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Heatmap: Cluster_100 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.21 0.29 1.03 0.98 0.21 -0.07 -0.45 -0.4 -0.83 -0.65 -1.0 -0.76
-0.08 0.26 0.15 0.3 0.12 0.26 0.12 0.12 0.04 -0.66 -0.48 -0.56
0.34 0.4 0.61 0.51 0.36 0.08 0.28 -0.01 -0.54 -0.99 -1.47 -1.47
-0.15 0.26 0.77 0.76 0.57 0.19 -0.2 -0.27 -0.79 -0.98 -0.75 -1.0
-0.02 0.69 0.81 0.71 0.25 0.17 0.02 0.1 -1.01 -1.23 -1.57 -1.56
0.4 0.34 0.48 0.36 0.16 -0.04 -0.11 -0.02 -0.39 -0.66 -0.63 -0.53
-0.14 0.05 0.04 0.35 0.26 0.13 0.11 0.23 -0.29 -0.47 -0.31 -0.19
0.04 0.34 0.59 0.24 0.31 0.01 -0.08 -0.03 -0.36 -0.52 -0.66 -0.44
-0.11 0.03 0.12 0.31 0.09 0.19 0.09 0.1 -0.18 -0.21 -0.15 -0.43
0.37 0.41 0.53 0.47 0.5 0.19 0.11 -0.2 -0.67 -1.02 -1.33 -0.91
-0.2 -0.25 0.14 0.1 0.11 0.18 0.11 0.1 -0.09 -0.06 -0.08 -0.15
0.39 0.32 0.46 0.35 0.32 -0.03 -0.02 0.01 -0.33 -0.75 -0.91 -0.64
-0.08 0.17 0.34 0.31 0.42 0.21 0.1 0.0 -0.27 -0.43 -0.56 -0.72
-0.57 0.0 0.17 0.25 0.18 0.22 0.18 0.06 -0.1 -0.12 -0.2 -0.29
-0.06 0.01 0.02 0.22 0.06 0.07 0.06 0.01 -0.01 -0.19 -0.11 -0.14
0.32 0.59 0.58 0.49 0.4 0.23 0.17 -0.01 -0.47 -1.37 -1.89 -1.45
0.44 0.34 0.28 0.28 0.04 -0.02 -0.12 0.02 -0.31 -0.39 -0.49 -0.48
-0.11 0.17 0.47 0.63 0.1 0.56 0.18 0.01 -0.28 -0.86 -0.88 -1.3
-0.41 -0.14 0.08 0.62 0.24 0.4 0.17 -0.01 -0.57 -0.5 -0.34 -0.04
0.02 0.18 0.36 0.28 0.23 0.03 0.03 -0.03 -0.09 -0.3 -0.45 -0.56
-0.57 0.17 0.44 0.29 0.18 0.19 0.16 0.12 -0.06 -0.38 -0.53 -0.46
0.44 0.32 0.29 0.1 0.16 -0.16 -0.07 0.02 -0.37 -0.37 -0.34 -0.34
-0.65 0.23 0.81 0.67 0.6 0.28 0.08 -0.17 -0.34 -0.72 -1.3 -1.47
-0.33 -0.05 -0.05 0.19 0.11 0.05 0.0 0.09 0.12 -0.07 -0.14 0.02
-0.1 0.01 0.34 0.44 0.45 0.32 0.12 0.17 -0.3 -0.57 -0.72 -0.99
-0.44 0.17 0.33 0.23 0.2 -0.01 -0.01 -0.09 -0.2 -0.13 -0.16 -0.06
-0.37 0.13 0.09 0.21 0.2 0.11 0.01 -0.02 -0.11 -0.11 -0.12 -0.13
-0.28 -0.03 0.16 0.43 0.24 0.5 0.06 0.12 -0.36 -0.46 -0.32 -0.5
0.17 0.32 0.33 0.23 0.22 0.12 -0.02 0.03 -0.3 -0.39 -0.53 -0.59
-0.09 0.6 1.01 0.9 0.62 -0.03 -0.37 -0.6 -0.92 -1.22 -1.56 -1.23
0.43 0.31 0.33 0.41 0.25 0.07 -0.01 0.09 -0.11 -0.62 -1.02 -1.08
-0.04 -0.07 0.02 0.23 0.08 0.18 0.11 0.07 -0.22 -0.18 -0.08 -0.18
0.07 0.45 0.51 0.62 0.29 0.14 -0.01 -0.16 -0.43 -0.73 -0.9 -0.9
0.42 0.2 0.56 0.55 0.24 -0.16 -0.23 -0.28 -0.32 -0.52 -0.5 -0.68
-0.38 0.03 0.11 0.2 0.11 0.28 0.14 0.14 -0.07 -0.3 -0.21 -0.23
-0.12 0.09 0.14 0.05 0.09 -0.05 -0.04 -0.04 -0.1 0.02 -0.06 -0.0
0.71 0.58 0.8 0.99 0.16 0.01 -1.08 -0.45 -1.09 -1.05 -1.23 -1.26
0.09 -0.01 0.3 0.43 0.49 0.3 0.11 -0.06 -0.18 -0.43 -0.84 -1.01
0.03 0.21 0.46 0.46 0.26 -0.03 0.16 -0.17 -0.13 -0.32 -0.71 -0.83
-0.0 0.18 0.47 0.42 0.01 0.1 -0.12 0.16 -0.27 -0.38 -0.59 -0.38
0.25 0.49 0.79 0.78 0.39 -0.05 -0.25 -0.45 -0.65 -0.93 -1.0 -1.15
0.14 0.48 0.64 0.7 0.54 0.36 0.16 -0.08 -0.94 -1.48 -1.87 -1.43
-0.16 0.29 0.23 0.19 0.18 0.07 -0.13 0.06 -0.14 -0.3 -0.27 -0.2
-0.18 -0.06 0.04 0.16 0.16 -0.11 0.07 0.01 0.02 0.04 -0.15 -0.04
0.1 0.26 0.61 0.55 0.53 0.07 -0.08 -0.27 -0.57 -0.78 -0.85 -0.62
-0.53 -0.19 -0.09 0.23 0.18 0.37 0.06 -0.02 -0.08 -0.15 -0.09 0.12
-0.15 0.83 1.5 1.16 0.52 -0.34 -0.7 -0.87 -1.57 -2.08 -2.88 -2.68
-0.32 0.04 0.21 0.26 0.13 0.22 0.16 0.02 -0.2 -0.28 -0.17 -0.26
0.17 0.28 0.32 0.26 0.06 0.0 -0.17 -0.27 -0.29 -0.2 -0.26 -0.11
-0.18 0.28 0.32 0.23 -0.04 0.18 0.09 0.16 -0.24 -0.25 -0.31 -0.51
-1.47 0.08 0.27 0.92 0.54 0.64 0.19 -0.02 -0.78 -0.57 -0.85 -0.9
0.15 0.21 0.09 0.05 -0.01 0.11 0.02 0.02 -0.01 -0.25 -0.18 -0.28
0.4 0.6 0.47 0.48 0.43 0.23 0.26 0.2 -0.63 -1.45 -2.13 -1.84
-0.09 0.15 0.31 0.27 0.09 0.12 0.03 0.02 -0.19 -0.32 -0.33 -0.24
0.54 0.5 0.51 0.58 0.42 0.13 0.04 -0.02 -0.55 -1.35 -1.74 -1.38
-0.36 0.23 0.67 0.79 0.57 0.27 0.04 -0.22 -0.48 -0.79 -1.24 -1.21
0.62 0.45 0.87 1.04 0.5 -0.1 -0.38 -0.5 -0.91 -1.62 -2.03 -1.77
-0.04 0.09 0.41 0.45 0.24 0.13 -0.0 0.01 -0.29 -0.52 -0.52 -0.39
0.36 0.46 0.59 0.68 0.64 0.45 0.27 0.23 -0.73 -2.26 -4.56 -3.61
0.62 0.72 0.62 0.69 0.48 0.27 0.07 0.07 -0.86 -2.22 -3.73 -3.17
0.51 0.67 1.16 0.73 0.34 -0.29 -0.39 -0.11 -0.87 -1.43 -2.4 -2.34
-0.46 0.71 0.34 0.46 -0.4 0.6 -0.06 0.12 -0.97 -0.22 -1.17 -0.19
-0.05 0.59 0.89 0.91 0.53 0.09 -0.25 -0.35 -0.85 -1.19 -1.74 -1.49
0.38 0.34 0.22 0.14 0.26 0.03 0.05 0.19 -0.22 -0.59 -0.55 -0.82
0.16 -0.27 -0.2 0.39 0.06 0.8 0.59 0.54 -1.07 -1.09 -1.0 -0.54
-0.08 0.06 0.03 0.32 0.08 0.19 -0.18 0.04 -0.34 -0.14 -0.15 0.04
-0.47 -0.19 0.37 0.3 0.42 0.45 0.4 0.16 -0.23 -0.57 -0.44 -1.09
0.1 0.28 0.47 0.37 0.12 -0.01 -0.1 -0.12 -0.24 -0.47 -0.48 -0.29
-0.22 -0.09 -0.06 0.85 0.27 0.32 -0.45 0.05 -0.62 0.18 -0.62 -0.34
0.11 -0.11 0.05 0.27 0.01 0.06 0.03 0.11 -0.19 -0.11 -0.11 -0.18
-0.72 -0.02 0.27 0.11 0.14 0.33 0.17 0.17 -0.09 -0.29 -0.21 -0.16
-0.06 0.06 0.15 0.15 -0.04 0.43 0.22 0.29 -0.37 -0.43 -0.29 -0.45
-0.08 0.14 0.41 0.65 0.52 0.19 0.32 0.19 -0.45 -0.93 -1.24 -1.34
-0.17 0.4 0.26 0.66 0.19 0.57 0.25 0.24 -0.96 -1.01 -1.43 -0.64
0.33 0.56 0.42 0.43 0.23 -0.16 -0.05 -0.08 -0.28 -0.6 -0.69 -0.97
0.29 0.47 0.57 0.69 0.4 0.15 0.04 -0.18 -0.64 -0.99 -1.34 -1.23
-2.2 -0.05 0.9 0.82 0.4 0.3 0.41 0.35 -0.15 -0.87 -1.65 -1.92
0.26 0.72 1.1 0.66 0.55 -0.08 -0.28 -0.43 -1.06 -1.43 -1.78 -1.63
-0.14 0.05 0.25 0.19 0.15 0.19 -0.09 -0.03 0.03 -0.15 -0.25 -0.33
-0.53 -0.12 -0.01 0.33 0.23 0.22 0.0 0.09 -0.04 -0.04 -0.2 -0.13
0.31 0.39 0.8 0.77 0.45 0.15 0.05 0.01 -0.83 -1.55 -1.9 -1.66
0.58 0.4 0.87 0.83 0.28 -0.08 -0.36 0.0 -0.93 -1.01 -1.76 -1.68
0.45 0.39 0.44 0.43 0.07 -0.21 -0.14 0.08 -0.39 -0.5 -0.63 -0.68
-0.85 -0.53 0.19 0.69 0.4 0.55 0.35 0.43 -0.62 -0.59 -0.56 -0.76
0.2 0.79 1.01 0.85 0.58 0.12 -0.33 -0.6 -1.08 -1.62 -2.21 -1.96
-0.13 0.16 0.19 0.21 0.04 -0.03 0.08 0.04 -0.02 -0.11 -0.27 -0.27
0.52 0.62 0.97 0.6 0.44 -0.05 0.09 0.05 -0.99 -1.88 -2.61 -2.37
0.64 0.29 0.45 0.52 0.47 0.25 0.12 0.06 -0.83 -1.22 -1.57 -1.43
-0.75 0.36 -0.36 0.76 0.49 0.42 0.26 -0.87 -0.32 0.05 -0.98 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.