.18 0.04 0.02
0.13 0.08 -0.2 -0.36 -0.27 0.04 0.05 0.05 0.15 0.22 0.05 -0.07
0.24 0.08 -0.18 -0.24 -0.13 -0.2 -0.18 -0.11 0.07 0.2 0.16 0.17
-0.02 -0.06 0.05 -0.26 -0.36 0.01 -0.05 0.31 0.03 0.08 0.17 -0.02
0.35 0.15 0.13 -0.92 -0.54 -0.3 -0.13 0.14 -0.01 0.34 0.31 -0.03
0.25 0.02 -0.05 -0.37 -0.17 -0.26 -0.03 0.12 0.08 0.15 0.06 0.09
0.34 0.07 -0.2 -0.24 -0.22 -0.26 -0.2 -0.12 0.07 0.13 0.2 0.25
-0.12 -0.15 -0.17 -0.31 0.07 -0.09 0.02 0.32 0.2 0.08 0.01 0.02
-0.2 -0.45 -1.45 -1.06 -0.73 -0.02 -0.04 0.4 0.84 0.68 0.43 -0.1
0.29 -0.04 -0.32 -0.17 -0.18 -0.16 -0.09 0.18 0.08 0.14 0.14 0.02
0.29 -0.13 -0.31 -0.36 -0.32 -0.1 -0.08 0.12 0.19 0.3 0.23 -0.05
- - -1.29 - -1.22 - -1.09 2.56 - 2.26 - -
0.12 0.05 -0.14 -0.22 -0.19 -0.1 0.06 0.14 0.21 0.09 -0.0 -0.09
0.3 0.03 -0.04 -0.03 0.03 -0.01 -0.14 0.01 0.04 -0.06 -0.08 -0.07
0.24 0.16 -0.06 -0.15 -0.2 -0.2 -0.1 -0.05 0.06 0.14 0.11 -0.04
0.12 0.08 -0.01 -0.26 -0.08 -0.32 -0.04 -0.0 0.16 0.11 0.08 0.08
0.04 -0.14 -0.15 -0.17 -0.12 -0.21 -0.03 0.04 0.21 0.05 0.16 0.22
0.22 0.01 -0.16 -0.31 -0.21 -0.05 -0.03 0.31 0.05 -0.01 0.0 0.07
0.37 0.03 -0.09 -0.08 -0.05 -0.1 -0.04 -0.01 0.05 -0.03 -0.05 -0.07
0.23 0.02 -0.13 -0.19 -0.09 -0.24 -0.1 0.02 0.12 0.05 0.09 0.14
0.3 0.17 0.14 -0.2 -0.09 -0.43 -0.15 0.06 -0.08 -0.06 -0.01 0.2
0.26 0.03 -0.23 -0.52 -0.26 -0.2 0.03 0.39 0.08 0.1 0.04 0.04
- -0.77 -1.22 0.68 -1.16 - - 1.59 0.79 1.65 -0.74 -1.14
0.2 -0.13 -0.42 -1.03 -0.64 -0.31 -0.04 0.56 -0.04 0.29 0.36 0.41
0.36 0.06 -0.27 -0.31 -0.3 -0.18 0.06 0.06 0.28 0.19 0.06 -0.23
0.12 0.15 -0.12 -0.14 -0.21 -0.24 -0.18 -0.06 0.08 0.11 0.1 0.27
- - -2.28 -1.82 -0.37 -1.45 0.32 2.28 -1.99 1.47 0.32 -
- - 1.55 - - - - 2.2 - 2.17 - -
0.55 0.0 -0.2 -0.44 -0.47 -0.51 -0.07 0.02 0.18 0.17 0.27 0.11
0.15 0.32 -0.45 -0.48 -0.37 -0.2 0.15 0.41 0.01 0.06 0.3 -0.25
-0.64 0.14 0.03 -0.9 0.11 -0.03 0.29 0.73 0.08 0.05 -0.23 -0.29
-0.03 -0.12 -0.19 -0.34 -0.12 0.09 0.2 0.13 0.21 0.17 0.04 -0.14
0.18 -0.23 -0.32 -0.41 -0.1 -0.15 -0.0 0.01 0.11 0.31 0.18 0.22
0.12 0.09 -0.11 -0.36 -0.26 -0.08 -0.08 -0.06 0.17 0.22 0.18 0.04
-0.29 0.09 0.19 -0.42 -0.03 -0.13 0.18 0.2 -0.01 -0.04 0.15 -0.03
0.58 0.37 0.33 -1.7 -0.4 -0.42 -0.01 0.39 -0.63 0.08 -0.04 0.23
- - - - - - - 2.6 - 2.57 - -
0.18 0.03 -0.21 -0.33 -0.18 -0.06 -0.01 0.08 0.07 0.19 0.23 -0.11
-0.44 0.06 -0.15 -0.2 0.16 0.16 -0.07 0.32 0.06 -0.11 0.09 -0.01
0.19 0.1 -0.04 -0.31 -0.26 -0.17 -0.03 0.19 -0.03 0.02 0.11 0.13
0.03 0.03 -0.04 -0.3 -0.14 -0.37 -0.1 0.2 0.17 0.16 0.2 0.03
0.59 -0.0 -0.46 -0.7 -0.68 -0.58 -0.18 0.27 0.09 -0.01 0.36 0.53
0.05 0.3 -0.05 -0.47 -0.13 -0.12 0.03 0.27 0.2 -0.03 -0.01 -0.18
-0.29 -0.16 -0.11 -0.14 -0.01 0.09 0.14 0.21 0.04 -0.02 0.08 0.08
0.29 0.04 -0.05 -0.3 -0.15 -0.18 -0.16 0.01 0.05 -0.03 0.21 0.17
0.01 0.02 0.01 -0.32 0.08 0.13 -0.0 0.11 0.05 -0.06 -0.05 -0.02
0.05 -0.08 0.04 -0.32 0.03 0.1 0.02 0.19 0.04 0.12 -0.0 -0.27
0.23 0.01 -0.12 -0.15 -0.19 -0.12 -0.12 0.06 -0.04 0.04 0.15 0.17
0.01 0.34 0.52 -0.37 0.2 -0.07 -0.16 -0.43 0.39 -0.06 0.22 -1.51
0.41 0.01 -0.35 -0.62 -0.54 -0.32 0.07 0.16 0.2 0.29 0.29 -0.03
0.15 0.13 -0.12 -0.47 -0.06 -0.16 -0.05 0.18 0.2 0.13 0.05 -0.11
-0.06 -0.02 -0.27 -0.26 -0.21 0.07 0.14 0.16 0.15 0.12 0.09 0.0
0.13 0.11 -0.03 -0.18 -0.17 -0.3 -0.1 0.2 0.08 0.04 0.05 0.09
0.21 -0.17 -0.27 -0.47 -0.24 -0.33 0.03 0.32 0.06 0.19 0.22 0.2
0.33 0.02 -0.21 -0.45 -0.19 -0.33 -0.22 0.12 0.32 0.22 0.1 0.05
0.18 0.1 -0.03 -0.27 -0.14 -0.33 -0.04 -0.06 0.15 0.24 0.09 -0.02
-0.11 -0.1 -0.23 -0.22 -0.16 -0.08 0.01 0.09 0.09 0.19 0.29 0.13
0.34 0.13 -0.15 -0.16 -0.22 -0.12 -0.09 0.05 0.23 0.0 -0.02 -0.11
0.33 -0.02 -0.02 -0.39 -0.17 -0.44 -0.12 0.28 -0.12 0.22 0.25 -0.04
-0.04 -0.21 -0.13 -0.16 -0.05 -0.01 0.12 0.13 -0.06 0.27 0.12 -0.06
0.29 0.0 -0.17 -0.27 -0.21 -0.33 -0.04 0.08 0.21 0.14 0.07 0.1
0.04 -0.01 -0.35 -0.4 -0.14 -0.25 -0.14 0.04 0.2 0.3 0.22 0.28
- - -1.36 -0.17 -1.3 - -1.43 1.6 0.82 2.02 0.12 -
-0.02 0.04 0.02 -0.13 -0.04 -0.09 -0.12 0.12 0.08 0.08 0.01 0.02
0.27 0.19 0.05 -0.14 -0.08 -0.27 -0.13 0.14 -0.0 -0.02 -0.02 -0.07
0.09 0.07 -0.04 -0.21 0.02 -0.12 -0.03 -0.0 0.06 0.07 0.04 0.03
-0.14 0.28 0.0 -0.7 -0.73 -0.04 0.08 0.45 -0.03 0.22 0.01 0.14
0.42 -0.15 -0.13 0.56 0.3 -0.35 -1.49 0.4 0.4 0.17 -0.42 -1.0
-0.21 0.03 0.14 0.0 -0.01 -0.18 0.02 0.21 0.0 0.05 -0.05 -0.07
0.16 0.02 -0.21 -0.36 -0.11 -0.12 0.08 -0.1 0.08 0.18 0.04 0.22
0.13 0.01 -0.21 -0.25 -0.26 -0.14 -0.05 0.19 0.04 -0.0 0.15 0.28
0.13 0.09 0.02 -0.1 -0.26 -0.47 -0.15 -0.08 0.1 0.18 0.1 0.27
-0.01 -0.01 -0.27 -0.01 -0.18 0.23 -0.01 0.06 0.08 0.0 -0.07 0.12
0.09 0.02 -0.28 -0.24 -0.27 -0.12 0.02 0.06 0.1 0.07 0.24 0.18
-0.09 -0.26 -0.14 -0.09 -0.07 0.03 -0.08 0.08 0.1 0.2 0.27 -0.03
0.69 0.21 0.02 -0.92 -0.37 -0.9 -0.3 0.09 0.03 0.17 0.25 0.21
0.25 0.28 -0.07 -0.64 -0.16 -0.3 -0.09 0.15 0.17 0.23 0.13 -0.23
0.69 0.02 -0.37 -0.78 -0.43 -0.39 -0.27 0.07 0.16 0.3 0.16 0.23
0.62 0.23 -0.07 -0.7 -0.4 -0.51 -0.41 0.11 0.09 0.15 0.23 0.14
0.57 0.01 -0.51 -0.84 -0.69 -0.47 -0.26 0.26 0.39 0.39 0.34 -0.02
0.53 0.16 -0.27 -0.3 -0.39 -0.47 -0.04 0.16 0.15 0.19 0.12 -0.16
-0.56 -1.27 -1.57 -0.13 0.18 -2.71 0.54 0.82 0.89 -0.3 0.26 0.37
0.21 0.05 -0.08 -0.46 -0.26 -0.3 0.06 0.19 0.01 0.07 0.22 0.13
0.35 0.15 0.21 -0.28 -0.18 -0.26 -0.25 -0.11 -0.25 0.17 0.21 0.03
0.07 0.18 0.3 -0.21 -0.09 -0.09 -0.19 -0.11 -0.04 0.07 0.01 0.03
0.21 0.12 -0.02 -0.1 -0.05 -0.11 -0.12 -0.13 0.06 0.05 0.03 -0.0
-0.01 0.12 -0.06 -0.54 -0.31 -0.2 0.16 0.33 0.01 0.19 0.16 -0.07
0.01 0.07 0.03 -0.3 -0.23 -0.05 0.05 0.22 0.12 0.05 0.03 -0.1
-1.13 0.33 -0.08 -0.42 -0.58 - -0.35 0.88 0.87 1.17 -2.04 -0.04
-0.06 -0.04 -0.16 -0.13 0.02 0.04 0.03 0.25 0.01 -0.06 0.05 0.01
0.19 0.06 -0.16 -0.56 -0.1 -0.42 -0.07 0.26 0.1 0.26 0.24 -0.05
-0.56 -0.11 0.11 -0.18 -0.24 -0.11 -0.19 0.51 0.2 0.34 0.08 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.