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Heatmap: Cluster_239 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.02 -0.84 -0.3 -0.4 0.17 -0.33 0.08 0.38 0.36 0.41 -0.45 0.31
-0.23 -0.25 -0.1 -0.37 0.15 0.06 -0.11 -0.19 0.18 0.19 0.27 0.2
0.08 -0.07 -0.05 0.0 0.02 -0.08 -0.05 -0.02 0.08 0.01 0.06 0.0
0.81 -0.76 -1.35 0.13 0.48 0.0 -0.37 0.4 0.05 0.14 -0.67 -0.13
0.28 0.04 0.06 -0.27 -0.17 -0.14 0.11 0.02 -0.02 -0.06 0.0 0.06
0.87 0.37 0.75 -0.15 0.41 1.21 -0.71 -2.4 -2.26 0.02 -1.19 -2.36
-0.17 -0.09 -0.14 0.08 -0.15 -0.51 0.32 -0.16 0.42 0.14 0.55 -0.87
- - 0.97 -0.99 1.0 -1.17 -0.43 -0.01 -1.78 -0.49 0.52 1.55
- -0.36 -1.21 0.12 0.54 0.83 -0.34 -1.06 -0.57 0.95 0.82 -0.29
0.1 -0.61 -0.16 -0.36 -0.2 -0.37 0.07 0.24 0.29 -0.26 0.19 0.61
0.11 0.03 0.01 -0.04 -0.07 -0.18 -0.05 0.04 0.04 -0.05 0.08 0.04
-0.11 -0.0 -0.14 -0.06 0.01 0.04 -0.01 0.13 0.02 -0.03 0.01 0.12
0.85 0.74 0.16 -0.26 -0.77 -1.27 -1.15 0.02 0.02 0.17 0.34 -0.49
- - - - - - - - - - 2.64 2.53
0.17 -0.02 -0.07 -0.14 -0.06 -0.13 -0.09 0.06 0.01 -0.01 0.13 0.1
0.05 -1.84 0.01 -0.05 -0.15 -0.55 -0.13 -0.75 -0.1 0.06 0.86 0.87
0.88 -0.09 -0.26 -0.62 -0.8 -0.43 -0.18 -0.54 -0.85 0.01 0.63 0.8
1.48 - - 0.39 - -1.06 -0.05 - 0.67 1.06 1.27 -1.49
0.55 0.31 -0.37 -0.12 -0.16 -0.26 -0.6 -0.02 -0.38 0.11 0.25 0.24
-0.08 0.07 0.0 -0.31 -0.07 -0.17 0.06 -0.11 -0.02 0.07 0.18 0.29
0.13 0.13 0.09 0.31 0.1 -0.17 -0.16 0.25 0.01 -0.48 -0.24 -0.17
0.36 0.27 0.06 -1.03 -2.49 1.15 -0.79 0.5 -0.79 -1.61 0.35 0.49
1.44 -0.08 0.32 - -0.79 0.99 0.08 -1.89 -0.93 -0.61 -0.14 0.15
0.01 0.08 -0.01 -0.1 0.05 -0.06 -0.14 0.04 -0.19 -0.1 -0.1 0.43
2.31 -0.45 - 2.1 - -0.34 -0.57 - - - - -0.83
1.07 -0.27 -0.1 -0.58 0.18 -1.29 -1.12 -0.35 -0.52 -0.27 0.46 0.84
-0.63 0.56 0.4 - -0.06 - 0.42 0.62 -0.72 - 0.62 1.36
-0.13 -0.05 0.0 -0.11 -0.11 -0.23 -0.16 -0.14 0.2 -0.04 0.19 0.43
-0.11 -0.44 -0.44 0.09 -0.11 0.24 -0.02 -0.22 -0.13 0.18 0.46 0.2
2.39 - -0.24 0.86 0.15 -0.93 -0.11 - -0.86 - -1.81 -0.51
-0.14 0.03 -0.12 -0.53 0.0 0.33 0.05 0.36 0.06 -0.24 0.02 -0.04
0.86 - 0.17 -1.81 0.78 - -2.07 -1.61 - 1.06 1.22 1.06
0.27 -0.26 -0.01 0.04 -0.13 -0.17 0.14 0.09 0.1 -0.36 -0.1 0.25
0.71 -2.89 -0.28 -0.53 0.27 -1.13 -0.78 0.13 0.16 0.29 0.79 0.37
0.34 -0.11 -0.19 -0.15 -0.04 -0.55 -0.06 -0.18 0.21 0.11 0.25 0.16
0.1 -0.04 -0.15 -0.14 -0.02 -0.03 -0.01 -0.03 0.06 -0.01 0.1 0.13
-0.03 -0.11 -0.43 -0.24 -0.14 -0.27 -0.05 0.11 -0.08 0.04 0.47 0.45
0.1 -0.72 -0.27 -4.36 0.26 -0.67 0.29 0.2 0.5 -0.06 -0.69 1.17
0.25 -0.12 -0.18 0.03 -0.0 -0.13 -0.04 0.01 0.01 -0.01 0.12 0.03
0.25 -0.01 -0.0 -0.36 -0.03 -0.44 0.09 -0.13 0.01 0.29 -0.01 0.17
0.9 0.36 0.01 0.07 -0.3 -0.08 -0.46 -0.01 -0.29 -0.24 -0.14 -0.41
-0.18 0.14 0.0 0.0 0.07 0.08 -0.36 -0.35 0.0 -0.02 0.22 0.25
0.43 -0.26 -0.44 -0.78 -0.23 -0.18 -0.35 0.36 0.2 0.06 -0.12 0.66
-0.93 -0.0 -0.68 -0.43 -0.43 -1.36 -0.57 0.84 -0.01 0.1 0.51 1.02
1.07 0.06 -1.0 0.27 -0.05 -1.61 -0.23 0.13 -0.07 -0.01 0.41 -0.64
2.66 - - 1.45 - 0.86 - 0.18 - - - -
0.67 0.17 -0.35 -1.93 -0.58 0.49 0.07 -1.26 0.94 0.11 -0.86 0.2
0.23 -0.33 -0.15 0.01 -0.25 -0.15 -0.34 0.13 -0.51 -0.03 0.5 0.47
0.27 0.2 0.06 -0.0 0.44 -1.98 0.21 -0.46 -0.1 -0.11 0.44 -0.18
- - -1.84 - 0.09 1.71 0.68 - - -0.84 - 2.38
-0.01 -0.35 -0.06 -0.25 -0.0 0.41 -0.18 0.06 -0.15 0.38 -0.31 0.22
0.1 -0.02 0.09 -0.06 0.05 -0.17 -0.23 -0.21 -0.17 -0.1 0.29 0.31
-0.2 0.3 0.25 -0.16 -0.31 -0.17 -0.21 -0.43 0.1 -0.31 0.61 0.14
0.96 - -0.44 - -0.54 1.87 - -0.1 - 0.38 - 1.45
0.37 -0.45 -0.34 -0.05 -0.0 -0.42 0.12 -0.04 -0.28 0.07 0.4 0.3
0.22 0.06 -0.15 -0.21 -0.07 -0.31 -0.06 -0.1 0.05 0.01 0.04 0.38
0.17 0.02 0.08 -0.08 0.04 -0.31 0.08 0.07 0.16 -0.03 -0.07 -0.21
1.71 - - - 0.52 - - - - - 2.03 1.69
0.51 -0.49 0.32 -1.0 -0.9 0.01 -0.47 -0.92 -0.03 0.53 -0.02 0.93
0.19 -0.03 -0.23 -0.13 -0.08 -0.19 -0.15 0.04 0.19 -0.01 0.14 0.16
-0.1 0.37 -0.12 -0.08 -0.3 -0.49 -0.38 -0.19 -0.0 0.04 0.37 0.49
-0.12 0.12 -0.03 -0.07 -0.19 -0.1 -0.01 0.08 0.1 0.08 0.05 0.06
-0.37 - 0.98 0.23 -1.4 - -1.53 -0.96 - -1.64 - 2.71
0.06 0.09 -0.05 -0.13 -0.01 -0.29 -0.05 0.09 0.07 0.01 0.04 0.11
1.86 - - - - - - - - - 2.25 1.85
0.08 0.11 0.0 -0.06 -0.07 -0.33 -0.27 -0.13 -0.03 0.03 0.16 0.37
2.81 - - 2.02 -0.11 - - - - - - -
-0.36 0.26 -0.36 -0.68 0.07 0.43 -0.37 -0.42 -0.02 0.25 0.32 0.35
0.42 0.39 0.05 -0.23 -0.28 -0.57 -0.3 -0.15 -0.22 -0.09 0.16 0.42
0.22 -0.05 -0.04 -0.09 -0.02 -0.33 -0.48 0.02 -0.18 -0.05 0.34 0.42
0.71 -0.17 -0.01 -0.66 -0.2 -0.29 -0.52 0.03 0.1 0.29 -0.04 0.23
2.43 - 0.96 1.51 -1.18 - 0.21 - -2.18 - - -
-0.13 0.45 0.17 -1.36 0.03 -2.04 0.75 -0.83 0.52 0.32 0.56 -0.9
0.36 -0.07 0.07 0.15 0.01 -0.23 -0.41 -0.43 -0.27 -0.02 0.3 0.25
0.08 0.27 0.23 -0.21 -0.2 -0.3 0.21 -0.43 -0.05 -0.23 0.14 0.26
0.08 0.06 -0.14 -0.18 -0.24 -0.42 -0.13 -0.09 0.08 0.1 0.24 0.44
0.49 0.14 -0.09 0.14 -0.24 -0.15 -0.24 0.09 -0.17 0.01 0.12 -0.29
-0.71 -0.1 0.39 -0.64 0.35 -1.17 -0.13 -0.17 0.21 -0.1 -0.01 0.93
0.79 -0.11 -0.07 -0.6 -0.02 -0.89 -0.08 0.3 0.02 -0.16 0.01 0.15
-0.33 0.11 -0.39 0.28 0.19 0.03 -0.1 -0.16 -0.25 -0.04 -0.03 0.45
0.27 0.15 0.07 -0.11 -0.09 -0.3 -0.35 0.04 -0.07 0.11 0.0 0.14
0.36 -0.23 0.18 -1.53 -0.36 0.14 -0.53 0.58 -0.38 0.5 0.34 -0.19
0.44 -0.17 -0.09 -0.56 -0.05 0.02 -0.25 -0.1 -0.19 0.01 0.22 0.4
0.57 0.6 0.07 -0.87 0.02 -0.98 -0.43 -0.54 -0.58 0.66 -0.3 0.49
-0.97 -1.24 -1.43 0.63 -0.36 0.06 -0.23 -0.1 0.84 0.94 0.81 -3.79
0.15 -0.21 -0.29 -0.44 -0.16 -0.46 -0.36 -0.14 -0.12 0.55 0.09 0.78
0.2 0.36 0.18 -0.21 0.19 0.14 -0.34 -0.41 -0.04 0.11 -0.16 -0.27
0.17 0.06 -0.02 -0.08 -0.07 -0.23 -0.06 0.2 -0.12 -0.06 0.07 0.08
-0.25 0.19 -0.2 0.37 -0.83 -0.1 -0.15 -0.23 -0.06 0.12 0.33 0.4
2.3 - -1.44 1.1 -1.12 - -0.99 - -1.18 0.72 0.59 -
0.81 -1.53 0.31 -1.2 -2.83 1.07 0.28 0.53 0.77 -2.09 -0.98 -0.2
0.54 0.19 -0.08 -0.36 -0.2 -0.41 -0.27 0.06 -0.13 0.08 0.19 0.09
-0.06 0.07 0.03 0.01 0.04 -0.12 -0.15 -0.17 -0.02 -0.02 0.18 0.15
1.71 - - - - 0.81 - 1.13 - 0.49 0.81 0.7
0.48 0.13 0.15 0.16 -0.14 -0.13 -0.04 0.19 -0.15 -0.07 0.07 -1.17
0.68 0.36 -0.44 -0.12 -0.61 -0.65 -0.26 -0.63 -0.22 0.14 0.36 0.53
0.41 -0.31 -0.32 -0.54 -0.29 -1.22 -0.13 0.16 0.36 -0.35 0.41 0.76
0.11 -0.14 -0.05 -0.05 -0.0 -0.03 -0.11 0.07 -0.07 0.03 0.1 0.12
0.1 0.14 -0.14 -0.19 -0.26 -0.49 -0.1 0.2 0.18 -0.05 -0.09 0.46
0.69 0.74 -0.27 -0.17 0.17 0.01 -0.1 -0.5 -0.36 -0.3 -1.11 0.23
0.09 0.05 -0.05 -0.17 -0.12 -0.37 -0.28 0.01 0.17 0.09 0.25 0.2
- 1.71 - - 0.17 - -1.38 - -1.73 -1.49 -1.13 2.61
0.01 0.05 0.01 -0.11 -0.07 -0.02 0.09 0.1 0.03 -0.02 -0.03 -0.05
0.14 -0.38 -0.14 -0.67 0.12 0.12 -0.12 0.1 -0.18 0.08 0.15 0.47
-0.75 -0.02 -1.4 -0.88 -0.26 0.93 -0.3 0.02 -0.04 1.0 -0.46 0.29
-1.72 0.56 -0.51 0.11 0.07 1.05 -0.33 -0.44 -0.25 0.21 -0.32 -0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.