Heatmap: Cluster_226 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.18 -0.1 -0.08 -0.12 0.03 -0.02 0.01 0.14 0.1 0.2 0.09 -0.13
-0.44 -0.51 -0.48 -0.25 -0.17 0.16 0.01 0.15 0.41 0.4 0.2 0.13
-0.33 -0.35 -0.32 -0.18 -0.03 0.1 0.08 0.14 0.29 0.19 0.11 0.12
-0.06 -0.23 -0.27 -0.19 -0.24 -0.16 -0.02 0.12 0.25 0.3 0.23 0.1
-0.47 -0.19 -0.36 -0.43 -0.15 -0.09 0.12 0.14 0.32 0.3 0.28 0.21
-0.29 -0.35 -0.25 -0.11 -0.03 0.11 0.08 0.17 0.21 0.14 0.14 0.06
-0.29 -0.48 -0.58 -0.38 -0.23 0.03 0.11 0.15 0.23 0.37 0.53 0.07
-0.48 -0.18 -0.02 -0.03 -0.02 0.02 -0.06 0.03 0.16 0.17 0.15 0.15
-0.65 -0.61 -0.28 -0.44 0.02 0.02 0.25 0.32 0.35 0.33 0.16 0.04
-0.13 -0.62 -0.68 -1.04 -0.35 -0.02 0.23 0.34 0.36 0.31 0.54 0.2
-0.3 -0.24 -0.36 -0.24 -0.16 0.08 0.1 0.21 0.34 0.3 0.18 -0.13
-0.17 -0.25 -0.28 -0.23 -0.11 0.06 0.04 0.12 0.22 0.32 0.09 0.03
-0.43 -0.29 -0.24 -0.08 -0.12 0.1 0.05 0.14 0.4 0.21 0.06 0.0
-0.2 -0.15 -0.13 -0.04 0.03 0.12 -0.04 0.05 0.16 0.1 0.13 -0.06
-0.53 -0.42 -0.89 -0.89 -0.09 -0.15 -0.02 0.59 0.29 0.42 0.24 0.49
-1.06 -0.4 -0.47 -0.42 -0.18 0.07 0.21 0.34 0.42 0.42 0.36 -0.02
-0.16 -0.44 -0.3 -0.39 -0.01 0.01 0.08 0.15 0.2 0.19 0.27 0.18
-0.26 -0.19 -0.17 -0.29 -0.19 -0.0 0.1 0.37 0.31 0.07 0.1 -0.02
0.03 -0.49 -0.34 -0.51 0.02 0.11 0.07 -0.26 0.72 0.1 0.25 -0.19
-0.26 -0.31 -0.25 -0.2 0.02 0.2 0.07 0.09 0.33 0.13 0.06 -0.03
-0.66 -0.75 -0.7 -0.49 -0.21 0.01 -0.02 0.28 0.44 0.43 0.39 0.44
-0.39 -0.53 -0.36 -0.53 0.04 0.21 0.05 0.22 0.3 0.3 0.3 0.01
-0.26 -0.22 -0.25 -0.15 0.04 0.04 0.11 0.11 0.23 0.11 0.08 0.06
-0.1 -0.15 -0.24 -0.27 -0.17 -0.03 0.08 0.27 0.18 0.16 0.1 0.04
-0.88 -0.25 -0.13 -0.27 0.02 0.02 -0.01 0.12 0.18 0.33 0.28 0.21
-0.08 -0.2 -0.16 -0.14 -0.06 -0.04 0.09 0.16 0.19 0.09 0.05 0.05
-0.08 -0.17 -0.14 -0.09 0.02 -0.04 -0.01 0.11 0.11 0.09 0.06 0.1
-0.48 -0.4 -0.33 -0.31 -0.07 0.11 0.12 0.23 0.21 0.16 0.22 0.25
- - - -0.25 - - -0.51 1.6 1.26 2.0 0.04 -
-0.25 -0.15 -0.2 -0.22 -0.09 -0.06 0.06 0.19 0.25 0.17 0.18 0.01
-0.18 -0.33 -0.14 -0.23 -0.15 -0.16 0.17 0.12 0.26 0.16 0.13 0.19
-0.12 -0.33 -0.22 -0.28 -0.04 -0.04 0.13 0.13 0.23 0.17 0.07 0.18
-0.01 -0.19 -0.17 -0.4 -0.21 -0.08 0.01 0.3 0.14 0.14 0.17 0.15
-0.28 -0.25 -0.19 -0.21 -0.18 -0.06 0.06 0.32 0.39 0.05 0.17 -0.04
-0.38 -0.19 -0.15 -0.21 -0.16 -0.0 0.11 0.27 0.26 0.22 0.06 0.02
-1.21 -1.16 -1.1 -1.33 -0.37 -0.49 -0.44 0.14 0.9 0.75 0.8 0.71
-0.26 -0.38 -0.28 -0.17 -0.08 0.03 0.08 0.02 0.28 0.26 0.21 0.11
-0.14 -0.25 -0.14 -0.12 -0.04 0.03 -0.0 0.15 0.12 0.21 0.09 0.01
-0.63 -0.47 -0.33 -0.08 0.01 -0.02 0.08 0.08 0.37 0.25 0.14 0.26
-0.2 -0.25 -0.16 -0.11 -0.04 -0.0 0.09 0.22 0.21 0.15 0.08 -0.07
-0.38 -0.25 -0.29 -0.46 -0.16 0.06 0.19 0.3 0.27 0.24 0.1 0.1
-0.25 -0.28 -0.28 -0.13 -0.08 0.03 0.05 0.13 0.09 0.13 0.18 0.27
-0.12 -0.12 -0.15 -0.03 -0.01 0.0 -0.02 -0.01 0.29 0.07 -0.01 0.04
-0.77 -0.43 -0.26 -0.25 -0.23 0.05 0.06 0.12 0.35 0.37 0.36 0.17
-0.25 -0.3 -0.18 -0.15 -0.03 -0.05 0.08 0.18 0.22 0.19 0.15 0.02
-0.2 -0.27 -0.27 -0.24 -0.19 -0.15 0.15 0.19 0.33 0.21 0.11 0.14
-0.82 -0.83 -0.8 -0.69 -0.62 -0.31 0.02 0.12 0.59 0.78 0.82 0.17
-0.45 -0.71 -0.54 -0.3 0.02 0.2 0.19 0.33 0.3 0.28 0.17 0.03
-0.73 -0.89 -0.51 -0.4 -0.01 0.12 -0.07 0.3 0.35 0.44 0.37 0.27
-0.34 -0.37 -0.09 -0.09 0.08 0.03 0.08 -0.05 0.23 0.18 0.12 0.08
-0.23 -0.25 -0.17 -0.2 -0.11 0.03 0.05 0.06 0.29 0.22 0.14 0.04
-0.19 -0.6 -0.28 -0.35 0.11 -0.13 0.18 0.13 0.53 0.14 0.04 0.1
-0.12 -0.07 -0.14 -0.26 -0.04 -0.03 -0.0 0.13 0.17 0.11 0.04 0.16
-0.14 -0.74 -0.57 -0.37 -0.08 0.21 0.17 0.18 0.61 0.04 0.06 0.13
-0.21 -0.16 -0.2 -0.28 -0.16 -0.23 -0.0 0.15 0.27 0.22 0.28 0.16
-0.33 -0.2 -0.46 -0.16 -0.25 -0.14 -0.02 0.11 0.36 0.41 0.23 0.17
-0.13 -0.26 -0.34 -0.66 -0.06 -0.01 0.02 0.25 0.23 0.23 0.13 0.29
-0.28 -0.45 -0.23 -0.28 0.05 0.16 0.1 0.11 0.24 0.22 0.16 0.0
-0.11 -0.3 -0.07 -0.09 -0.02 0.06 0.02 0.1 0.14 0.12 0.06 0.02
-0.3 -0.38 -0.3 -0.24 0.06 0.12 0.1 0.12 0.21 0.2 0.16 0.07
-0.59 -0.71 -0.43 -0.49 -0.06 0.23 0.22 0.27 0.22 0.33 0.34 0.11
-0.46 -0.44 -0.34 -0.15 -0.14 0.22 0.04 0.1 0.27 0.4 0.17 0.03
-2.54 -1.68 -0.63 0.16 -0.01 0.6 0.35 -0.03 0.69 0.49 0.13 -0.19
-0.28 -0.23 -0.26 -0.16 -0.04 0.15 0.1 0.1 0.2 0.15 0.13 0.02
-0.3 -0.42 -0.24 -0.15 -0.03 0.04 0.03 0.04 0.21 0.21 0.28 0.16
-0.19 -0.35 -0.27 -0.07 -0.03 0.08 -0.0 0.07 0.21 0.2 0.15 0.08
-0.26 -0.22 -0.17 -0.07 -0.04 0.11 0.03 0.1 0.21 0.15 0.12 -0.06
-0.72 -0.44 -0.31 -0.2 -0.16 0.0 0.16 0.42 0.41 0.35 0.06 -0.02
-0.21 -0.19 -0.06 -0.11 0.04 -0.01 -0.08 0.07 0.17 0.13 0.08 0.12
-0.17 -1.04 -1.08 -0.61 -0.57 -0.26 -0.11 -0.14 0.58 0.68 0.62 0.6
-0.44 -0.34 -0.49 -0.41 -0.09 0.05 0.17 0.27 0.44 0.25 0.06 0.15
-0.3 -0.32 -0.15 -0.15 -0.02 -0.05 0.05 0.22 0.2 0.16 0.17 0.06
-0.08 -0.43 -0.65 -0.42 -0.57 -0.11 0.15 -0.08 0.6 0.44 0.3 0.22
-0.58 -0.23 -0.35 -0.39 -0.03 0.1 0.2 0.35 0.28 0.14 0.05 0.13
-0.27 -0.35 -0.25 -0.23 -0.16 0.21 -0.02 0.13 0.1 0.23 0.26 0.17
-1.07 -0.45 -0.19 -0.39 -0.11 -0.05 0.13 0.46 0.26 0.33 0.28 0.15
-0.48 -0.59 -0.37 -0.35 0.17 0.08 0.13 0.11 0.34 0.27 0.24 0.08
-0.52 -0.48 -0.36 -0.36 -0.26 0.14 0.19 0.37 0.37 0.3 0.2 -0.03
-0.03 -0.28 -0.13 -0.17 0.12 -0.11 0.04 0.12 0.22 0.07 0.0 0.06
-0.56 -0.58 -0.51 -0.46 -0.29 -0.01 0.22 0.2 0.64 0.51 0.22 -0.08
-0.51 -0.33 -0.22 -0.18 -0.2 -0.08 0.17 0.29 0.31 0.24 0.14 0.1
-0.51 -0.4 -0.24 -0.09 -0.05 0.08 -0.08 -0.07 0.46 0.37 0.16 0.06
-0.86 -0.36 -0.23 -0.29 0.02 -0.03 -0.06 0.34 0.29 0.37 0.2 0.15
-0.68 -0.3 -0.34 -0.35 -0.21 0.03 0.12 0.28 0.41 0.3 0.21 0.12
-0.39 -0.16 -0.13 -0.18 -0.14 0.09 -0.03 0.14 0.18 0.13 0.32 0.03
-0.12 -0.07 -0.08 -0.08 -0.09 0.03 0.05 0.13 0.08 0.04 0.07 0.01
-0.18 -0.32 -0.25 -0.17 -0.02 0.04 -0.11 0.12 0.22 0.29 0.23 -0.01
-0.17 -0.08 -0.12 -0.11 -0.08 0.05 0.03 0.15 0.1 0.12 0.07 0.01
-0.3 -0.43 -0.2 -0.1 -0.04 0.07 0.17 0.13 0.17 0.21 0.09 0.08
-0.28 -0.38 -0.17 -0.12 -0.02 0.14 0.03 0.13 0.23 0.16 0.1 0.04
-0.33 -0.54 -0.25 -0.4 -0.05 0.13 0.08 0.23 0.4 0.29 0.1 0.03
-0.32 -0.34 -0.41 -0.34 -0.11 0.03 0.2 0.31 0.39 0.22 0.14 -0.06
-0.36 -0.56 -0.59 -0.41 -0.2 0.11 0.14 0.23 0.34 0.35 0.26 0.21
-0.58 -0.47 -0.26 -0.23 -0.1 -0.02 0.08 0.27 0.4 0.31 0.16 0.07
-2.07 -1.14 -0.36 -0.17 0.21 0.04 -0.11 -0.05 0.72 0.66 0.23 0.2
-0.22 -0.41 -0.11 -0.1 0.07 0.08 0.01 0.0 0.28 0.15 0.05 0.08
-0.11 -0.1 -0.18 -0.03 -0.05 0.03 -0.03 0.11 0.17 0.13 0.09 -0.06
-0.6 -0.29 -0.34 -0.29 -0.19 0.11 0.21 0.09 0.36 0.33 0.24 0.02
-0.29 -0.35 -0.16 -0.23 -0.01 0.08 -0.03 0.2 0.22 0.17 0.11 0.15
0.02 -0.13 0.04 -0.14 0.11 -0.25 -0.13 0.21 0.12 0.11 -0.03 0.0
-0.08 -0.24 -0.21 -0.14 -0.08 -0.05 0.02 0.15 0.17 0.13 0.1 0.14
0.02 -0.23 -0.32 -0.44 -0.15 0.07 0.01 0.31 0.24 0.13 0.03 0.13
-0.42 -0.33 -0.26 -0.15 -0.05 0.04 0.09 0.3 0.11 0.25 0.17 0.06
-0.49 -0.29 -0.2 -0.02 -0.06 -0.01 0.12 0.3 0.19 0.18 0.1 0.0
-0.38 -0.22 -0.28 -0.36 -0.17 -0.16 0.18 0.19 0.33 0.23 0.25 0.14
-0.07 -0.27 -0.26 -0.22 -0.05 -0.02 0.15 0.08 0.12 0.15 0.14 0.13
-0.23 -0.66 -0.6 -0.41 -0.05 0.16 0.06 0.25 0.45 0.31 0.19 0.08
-0.29 -0.52 -0.54 -0.35 -0.07 0.04 0.12 0.17 0.3 0.23 0.24 0.31
-0.39 -0.47 -0.23 -0.12 0.02 0.08 0.05 -0.07 0.29 0.28 0.26 0.08
-0.24 -0.33 -0.42 -0.06 -0.17 0.16 -0.06 -0.05 0.47 0.32 0.05 0.07
0.01 -0.21 -0.19 -0.19 -0.07 0.0 0.07 0.15 0.17 0.11 0.11 -0.02
-0.59 -0.38 -0.34 -0.24 -0.09 0.14 0.15 0.26 0.37 0.24 0.1 0.05
-0.15 -0.31 -0.17 -0.13 -0.01 0.03 0.03 0.09 0.16 0.13 0.18 0.06
-0.25 -0.46 -0.39 -0.17 0.03 0.23 0.15 0.2 0.17 0.09 0.16 0.03
-0.32 -0.76 -0.39 -0.21 0.0 0.05 0.06 0.31 0.42 0.24 0.11 0.08
-0.18 -0.2 -0.15 -0.14 -0.06 0.03 0.05 0.14 0.18 0.08 0.07 0.1
0.13 -0.25 -0.46 -0.36 -0.21 -0.1 0.17 0.08 0.3 0.24 0.0 0.2
0.09 -0.31 -0.28 -0.3 -0.07 -0.01 0.08 0.09 0.19 0.18 0.16 0.04
- - - - - - - 2.3 - 2.83 - -
-0.44 -0.23 -0.26 -0.18 -0.09 0.01 0.17 0.17 0.3 0.15 0.17 0.03
-0.37 -0.2 -0.14 -0.22 -0.06 0.01 0.03 0.19 0.17 0.05 0.24 0.16
-0.26 -0.33 -0.16 -0.12 -0.24 -0.34 -0.17 -0.03 0.3 0.33 0.27 0.45
-0.35 -0.47 -0.45 -0.38 0.03 0.04 0.12 0.18 0.4 0.22 0.17 0.15
-0.29 -0.46 -0.51 -0.35 -0.22 0.05 0.11 0.24 0.44 0.33 0.19 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.