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Heatmap: Cluster_254 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.16 -1.81 -0.77 1.51 -0.56 -0.87 0.9 -0.61 0.19 0.03 0.95 -
0.01 -0.15 -0.08 0.05 -0.0 0.06 0.13 0.04 0.08 -0.03 -0.03 -0.12
0.21 -0.08 -0.15 0.08 -0.06 -0.05 0.19 -0.08 0.06 -0.08 0.11 -0.21
-1.52 0.49 -1.08 0.58 0.87 0.37 -1.4 -0.86 -0.59 0.09 0.54 0.05
-0.69 -0.01 0.34 0.73 0.67 -0.48 -0.15 0.33 -0.09 -0.52 -1.17 -0.14
- - - - 0.74 - 0.84 2.09 - 2.1 - -
-0.09 -0.03 -0.12 0.15 0.0 -0.1 0.04 0.21 0.2 0.01 0.01 -0.38
-0.21 -0.09 -0.63 0.17 0.23 -0.38 0.28 0.46 0.07 0.0 0.05 -0.32
-0.84 -0.16 -0.56 0.5 -0.59 0.4 -0.43 0.86 0.03 0.26 -0.29 -0.17
-0.4 -0.06 0.07 -0.53 -0.03 0.15 -0.23 -0.09 0.45 0.14 0.51 -0.37
-0.02 -0.04 0.08 -0.05 -0.1 -0.09 -0.04 0.03 -0.11 0.08 0.16 0.07
-0.2 -0.04 -0.19 0.06 0.02 -0.09 0.13 0.19 0.22 0.12 -0.06 -0.26
-1.75 -0.04 -0.49 0.03 -0.04 0.6 -1.07 0.42 0.27 0.06 0.44 0.13
-0.14 -0.05 -0.03 0.09 -0.05 0.02 0.0 0.11 0.08 0.07 0.02 -0.17
-1.56 -0.22 0.13 -0.2 0.36 -0.17 0.13 0.13 0.38 0.14 0.42 -0.43
- -0.1 1.46 -0.36 -0.46 - 2.19 1.18 - - - -
-1.02 0.19 -0.03 0.34 0.13 0.05 -0.12 0.14 -0.05 -0.06 -0.22 0.24
0.08 -0.14 -0.14 0.02 0.18 0.07 0.07 0.11 0.03 -0.07 -0.12 -0.14
-0.24 -0.08 0.03 0.12 -0.06 0.06 0.0 0.21 0.12 0.02 -0.04 -0.21
- -0.58 -0.48 -0.27 0.88 0.74 0.2 0.95 -0.25 0.63 -1.2 -1.42
-0.25 0.06 -0.12 -0.08 -0.46 -0.02 -0.13 0.31 0.25 0.1 0.24 -0.1
-0.14 -0.32 -0.44 0.34 0.12 0.12 0.08 0.17 -0.11 -0.04 0.12 -0.08
0.26 0.08 0.73 0.64 -0.21 -1.84 -0.08 0.81 -0.87 0.39 -0.76 -1.98
- - -0.21 - - - 2.31 0.3 -0.23 - 1.84 -0.97
-0.37 0.04 -0.78 0.51 -0.36 0.14 0.45 0.4 0.34 -0.11 -0.15 -0.93
- - 0.98 - 0.68 -0.37 1.8 - -0.53 -0.69 1.1 -0.48
-0.25 -0.1 0.05 -0.02 0.12 -0.01 0.0 0.05 0.09 0.06 0.08 -0.12
-0.36 -0.05 -0.01 0.15 -0.03 0.1 -0.04 0.16 0.1 -0.04 -0.06 0.01
0.02 -0.19 -0.19 0.19 -0.1 -0.22 0.18 0.23 0.25 0.04 -0.2 -0.13
-0.28 -0.82 -0.61 0.02 0.12 0.65 1.03 -0.46 -0.14 0.15 -0.01 -1.0
-0.27 -0.25 -0.05 0.21 -0.09 -0.06 -0.02 0.33 0.25 -0.11 0.03 -0.11
- - -0.33 -1.22 0.62 -1.4 -0.16 0.98 1.21 0.32 1.04 -1.43
-0.24 -0.04 0.32 0.33 0.08 -0.48 0.05 0.4 -0.02 0.04 -0.36 -0.41
-0.35 -0.24 -0.55 -0.42 -0.06 -0.19 -0.13 0.56 0.36 0.3 0.27 -0.0
0.16 -0.19 0.03 -0.23 -0.09 -0.46 0.18 0.15 -0.35 0.01 0.45 0.08
-0.88 -0.16 -0.17 0.03 -0.16 -0.01 0.04 0.4 0.35 0.18 0.11 -0.1
0.28 - -2.85 1.48 -1.38 -1.28 - - 1.33 0.6 0.85 0.32
- - 0.59 - - -0.8 2.66 1.84 - - - -
- - - - - - 2.82 1.53 1.03 - - -
-0.19 -0.1 -0.35 0.14 -0.04 0.0 0.18 0.18 0.25 -0.03 0.03 -0.18
-0.29 0.11 0.22 0.12 0.0 -0.14 -0.25 0.06 0.03 -0.07 0.07 0.03
-0.26 -0.05 -0.21 0.05 -0.02 -0.02 -0.04 0.2 0.22 0.13 -0.06 -0.02
-3.25 -1.48 -2.76 0.4 -0.39 0.64 0.57 1.09 -0.59 1.03 -0.03 -1.17
0.19 -0.04 0.0 -0.11 -0.13 -0.17 -0.02 -0.06 0.33 -0.07 0.25 -0.33
-0.02 -0.02 -0.04 -0.02 0.0 -0.03 -0.02 0.06 -0.02 -0.02 0.06 0.06
- - - - - - 2.41 -0.21 1.69 -0.89 - 1.04
-0.49 -0.17 0.01 -0.02 0.05 0.13 0.14 0.01 0.02 0.15 0.05 0.01
-2.58 0.31 0.31 -0.04 -0.41 -1.66 -0.04 0.36 0.7 -0.11 0.88 -0.6
0.01 0.61 0.19 -0.62 -0.38 -0.71 -0.3 0.16 -0.02 -0.05 0.51 -0.01
-0.02 -0.04 -0.01 -0.14 -0.08 -0.59 -0.34 -0.09 -0.07 0.17 0.64 0.22
-0.3 0.12 -0.11 -0.18 -0.07 0.03 -0.35 0.29 0.02 0.05 0.29 0.05
- -1.2 - - 0.7 -0.16 0.3 1.44 -1.49 1.54 0.14 -0.45
- - 0.25 - 0.96 -1.75 1.79 1.62 0.06 -1.58 -1.46 -1.86
-0.07 -0.21 0.24 0.49 0.42 -0.37 -0.28 0.33 -0.11 -0.28 -0.37 -0.19
0.05 0.67 -0.02 0.15 -0.52 -2.25 -0.07 0.77 0.19 -0.16 0.56 -2.27
1.62 - -2.06 1.69 -2.16 -1.87 - -1.71 1.27 0.93 -1.57 -
-0.53 -0.49 -0.22 0.01 0.25 0.41 0.62 -0.64 0.21 0.15 0.25 -0.79
1.73 - -1.17 1.21 -1.08 - - - 1.46 0.38 0.49 -
-1.6 -1.2 0.7 1.13 0.76 0.33 0.59 -0.6 -0.59 -1.15 -0.19 -1.65
-0.7 0.01 1.07 0.25 0.24 -2.32 0.11 -0.42 0.34 0.01 0.21 -1.17
-0.67 -0.08 -0.22 -0.12 0.11 -0.08 0.13 0.2 0.22 0.1 0.19 -0.0
-0.15 -0.05 -0.13 0.12 0.04 -0.04 0.08 0.15 0.02 -0.02 -0.03 -0.02
-0.41 -0.32 -0.31 -0.35 0.12 -0.12 0.36 0.69 0.13 0.32 -0.02 -0.7
-0.35 -0.01 0.0 0.1 0.08 0.02 0.06 0.17 -0.03 -0.06 0.13 -0.18
-0.16 -1.21 -0.22 -0.16 -0.41 0.57 0.77 0.16 0.23 0.36 0.18 -1.93
- -0.74 -0.49 0.73 0.85 0.25 0.87 0.63 0.24 -0.91 -0.25 -3.2
- - - - 1.51 -0.61 2.42 0.93 - 0.29 - -
-1.5 -2.04 0.48 1.05 -0.24 0.33 0.25 0.78 -0.04 0.07 -0.71 -1.77
-1.39 -0.82 -0.12 -0.5 -0.64 0.77 -0.75 0.98 1.21 0.05 -0.74 -0.82
-0.11 -0.03 -0.09 -0.03 -0.01 0.04 0.02 0.06 -0.01 -0.03 0.06 0.12
-0.27 0.36 0.56 0.48 0.25 -0.51 -1.45 0.07 0.19 -0.66 0.1 -0.21
0.15 -1.16 -0.34 1.3 -0.1 -1.37 -0.44 1.01 -0.6 0.4 -1.08 -0.58
-1.48 -0.27 0.28 0.21 0.27 -0.43 -0.36 0.81 -0.17 0.38 -0.04 -0.33
0.07 -0.16 0.05 0.17 0.02 -0.11 -0.09 -0.05 0.12 0.01 0.09 -0.17
-0.32 -0.22 -0.06 0.23 0.08 0.17 0.03 0.15 -0.01 -0.14 -0.02 0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.